MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_014804	TC	4	8	1221297	1221304	0 %	50 %	0 %	50 %	315231170
24502	NC_014804	CTT	2	6	1221323	1221328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231170
24503	NC_014804	TCT	2	6	1221378	1221383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231170
24504	NC_014804	GTA	2	6	1221387	1221392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231170
24505	NC_014804	CCA	2	6	1221419	1221424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231171
24506	NC_014804	TTC	2	6	1221480	1221485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231171
24507	NC_014804	CTGG	2	8	1221497	1221504	0 %	25 %	50 %	25 %	315231171
24508	NC_014804	CT	3	6	1221536	1221541	0 %	50 %	0 %	50 %	315231171
24509	NC_014804	GGA	2	6	1221565	1221570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231171
24510	NC_014804	CTC	2	6	1221606	1221611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231171
24511	NC_014804	GCA	2	6	1221665	1221670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231171
24512	NC_014804	CTTT	2	8	1221680	1221687	0 %	75 %	0 %	25 %	315231171
24513	NC_014804	TAT	2	6	1221702	1221707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231171
24514	NC_014804	T	6	6	1221727	1221732	0 %	100 %	0 %	0 %	315231171
24515	NC_014804	CCAA	2	8	1221739	1221746	50 %	0 %	0 %	50 %	315231171
24516	NC_014804	TCT	2	6	1221752	1221757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231171
24517	NC_014804	ATAA	2	8	1221838	1221845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24518	NC_014804	ATTTA	2	10	1221886	1221895	40 %	60 %	0 %	0 %	315231172
24519	NC_014804	CCATT	2	10	1221970	1221979	20 %	40 %	0 %	40 %	315231172
24520	NC_014804	TCCT	2	8	1222099	1222106	0 %	50 %	0 %	50 %	315231172
24521	NC_014804	GCT	2	6	1222154	1222159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231172
24522	NC_014804	CAA	2	6	1222168	1222173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231172
24523	NC_014804	GTA	2	6	1222183	1222188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231172
24524	NC_014804	AT	3	6	1222225	1222230	50 %	50 %	0 %	0 %	315231172
24525	NC_014804	AAC	2	6	1222319	1222324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231172
24526	NC_014804	TTAC	2	8	1222394	1222401	25 %	50 %	0 %	25 %	315231172
24527	NC_014804	ACC	3	9	1222469	1222477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231172
24528	NC_014804	TA	3	6	1222480	1222485	50 %	50 %	0 %	0 %	315231172
24529	NC_014804	ATT	2	6	1222541	1222546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231172
24530	NC_014804	TTTGA	2	10	1222600	1222609	20 %	60 %	20 %	0 %	315231172
24531	NC_014804	TAT	2	6	1222654	1222659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231172
24532	NC_014804	CT	3	6	1222675	1222680	0 %	50 %	0 %	50 %	315231172
24533	NC_014804	ATC	2	6	1222703	1222708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231172
24534	NC_014804	CTAAT	2	10	1222739	1222748	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24535	NC_014804	TTTACC	2	12	1222766	1222777	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24536	NC_014804	GTTA	2	8	1222796	1222803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24537	NC_014804	TAT	2	6	1222868	1222873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24538	NC_014804	TTAC	2	8	1222922	1222929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24539	NC_014804	CCA	2	6	1222992	1222997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231173
24540	NC_014804	CCT	2	6	1223092	1223097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231173
24541	NC_014804	CTC	2	6	1223114	1223119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231173
24542	NC_014804	GAC	2	6	1223149	1223154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231173
24543	NC_014804	TAT	2	6	1223170	1223175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231173
24544	NC_014804	CAG	2	6	1223241	1223246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231173
24545	NC_014804	TATCT	2	10	1223264	1223273	20 %	60 %	0 %	20 %	315231173
24546	NC_014804	CCTT	2	8	1223351	1223358	0 %	50 %	0 %	50 %	315231173
24547	NC_014804	CTC	2	6	1223365	1223370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231173
24548	NC_014804	GTA	2	6	1223371	1223376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231173
24549	NC_014804	CTC	2	6	1223386	1223391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231173
24550	NC_014804	GTC	2	6	1223485	1223490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231173
24551	NC_014804	TA	3	6	1223587	1223592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24552	NC_014804	AACAA	2	10	1223715	1223724	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24553	NC_014804	GAA	2	6	1223727	1223732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24554	NC_014804	AAAG	2	8	1223733	1223740	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24555	NC_014804	TCG	2	6	1223866	1223871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231174
24556	NC_014804	CGA	2	6	1224043	1224048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231174
24557	NC_014804	CAC	2	6	1224122	1224127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231174
24558	NC_014804	CAG	2	6	1224158	1224163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231174
24559	NC_014804	C	6	6	1224181	1224186	0 %	0 %	0 %	100 %	315231174
24560	NC_014804	TTC	2	6	1224273	1224278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231174
24561	NC_014804	CAG	2	6	1224281	1224286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231174
24562	NC_014804	CAG	2	6	1224296	1224301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231174
24563	NC_014804	ACC	2	6	1224320	1224325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24564	NC_014804	AAAT	2	8	1224361	1224368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24565	NC_014804	GGGC	2	8	1224479	1224486	0 %	0 %	75 %	25 %	315231175
