MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_014804	TTC	2	6	1552261	1552266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231524
31003	NC_014804	TAAT	2	8	1552297	1552304	50 %	50 %	0 %	0 %	315231524
31004	NC_014804	TTC	2	6	1552360	1552365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231524
31005	NC_014804	CAAA	2	8	1552394	1552401	75 %	0 %	0 %	25 %	315231524
31006	NC_014804	CCG	2	6	1552411	1552416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231524
31007	NC_014804	AGA	2	6	1552558	1552563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231524
31008	NC_014804	ATCA	2	8	1552599	1552606	50 %	25 %	0 %	25 %	315231524
31009	NC_014804	TC	3	6	1552619	1552624	0 %	50 %	0 %	50 %	315231524
31010	NC_014804	TC	3	6	1552642	1552647	0 %	50 %	0 %	50 %	315231524
31011	NC_014804	GGA	2	6	1552681	1552686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231524
31012	NC_014804	TCT	2	6	1552751	1552756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231525
31013	NC_014804	CTT	2	6	1552773	1552778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231525
31014	NC_014804	TTCTA	2	10	1552929	1552938	20 %	60 %	0 %	20 %	315231525
31015	NC_014804	GCTT	2	8	1552968	1552975	0 %	50 %	25 %	25 %	315231525
31016	NC_014804	TAA	2	6	1552977	1552982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231525
31017	NC_014804	ACC	2	6	1552998	1553003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31018	NC_014804	TC	3	6	1553031	1553036	0 %	50 %	0 %	50 %	315231526
31019	NC_014804	TTA	2	6	1553040	1553045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231526
31020	NC_014804	ATT	2	6	1553082	1553087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231526
31021	NC_014804	GGA	2	6	1553119	1553124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231526
31022	NC_014804	GAA	2	6	1553273	1553278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231526
31023	NC_014804	TGG	2	6	1553305	1553310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231526
31024	NC_014804	CTG	2	6	1553323	1553328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231526
31025	NC_014804	CGC	2	6	1553359	1553364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231526
31026	NC_014804	GATG	2	8	1553395	1553402	25 %	25 %	50 %	0 %	315231526
31027	NC_014804	TTA	2	6	1553434	1553439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231526
31028	NC_014804	AAG	2	6	1553503	1553508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231526
31029	NC_014804	ATT	2	6	1553592	1553597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231526
31030	NC_014804	ATTG	2	8	1553654	1553661	25 %	50 %	25 %	0 %	315231526
31031	NC_014804	CCT	2	6	1553735	1553740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231526
31032	NC_014804	AGA	2	6	1553746	1553751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231526
31033	NC_014804	CTT	2	6	1553752	1553757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231526
31034	NC_014804	TGAA	2	8	1553760	1553767	50 %	25 %	25 %	0 %	315231526
31035	NC_014804	AATG	2	8	1553768	1553775	50 %	25 %	25 %	0 %	315231526
31036	NC_014804	ATC	2	6	1553799	1553804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231526
31037	NC_014804	TCA	2	6	1553825	1553830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31038	NC_014804	A	6	6	1553839	1553844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31039	NC_014804	T	11	11	1553871	1553881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31040	NC_014804	AGT	2	6	1553920	1553925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31041	NC_014804	TTAT	2	8	1553949	1553956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31042	NC_014804	TG	4	8	1554060	1554067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31043	NC_014804	TG	3	6	1554120	1554125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31044	NC_014804	TG	4	8	1554150	1554157	0 %	50 %	50 %	0 %	315231527
31045	NC_014804	TTA	2	6	1554158	1554163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231527
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31047	NC_014804	CTC	2	6	1554200	1554205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231527
31048	NC_014804	AT	3	6	1554206	1554211	50 %	50 %	0 %	0 %	315231527
31049	NC_014804	AGG	2	6	1554232	1554237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231527
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31051	NC_014804	ATG	2	6	1554247	1554252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231527
31052	NC_014804	TGAA	2	8	1554308	1554315	50 %	25 %	25 %	0 %	315231527
31053	NC_014804	AC	3	6	1554338	1554343	50 %	0 %	0 %	50 %	315231527
31054	NC_014804	AAG	2	6	1554380	1554385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231527
31055	NC_014804	GA	3	6	1554438	1554443	50 %	0 %	50 %	0 %	315231527
31056	NC_014804	ATT	2	6	1554482	1554487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231527
31057	NC_014804	TGCT	2	8	1554521	1554528	0 %	50 %	25 %	25 %	315231527
31058	NC_014804	AGG	2	6	1554615	1554620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231527
