MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_014804	CGC	2	6	1246865	1246870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231199
25003	NC_014804	AGA	2	6	1247043	1247048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231199
25004	NC_014804	GAA	2	6	1247094	1247099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231199
25005	NC_014804	ACT	2	6	1247132	1247137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231199
25006	NC_014804	ACA	2	6	1247216	1247221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231199
25007	NC_014804	A	6	6	1247226	1247231	100 %	0 %	0 %	0 %	315231199
25008	NC_014804	AGG	2	6	1247292	1247297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231199
25009	NC_014804	ATA	2	6	1247377	1247382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231199
25010	NC_014804	TAC	2	6	1247398	1247403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231199
25011	NC_014804	TGA	2	6	1247445	1247450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231199
25012	NC_014804	TGA	2	6	1247487	1247492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231199
25013	NC_014804	A	6	6	1247582	1247587	100 %	0 %	0 %	0 %	315231199
25014	NC_014804	TTA	2	6	1247673	1247678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231200
25015	NC_014804	TCC	2	6	1247683	1247688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231200
25016	NC_014804	ATA	2	6	1247815	1247820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231200
25017	NC_014804	GCT	2	6	1247895	1247900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231200
25018	NC_014804	T	6	6	1247935	1247940	0 %	100 %	0 %	0 %	315231200
25019	NC_014804	ATG	2	6	1248003	1248008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231200
25020	NC_014804	ACA	2	6	1248086	1248091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231200
25021	NC_014804	ATT	2	6	1248182	1248187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231200
25022	NC_014804	CAC	2	6	1248220	1248225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25023	NC_014804	GGT	2	6	1248337	1248342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25024	NC_014804	AGA	2	6	1248359	1248364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231201
25025	NC_014804	TA	3	6	1248398	1248403	50 %	50 %	0 %	0 %	315231201
25026	NC_014804	TGT	2	6	1248440	1248445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231201
25027	NC_014804	TAC	2	6	1248462	1248467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231201
25028	NC_014804	A	6	6	1248596	1248601	100 %	0 %	0 %	0 %	315231201
25029	NC_014804	TGGAA	2	10	1248637	1248646	40 %	20 %	40 %	0 %	315231201
25030	NC_014804	ACA	2	6	1248666	1248671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231201
25031	NC_014804	CAC	2	6	1248681	1248686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231201
25032	NC_014804	ATT	2	6	1248741	1248746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231201
25033	NC_014804	GAT	2	6	1248753	1248758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231201
25034	NC_014804	A	7	7	1248787	1248793	100 %	0 %	0 %	0 %	315231201
25035	NC_014804	AGA	2	6	1248884	1248889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231201
25036	NC_014804	TGT	2	6	1248902	1248907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231201
25037	NC_014804	GAG	2	6	1249032	1249037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231201
25038	NC_014804	CCA	2	6	1249056	1249061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231201
25039	NC_014804	AGG	2	6	1249067	1249072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231201
25040	NC_014804	CTG	2	6	1249097	1249102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231201
25041	NC_014804	AG	3	6	1249124	1249129	50 %	0 %	50 %	0 %	315231201
25042	NC_014804	CGG	2	6	1249154	1249159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231201
25043	NC_014804	ACT	2	6	1249248	1249253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231201
25044	NC_014804	A	6	6	1249302	1249307	100 %	0 %	0 %	0 %	315231201
25045	NC_014804	GTT	2	6	1249317	1249322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231201
25046	NC_014804	ATG	2	6	1249351	1249356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231201
25047	NC_014804	TGA	2	6	1249420	1249425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231201
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25049	NC_014804	TC	3	6	1249541	1249546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25050	NC_014804	T	6	6	1249572	1249577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25051	NC_014804	GAA	2	6	1249686	1249691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231202
25052	NC_014804	GAA	2	6	1249824	1249829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231202
25053	NC_014804	T	6	6	1249958	1249963	0 %	100 %	0 %	0 %	315231203
25054	NC_014804	TGA	2	6	1249966	1249971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231203
25055	NC_014804	CTG	2	6	1250120	1250125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231203
