MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_014804	CT	3	6	1349695	1349700	0 %	50 %	0 %	50 %	315231324
27002	NC_014804	AAG	2	6	1349767	1349772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231324
27003	NC_014804	CAA	2	6	1349820	1349825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231324
27004	NC_014804	GGC	2	6	1349831	1349836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231324
27005	NC_014804	ATC	2	6	1349839	1349844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231324
27006	NC_014804	CT	3	6	1349874	1349879	0 %	50 %	0 %	50 %	315231324
27007	NC_014804	TTG	2	6	1349901	1349906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231324
27008	NC_014804	TCT	2	6	1349948	1349953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231324
27009	NC_014804	ATG	2	6	1350014	1350019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231324
27010	NC_014804	CTT	2	6	1350027	1350032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231324
27011	NC_014804	TCC	2	6	1350059	1350064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231324
27012	NC_014804	TC	3	6	1350070	1350075	0 %	50 %	0 %	50 %	315231324
27013	NC_014804	CT	3	6	1350193	1350198	0 %	50 %	0 %	50 %	315231324
27014	NC_014804	CTT	2	6	1350249	1350254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231324
27015	NC_014804	CT	3	6	1350264	1350269	0 %	50 %	0 %	50 %	315231324
27016	NC_014804	TTC	2	6	1350451	1350456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231324
27017	NC_014804	CTC	2	6	1350508	1350513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231324
27018	NC_014804	TAA	2	6	1350552	1350557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231324
27019	NC_014804	T	6	6	1350700	1350705	0 %	100 %	0 %	0 %	315231325
27020	NC_014804	AAC	2	6	1350769	1350774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231325
27021	NC_014804	TC	3	6	1350813	1350818	0 %	50 %	0 %	50 %	315231325
27022	NC_014804	CAA	2	6	1350825	1350830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231325
27023	NC_014804	AAC	2	6	1350838	1350843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231325
27024	NC_014804	CTT	2	6	1350888	1350893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231325
27025	NC_014804	CTC	2	6	1350907	1350912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231325
27026	NC_014804	GCT	2	6	1350927	1350932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231325
27027	NC_014804	TCA	2	6	1350933	1350938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231325
27028	NC_014804	CAC	2	6	1350985	1350990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27029	NC_014804	T	6	6	1351103	1351108	0 %	100 %	0 %	0 %	315231326
27030	NC_014804	TTC	2	6	1351124	1351129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231326
27031	NC_014804	CCA	2	6	1351189	1351194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231326
27032	NC_014804	TCT	3	9	1351202	1351210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231326
27033	NC_014804	TTC	2	6	1351261	1351266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231326
27034	NC_014804	CTT	2	6	1351317	1351322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231326
27035	NC_014804	CTTC	2	8	1351326	1351333	0 %	50 %	0 %	50 %	315231326
27036	NC_014804	TAG	2	6	1351337	1351342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231326
27037	NC_014804	TCC	2	6	1351376	1351381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231326
27038	NC_014804	CTC	3	9	1351429	1351437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231326
27039	NC_014804	TTC	2	6	1351484	1351489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231326
27040	NC_014804	GCT	2	6	1351542	1351547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231326
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27042	NC_014804	CAG	2	6	1351635	1351640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231326
27043	NC_014804	CTT	2	6	1351657	1351662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231326
27044	NC_014804	GCT	2	6	1351679	1351684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231326
27045	NC_014804	T	6	6	1351698	1351703	0 %	100 %	0 %	0 %	315231326
27046	NC_014804	TCTG	2	8	1351726	1351733	0 %	50 %	25 %	25 %	315231326
27047	NC_014804	TAT	2	6	1351798	1351803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231326
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27050	NC_014804	AGTC	2	8	1351945	1351952	25 %	25 %	25 %	25 %	315231326
