MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014804	TGGC	2	8	649517	649524	0 %	25 %	50 %	25 %	315230505
13002	NC_014804	ATTT	2	8	649545	649552	25 %	75 %	0 %	0 %	315230505
13003	NC_014804	CAG	2	6	649627	649632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230505
13004	NC_014804	TGT	2	6	649637	649642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230505
13005	NC_014804	GAC	2	6	649643	649648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230505
13006	NC_014804	GAG	2	6	649665	649670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230505
13007	NC_014804	TAC	2	6	649737	649742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230505
13008	NC_014804	AGA	2	6	649754	649759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230505
13009	NC_014804	TATT	2	8	649804	649811	25 %	75 %	0 %	0 %	315230505
13010	NC_014804	A	6	6	649831	649836	100 %	0 %	0 %	0 %	315230505
13011	NC_014804	AGA	2	6	649843	649848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_014804	TGAT	2	8	649950	649957	25 %	50 %	25 %	0 %	315230506
13013	NC_014804	TCA	2	6	649978	649983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230506
13014	NC_014804	CGA	2	6	650038	650043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230506
13015	NC_014804	AGT	2	6	650248	650253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230506
13016	NC_014804	TTCT	2	8	650298	650305	0 %	75 %	0 %	25 %	315230506
13017	NC_014804	ATGGA	2	10	650354	650363	40 %	20 %	40 %	0 %	315230506
13018	NC_014804	T	6	6	650395	650400	0 %	100 %	0 %	0 %	315230506
13019	NC_014804	TTA	2	6	650409	650414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230506
13020	NC_014804	GTT	2	6	650424	650429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230506
13021	NC_014804	CT	3	6	650440	650445	0 %	50 %	0 %	50 %	315230506
13022	NC_014804	CCT	2	6	650518	650523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230506
13023	NC_014804	TCAAAT	2	12	650619	650630	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	315230506
13024	NC_014804	TCC	2	6	650656	650661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230506
13025	NC_014804	CTC	2	6	650689	650694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230506
13026	NC_014804	CTC	2	6	650755	650760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230506
13027	NC_014804	AGT	2	6	650833	650838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230506
13028	NC_014804	CCT	2	6	650848	650853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230506
13029	NC_014804	CTT	2	6	650857	650862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230506
13030	NC_014804	TCT	2	6	650869	650874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230506
13031	NC_014804	CT	3	6	650879	650884	0 %	50 %	0 %	50 %	315230506
13032	NC_014804	TTAGC	2	10	650932	650941	20 %	40 %	20 %	20 %	315230506
13033	NC_014804	CTT	2	6	650966	650971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230506
13034	NC_014804	GGA	2	6	651062	651067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230506
13035	NC_014804	TCA	2	6	651135	651140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230506
13036	NC_014804	A	6	6	651140	651145	100 %	0 %	0 %	0 %	315230506
13037	NC_014804	ATT	2	6	651191	651196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230507
13038	NC_014804	TCT	2	6	651300	651305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230507
13039	NC_014804	TGAGC	2	10	651414	651423	20 %	20 %	40 %	20 %	315230507
13040	NC_014804	CCT	2	6	651428	651433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230507
13041	NC_014804	CAA	2	6	651441	651446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230507
13042	NC_014804	ATA	2	6	651448	651453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230507
13043	NC_014804	ATC	2	6	651473	651478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230507
13044	NC_014804	TGA	2	6	651525	651530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230507
13045	NC_014804	G	6	6	651533	651538	0 %	0 %	100 %	0 %	315230507
13046	NC_014804	ATG	2	6	651638	651643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230507
13047	NC_014804	TCA	3	9	651668	651676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230507
13048	NC_014804	GCC	2	6	651694	651699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315230507
13049	NC_014804	CGA	2	6	651702	651707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230507
13050	NC_014804	TC	3	6	651709	651714	0 %	50 %	0 %	50 %	315230507
13051	NC_014804	CAA	2	6	651846	651851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230507
13052	NC_014804	CTCTC	2	10	651859	651868	0 %	40 %	0 %	60 %	315230507
13053	NC_014804	GTTGA	2	10	651883	651892	20 %	40 %	40 %	0 %	315230507
13054	NC_014804	CTT	2	6	651901	651906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230507
13055	NC_014804	CT	3	6	651912	651917	0 %	50 %	0 %	50 %	315230507
13056	NC_014804	CAA	2	6	651921	651926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230507
13057	NC_014804	CCTT	2	8	652010	652017	0 %	50 %	0 %	50 %	315230507
13058	NC_014804	GAG	2	6	652084	652089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230507
13059	NC_014804	T	6	6	652092	652097	0 %	100 %	0 %	0 %	315230507
13060	NC_014804	CAC	2	6	652098	652103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230507
13061	NC_014804	TCC	2	6	652145	652150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230507
13062	NC_014804	CT	3	6	652168	652173	0 %	50 %	0 %	50 %	315230507
13063	NC_014804	ACA	2	6	652235	652240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230507
13064	NC_014804	TTTGCT	2	12	652283	652294	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	315230507
13065	NC_014804	CTT	2	6	652317	652322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230507
