MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30004	NC_014804	TCC	2	6	1501670	1501675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231471
30005	NC_014804	CAA	2	6	1501719	1501724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231471
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30013	NC_014804	AG	4	8	1502044	1502051	50 %	0 %	50 %	0 %	315231472
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30017	NC_014804	AGT	2	6	1502262	1502267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231472
30018	NC_014804	AAAG	2	8	1502290	1502297	75 %	0 %	25 %	0 %	315231472
30019	NC_014804	CAA	2	6	1502425	1502430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231472
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30119	NC_014804	CTT	2	6	1507815	1507820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231477
30120	NC_014804	TCC	2	6	1507821	1507826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231477
30121	NC_014804	CCG	4	12	1507828	1507839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231477
30122	NC_014804	TTA	2	6	1507850	1507855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231477
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30124	NC_014804	CT	3	6	1507943	1507948	0 %	50 %	0 %	50 %	315231477
30125	NC_014804	TTC	2	6	1507954	1507959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231477
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30128	NC_014804	TTCT	2	8	1508079	1508086	0 %	75 %	0 %	25 %	315231477
30129	NC_014804	CTC	2	6	1508121	1508126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231477
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30132	NC_014804	TCT	2	6	1508186	1508191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231477
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30135	NC_014804	TC	3	6	1508253	1508258	0 %	50 %	0 %	50 %	315231477
30136	NC_014804	CCA	2	6	1508332	1508337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231477
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30139	NC_014804	TC	3	6	1508673	1508678	0 %	50 %	0 %	50 %	315231477
30140	NC_014804	ATC	2	6	1508859	1508864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231477
30141	NC_014804	T	6	6	1508966	1508971	0 %	100 %	0 %	0 %	315231477
30142	NC_014804	CTT	2	6	1508972	1508977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231477
30143	NC_014804	TCT	2	6	1508993	1508998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231477
30144	NC_014804	CTT	2	6	1509146	1509151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231477
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30147	NC_014804	CT	3	6	1509191	1509196	0 %	50 %	0 %	50 %	315231477
30148	NC_014804	TCTCT	2	10	1509213	1509222	0 %	60 %	0 %	40 %	315231477
30149	NC_014804	TCC	2	6	1509250	1509255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231477
30150	NC_014804	CT	3	6	1509339	1509344	0 %	50 %	0 %	50 %	315231477
30151	NC_014804	AAC	2	6	1509408	1509413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231477
30152	NC_014804	CAGC	2	8	1509419	1509426	25 %	0 %	25 %	50 %	315231477
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30154	NC_014804	TTA	2	6	1509482	1509487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231477
30155	NC_014804	TC	3	6	1509489	1509494	0 %	50 %	0 %	50 %	315231477
30156	NC_014804	CTC	2	6	1509535	1509540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231477
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30163	NC_014804	CAA	2	6	1509737	1509742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231477
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30168	NC_014804	CATC	2	8	1509986	1509993	25 %	25 %	0 %	50 %	315231477
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30171	NC_014804	TGA	2	6	1510151	1510156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231477
30172	NC_014804	CTA	2	6	1510187	1510192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231477
30173	NC_014804	CAT	2	6	1510199	1510204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231477
30174	NC_014804	TC	3	6	1510254	1510259	0 %	50 %	0 %	50 %	315231477
30175	NC_014804	AAG	2	6	1510261	1510266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231477
30176	NC_014804	TC	3	6	1510279	1510284	0 %	50 %	0 %	50 %	315231477
30177	NC_014804	TTC	2	6	1510287	1510292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231477
30178	NC_014804	CTT	2	6	1510302	1510307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231477
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30180	NC_014804	TC	3	6	1510364	1510369	0 %	50 %	0 %	50 %	315231477
30181	NC_014804	ACA	2	6	1510516	1510521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30182	NC_014804	ATG	2	6	1510569	1510574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231478
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30186	NC_014804	ATT	2	6	1510740	1510745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231478
30187	NC_014804	TCTTT	2	10	1510789	1510798	0 %	80 %	0 %	20 %	315231478
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30189	NC_014804	TCA	2	6	1510833	1510838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30190	NC_014804	TCA	2	6	1510862	1510867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30191	NC_014804	AT	3	6	1510900	1510905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30192	NC_014804	CTT	2	6	1510914	1510919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30193	NC_014804	CAA	2	6	1510999	1511004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30194	NC_014804	ACAGC	2	10	1511081	1511090	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30195	NC_014804	TAA	2	6	1511103	1511108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30202	NC_014804	TGGATG	2	12	1511424	1511435	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	315231479
30203	NC_014804	CAA	2	6	1511455	1511460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231479
30204	NC_014804	GGT	2	6	1511523	1511528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231479
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30206	NC_014804	CAA	2	6	1511638	1511643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231479
30207	NC_014804	GCG	2	6	1511650	1511655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231479
