MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_014804	GGA	2	6	52225	52230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315229824
1003	NC_014804	TA	3	6	52258	52263	50 %	50 %	0 %	0 %	315229824
1004	NC_014804	CACTAA	2	12	52275	52286	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	315229824
1005	NC_014804	ATCT	2	8	52291	52298	25 %	50 %	0 %	25 %	315229824
1006	NC_014804	TGC	2	6	52353	52358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229824
1007	NC_014804	CAA	2	6	52385	52390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229824
1008	NC_014804	TAC	2	6	52414	52419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229824
1009	NC_014804	AAG	2	6	52508	52513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229824
1010	NC_014804	ACA	2	6	52541	52546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229824
1011	NC_014804	GA	3	6	52582	52587	50 %	0 %	50 %	0 %	315229824
1012	NC_014804	AAT	2	6	52618	52623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229824
1013	NC_014804	ACC	2	6	52641	52646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315229824
1014	NC_014804	TA	3	6	52657	52662	50 %	50 %	0 %	0 %	315229824
1015	NC_014804	A	6	6	52730	52735	100 %	0 %	0 %	0 %	315229825
1016	NC_014804	AAT	2	6	52741	52746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229825
1017	NC_014804	GGCT	2	8	52747	52754	0 %	25 %	50 %	25 %	315229825
1018	NC_014804	TTC	2	6	52782	52787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229825
1019	NC_014804	TGTT	2	8	52796	52803	0 %	75 %	25 %	0 %	315229825
1020	NC_014804	GTT	2	6	52844	52849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229825
1021	NC_014804	ATA	2	6	52886	52891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229825
1022	NC_014804	T	6	6	52909	52914	0 %	100 %	0 %	0 %	315229825
1023	NC_014804	CCA	2	6	52937	52942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315229825
1024	NC_014804	AACAA	2	10	52991	53000	80 %	0 %	0 %	20 %	315229825
1025	NC_014804	GTTT	2	8	53096	53103	0 %	75 %	25 %	0 %	315229825
1026	NC_014804	A	6	6	53136	53141	100 %	0 %	0 %	0 %	315229825
1027	NC_014804	AGA	2	6	53183	53188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014804	AGG	2	6	53230	53235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014804	AAT	2	6	53237	53242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014804	T	7	7	53395	53401	0 %	100 %	0 %	0 %	315229826
1031	NC_014804	ATT	2	6	53402	53407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229826
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1033	NC_014804	TAT	2	6	53619	53624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229826
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1035	NC_014804	ATT	2	6	53692	53697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229826
1036	NC_014804	TA	3	6	53718	53723	50 %	50 %	0 %	0 %	315229826
1037	NC_014804	A	6	6	53842	53847	100 %	0 %	0 %	0 %	315229826
1038	NC_014804	AG	3	6	53943	53948	50 %	0 %	50 %	0 %	315229826
1039	NC_014804	T	6	6	53961	53966	0 %	100 %	0 %	0 %	315229826
1040	NC_014804	AAT	2	6	53996	54001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229826
1041	NC_014804	TGTA	2	8	54017	54024	25 %	50 %	25 %	0 %	315229826
1042	NC_014804	AATC	2	8	54075	54082	50 %	25 %	0 %	25 %	315229826
1043	NC_014804	AGT	2	6	54135	54140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229826
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1048	NC_014804	TC	3	6	54310	54315	0 %	50 %	0 %	50 %	315229826
1049	NC_014804	GGAT	2	8	54362	54369	25 %	25 %	50 %	0 %	315229826
1050	NC_014804	TGA	2	6	54500	54505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229826
1051	NC_014804	GATA	2	8	54519	54526	50 %	25 %	25 %	0 %	315229826
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1057	NC_014804	TAAC	2	8	54733	54740	50 %	25 %	0 %	25 %	315229827
1058	NC_014804	TGG	2	6	54812	54817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315229827
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1061	NC_014804	ATG	2	6	54946	54951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229827
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1069	NC_014804	GGA	2	6	55212	55217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315229827
1070	NC_014804	AGT	2	6	55220	55225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229827
