MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_014804	AT	3	6	1147120	1147125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23002	NC_014804	ACA	2	6	1147154	1147159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23003	NC_014804	TTA	2	6	1147240	1147245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23004	NC_014804	GGT	2	6	1147266	1147271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23005	NC_014804	GAAG	2	8	1147318	1147325	50 %	0 %	50 %	0 %	315231079
23006	NC_014804	AGA	2	6	1147463	1147468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231079
23007	NC_014804	TTG	2	6	1147511	1147516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231079
23008	NC_014804	AAC	2	6	1147533	1147538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231079
23009	NC_014804	TGG	2	6	1147631	1147636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231079
23010	NC_014804	GTAT	2	8	1147698	1147705	25 %	50 %	25 %	0 %	315231079
23011	NC_014804	GGA	2	6	1147765	1147770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231079
23012	NC_014804	GGC	2	6	1147794	1147799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231079
23013	NC_014804	ACA	2	6	1147847	1147852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231079
23014	NC_014804	GCC	2	6	1147857	1147862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315231079
23015	NC_014804	AGA	2	6	1147878	1147883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231079
23016	NC_014804	AAG	2	6	1147888	1147893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231079
23017	NC_014804	TTG	2	6	1147895	1147900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231079
23018	NC_014804	CTTTT	2	10	1147969	1147978	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23019	NC_014804	TGG	2	6	1147989	1147994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23020	NC_014804	GAA	2	6	1148002	1148007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231080
23021	NC_014804	TTTCAC	2	12	1148019	1148030	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	315231080
23022	NC_014804	CTT	2	6	1148069	1148074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231080
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23025	NC_014804	ATG	2	6	1148127	1148132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231080
23026	NC_014804	TGA	2	6	1148212	1148217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231080
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23028	NC_014804	AAG	2	6	1148301	1148306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231080
23029	NC_014804	TC	3	6	1148320	1148325	0 %	50 %	0 %	50 %	315231080
23030	NC_014804	GAA	2	6	1148545	1148550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231080
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23034	NC_014804	GTGCT	2	10	1148715	1148724	0 %	40 %	40 %	20 %	315231080
23035	NC_014804	TC	3	6	1148726	1148731	0 %	50 %	0 %	50 %	315231080
23036	NC_014804	AGA	2	6	1148766	1148771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231080
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23042	NC_014804	TAA	2	6	1149091	1149096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23043	NC_014804	CTT	2	6	1149115	1149120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231081
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23047	NC_014804	TGT	2	6	1149308	1149313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23049	NC_014804	GATA	2	8	1149401	1149408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23050	NC_014804	AGA	2	6	1149409	1149414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23051	NC_014804	GGAGC	2	10	1149426	1149435	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23052	NC_014804	GAT	2	6	1149581	1149586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231082
23053	NC_014804	GTT	2	6	1149590	1149595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231082
23054	NC_014804	GCAA	2	8	1149754	1149761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23055	NC_014804	TGG	2	6	1149771	1149776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23056	NC_014804	GCG	2	6	1149817	1149822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23057	NC_014804	AAT	2	6	1149857	1149862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23058	NC_014804	TC	3	6	1149898	1149903	0 %	50 %	0 %	50 %	315231083
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23062	NC_014804	GAGC	2	8	1150056	1150063	25 %	0 %	50 %	25 %	315231083
23063	NC_014804	GAA	2	6	1150136	1150141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231083
23064	NC_014804	TTCG	2	8	1150152	1150159	0 %	50 %	25 %	25 %	315231083
23065	NC_014804	TG	3	6	1150206	1150211	0 %	50 %	50 %	0 %	315231083
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23071	NC_014804	CGG	2	6	1150722	1150727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23072	NC_014804	CTCCGG	2	12	1150744	1150755	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23073	NC_014804	TTA	2	6	1150801	1150806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23074	NC_014804	TGC	2	6	1150837	1150842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23075	NC_014804	TA	3	6	1150851	1150856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23076	NC_014804	T	6	6	1150869	1150874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23081	NC_014804	A	7	7	1151177	1151183	100 %	0 %	0 %	0 %	315231084
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23091	NC_014804	GATGG	2	10	1151682	1151691	20 %	20 %	60 %	0 %	315231084
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23093	NC_014804	TC	3	6	1151795	1151800	0 %	50 %	0 %	50 %	315231084
23094	NC_014804	AC	3	6	1151937	1151942	50 %	0 %	0 %	50 %	315231084
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23099	NC_014804	ATT	2	6	1152218	1152223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23101	NC_014804	AAG	2	6	1152334	1152339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231085
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23107	NC_014804	GGATG	2	10	1152565	1152574	20 %	20 %	60 %	0 %	315231085
23108	NC_014804	ATA	2	6	1152577	1152582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231085
