MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_014804	TCT	2	6	674343	674348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230531
13502	NC_014804	AT	3	6	674409	674414	50 %	50 %	0 %	0 %	315230531
13503	NC_014804	TTGG	2	8	674562	674569	0 %	50 %	50 %	0 %	315230531
13504	NC_014804	AATT	2	8	674581	674588	50 %	50 %	0 %	0 %	315230531
13505	NC_014804	TTC	2	6	674630	674635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230531
13506	NC_014804	TGA	2	6	674775	674780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230531
13507	NC_014804	A	6	6	674802	674807	100 %	0 %	0 %	0 %	315230531
13508	NC_014804	ATT	2	6	674841	674846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230531
13509	NC_014804	ATG	2	6	674915	674920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_014804	GGT	2	6	674974	674979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_014804	GAG	2	6	675119	675124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230532
13512	NC_014804	CAC	2	6	675180	675185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230532
13513	NC_014804	ATC	2	6	675188	675193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230532
13514	NC_014804	CGG	2	6	675208	675213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315230532
13515	NC_014804	GAT	2	6	675236	675241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230532
13516	NC_014804	TGG	2	6	675406	675411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230532
13517	NC_014804	GAA	2	6	675467	675472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230532
13518	NC_014804	ATGAGG	2	12	675639	675650	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	315230532
13519	NC_014804	CAGTTG	2	12	675651	675662	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315230532
13520	NC_014804	TTCTT	2	10	675688	675697	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13521	NC_014804	T	6	6	676088	676093	0 %	100 %	0 %	0 %	315230533
13522	NC_014804	CAT	2	6	676164	676169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230533
13523	NC_014804	TCCA	2	8	676233	676240	25 %	25 %	0 %	50 %	315230533
13524	NC_014804	TTG	2	6	676274	676279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230533
13525	NC_014804	CAA	2	6	676337	676342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230533
13526	NC_014804	T	6	6	676362	676367	0 %	100 %	0 %	0 %	315230533
13527	NC_014804	ATT	2	6	676426	676431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230533
13528	NC_014804	GCA	2	6	676438	676443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230533
13529	NC_014804	TC	3	6	676479	676484	0 %	50 %	0 %	50 %	315230533
13530	NC_014804	CT	3	6	676514	676519	0 %	50 %	0 %	50 %	315230533
13531	NC_014804	CAA	2	6	676562	676567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230533
13532	NC_014804	CAT	2	6	676721	676726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230533
13533	NC_014804	TCC	2	6	676738	676743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230533
13534	NC_014804	TTG	2	6	676829	676834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230533
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13536	NC_014804	AAC	2	6	676890	676895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230533
13537	NC_014804	TC	3	6	676971	676976	0 %	50 %	0 %	50 %	315230533
13538	NC_014804	GAAG	2	8	677137	677144	50 %	0 %	50 %	0 %	315230533
13539	NC_014804	AT	3	6	677171	677176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_014804	CTAAA	2	10	677202	677211	60 %	20 %	0 %	20 %	315230534
13541	NC_014804	ATC	2	6	677242	677247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230534
13542	NC_014804	CAA	2	6	677253	677258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230534
13543	NC_014804	TTCCA	2	10	677295	677304	20 %	40 %	0 %	40 %	315230534
13544	NC_014804	CAA	2	6	677360	677365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230534
13545	NC_014804	TTC	2	6	677413	677418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230534
13546	NC_014804	T	6	6	677471	677476	0 %	100 %	0 %	0 %	315230534
13547	NC_014804	ACA	2	6	677491	677496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230534
13548	NC_014804	AAAG	2	8	677527	677534	75 %	0 %	25 %	0 %	315230534
13549	NC_014804	AAG	2	6	677549	677554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230534
13550	NC_014804	AAG	2	6	677644	677649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230534
13551	NC_014804	AT	3	6	677650	677655	50 %	50 %	0 %	0 %	315230534
13552	NC_014804	ATTC	2	8	677660	677667	25 %	50 %	0 %	25 %	315230534
13553	NC_014804	TAAA	2	8	677711	677718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_014804	TGA	2	6	677777	677782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_014804	GGGAA	2	10	677791	677800	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_014804	GAT	2	6	677801	677806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_014804	TAC	2	6	677886	677891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230535
13558	NC_014804	CAA	2	6	677999	678004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230535
