MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_014804	AGA	2	6	1299568	1299573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231269
26002	NC_014804	TGA	2	6	1299598	1299603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231269
26003	NC_014804	AAG	2	6	1299687	1299692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231269
26004	NC_014804	GTC	2	6	1299725	1299730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231269
26005	NC_014804	AAAG	2	8	1299827	1299834	75 %	0 %	25 %	0 %	315231269
26006	NC_014804	GAAG	2	8	1299842	1299849	50 %	0 %	50 %	0 %	315231269
26007	NC_014804	GAG	2	6	1299878	1299883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231269
26008	NC_014804	CCT	2	6	1299992	1299997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231269
26009	NC_014804	CAA	3	9	1300086	1300094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231269
26010	NC_014804	CTG	2	6	1300130	1300135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231269
26011	NC_014804	AAT	2	6	1300159	1300164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231269
26012	NC_014804	TGG	2	6	1300176	1300181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231269
26013	NC_014804	AAT	2	6	1300189	1300194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231269
26014	NC_014804	TGGT	2	8	1300221	1300228	0 %	50 %	50 %	0 %	315231269
26015	NC_014804	TAC	2	6	1300235	1300240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231269
26016	NC_014804	GCTCT	2	10	1300322	1300331	0 %	40 %	20 %	40 %	315231269
26017	NC_014804	AAG	2	6	1300408	1300413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231269
26018	NC_014804	CATGAT	2	12	1300432	1300443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315231269
26019	NC_014804	CCTCT	2	10	1300445	1300454	0 %	40 %	0 %	60 %	315231269
26020	NC_014804	CCA	2	6	1300496	1300501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231269
26021	NC_014804	TCA	2	6	1300614	1300619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231269
26022	NC_014804	TTC	2	6	1300649	1300654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231269
26023	NC_014804	AGCC	2	8	1300761	1300768	25 %	0 %	25 %	50 %	315231270
26024	NC_014804	TCC	2	6	1300891	1300896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231270
26025	NC_014804	T	6	6	1300980	1300985	0 %	100 %	0 %	0 %	315231270
26026	NC_014804	CTT	2	6	1301070	1301075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231270
26027	NC_014804	CTTCAA	2	12	1301111	1301122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231270
26028	NC_014804	CTT	2	6	1301123	1301128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231270
26029	NC_014804	TC	4	8	1301135	1301142	0 %	50 %	0 %	50 %	315231270
26030	NC_014804	TGC	2	6	1301148	1301153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26031	NC_014804	ATGC	2	8	1301226	1301233	25 %	25 %	25 %	25 %	315231271
26032	NC_014804	TA	3	6	1301263	1301268	50 %	50 %	0 %	0 %	315231271
26033	NC_014804	CAT	2	6	1301289	1301294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231271
26034	NC_014804	TTG	2	6	1301426	1301431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231271
26035	NC_014804	GTT	2	6	1301512	1301517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231271
26036	NC_014804	CAT	2	6	1301556	1301561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231271
26037	NC_014804	TCG	2	6	1301744	1301749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231271
26038	NC_014804	AGA	2	6	1301774	1301779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231271
26039	NC_014804	CTG	2	6	1301851	1301856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231271
26040	NC_014804	GAG	2	6	1301903	1301908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231271
26041	NC_014804	GAT	2	6	1301934	1301939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231271
26042	NC_014804	A	6	6	1301953	1301958	100 %	0 %	0 %	0 %	315231271
26043	NC_014804	CTT	3	9	1301988	1301996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231271
26044	NC_014804	T	6	6	1302047	1302052	0 %	100 %	0 %	0 %	315231272
26045	NC_014804	TTTCT	2	10	1302066	1302075	0 %	80 %	0 %	20 %	315231272
26046	NC_014804	ATC	2	6	1302079	1302084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231272
26047	NC_014804	CT	3	6	1302207	1302212	0 %	50 %	0 %	50 %	315231272
26048	NC_014804	T	6	6	1302233	1302238	0 %	100 %	0 %	0 %	315231272
26049	NC_014804	TAT	2	6	1302256	1302261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231272
26050	NC_014804	AAT	2	6	1302328	1302333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231272
26051	NC_014804	CTT	2	6	1302346	1302351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231272
26052	NC_014804	ATTC	2	8	1302433	1302440	25 %	50 %	0 %	25 %	315231272
26053	NC_014804	CT	3	6	1302462	1302467	0 %	50 %	0 %	50 %	315231272
26054	NC_014804	CA	3	6	1302571	1302576	50 %	0 %	0 %	50 %	315231272