13066	NC_014804	GGTT	2	8	652350	652357	0 %	50 %	50 %	0 %	315230507
13067	NC_014804	GAA	2	6	652358	652363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230507
13068	NC_014804	CTC	2	6	652401	652406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230507
13069	NC_014804	TTTG	2	8	652414	652421	0 %	75 %	25 %	0 %	315230507
13070	NC_014804	ACC	2	6	652556	652561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13071	NC_014804	ACC	2	6	652591	652596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13072	NC_014804	GAAG	2	8	652642	652649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_014804	AGG	2	6	652657	652662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_014804	GAA	2	6	652886	652891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230508
13075	NC_014804	ATG	2	6	652899	652904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230508
13076	NC_014804	ACT	2	6	653001	653006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230508
13077	NC_014804	GAT	2	6	653012	653017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230508
13078	NC_014804	TAC	2	6	653072	653077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_014804	TTCT	2	8	653081	653088	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13080	NC_014804	CTT	2	6	653093	653098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_014804	GGA	2	6	653297	653302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230509
13082	NC_014804	AAT	2	6	653367	653372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230509
13083	NC_014804	AAAC	2	8	653421	653428	75 %	0 %	0 %	25 %	315230509
13084	NC_014804	CAG	2	6	653457	653462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230509
13085	NC_014804	GA	3	6	653492	653497	50 %	0 %	50 %	0 %	315230509
13086	NC_014804	CTT	2	6	653532	653537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230509
13087	NC_014804	GAA	2	6	653631	653636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230509
13088	NC_014804	TGC	2	6	653684	653689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230509
13089	NC_014804	CAT	2	6	653730	653735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230509
13090	NC_014804	TAA	2	6	653744	653749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230509
13091	NC_014804	ATC	2	6	653816	653821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_014804	TCA	2	6	653843	653848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_014804	AGA	2	6	653890	653895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230510
13094	NC_014804	TCC	2	6	653898	653903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230510
13095	NC_014804	TTG	2	6	653947	653952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230510
13096	NC_014804	CCT	2	6	653995	654000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230510
13097	NC_014804	TC	3	6	654097	654102	0 %	50 %	0 %	50 %	315230510
13098	NC_014804	CTCAT	2	10	654111	654120	20 %	40 %	0 %	40 %	315230510
13099	NC_014804	TCT	2	6	654139	654144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230510
13100	NC_014804	TCC	2	6	654155	654160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230510
13101	NC_014804	CAA	2	6	654187	654192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230510
13102	NC_014804	TTC	2	6	654224	654229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230510
13103	NC_014804	CTT	2	6	654259	654264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230510
13104	NC_014804	T	6	6	654263	654268	0 %	100 %	0 %	0 %	315230510
13105	NC_014804	CAT	2	6	654331	654336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230510
13106	NC_014804	AGT	2	6	654343	654348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230510
13107	NC_014804	T	6	6	654368	654373	0 %	100 %	0 %	0 %	315230510
13108	NC_014804	A	6	6	654469	654474	100 %	0 %	0 %	0 %	315230510
13109	NC_014804	T	6	6	654544	654549	0 %	100 %	0 %	0 %	315230510
13110	NC_014804	T	7	7	654575	654581	0 %	100 %	0 %	0 %	315230510
13111	NC_014804	CTT	2	6	654744	654749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_014804	T	6	6	654748	654753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_014804	TGG	2	6	654828	654833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_014804	GCCC	2	8	654902	654909	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13115	NC_014804	TGG	2	6	654915	654920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_014804	CCGG	2	8	654922	654929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13117	NC_014804	GGC	2	6	654960	654965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_014804	AGTT	2	8	655016	655023	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_014804	CTC	2	6	655083	655088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230511
13120	NC_014804	TA	3	6	655111	655116	50 %	50 %	0 %	0 %	315230511
13121	NC_014804	TCCCCA	2	12	655199	655210	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	315230511
13122	NC_014804	CTT	2	6	655221	655226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230511
13123	NC_014804	CT	3	6	655354	655359	0 %	50 %	0 %	50 %	315230511
13124	NC_014804	AAC	2	6	655360	655365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230511
13125	NC_014804	CTT	2	6	655403	655408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230511
13126	NC_014804	TTC	2	6	655454	655459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230511
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13128	NC_014804	ATT	2	6	655510	655515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230511
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13133	NC_014804	ACC	2	6	655745	655750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13166	NC_014804	TCC	2	6	657448	657453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230514