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1073	NC_014804	AAC	2	6	55450	55455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229827
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1077	NC_014804	A	6	6	55658	55663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_014804	GCG	3	9	56358	56366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315229828
1093	NC_014804	AG	4	8	56367	56374	50 %	0 %	50 %	0 %	315229828
1094	NC_014804	A	6	6	56405	56410	100 %	0 %	0 %	0 %	315229828
1095	NC_014804	GA	3	6	56501	56506	50 %	0 %	50 %	0 %	315229828
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1101	NC_014804	ATT	2	6	56842	56847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229829
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1112	NC_014804	CAC	3	9	57183	57191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315229829
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1118	NC_014804	ATT	2	6	57343	57348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014804	TGC	2	6	57406	57411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229830
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1123	NC_014804	GAA	2	6	57559	57564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229830
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1125	NC_014804	ATG	2	6	57614	57619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229830
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1127	NC_014804	TCT	2	6	57681	57686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229830
1128	NC_014804	CTT	3	9	57765	57773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229830
1129	NC_014804	GTG	2	6	57778	57783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315229830
1130	NC_014804	TTC	2	6	57819	57824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229830
1131	NC_014804	CCG	3	9	57890	57898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315229830
1132	NC_014804	CTA	2	6	58113	58118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229830
1133	NC_014804	T	6	6	58168	58173	0 %	100 %	0 %	0 %	315229830
1134	NC_014804	CTC	2	6	58221	58226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315229830
1135	NC_014804	GCG	2	6	58283	58288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315229830
1136	NC_014804	TTC	2	6	58337	58342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229830
1137	NC_014804	TCT	2	6	58481	58486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229830
1138	NC_014804	CCTG	2	8	58498	58505	0 %	25 %	25 %	50 %	315229830
1139	NC_014804	GGCA	2	8	58510	58517	25 %	0 %	50 %	25 %	315229830
1140	NC_014804	CTC	2	6	58548	58553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315229830
1141	NC_014804	CTT	2	6	58563	58568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229830
1142	NC_014804	ATGTTT	2	12	58592	58603	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	315229830
1143	NC_014804	CTT	2	6	58662	58667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229830
1144	NC_014804	AAG	2	6	58706	58711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229830
1145	NC_014804	TCCTC	2	10	58719	58728	0 %	40 %	0 %	60 %	315229830
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1148	NC_014804	TCT	2	6	58824	58829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229831
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1150	NC_014804	TC	3	6	58923	58928	0 %	50 %	0 %	50 %	315229831
1151	NC_014804	CAA	2	6	59031	59036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229831
1152	NC_014804	TCA	2	6	59040	59045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229831
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1156	NC_014804	TCC	2	6	59192	59197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315229831
1157	NC_014804	ATC	2	6	59309	59314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229831
1158	NC_014804	TGGCT	2	10	59339	59348	0 %	40 %	40 %	20 %	315229831
1159	NC_014804	GT	3	6	59407	59412	0 %	50 %	50 %	0 %	315229831
1160	NC_014804	TTCT	2	8	59487	59494	0 %	75 %	0 %	25 %	315229831
1161	NC_014804	T	7	7	59539	59545	0 %	100 %	0 %	0 %	315229831
1162	NC_014804	T	6	6	59633	59638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1163	NC_014804	TAAC	2	8	59683	59690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1164	NC_014804	TGA	2	6	59753	59758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1167	NC_014804	AGA	2	6	59886	59891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229832