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30210	NC_014804	CT	3	6	1511726	1511731	0 %	50 %	0 %	50 %	315231479
30211	NC_014804	AAT	2	6	1511873	1511878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231479
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30214	NC_014804	CGC	3	9	1512161	1512169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231479
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30218	NC_014804	CAGA	2	8	1512416	1512423	50 %	0 %	25 %	25 %	315231479
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30221	NC_014804	ATG	2	6	1512576	1512581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231479
30222	NC_014804	GTT	2	6	1512765	1512770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231480
30223	NC_014804	GA	4	8	1512804	1512811	50 %	0 %	50 %	0 %	315231480
30224	NC_014804	AAG	2	6	1512813	1512818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231480
30225	NC_014804	TCT	2	6	1512825	1512830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231480
30226	NC_014804	CTT	2	6	1512917	1512922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231480
30227	NC_014804	AGC	2	6	1512929	1512934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231480
30228	NC_014804	GCGAT	2	10	1513114	1513123	20 %	20 %	40 %	20 %	315231480
30229	NC_014804	AGC	2	6	1513223	1513228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231480
30230	NC_014804	AGA	2	6	1513243	1513248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231480
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30232	NC_014804	CCG	2	6	1513464	1513469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231480
30233	NC_014804	GAA	2	6	1513552	1513557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231480
30234	NC_014804	TAAAG	2	10	1513586	1513595	60 %	20 %	20 %	0 %	315231480
30235	NC_014804	GCTGA	2	10	1513662	1513671	20 %	20 %	40 %	20 %	315231480
30236	NC_014804	CAG	2	6	1513705	1513710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231480
30237	NC_014804	CAG	3	9	1513726	1513734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231480
30238	NC_014804	GAG	2	6	1513758	1513763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231480
30239	NC_014804	ATG	2	6	1513837	1513842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231480
30240	NC_014804	TGA	2	6	1513870	1513875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231480
30241	NC_014804	TCA	2	6	1513993	1513998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231480
30242	NC_014804	C	7	7	1514005	1514011	0 %	0 %	0 %	100 %	315231480
30243	NC_014804	TGA	2	6	1514118	1514123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231480
30244	NC_014804	TTC	2	6	1514128	1514133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30245	NC_014804	GGA	3	9	1514211	1514219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231481
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30249	NC_014804	GTA	2	6	1514400	1514405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231482
30250	NC_014804	GA	3	6	1514418	1514423	50 %	0 %	50 %	0 %	315231482
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30259	NC_014804	AGTC	2	8	1514638	1514645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30260	NC_014804	TCA	2	6	1514649	1514654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30285	NC_014804	TC	3	6	1515905	1515910	0 %	50 %	0 %	50 %	315231483
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30338	NC_014804	AAGAC	2	10	1517850	1517859	60 %	0 %	20 %	20 %	315231488
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30352	NC_014804	TAT	2	6	1518546	1518551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231488
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30470	NC_014804	TGG	2	6	1524145	1524150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30471	NC_014804	GTCATT	2	12	1524165	1524176	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	315231496
30472	NC_014804	CTT	2	6	1524186	1524191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231496
30473	NC_014804	TG	3	6	1524236	1524241	0 %	50 %	50 %	0 %	315231496
30474	NC_014804	GTT	2	6	1524288	1524293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231496
30475	NC_014804	ATA	2	6	1524394	1524399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231496
30476	NC_014804	ATCT	2	8	1524405	1524412	25 %	50 %	0 %	25 %	315231496
30477	NC_014804	AT	3	6	1524435	1524440	50 %	50 %	0 %	0 %	315231496
30478	NC_014804	CAG	2	6	1524442	1524447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231496
30479	NC_014804	TTC	2	6	1524448	1524453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231496
30480	NC_014804	TTA	2	6	1524520	1524525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231496
30481	NC_014804	CT	3	6	1524576	1524581	0 %	50 %	0 %	50 %	315231496
30482	NC_014804	GA	3	6	1524585	1524590	50 %	0 %	50 %	0 %	315231496
30483	NC_014804	TA	3	6	1524683	1524688	50 %	50 %	0 %	0 %	315231496
30484	NC_014804	A	6	6	1524757	1524762	100 %	0 %	0 %	0 %	315231496
30485	NC_014804	GTT	2	6	1524782	1524787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231496
30486	NC_014804	TGA	2	6	1524803	1524808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231496
30487	NC_014804	A	6	6	1525002	1525007	100 %	0 %	0 %	0 %	315231496
30488	NC_014804	AAT	2	6	1525086	1525091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231496
30489	NC_014804	TGA	2	6	1525115	1525120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231496
30490	NC_014804	AG	3	6	1525134	1525139	50 %	0 %	50 %	0 %	315231496
30491	NC_014804	CAT	2	6	1525334	1525339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231496
30492	NC_014804	CAACG	2	10	1525496	1525505	40 %	0 %	20 %	40 %	315231496
30493	NC_014804	CTAT	2	8	1525540	1525547	25 %	50 %	0 %	25 %	315231496
30494	NC_014804	TTTTG	2	10	1525565	1525574	0 %	80 %	20 %	0 %	315231496
30495	NC_014804	CAG	2	6	1525621	1525626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231496
30496	NC_014804	GTT	2	6	1525782	1525787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231496
30497	NC_014804	AC	3	6	1525879	1525884	50 %	0 %	0 %	50 %	315231496
30498	NC_014804	AGT	2	6	1525895	1525900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231496
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30500	NC_014804	GA	3	6	1526013	1526018	50 %	0 %	50 %	0 %	315231496

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