27051	NC_014804	TAT	2	6	1352050	1352055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231326
27052	NC_014804	AAC	2	6	1352154	1352159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231327
27053	NC_014804	ATT	2	6	1352176	1352181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231327
27054	NC_014804	T	7	7	1352280	1352286	0 %	100 %	0 %	0 %	315231327
27055	NC_014804	CTTT	2	8	1352303	1352310	0 %	75 %	0 %	25 %	315231327
27056	NC_014804	ACCA	2	8	1352370	1352377	50 %	0 %	0 %	50 %	315231327
27057	NC_014804	T	6	6	1352408	1352413	0 %	100 %	0 %	0 %	315231327
27058	NC_014804	T	6	6	1352607	1352612	0 %	100 %	0 %	0 %	315231328
27059	NC_014804	AT	3	6	1352659	1352664	50 %	50 %	0 %	0 %	315231328
27060	NC_014804	GCTC	2	8	1352751	1352758	0 %	25 %	25 %	50 %	315231328
27061	NC_014804	CTTCT	2	10	1352779	1352788	0 %	60 %	0 %	40 %	315231328
27062	NC_014804	TCT	2	6	1352816	1352821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231328
27063	NC_014804	GCT	2	6	1352844	1352849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231328
27064	NC_014804	AAC	2	6	1352866	1352871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231328
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27068	NC_014804	TTC	2	6	1352950	1352955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231328
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27070	NC_014804	CTC	2	6	1353031	1353036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231328
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27079	NC_014804	TC	3	6	1353588	1353593	0 %	50 %	0 %	50 %	315231329
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27087	NC_014804	GAAAAT	2	12	1354037	1354048	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	315231330
27088	NC_014804	ATG	2	6	1354111	1354116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231330
27089	NC_014804	TCCA	2	8	1354198	1354205	25 %	25 %	0 %	50 %	315231330
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27091	NC_014804	CAA	2	6	1354255	1354260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231330
27092	NC_014804	GAAA	2	8	1354309	1354316	75 %	0 %	25 %	0 %	315231330
27093	NC_014804	A	6	6	1354376	1354381	100 %	0 %	0 %	0 %	315231330
27094	NC_014804	TTA	2	6	1354431	1354436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231330
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27099	NC_014804	GA	3	6	1354753	1354758	50 %	0 %	50 %	0 %	315231331
27100	NC_014804	AG	3	6	1354796	1354801	50 %	0 %	50 %	0 %	315231331
27101	NC_014804	GTT	2	6	1354914	1354919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231331
27102	NC_014804	TAAA	2	8	1354929	1354936	75 %	25 %	0 %	0 %	315231331
27103	NC_014804	GAA	2	6	1354965	1354970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231332
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27105	NC_014804	AATGA	2	10	1355057	1355066	60 %	20 %	20 %	0 %	315231332
27106	NC_014804	TGA	2	6	1355109	1355114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231332
27107	NC_014804	GA	3	6	1355113	1355118	50 %	0 %	50 %	0 %	315231332
27108	NC_014804	GA	4	8	1355155	1355162	50 %	0 %	50 %	0 %	315231332
27109	NC_014804	TTC	2	6	1355190	1355195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231332
27110	NC_014804	TGC	2	6	1355251	1355256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231332
27111	NC_014804	CAT	2	6	1355340	1355345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231332
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27113	NC_014804	AGA	2	6	1355428	1355433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231332
27114	NC_014804	GAA	2	6	1355438	1355443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231332
27115	NC_014804	AAC	2	6	1355500	1355505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231332
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27118	NC_014804	GAA	2	6	1355669	1355674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231333
27119	NC_014804	AG	3	6	1355714	1355719	50 %	0 %	50 %	0 %	315231333
27120	NC_014804	AAGC	2	8	1355762	1355769	50 %	0 %	25 %	25 %	315231333
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27157	NC_014804	TGAA	2	8	1357941	1357948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27158	NC_014804	TTA	2	6	1357951	1357956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27351	NC_014804	A	6	6	1368965	1368970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27472	NC_014804	ATA	2	6	1374309	1374314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231345
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