25056	NC_014804	A	7	7	1250134	1250140	100 %	0 %	0 %	0 %	315231203
25057	NC_014804	CA	3	6	1250170	1250175	50 %	0 %	0 %	50 %	315231203
25058	NC_014804	AACTT	2	10	1250208	1250217	40 %	40 %	0 %	20 %	315231203
25059	NC_014804	AAT	2	6	1250246	1250251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231203
25060	NC_014804	A	6	6	1250306	1250311	100 %	0 %	0 %	0 %	315231203
25061	NC_014804	GA	3	6	1250389	1250394	50 %	0 %	50 %	0 %	315231203
25062	NC_014804	GA	3	6	1250438	1250443	50 %	0 %	50 %	0 %	315231203
25063	NC_014804	TTTGA	2	10	1250474	1250483	20 %	60 %	20 %	0 %	315231203
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25072	NC_014804	ATT	2	6	1251037	1251042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231204
25073	NC_014804	TGA	2	6	1251123	1251128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231204
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25075	NC_014804	AGAGG	2	10	1251150	1251159	40 %	0 %	60 %	0 %	315231204
25076	NC_014804	AAGAA	2	10	1251231	1251240	80 %	0 %	20 %	0 %	315231204
25077	NC_014804	AC	3	6	1251266	1251271	50 %	0 %	0 %	50 %	315231204
25078	NC_014804	CTGC	2	8	1251288	1251295	0 %	25 %	25 %	50 %	315231204
25079	NC_014804	AAAAG	2	10	1251324	1251333	80 %	0 %	20 %	0 %	315231204
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25084	NC_014804	GA	3	6	1251477	1251482	50 %	0 %	50 %	0 %	315231204
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25087	NC_014804	AAGA	2	8	1251655	1251662	75 %	0 %	25 %	0 %	315231204
25088	NC_014804	AGC	2	6	1251675	1251680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231204
25089	NC_014804	GGGA	2	8	1251713	1251720	25 %	0 %	75 %	0 %	315231204
25090	NC_014804	GAG	2	6	1251798	1251803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231204
25091	NC_014804	TCA	2	6	1251860	1251865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231205
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25100	NC_014804	GGCT	2	8	1252185	1252192	0 %	25 %	50 %	25 %	315231205
25101	NC_014804	AG	4	8	1252241	1252248	50 %	0 %	50 %	0 %	315231205
25102	NC_014804	GAAT	2	8	1252277	1252284	50 %	25 %	25 %	0 %	315231205
25103	NC_014804	ATT	2	6	1252314	1252319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25104	NC_014804	CA	4	8	1252341	1252348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25105	NC_014804	TTA	2	6	1252350	1252355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25106	NC_014804	AGT	2	6	1252410	1252415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25107	NC_014804	TCA	2	6	1252418	1252423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25108	NC_014804	T	6	6	1252460	1252465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25110	NC_014804	CTG	2	6	1252606	1252611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25111	NC_014804	CAA	2	6	1252647	1252652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231206
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25113	NC_014804	ATAAA	2	10	1252784	1252793	80 %	20 %	0 %	0 %	315231206
25114	NC_014804	A	6	6	1252791	1252796	100 %	0 %	0 %	0 %	315231206
25115	NC_014804	CAG	2	6	1252894	1252899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231206
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25117	NC_014804	CCA	2	6	1252980	1252985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231206
25118	NC_014804	A	6	6	1253016	1253021	100 %	0 %	0 %	0 %	315231206
25119	NC_014804	GTAG	2	8	1253023	1253030	25 %	25 %	50 %	0 %	315231206
25120	NC_014804	CT	3	6	1253053	1253058	0 %	50 %	0 %	50 %	315231207
25121	NC_014804	ACT	2	6	1253061	1253066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231207
25122	NC_014804	TCA	2	6	1253080	1253085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231207
25123	NC_014804	CTC	2	6	1253087	1253092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231207
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25142	NC_014804	A	6	6	1254409	1254414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25143	NC_014804	AGG	2	6	1254423	1254428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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25201	NC_014804	TAA	2	6	1257977	1257982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25203	NC_014804	T	7	7	1258104	1258110	0 %	100 %	0 %	0 %	315231212
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25217	NC_014804	AG	3	6	1258858	1258863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25218	NC_014804	TTC	2	6	1258903	1258908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25219	NC_014804	ATT	2	6	1258942	1258947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25220	NC_014804	CAA	3	9	1259011	1259019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25221	NC_014804	ATT	2	6	1259189	1259194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231213
25222	NC_014804	TAT	2	6	1259201	1259206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231213
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25225	NC_014804	TATG	2	8	1259309	1259316	25 %	50 %	25 %	0 %	315231213
25226	NC_014804	TCAT	2	8	1259416	1259423	25 %	50 %	0 %	25 %	315231213