26055	NC_014804	AGT	2	6	1302641	1302646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231273
26056	NC_014804	CTT	2	6	1302657	1302662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231273
26057	NC_014804	CAA	2	6	1302720	1302725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231273
26058	NC_014804	TC	3	6	1302756	1302761	0 %	50 %	0 %	50 %	315231273
26059	NC_014804	CTC	2	6	1302865	1302870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231273
26060	NC_014804	CCA	2	6	1302890	1302895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231273
26061	NC_014804	CTC	2	6	1302906	1302911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231273
26062	NC_014804	CCT	2	6	1302967	1302972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231273
26063	NC_014804	GA	3	6	1302999	1303004	50 %	0 %	50 %	0 %	315231273
26064	NC_014804	AAT	2	6	1303029	1303034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231273
26065	NC_014804	TCAC	2	8	1303084	1303091	25 %	25 %	0 %	50 %	315231273
26066	NC_014804	TCC	2	6	1303159	1303164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231273
26067	NC_014804	TTCC	2	8	1303230	1303237	0 %	50 %	0 %	50 %	315231273
26068	NC_014804	GGATTT	2	12	1303297	1303308	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	315231273
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26070	NC_014804	TGA	2	6	1303498	1303503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231273
26071	NC_014804	TCT	2	6	1303514	1303519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231273
26072	NC_014804	TAAT	2	8	1303565	1303572	50 %	50 %	0 %	0 %	315231273
26073	NC_014804	GCA	2	6	1303594	1303599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231273
26074	NC_014804	TTC	2	6	1303659	1303664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231273
26075	NC_014804	CAA	2	6	1303682	1303687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231273
26076	NC_014804	CTT	2	6	1303700	1303705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231273
26077	NC_014804	ATC	2	6	1303735	1303740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231273
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26080	NC_014804	TTCT	2	8	1303904	1303911	0 %	75 %	0 %	25 %	315231273
26081	NC_014804	ATG	2	6	1303929	1303934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231273
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26083	NC_014804	TTGG	2	8	1303975	1303982	0 %	50 %	50 %	0 %	315231273
26084	NC_014804	GCC	2	6	1304042	1304047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231273
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26086	NC_014804	TCT	2	6	1304088	1304093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231273
26087	NC_014804	GA	3	6	1304145	1304150	50 %	0 %	50 %	0 %	315231273
26088	NC_014804	CAGC	2	8	1304276	1304283	25 %	0 %	25 %	50 %	315231273
26089	NC_014804	ATA	2	6	1304345	1304350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231273
26090	NC_014804	AAG	2	6	1304385	1304390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231273
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26096	NC_014804	CGCT	2	8	1304684	1304691	0 %	25 %	25 %	50 %	315231273
26097	NC_014804	CTC	2	6	1304734	1304739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231273
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26099	NC_014804	ATT	2	6	1304797	1304802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231273
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26101	NC_014804	TGCAT	2	10	1304839	1304848	20 %	40 %	20 %	20 %	315231273
26102	NC_014804	AT	3	6	1304943	1304948	50 %	50 %	0 %	0 %	315231274
26103	NC_014804	AAG	2	6	1304968	1304973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231274
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26105	NC_014804	A	6	6	1305090	1305095	100 %	0 %	0 %	0 %	315231274
26106	NC_014804	TGTT	2	8	1305098	1305105	0 %	75 %	25 %	0 %	315231274
26107	NC_014804	GA	3	6	1305125	1305130	50 %	0 %	50 %	0 %	315231274
26108	NC_014804	AG	3	6	1305244	1305249	50 %	0 %	50 %	0 %	315231274
26109	NC_014804	GCTAT	2	10	1305250	1305259	20 %	40 %	20 %	20 %	315231274
26110	NC_014804	CTA	2	6	1305342	1305347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231274
26111	NC_014804	AT	3	6	1305403	1305408	50 %	50 %	0 %	0 %	315231274
26112	NC_014804	CAG	2	6	1305474	1305479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231275
26113	NC_014804	TGG	2	6	1305486	1305491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231275
26114	NC_014804	TCAACC	2	12	1305498	1305509	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	315231275
26115	NC_014804	TGG	2	6	1305512	1305517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231275
26116	NC_014804	CTT	2	6	1305520	1305525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231275
26117	NC_014804	CA	3	6	1305531	1305536	50 %	0 %	0 %	50 %	315231275
26118	NC_014804	GCTTT	2	10	1305622	1305631	0 %	60 %	20 %	20 %	315231275
