MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_014804	TCA	2	6	1171827	1171832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231111
23503	NC_014804	TAT	2	6	1171970	1171975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231112
23504	NC_014804	GCC	2	6	1171976	1171981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231112
23505	NC_014804	TCA	2	6	1171984	1171989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231112
23506	NC_014804	TTAA	2	8	1172007	1172014	50 %	50 %	0 %	0 %	315231112
23507	NC_014804	CTG	2	6	1172074	1172079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231112
23508	NC_014804	CTT	2	6	1172101	1172106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231112
23509	NC_014804	T	6	6	1172129	1172134	0 %	100 %	0 %	0 %	315231112
23510	NC_014804	ACT	2	6	1172178	1172183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231112
23511	NC_014804	TCC	2	6	1172195	1172200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231112
23512	NC_014804	C	6	6	1172199	1172204	0 %	0 %	0 %	100 %	315231112
23513	NC_014804	AT	3	6	1172219	1172224	50 %	50 %	0 %	0 %	315231112
23514	NC_014804	TGA	2	6	1172260	1172265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231112
23515	NC_014804	C	6	6	1172311	1172316	0 %	0 %	0 %	100 %	315231113
23516	NC_014804	AGA	2	6	1172321	1172326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231113
23517	NC_014804	AGG	2	6	1172351	1172356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231113
23518	NC_014804	GTA	2	6	1172446	1172451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231113
23519	NC_014804	TCC	2	6	1172461	1172466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231113
23520	NC_014804	CAA	2	6	1172491	1172496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231113
23521	NC_014804	AGC	2	6	1172524	1172529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231113
23522	NC_014804	AAT	2	6	1172598	1172603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231114
23523	NC_014804	ACC	2	6	1172707	1172712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231114
23524	NC_014804	TCTT	2	8	1172718	1172725	0 %	75 %	0 %	25 %	315231114
23525	NC_014804	CATA	2	8	1172787	1172794	50 %	25 %	0 %	25 %	315231114
23526	NC_014804	CCA	3	9	1172796	1172804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231115
23527	NC_014804	TGCG	2	8	1172845	1172852	0 %	25 %	50 %	25 %	315231115
23528	NC_014804	TTA	2	6	1172865	1172870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231115
23529	NC_014804	TGA	2	6	1172907	1172912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231115
23530	NC_014804	TGCA	2	8	1172986	1172993	25 %	25 %	25 %	25 %	315231115
23531	NC_014804	CCT	2	6	1173092	1173097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231116
23532	NC_014804	CCA	2	6	1173123	1173128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231116
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23535	NC_014804	TAT	2	6	1173203	1173208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231116
23536	NC_014804	AAC	2	6	1173209	1173214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231116
23537	NC_014804	C	6	6	1173319	1173324	0 %	0 %	0 %	100 %	315231116
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23540	NC_014804	CT	3	6	1173455	1173460	0 %	50 %	0 %	50 %	315231117
23541	NC_014804	TAT	2	6	1173553	1173558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231117
23542	NC_014804	ATT	2	6	1173629	1173634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231117
23543	NC_014804	CAG	3	9	1173655	1173663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231117
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23545	NC_014804	TC	3	6	1173722	1173727	0 %	50 %	0 %	50 %	315231117
23546	NC_014804	ATG	2	6	1173732	1173737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231117
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23550	NC_014804	TCC	2	6	1173888	1173893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231117
23551	NC_014804	CTT	2	6	1173900	1173905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231117
23552	NC_014804	TTTTAA	2	12	1174046	1174057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23553	NC_014804	CTC	2	6	1174073	1174078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23554	NC_014804	GGGGT	2	10	1174187	1174196	0 %	20 %	80 %	0 %	315231118
23555	NC_014804	GAA	2	6	1174292	1174297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231118
23556	NC_014804	TTC	2	6	1174314	1174319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231118
23557	NC_014804	CCT	2	6	1174340	1174345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231118
23558	NC_014804	AGA	2	6	1174413	1174418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231118
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23560	NC_014804	TGG	2	6	1174435	1174440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231118
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23563	NC_014804	CCAA	2	8	1174502	1174509	50 %	0 %	0 %	50 %	315231118
23564	NC_014804	GA	3	6	1174606	1174611	50 %	0 %	50 %	0 %	315231118
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23566	NC_014804	AGA	2	6	1174661	1174666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231118
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23571	NC_014804	TTGC	2	8	1174824	1174831	0 %	50 %	25 %	25 %	315231118
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23577	NC_014804	GAAA	2	8	1175001	1175008	75 %	0 %	25 %	0 %	315231118
23578	NC_014804	CATT	2	8	1175080	1175087	25 %	50 %	0 %	25 %	315231118
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23587	NC_014804	TAC	2	6	1175765	1175770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231118
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23589	NC_014804	CTA	2	6	1175797	1175802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231118
23590	NC_014804	AT	3	6	1175837	1175842	50 %	50 %	0 %	0 %	315231118
23591	NC_014804	AGA	2	6	1175848	1175853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231118
23592	NC_014804	GA	4	8	1175947	1175954	50 %	0 %	50 %	0 %	315231118
23593	NC_014804	CAGG	2	8	1176145	1176152	25 %	0 %	50 %	25 %	315231118
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23597	NC_014804	TTA	2	6	1176478	1176483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23599	NC_014804	GGA	2	6	1176588	1176593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231119
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23601	NC_014804	GAG	2	6	1176641	1176646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231119
23602	NC_014804	GAT	2	6	1176664	1176669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231119
23603	NC_014804	CAA	2	6	1176674	1176679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231119
23604	NC_014804	CA	3	6	1176721	1176726	50 %	0 %	0 %	50 %	315231119
23605	NC_014804	AAG	2	6	1176845	1176850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231119
23606	NC_014804	GGTTCC	2	12	1176909	1176920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231119
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23974	NC_014804	CAG	2	6	1196484	1196489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231140
23975	NC_014804	AGG	2	6	1196525	1196530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231140
23976	NC_014804	TGT	2	6	1196586	1196591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231140
23977	NC_014804	GAA	2	6	1196638	1196643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231140
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23979	NC_014804	A	6	6	1196671	1196676	100 %	0 %	0 %	0 %	315231140
23980	NC_014804	CCA	2	6	1196791	1196796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231140
23981	NC_014804	ACT	2	6	1196822	1196827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231140
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23984	NC_014804	CTG	2	6	1196889	1196894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231140
23985	NC_014804	AG	3	6	1196908	1196913	50 %	0 %	50 %	0 %	315231140
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23989	NC_014804	AGC	2	6	1197137	1197142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231141
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23994	NC_014804	ATT	2	6	1197587	1197592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231142
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23998	NC_014804	TAT	2	6	1197841	1197846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231143
23999	NC_014804	CTTC	2	8	1197932	1197939	0 %	50 %	0 %	50 %	315231143
24000	NC_014804	CAA	2	6	1197951	1197956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231143

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