23109	NC_014804	ACC	2	6	1152599	1152604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231085
23110	NC_014804	TA	3	6	1152616	1152621	50 %	50 %	0 %	0 %	315231085
23111	NC_014804	ACG	2	6	1152623	1152628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231085
23112	NC_014804	AT	3	6	1152656	1152661	50 %	50 %	0 %	0 %	315231085
23113	NC_014804	GTC	2	6	1152670	1152675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231085
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23117	NC_014804	GGT	2	6	1152849	1152854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231085
23118	NC_014804	AG	3	6	1152869	1152874	50 %	0 %	50 %	0 %	315231085
23119	NC_014804	AAG	2	6	1152934	1152939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231085
23120	NC_014804	GGA	2	6	1152955	1152960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231085
23121	NC_014804	CAA	2	6	1153019	1153024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231085
23122	NC_014804	AGA	2	6	1153056	1153061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231085
23123	NC_014804	CCA	2	6	1153363	1153368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231085
23124	NC_014804	ACT	2	6	1153397	1153402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231085
23125	NC_014804	CTGC	2	8	1153519	1153526	0 %	25 %	25 %	50 %	315231085
23126	NC_014804	ACA	2	6	1153574	1153579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231085
23127	NC_014804	GAG	2	6	1153580	1153585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231085
23128	NC_014804	CGA	2	6	1153662	1153667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231085
23129	NC_014804	AAAGAT	2	12	1153668	1153679	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	315231085
23130	NC_014804	TGC	2	6	1153716	1153721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231085
23131	NC_014804	GAC	2	6	1153759	1153764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231085
23132	NC_014804	AGA	2	6	1153809	1153814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231085
23133	NC_014804	GA	3	6	1153831	1153836	50 %	0 %	50 %	0 %	315231085
23134	NC_014804	AG	3	6	1153848	1153853	50 %	0 %	50 %	0 %	315231085
23135	NC_014804	AC	3	6	1153895	1153900	50 %	0 %	0 %	50 %	315231085
23136	NC_014804	CTT	2	6	1153912	1153917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231085
23137	NC_014804	GTC	2	6	1153954	1153959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231085
23138	NC_014804	TAC	2	6	1153984	1153989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231085
23139	NC_014804	AAGGT	2	10	1154012	1154021	40 %	20 %	40 %	0 %	315231085
23140	NC_014804	AGA	2	6	1154025	1154030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231085
23141	NC_014804	ATCTT	2	10	1154084	1154093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23142	NC_014804	T	6	6	1154092	1154097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23143	NC_014804	TAA	2	6	1154100	1154105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23144	NC_014804	TAAA	2	8	1154114	1154121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23145	NC_014804	TCG	2	6	1154123	1154128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23146	NC_014804	TTC	2	6	1154200	1154205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23147	NC_014804	C	6	6	1154234	1154239	0 %	0 %	0 %	100 %	315231086
23148	NC_014804	TGT	2	6	1154292	1154297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231086
23149	NC_014804	AGA	2	6	1154376	1154381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231086
23150	NC_014804	GA	3	6	1154398	1154403	50 %	0 %	50 %	0 %	315231086
23151	NC_014804	AGG	2	6	1154411	1154416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231086
23152	NC_014804	AAT	2	6	1154541	1154546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231086
23153	NC_014804	TTTC	2	8	1154577	1154584	0 %	75 %	0 %	25 %	315231086
23154	NC_014804	A	7	7	1154599	1154605	100 %	0 %	0 %	0 %	315231086
23155	NC_014804	TC	3	6	1154642	1154647	0 %	50 %	0 %	50 %	315231086
23156	NC_014804	TAC	2	6	1154710	1154715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231086
23157	NC_014804	GTT	2	6	1154724	1154729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231086
23158	NC_014804	AGG	2	6	1154746	1154751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231086
23159	NC_014804	CTT	2	6	1154752	1154757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231086
23160	NC_014804	CATT	2	8	1154823	1154830	25 %	50 %	0 %	25 %	315231087
23161	NC_014804	TGA	2	6	1154863	1154868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231087
23162	NC_014804	AGG	2	6	1154937	1154942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231087
23163	NC_014804	CTT	2	6	1155033	1155038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23164	NC_014804	TC	3	6	1155063	1155068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23165	NC_014804	TCA	2	6	1155145	1155150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23166	NC_014804	CATT	2	8	1155165	1155172	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23167	NC_014804	CTG	2	6	1155232	1155237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231088
23168	NC_014804	TTC	2	6	1155282	1155287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231088
23169	NC_014804	TGG	2	6	1155291	1155296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231088
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23172	NC_014804	A	6	6	1155470	1155475	100 %	0 %	0 %	0 %	315231089
23173	NC_014804	A	6	6	1155490	1155495	100 %	0 %	0 %	0 %	315231089
23174	NC_014804	ATC	2	6	1155530	1155535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231089
23175	NC_014804	CTTT	2	8	1155542	1155549	0 %	75 %	0 %	25 %	315231089
23176	NC_014804	GA	3	6	1155585	1155590	50 %	0 %	50 %	0 %	315231089
23177	NC_014804	CAGC	2	8	1155645	1155652	25 %	0 %	25 %	50 %	315231089
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23179	NC_014804	TGAT	2	8	1155815	1155822	25 %	50 %	25 %	0 %	315231089
23180	NC_014804	GTGGA	2	10	1155880	1155889	20 %	20 %	60 %	0 %	315231089
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23183	NC_014804	TTC	2	6	1156066	1156071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231089