31059	NC_014804	A	6	6	1554633	1554638	100 %	0 %	0 %	0 %	315231527
31060	NC_014804	A	6	6	1554663	1554668	100 %	0 %	0 %	0 %	315231527
31061	NC_014804	TGG	2	6	1554714	1554719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231527
31062	NC_014804	AC	3	6	1554752	1554757	50 %	0 %	0 %	50 %	315231527
31063	NC_014804	GAAA	2	8	1554768	1554775	75 %	0 %	25 %	0 %	315231527
31064	NC_014804	AATAAA	2	12	1554930	1554941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	315231527
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31067	NC_014804	ACT	2	6	1554981	1554986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231527
31068	NC_014804	GACAA	2	10	1555039	1555048	60 %	0 %	20 %	20 %	315231527
31069	NC_014804	ATT	2	6	1555068	1555073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231527
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31071	NC_014804	GAAG	2	8	1555086	1555093	50 %	0 %	50 %	0 %	315231527
31072	NC_014804	AAG	2	6	1555217	1555222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231527
31073	NC_014804	TG	3	6	1555276	1555281	0 %	50 %	50 %	0 %	315231527
31074	NC_014804	GTT	2	6	1555303	1555308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231527
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31078	NC_014804	TAAAA	2	10	1555371	1555380	80 %	20 %	0 %	0 %	315231527
31079	NC_014804	TAT	2	6	1555411	1555416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231527
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31085	NC_014804	GAA	2	6	1555654	1555659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231527
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31091	NC_014804	TGA	2	6	1555832	1555837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231528
31092	NC_014804	TCA	2	6	1555867	1555872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231528
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31096	NC_014804	GA	3	6	1556052	1556057	50 %	0 %	50 %	0 %	315231528
31097	NC_014804	TGA	2	6	1556198	1556203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231528
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31100	NC_014804	GAT	2	6	1556417	1556422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231528
31101	NC_014804	ATG	2	6	1556437	1556442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231528
31102	NC_014804	TCC	2	6	1556487	1556492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231528
31103	NC_014804	TGT	2	6	1556504	1556509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231528
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31107	NC_014804	TTA	2	6	1556655	1556660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231528
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31109	NC_014804	ACA	2	6	1556811	1556816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231528
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31112	NC_014804	CTA	2	6	1556917	1556922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231528
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31115	NC_014804	CTT	2	6	1556996	1557001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231528
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31475	NC_014804	GTG	2	6	1576114	1576119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31476	NC_014804	TCA	2	6	1576127	1576132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31477	NC_014804	AGG	2	6	1576139	1576144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31478	NC_014804	CAT	3	9	1576152	1576160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31479	NC_014804	TGG	2	6	1576198	1576203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31480	NC_014804	TGA	2	6	1576259	1576264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231549
31481	NC_014804	CAAGC	2	10	1576325	1576334	40 %	0 %	20 %	40 %	315231549
31482	NC_014804	GGA	2	6	1576431	1576436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231549
31483	NC_014804	ACG	2	6	1576447	1576452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231549
31484	NC_014804	GTT	2	6	1576476	1576481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231549
31485	NC_014804	CAT	2	6	1576604	1576609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231549
31486	NC_014804	AGA	2	6	1576621	1576626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231549
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31491	NC_014804	CAG	2	6	1576808	1576813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231549
31492	NC_014804	GA	4	8	1576835	1576842	50 %	0 %	50 %	0 %	315231549
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31496	NC_014804	GGA	2	6	1577164	1577169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231550
31497	NC_014804	AG	3	6	1577228	1577233	50 %	0 %	50 %	0 %	315231550
31498	NC_014804	TGA	2	6	1577271	1577276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231550
31499	NC_014804	TCG	2	6	1577324	1577329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231550
31500	NC_014804	TGA	2	6	1577334	1577339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231550

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