25227	NC_014804	GAAA	2	8	1259479	1259486	75 %	0 %	25 %	0 %	315231213
25228	NC_014804	CAA	2	6	1259531	1259536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231213
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25230	NC_014804	ATA	2	6	1259718	1259723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231213
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25232	NC_014804	GAT	2	6	1259766	1259771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231213
25233	NC_014804	GTA	2	6	1259841	1259846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231213
25234	NC_014804	TGT	2	6	1259990	1259995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231213
25235	NC_014804	TGA	2	6	1259996	1260001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231213
25236	NC_014804	TCA	2	6	1260081	1260086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231213
25237	NC_014804	AACA	2	8	1260176	1260183	75 %	0 %	0 %	25 %	315231213
25238	NC_014804	GA	3	6	1260361	1260366	50 %	0 %	50 %	0 %	315231213
25239	NC_014804	GCA	2	6	1260392	1260397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231213
25240	NC_014804	CAG	2	6	1260454	1260459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231213
25241	NC_014804	AAT	2	6	1260515	1260520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231213
25242	NC_014804	AGC	2	6	1260553	1260558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231213
25243	NC_014804	TA	3	6	1260561	1260566	50 %	50 %	0 %	0 %	315231213
25244	NC_014804	AAC	2	6	1260644	1260649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231213
25245	NC_014804	AGA	2	6	1260665	1260670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231213
25246	NC_014804	AAGT	2	8	1260685	1260692	50 %	25 %	25 %	0 %	315231213
25247	NC_014804	GGA	2	6	1260741	1260746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231213
25248	NC_014804	GAAA	2	8	1260770	1260777	75 %	0 %	25 %	0 %	315231213
25249	NC_014804	A	6	6	1260779	1260784	100 %	0 %	0 %	0 %	315231213
25250	NC_014804	ACC	2	6	1260891	1260896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231213
25251	NC_014804	CTTA	2	8	1260991	1260998	25 %	50 %	0 %	25 %	315231213
25252	NC_014804	AAG	2	6	1261064	1261069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231213
25253	NC_014804	ACC	2	6	1261142	1261147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231213
25254	NC_014804	AGAT	2	8	1261180	1261187	50 %	25 %	25 %	0 %	315231213
25255	NC_014804	AGG	2	6	1261244	1261249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231213
25256	NC_014804	GAG	2	6	1261252	1261257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231213
25257	NC_014804	GTA	2	6	1261405	1261410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231213
25258	NC_014804	TTC	2	6	1261423	1261428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231213
25259	NC_014804	GAAGAT	2	12	1261512	1261523	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	315231213
25260	NC_014804	TGGAAC	2	12	1261539	1261550	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315231213
25261	NC_014804	AAC	2	6	1261562	1261567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231213
25262	NC_014804	AG	3	6	1261574	1261579	50 %	0 %	50 %	0 %	315231213
25263	NC_014804	ATTCAT	2	12	1261591	1261602	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	315231213
25264	NC_014804	AAGC	2	8	1261654	1261661	50 %	0 %	25 %	25 %	315231213
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25266	NC_014804	TTG	2	6	1261759	1261764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231213
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25268	NC_014804	CAA	2	6	1261831	1261836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231213
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25271	NC_014804	GTA	2	6	1261938	1261943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231213
25272	NC_014804	ACCGAA	2	12	1261962	1261973	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	315231213
25273	NC_014804	AG	3	6	1262003	1262008	50 %	0 %	50 %	0 %	315231213
25274	NC_014804	TGG	2	6	1262116	1262121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231213
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25277	NC_014804	CTT	2	6	1262195	1262200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25278	NC_014804	A	6	6	1262277	1262282	100 %	0 %	0 %	0 %	315231214
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25284	NC_014804	GAAA	2	8	1262566	1262573	75 %	0 %	25 %	0 %	315231214
25285	NC_014804	TGAG	2	8	1262585	1262592	25 %	25 %	50 %	0 %	315231214
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25288	NC_014804	AAG	2	6	1262695	1262700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231214
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25291	NC_014804	A	6	6	1262750	1262755	100 %	0 %	0 %	0 %	315231214
25292	NC_014804	CTTTT	2	10	1262783	1262792	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25293	NC_014804	ATT	2	6	1262837	1262842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231215