24566	NC_014804	TAG	2	6	1224662	1224667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231176
24567	NC_014804	CGT	2	6	1224770	1224775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231176
24568	NC_014804	GCG	2	6	1224808	1224813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231176
24569	NC_014804	CCT	2	6	1224816	1224821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231176
24570	NC_014804	TCG	2	6	1224875	1224880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231176
24571	NC_014804	CTC	2	6	1224904	1224909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231176
24572	NC_014804	GTG	2	6	1224910	1224915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231176
24573	NC_014804	CAG	2	6	1224971	1224976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231176
24574	NC_014804	CTG	2	6	1225020	1225025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231176
24575	NC_014804	ACGTC	2	10	1225052	1225061	20 %	20 %	20 %	40 %	315231176
24576	NC_014804	ACCC	2	8	1225072	1225079	25 %	0 %	0 %	75 %	315231176
24577	NC_014804	CGG	2	6	1225080	1225085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231176
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24579	NC_014804	A	6	6	1225229	1225234	100 %	0 %	0 %	0 %	315231176
24580	NC_014804	GCT	2	6	1225277	1225282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231177
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24584	NC_014804	GGC	2	6	1225464	1225469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231177
24585	NC_014804	GCCGG	2	10	1225485	1225494	0 %	0 %	60 %	40 %	315231177
24586	NC_014804	CGGG	2	8	1225543	1225550	0 %	0 %	75 %	25 %	315231177
24587	NC_014804	GCG	2	6	1225603	1225608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231177
24588	NC_014804	GCT	2	6	1225825	1225830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231177
24589	NC_014804	GTTG	2	8	1225883	1225890	0 %	50 %	50 %	0 %	315231177
24590	NC_014804	GAT	2	6	1225901	1225906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231177
24591	NC_014804	CAT	2	6	1225910	1225915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231177
24592	NC_014804	GTGTT	2	10	1225951	1225960	0 %	60 %	40 %	0 %	315231177
24593	NC_014804	CTT	2	6	1226066	1226071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231177
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24599	NC_014804	TCG	2	6	1226442	1226447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231177
24600	NC_014804	CAA	2	6	1226458	1226463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231177
24601	NC_014804	GTG	2	6	1226466	1226471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231177
24602	NC_014804	CGG	2	6	1226477	1226482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231177
24603	NC_014804	CTT	2	6	1226597	1226602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231177
24604	NC_014804	CCTC	2	8	1226652	1226659	0 %	25 %	0 %	75 %	315231177
24605	NC_014804	AT	3	6	1226693	1226698	50 %	50 %	0 %	0 %	315231177
24606	NC_014804	CAT	2	6	1226735	1226740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231177
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24608	NC_014804	TCT	2	6	1226808	1226813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231177
24609	NC_014804	GTG	3	9	1226841	1226849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231177
24610	NC_014804	GA	3	6	1226912	1226917	50 %	0 %	50 %	0 %	315231177
24611	NC_014804	GTT	2	6	1227089	1227094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231177
24612	NC_014804	TCC	2	6	1227108	1227113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231177
24613	NC_014804	TGG	2	6	1227133	1227138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231177
24614	NC_014804	C	6	6	1227152	1227157	0 %	0 %	0 %	100 %	315231177
24615	NC_014804	T	7	7	1227262	1227268	0 %	100 %	0 %	0 %	315231177
24616	NC_014804	TA	3	6	1227358	1227363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24617	NC_014804	CAG	2	6	1227504	1227509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231178
24618	NC_014804	TTC	2	6	1227553	1227558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231178
24619	NC_014804	GAA	2	6	1227588	1227593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231178
24620	NC_014804	GAA	2	6	1227600	1227605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231178
24621	NC_014804	CTC	2	6	1227692	1227697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231178
24622	NC_014804	TA	3	6	1227787	1227792	50 %	50 %	0 %	0 %	315231178
24623	NC_014804	TAC	2	6	1227897	1227902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231178
24624	NC_014804	TCA	2	6	1227935	1227940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231178
24625	NC_014804	ATA	2	6	1227990	1227995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24626	NC_014804	CTT	2	6	1228049	1228054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231179
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24656	NC_014804	TAT	2	6	1229685	1229690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231180
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24688	NC_014804	TTC	2	6	1231322	1231327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24689	NC_014804	CTC	2	6	1231424	1231429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231182
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24691	NC_014804	TCC	2	6	1231536	1231541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231182
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24694	NC_014804	CA	3	6	1231713	1231718	50 %	0 %	0 %	50 %	315231182
24695	NC_014804	TC	3	6	1231731	1231736	0 %	50 %	0 %	50 %	315231182