1168	NC_014804	GAA	2	6	59928	59933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229832
1169	NC_014804	GAA	2	6	59986	59991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229832
1170	NC_014804	A	6	6	60005	60010	100 %	0 %	0 %	0 %	315229832
1171	NC_014804	GAA	2	6	60076	60081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229832
1172	NC_014804	CTA	2	6	60093	60098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229832
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1179	NC_014804	GT	3	6	60472	60477	0 %	50 %	50 %	0 %	315229832
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1183	NC_014804	TAC	2	6	60634	60639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229832
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1195	NC_014804	CT	3	6	61606	61611	0 %	50 %	0 %	50 %	315229833
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1199	NC_014804	GT	3	6	62112	62117	0 %	50 %	50 %	0 %	315229834
1200	NC_014804	A	6	6	62156	62161	100 %	0 %	0 %	0 %	315229834
1201	NC_014804	GTGG	2	8	62190	62197	0 %	25 %	75 %	0 %	315229834
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1210	NC_014804	GA	3	6	62761	62766	50 %	0 %	50 %	0 %	315229835
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1218	NC_014804	CT	3	6	63300	63305	0 %	50 %	0 %	50 %	315229835
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1220	NC_014804	TCAT	2	8	63393	63400	25 %	50 %	0 %	25 %	315229835
1221	NC_014804	ATA	2	6	63443	63448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229835
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1223	NC_014804	TCTA	2	8	63632	63639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1224	NC_014804	AAATCA	2	12	63648	63659	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1225	NC_014804	ACTGT	2	10	63757	63766	20 %	40 %	20 %	20 %	315229836
1226	NC_014804	AT	3	6	63769	63774	50 %	50 %	0 %	0 %	315229836
1227	NC_014804	T	6	6	63808	63813	0 %	100 %	0 %	0 %	315229836
1228	NC_014804	GAT	2	6	63853	63858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229836
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1230	NC_014804	GATA	2	8	63906	63913	50 %	25 %	25 %	0 %	315229836
1231	NC_014804	T	6	6	63919	63924	0 %	100 %	0 %	0 %	315229836
1232	NC_014804	T	6	6	64088	64093	0 %	100 %	0 %	0 %	315229836
1233	NC_014804	CAA	2	6	64100	64105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229836
1234	NC_014804	TCTT	2	8	64144	64151	0 %	75 %	0 %	25 %	315229836
1235	NC_014804	A	6	6	64157	64162	100 %	0 %	0 %	0 %	315229836
1236	NC_014804	TA	4	8	64175	64182	50 %	50 %	0 %	0 %	315229836
1237	NC_014804	CTTT	2	8	64226	64233	0 %	75 %	0 %	25 %	315229836
1238	NC_014804	TA	4	8	64254	64261	50 %	50 %	0 %	0 %	315229836
1239	NC_014804	GTTG	2	8	64317	64324	0 %	50 %	50 %	0 %	315229836
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1242	NC_014804	A	6	6	64404	64409	100 %	0 %	0 %	0 %	315229837
1243	NC_014804	CAA	2	6	64424	64429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229837
1244	NC_014804	TA	3	6	64532	64537	50 %	50 %	0 %	0 %	315229837
1245	NC_014804	GA	3	6	64559	64564	50 %	0 %	50 %	0 %	315229837
1246	NC_014804	TGT	2	6	64628	64633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229837
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1248	NC_014804	CTT	2	6	64677	64682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229837
1249	NC_014804	ATA	2	6	64750	64755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229838
1250	NC_014804	TGT	2	6	64845	64850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229838
1251	NC_014804	GTT	2	6	64975	64980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229838
1252	NC_014804	AGA	2	6	65018	65023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229838
1253	NC_014804	AGCA	2	8	65154	65161	50 %	0 %	25 %	25 %	315229838
1254	NC_014804	TGA	2	6	65168	65173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229838
1255	NC_014804	AAG	2	6	65195	65200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229838
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1257	NC_014804	AG	3	6	65251	65256	50 %	0 %	50 %	0 %	315229838
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1362	NC_014804	AG	3	6	70979	70984	50 %	0 %	50 %	0 %	315229843
1363	NC_014804	AT	5	10	71071	71080	50 %	50 %	0 %	0 %	315229843
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