26119	NC_014804	CTGGAA	2	12	1305655	1305666	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315231275
26120	NC_014804	GAG	2	6	1305674	1305679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231275
26121	NC_014804	ACCT	2	8	1305728	1305735	25 %	25 %	0 %	50 %	315231275
26122	NC_014804	GAC	2	6	1305785	1305790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231275
26123	NC_014804	TCA	2	6	1305900	1305905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231275
26124	NC_014804	TCTCTG	2	12	1305953	1305964	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	315231275
26125	NC_014804	ACC	2	6	1305965	1305970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231275
26126	NC_014804	AGG	2	6	1306026	1306031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231275
26127	NC_014804	ATC	2	6	1306052	1306057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231275
26128	NC_014804	ATT	2	6	1306092	1306097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231275
26129	NC_014804	TCC	2	6	1306159	1306164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231275
26130	NC_014804	TCA	2	6	1306179	1306184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231275
26131	NC_014804	CAG	2	6	1306228	1306233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231275
26132	NC_014804	TTC	2	6	1306258	1306263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231275
26133	NC_014804	CTA	2	6	1306294	1306299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231275
26134	NC_014804	TCA	2	6	1306338	1306343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231275
26135	NC_014804	TTTC	2	8	1306477	1306484	0 %	75 %	0 %	25 %	315231276
26136	NC_014804	CAA	2	6	1306744	1306749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231276
26137	NC_014804	TCAAG	2	10	1306810	1306819	40 %	20 %	20 %	20 %	315231276
26138	NC_014804	ATTCCA	2	12	1306893	1306904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231276
26139	NC_014804	CT	3	6	1306912	1306917	0 %	50 %	0 %	50 %	315231276
26140	NC_014804	GCTCA	2	10	1306931	1306940	20 %	20 %	20 %	40 %	315231276
26141	NC_014804	T	6	6	1307006	1307011	0 %	100 %	0 %	0 %	315231276
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26145	NC_014804	CCAA	2	8	1307295	1307302	50 %	0 %	0 %	50 %	315231276
26146	NC_014804	CTT	2	6	1307433	1307438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231277
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26148	NC_014804	CTT	2	6	1307467	1307472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231277
26149	NC_014804	CAG	2	6	1307508	1307513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231277
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26154	NC_014804	CCA	2	6	1307847	1307852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231277
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26163	NC_014804	TAT	2	6	1308236	1308241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231277
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26166	NC_014804	GAA	2	6	1308318	1308323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231277
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26168	NC_014804	TTCTT	2	10	1308463	1308472	0 %	80 %	0 %	20 %	315231277
26169	NC_014804	ACC	2	6	1308574	1308579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26170	NC_014804	ACC	2	6	1308623	1308628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231278
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26174	NC_014804	TGC	2	6	1308989	1308994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231278
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26179	NC_014804	ATCA	2	8	1309333	1309340	50 %	25 %	0 %	25 %	315231278
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26185	NC_014804	AAAGA	2	10	1309639	1309648	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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26218	NC_014804	GTT	2	6	1311743	1311748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231279
26219	NC_014804	TC	3	6	1311750	1311755	0 %	50 %	0 %	50 %	315231279
26220	NC_014804	ACT	2	6	1311776	1311781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231279
26221	NC_014804	CTT	2	6	1311823	1311828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231279
26222	NC_014804	C	6	6	1311838	1311843	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26223	NC_014804	AAT	2	6	1311853	1311858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26224	NC_014804	TAA	2	6	1311877	1311882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26225	NC_014804	AAT	2	6	1311915	1311920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26226	NC_014804	TA	3	6	1311952	1311957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26227	NC_014804	A	7	7	1311992	1311998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26228	NC_014804	ATC	2	6	1312139	1312144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26229	NC_014804	A	6	6	1312148	1312153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26230	NC_014804	TGG	2	6	1312160	1312165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26231	NC_014804	AGA	2	6	1312227	1312232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231280