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24702	NC_014804	AATG	2	8	1232108	1232115	50 %	25 %	25 %	0 %	315231182
24703	NC_014804	TC	4	8	1232251	1232258	0 %	50 %	0 %	50 %	315231182
24704	NC_014804	GAAACA	2	12	1232265	1232276	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	315231182
24705	NC_014804	GCA	2	6	1232304	1232309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231182
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24708	NC_014804	ACC	2	6	1232476	1232481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231183
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24717	NC_014804	ATT	2	6	1232996	1233001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231183
24718	NC_014804	TGT	2	6	1233096	1233101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231183
24719	NC_014804	TCT	2	6	1233224	1233229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231183
24720	NC_014804	ATAG	2	8	1233235	1233242	50 %	25 %	25 %	0 %	315231183
24721	NC_014804	CAA	2	6	1233279	1233284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231183
24722	NC_014804	T	7	7	1233307	1233313	0 %	100 %	0 %	0 %	315231183
24723	NC_014804	ACT	2	6	1233353	1233358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231183
24724	NC_014804	GAT	2	6	1233400	1233405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231183
24725	NC_014804	CAA	2	6	1233481	1233486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24726	NC_014804	GAA	2	6	1233539	1233544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231184
24727	NC_014804	TCT	2	6	1233638	1233643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231184
24728	NC_014804	CCT	3	9	1233653	1233661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231184
24729	NC_014804	TGA	2	6	1233674	1233679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231184
24730	NC_014804	TCG	2	6	1233698	1233703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231184
24731	NC_014804	AGT	2	6	1233704	1233709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231184
24732	NC_014804	TCC	2	6	1233715	1233720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231184
24733	NC_014804	TGCTCG	2	12	1233763	1233774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231184
24734	NC_014804	GGC	2	6	1233777	1233782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231184
24735	NC_014804	GCT	2	6	1233821	1233826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231184
24736	NC_014804	TTC	3	9	1233897	1233905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231184
24737	NC_014804	CT	3	6	1233996	1234001	0 %	50 %	0 %	50 %	315231184
24738	NC_014804	GTT	2	6	1234007	1234012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231184
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24907	NC_014804	T	6	6	1241713	1241718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24908	NC_014804	ATA	2	6	1241752	1241757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24969	NC_014804	TTG	2	6	1245213	1245218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231198
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24971	NC_014804	CAA	2	6	1245336	1245341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231198
24972	NC_014804	ATG	2	6	1245345	1245350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231198
24973	NC_014804	TGA	2	6	1245406	1245411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231198
24974	NC_014804	GAA	2	6	1245412	1245417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231198
24975	NC_014804	AGA	2	6	1245445	1245450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231198
24976	NC_014804	AG	3	6	1245483	1245488	50 %	0 %	50 %	0 %	315231198
24977	NC_014804	AGA	2	6	1245520	1245525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231198
24978	NC_014804	CTG	2	6	1245557	1245562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231198
24979	NC_014804	GGA	2	6	1245654	1245659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231198
24980	NC_014804	TGAG	2	8	1245663	1245670	25 %	25 %	50 %	0 %	315231198
24981	NC_014804	CTA	2	6	1245715	1245720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231198
24982	NC_014804	CAA	2	6	1245738	1245743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231198
24983	NC_014804	GAT	2	6	1245770	1245775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231198
24984	NC_014804	ATT	2	6	1245783	1245788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231198
24985	NC_014804	TTC	2	6	1245817	1245822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231198
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24987	NC_014804	AG	3	6	1245903	1245908	50 %	0 %	50 %	0 %	315231198
24988	NC_014804	ATT	2	6	1246002	1246007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231198
24989	NC_014804	CTC	2	6	1246021	1246026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231198
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24991	NC_014804	CAT	2	6	1246246	1246251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231198
24992	NC_014804	GCT	2	6	1246306	1246311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231198
24993	NC_014804	ATG	2	6	1246449	1246454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231198
24994	NC_014804	TGC	2	6	1246580	1246585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231199
24995	NC_014804	TCT	2	6	1246591	1246596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231199
24996	NC_014804	CT	3	6	1246595	1246600	0 %	50 %	0 %	50 %	315231199
24997	NC_014804	TA	3	6	1246605	1246610	50 %	50 %	0 %	0 %	315231199
24998	NC_014804	TGT	2	6	1246686	1246691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231199
24999	NC_014804	TTCAT	2	10	1246702	1246711	20 %	60 %	0 %	20 %	315231199
25000	NC_014804	AG	3	6	1246800	1246805	50 %	0 %	50 %	0 %	315231199

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