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13231	NC_014804	TAT	2	6	660496	660501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230515
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13236	NC_014804	CAGC	2	8	660795	660802	25 %	0 %	25 %	50 %	315230515
13237	NC_014804	TTC	2	6	660827	660832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230515
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13239	NC_014804	GAA	2	6	660985	660990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230516
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13242	NC_014804	CTT	2	6	661079	661084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230516
13243	NC_014804	CAT	2	6	661087	661092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230516
13244	NC_014804	TC	4	8	661105	661112	0 %	50 %	0 %	50 %	315230516
13245	NC_014804	TCA	2	6	661147	661152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230516
13246	NC_014804	TTC	2	6	661164	661169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230516
13247	NC_014804	T	7	7	661335	661341	0 %	100 %	0 %	0 %	315230516
13248	NC_014804	CTG	2	6	661345	661350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230516
13249	NC_014804	GTC	2	6	661361	661366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230516
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13251	NC_014804	CCT	2	6	661410	661415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13252	NC_014804	T	6	6	661450	661455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13253	NC_014804	GGT	2	6	661506	661511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13254	NC_014804	TTTTG	2	10	661534	661543	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13255	NC_014804	C	6	6	661659	661664	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13256	NC_014804	TGGA	2	8	661765	661772	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13257	NC_014804	TTTC	2	8	661801	661808	0 %	75 %	0 %	25 %	315230517
13258	NC_014804	TCTA	2	8	661814	661821	25 %	50 %	0 %	25 %	315230517
13259	NC_014804	CTC	2	6	661826	661831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230517
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13264	NC_014804	TGCA	2	8	662259	662266	25 %	25 %	25 %	25 %	315230517
13265	NC_014804	GT	3	6	662286	662291	0 %	50 %	50 %	0 %	315230517
13266	NC_014804	GT	3	6	662300	662305	0 %	50 %	50 %	0 %	315230517
13267	NC_014804	CT	3	6	662309	662314	0 %	50 %	0 %	50 %	315230517
13268	NC_014804	A	6	6	662318	662323	100 %	0 %	0 %	0 %	315230517
13269	NC_014804	ACC	2	6	662403	662408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13272	NC_014804	TGGT	2	8	662771	662778	0 %	50 %	50 %	0 %	315230518
13273	NC_014804	T	6	6	662787	662792	0 %	100 %	0 %	0 %	315230518
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13279	NC_014804	T	6	6	663136	663141	0 %	100 %	0 %	0 %	315230518
13280	NC_014804	GAAATT	2	12	663144	663155	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	315230518
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13328	NC_014804	GAC	2	6	665800	665805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230522
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13337	NC_014804	ATT	2	6	666156	666161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13338	NC_014804	TG	3	6	666174	666179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13339	NC_014804	ACA	2	6	666194	666199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13340	NC_014804	AG	3	6	666285	666290	50 %	0 %	50 %	0 %	315230523
13341	NC_014804	ATGT	2	8	666297	666304	25 %	50 %	25 %	0 %	315230523
13342	NC_014804	A	7	7	666319	666325	100 %	0 %	0 %	0 %	315230523
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13348	NC_014804	CT	3	6	666535	666540	0 %	50 %	0 %	50 %	315230523
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13352	NC_014804	CCCTG	2	10	666638	666647	0 %	20 %	20 %	60 %	315230523
13353	NC_014804	GAA	2	6	666695	666700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230523
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13355	NC_014804	GAA	2	6	666747	666752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230523
13356	NC_014804	AT	3	6	666753	666758	50 %	50 %	0 %	0 %	315230523
13357	NC_014804	GGA	2	6	666830	666835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230523
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13359	NC_014804	AGATA	2	10	666905	666914	60 %	20 %	20 %	0 %	315230523
13360	NC_014804	A	7	7	666932	666938	100 %	0 %	0 %	0 %	315230523
13361	NC_014804	ATA	2	6	667010	667015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230524
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13363	NC_014804	A	7	7	667126	667132	100 %	0 %	0 %	0 %	315230524
13364	NC_014804	GAG	2	6	667160	667165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230524
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13491	NC_014804	TCTCT	2	10	673743	673752	0 %	60 %	0 %	40 %	315230531
13492	NC_014804	TGT	2	6	673859	673864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230531
13493	NC_014804	CT	3	6	673982	673987	0 %	50 %	0 %	50 %	315230531
13494	NC_014804	ATC	2	6	674019	674024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230531
13495	NC_014804	T	6	6	674083	674088	0 %	100 %	0 %	0 %	315230531
13496	NC_014804	CAG	2	6	674107	674112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230531
13497	NC_014804	AAC	2	6	674147	674152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230531
13498	NC_014804	GGA	2	6	674157	674162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230531
13499	NC_014804	TTGT	2	8	674217	674224	0 %	75 %	25 %	0 %	315230531
13500	NC_014804	TTG	2	6	674262	674267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230531

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