13559	NC_014804	A	7	7	678059	678065	100 %	0 %	0 %	0 %	315230535
13560	NC_014804	CAGT	2	8	678091	678098	25 %	25 %	25 %	25 %	315230535
13561	NC_014804	CCA	2	6	678170	678175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230535
13562	NC_014804	TTG	2	6	678205	678210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230535
13563	NC_014804	GAG	2	6	678285	678290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230535
13564	NC_014804	TTG	2	6	678300	678305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230535
13565	NC_014804	TC	3	6	678306	678311	0 %	50 %	0 %	50 %	315230535
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13572	NC_014804	CAT	2	6	678713	678718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13573	NC_014804	ATG	2	6	678756	678761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_014804	ATA	2	6	678767	678772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_014804	ATA	2	6	678795	678800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_014804	TGAA	2	8	678888	678895	50 %	25 %	25 %	0 %	315230536
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13596	NC_014804	CATT	2	8	679809	679816	25 %	50 %	0 %	25 %	315230536
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13601	NC_014804	TCT	2	6	679952	679957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230537
13602	NC_014804	A	7	7	679963	679969	100 %	0 %	0 %	0 %	315230537
13603	NC_014804	TTC	3	9	679983	679991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230537
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13605	NC_014804	CTTG	2	8	680055	680062	0 %	50 %	25 %	25 %	315230537
13606	NC_014804	GA	3	6	680144	680149	50 %	0 %	50 %	0 %	315230537
13607	NC_014804	TAAG	2	8	680215	680222	50 %	25 %	25 %	0 %	315230537
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13612	NC_014804	GGT	2	6	680633	680638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_014804	ACA	2	6	680742	680747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230538
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13619	NC_014804	AGA	2	6	681015	681020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230538
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13623	NC_014804	CCA	2	6	681103	681108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230539
13624	NC_014804	GAT	2	6	681120	681125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230539
13625	NC_014804	AAG	2	6	681164	681169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230539
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13630	NC_014804	AG	3	6	681376	681381	50 %	0 %	50 %	0 %	315230540
13631	NC_014804	TCACC	2	10	681418	681427	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
13632	NC_014804	GCA	2	6	681471	681476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230541
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13636	NC_014804	CTT	2	6	681583	681588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230541
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13643	NC_014804	CTC	2	6	682106	682111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230541
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13645	NC_014804	TC	3	6	682290	682295	0 %	50 %	0 %	50 %	315230541
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13649	NC_014804	AAT	2	6	682420	682425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230541
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13652	NC_014804	CTT	3	9	682539	682547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230542
13653	NC_014804	CTCA	2	8	682614	682621	25 %	25 %	0 %	50 %	315230542
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13662	NC_014804	T	6	6	682863	682868	0 %	100 %	0 %	0 %	315230543
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13665	NC_014804	TAT	2	6	683075	683080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13675	NC_014804	TCC	2	6	683640	683645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230546
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13720	NC_014804	AT	3	6	685797	685802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13721	NC_014804	T	6	6	685809	685814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13722	NC_014804	TGTT	2	8	685839	685846	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13723	NC_014804	TTG	2	6	685877	685882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13740	NC_014804	TCCA	2	8	686726	686733	25 %	25 %	0 %	50 %	315230549
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13743	NC_014804	TTC	2	6	686885	686890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230550
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13991	NC_014804	TACT	2	8	699213	699220	25 %	50 %	0 %	25 %	315230568
13992	NC_014804	TTA	2	6	699318	699323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230568
13993	NC_014804	TA	3	6	699360	699365	50 %	50 %	0 %	0 %	315230568
13994	NC_014804	TCT	2	6	699373	699378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230568
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