26232	NC_014804	ATG	2	6	1312283	1312288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231280
26233	NC_014804	AAT	2	6	1312290	1312295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231280
26234	NC_014804	AGC	2	6	1312305	1312310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231280
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26236	NC_014804	GTT	2	6	1312390	1312395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231280
26237	NC_014804	ACT	2	6	1312413	1312418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231280
26238	NC_014804	TCC	2	6	1312422	1312427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231281
26239	NC_014804	GCT	2	6	1312604	1312609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231281
26240	NC_014804	AAT	2	6	1312612	1312617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231281
26241	NC_014804	TCA	2	6	1312619	1312624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231281
26242	NC_014804	TAC	2	6	1312708	1312713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231281
26243	NC_014804	AGATA	2	10	1312749	1312758	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26244	NC_014804	TGG	2	6	1312771	1312776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26245	NC_014804	GAG	2	6	1312825	1312830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231282
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26247	NC_014804	GA	3	6	1312888	1312893	50 %	0 %	50 %	0 %	315231282
26248	NC_014804	GTT	2	6	1312926	1312931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231282
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26252	NC_014804	TGA	2	6	1313078	1313083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231282
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26255	NC_014804	ATTT	2	8	1313280	1313287	25 %	75 %	0 %	0 %	315231282
26256	NC_014804	TGG	2	6	1313302	1313307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231282
26257	NC_014804	AGA	2	6	1313330	1313335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231282
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26263	NC_014804	ATC	2	6	1313552	1313557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231283
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26278	NC_014804	TCA	2	6	1314193	1314198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26349	NC_014804	TTCC	2	8	1317817	1317824	0 %	50 %	0 %	50 %	315231288
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26424	NC_014804	TCCT	2	8	1320977	1320984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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26474	NC_014804	A	6	6	1322870	1322875	100 %	0 %	0 %	0 %	315231295
26475	NC_014804	AAG	2	6	1322998	1323003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231295
26476	NC_014804	AAATTG	2	12	1323063	1323074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	315231295
26477	NC_014804	CTT	2	6	1323087	1323092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231296
26478	NC_014804	T	6	6	1323091	1323096	0 %	100 %	0 %	0 %	315231296
26479	NC_014804	TGA	2	6	1323114	1323119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231296
26480	NC_014804	CTGTT	2	10	1323129	1323138	0 %	60 %	20 %	20 %	315231296
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26482	NC_014804	CTTG	2	8	1323238	1323245	0 %	50 %	25 %	25 %	315231296
26483	NC_014804	AACG	2	8	1323273	1323280	50 %	0 %	25 %	25 %	315231296
26484	NC_014804	CTT	2	6	1323294	1323299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231296
26485	NC_014804	TCC	2	6	1323341	1323346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231296
26486	NC_014804	GAT	2	6	1323376	1323381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231296
26487	NC_014804	GTT	2	6	1323395	1323400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231296
26488	NC_014804	T	7	7	1323433	1323439	0 %	100 %	0 %	0 %	315231296
26489	NC_014804	TTC	2	6	1323477	1323482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231296
26490	NC_014804	TCCC	2	8	1323529	1323536	0 %	25 %	0 %	75 %	315231296
26491	NC_014804	T	6	6	1323570	1323575	0 %	100 %	0 %	0 %	315231296
26492	NC_014804	TGG	2	6	1323625	1323630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26493	NC_014804	TCCT	2	8	1323671	1323678	0 %	50 %	0 %	50 %	315231297
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26497	NC_014804	GGGA	2	8	1323902	1323909	25 %	0 %	75 %	0 %	315231297
26498	NC_014804	CCA	2	6	1323981	1323986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231297
26499	NC_014804	AACA	2	8	1323995	1324002	75 %	0 %	0 %	25 %	315231297
26500	NC_014804	CTC	3	9	1324140	1324148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231297

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