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25300	NC_014804	CTT	2	6	1263312	1263317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231215
25301	NC_014804	CAAC	2	8	1263398	1263405	50 %	0 %	0 %	50 %	315231215
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25304	NC_014804	AGT	2	6	1263495	1263500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231215
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25307	NC_014804	T	6	6	1263538	1263543	0 %	100 %	0 %	0 %	315231215
25308	NC_014804	T	6	6	1263569	1263574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25309	NC_014804	CAAAG	2	10	1263636	1263645	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25310	NC_014804	ATT	2	6	1263669	1263674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25311	NC_014804	TGT	2	6	1263685	1263690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25312	NC_014804	TCA	3	9	1263691	1263699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25321	NC_014804	TATCA	2	10	1264317	1264326	40 %	40 %	0 %	20 %	315231217
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25335	NC_014804	TAG	2	6	1265464	1265469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231217
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25339	NC_014804	GAT	2	6	1265825	1265830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231217
25340	NC_014804	CCA	2	6	1265861	1265866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231217
25341	NC_014804	T	6	6	1265885	1265890	0 %	100 %	0 %	0 %	315231217
25342	NC_014804	A	6	6	1265993	1265998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25343	NC_014804	T	6	6	1266058	1266063	0 %	100 %	0 %	0 %	315231218
25344	NC_014804	GTC	2	6	1266071	1266076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231218
25345	NC_014804	TGA	2	6	1266088	1266093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231218
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25347	NC_014804	CAAA	2	8	1266154	1266161	75 %	0 %	0 %	25 %	315231218
25348	NC_014804	TTG	2	6	1266198	1266203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231218
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25350	NC_014804	GTA	2	6	1266374	1266379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231218
25351	NC_014804	AG	3	6	1266390	1266395	50 %	0 %	50 %	0 %	315231218
25352	NC_014804	TTC	2	6	1266412	1266417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231218
25353	NC_014804	AAGC	2	8	1266485	1266492	50 %	0 %	25 %	25 %	315231218
25354	NC_014804	TCA	2	6	1266540	1266545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231218
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25475	NC_014804	CCA	2	6	1272372	1272377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231225
25476	NC_014804	AAC	2	6	1272512	1272517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231225
25477	NC_014804	AAC	2	6	1272522	1272527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231225
25478	NC_014804	AAT	2	6	1272617	1272622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231225
25479	NC_014804	CAT	2	6	1272623	1272628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231225
25480	NC_014804	AGAAC	2	10	1272697	1272706	60 %	0 %	20 %	20 %	315231225
25481	NC_014804	ACTA	2	8	1272752	1272759	50 %	25 %	0 %	25 %	315231225
25482	NC_014804	TAAG	2	8	1272768	1272775	50 %	25 %	25 %	0 %	315231225
25483	NC_014804	T	6	6	1273031	1273036	0 %	100 %	0 %	0 %	315231226
25484	NC_014804	CAT	2	6	1273052	1273057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231226
25485	NC_014804	CTC	2	6	1273077	1273082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231226
25486	NC_014804	CAT	2	6	1273160	1273165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231226
25487	NC_014804	CTT	2	6	1273312	1273317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231226
25488	NC_014804	AAC	2	6	1273357	1273362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231226
25489	NC_014804	CCAT	2	8	1273364	1273371	25 %	25 %	0 %	50 %	315231226
25490	NC_014804	TTA	2	6	1273386	1273391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25491	NC_014804	ATTT	2	8	1273412	1273419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25492	NC_014804	ATTAA	2	10	1273461	1273470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25493	NC_014804	AAT	2	6	1273495	1273500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231227
25494	NC_014804	CGC	2	6	1273542	1273547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231227
25495	NC_014804	AGT	2	6	1273582	1273587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231227
25496	NC_014804	CAG	2	6	1273599	1273604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231227
25497	NC_014804	GCT	2	6	1273739	1273744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231227
25498	NC_014804	ATG	2	6	1273785	1273790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231227
25499	NC_014804	GGA	2	6	1273826	1273831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231227
25500	NC_014804	CTG	2	6	1273836	1273841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231227

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