23184	NC_014804	AG	3	6	1156117	1156122	50 %	0 %	50 %	0 %	315231089
23185	NC_014804	AAG	2	6	1156165	1156170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231089
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23189	NC_014804	CTT	2	6	1156412	1156417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231090
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23192	NC_014804	CA	3	6	1156560	1156565	50 %	0 %	0 %	50 %	315231090
23193	NC_014804	TCCT	2	8	1156647	1156654	0 %	50 %	0 %	50 %	315231090
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23209	NC_014804	TTG	2	6	1157593	1157598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231091
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23213	NC_014804	TCT	2	6	1157939	1157944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23214	NC_014804	GAA	2	6	1157959	1157964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23215	NC_014804	CTC	2	6	1157980	1157985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231092
23216	NC_014804	GCT	2	6	1158017	1158022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231092
23217	NC_014804	GTCT	2	8	1158040	1158047	0 %	50 %	25 %	25 %	315231092
23218	NC_014804	TCG	2	6	1158074	1158079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315231092
23219	NC_014804	CCAA	2	8	1158222	1158229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23220	NC_014804	ACT	2	6	1158239	1158244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23221	NC_014804	TC	3	6	1158255	1158260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23222	NC_014804	AAAC	2	8	1158301	1158308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23223	NC_014804	A	6	6	1158341	1158346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23224	NC_014804	GACAT	2	10	1158395	1158404	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23225	NC_014804	A	7	7	1158489	1158495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23226	NC_014804	TCC	2	6	1158604	1158609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315231093
23227	NC_014804	ATAC	2	8	1158697	1158704	50 %	25 %	0 %	25 %	315231093
23228	NC_014804	TTTG	2	8	1158780	1158787	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23229	NC_014804	AAAAG	2	10	1158828	1158837	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23230	NC_014804	ATCT	2	8	1158844	1158851	25 %	50 %	0 %	25 %	315231094
23231	NC_014804	AT	4	8	1158857	1158864	50 %	50 %	0 %	0 %	315231094
23232	NC_014804	GCAG	2	8	1158865	1158872	25 %	0 %	50 %	25 %	315231094
23233	NC_014804	TAT	2	6	1158922	1158927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315231094
23234	NC_014804	TCA	2	6	1158956	1158961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315231094
23235	NC_014804	AAAT	2	8	1159155	1159162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23236	NC_014804	TAA	2	6	1159190	1159195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23237	NC_014804	A	6	6	1159211	1159216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23238	NC_014804	CTT	3	9	1159243	1159251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231095
23239	NC_014804	GGA	2	6	1159283	1159288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231095
23240	NC_014804	AT	3	6	1159441	1159446	50 %	50 %	0 %	0 %	315231095
23241	NC_014804	ACG	2	6	1159460	1159465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231095
23242	NC_014804	CTT	2	6	1159515	1159520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315231095
23243	NC_014804	TGTT	2	8	1159615	1159622	0 %	75 %	25 %	0 %	315231096
23244	NC_014804	GCG	2	6	1159740	1159745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315231096
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23304	NC_014804	ATA	2	6	1162234	1162239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315231099
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23323	NC_014804	GTG	2	6	1163441	1163446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315231100
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23329	NC_014804	TGT	2	6	1163618	1163623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315231100
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23339	NC_014804	GGA	2	6	1164013	1164018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315231101
23340	NC_014804	AG	3	6	1164032	1164037	50 %	0 %	50 %	0 %	315231101
23341	NC_014804	AGA	2	6	1164051	1164056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231101
23342	NC_014804	CAG	2	6	1164161	1164166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315231101
23343	NC_014804	TA	3	6	1164183	1164188	50 %	50 %	0 %	0 %	315231101
23344	NC_014804	AATC	2	8	1164221	1164228	50 %	25 %	0 %	25 %	315231101
23345	NC_014804	CAA	2	6	1164253	1164258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231101
23346	NC_014804	ACC	2	6	1164279	1164284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315231101
23347	NC_014804	AAGAG	2	10	1164311	1164320	60 %	0 %	40 %	0 %	315231101
23348	NC_014804	AG	4	8	1164317	1164324	50 %	0 %	50 %	0 %	315231101
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23350	NC_014804	G	6	6	1164378	1164383	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23351	NC_014804	TTA	2	6	1164391	1164396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23352	NC_014804	TAA	2	6	1164399	1164404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23353	NC_014804	GA	3	6	1164476	1164481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23354	NC_014804	AGC	2	6	1164539	1164544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23355	NC_014804	AG	3	6	1164607	1164612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23356	NC_014804	ATG	2	6	1164739	1164744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231102
23357	NC_014804	CAA	2	6	1164812	1164817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315231102
23358	NC_014804	GAT	2	6	1164896	1164901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315231102
23359	NC_014804	AGA	2	6	1164931	1164936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315231102
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