MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014804	ATTT	2	8	500204	500211	25 %	75 %	0 %	0 %	315230349
10002	NC_014804	TC	3	6	500327	500332	0 %	50 %	0 %	50 %	315230349
10003	NC_014804	T	7	7	500347	500353	0 %	100 %	0 %	0 %	315230349
10004	NC_014804	TC	3	6	500363	500368	0 %	50 %	0 %	50 %	315230349
10005	NC_014804	TTC	2	6	500369	500374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230349
10006	NC_014804	TCAA	2	8	500397	500404	50 %	25 %	0 %	25 %	315230349
10007	NC_014804	ATT	2	6	500418	500423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230349
10008	NC_014804	T	6	6	500467	500472	0 %	100 %	0 %	0 %	315230349
10009	NC_014804	AAG	2	6	500477	500482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230349
10010	NC_014804	TC	3	6	500512	500517	0 %	50 %	0 %	50 %	315230349
10011	NC_014804	CA	3	6	500644	500649	50 %	0 %	0 %	50 %	315230349
10012	NC_014804	TCA	2	6	500682	500687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230349
10013	NC_014804	GTCT	2	8	500799	500806	0 %	50 %	25 %	25 %	315230349
10014	NC_014804	TAAGC	2	10	500853	500862	40 %	20 %	20 %	20 %	315230349
10015	NC_014804	TCGCT	2	10	500920	500929	0 %	40 %	20 %	40 %	315230349
10016	NC_014804	ACA	2	6	500988	500993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_014804	GTT	2	6	501022	501027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_014804	GAGAAA	2	12	501088	501099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230350
10019	NC_014804	TTCTC	2	10	501180	501189	0 %	60 %	0 %	40 %	315230350
10020	NC_014804	TGA	2	6	501221	501226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230350
10021	NC_014804	TGA	2	6	501312	501317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230350
10022	NC_014804	A	6	6	501327	501332	100 %	0 %	0 %	0 %	315230350
10023	NC_014804	A	6	6	501355	501360	100 %	0 %	0 %	0 %	315230350
10024	NC_014804	AAG	2	6	501487	501492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230350
10025	NC_014804	TAC	2	6	501511	501516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230350
10026	NC_014804	TCT	2	6	501575	501580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230351
10027	NC_014804	GTAA	2	8	501664	501671	50 %	25 %	25 %	0 %	315230351
10028	NC_014804	GTA	2	6	501717	501722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230351
10029	NC_014804	TCT	2	6	501754	501759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230351
10030	NC_014804	TAT	2	6	501813	501818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230351
10031	NC_014804	T	6	6	501879	501884	0 %	100 %	0 %	0 %	315230351
10032	NC_014804	ACA	2	6	501961	501966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230351
10033	NC_014804	CCA	2	6	501983	501988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230351
10034	NC_014804	TGAG	2	8	502012	502019	25 %	25 %	50 %	0 %	315230351
10035	NC_014804	ACC	2	6	502029	502034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10036	NC_014804	ATA	2	6	502107	502112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230352
10037	NC_014804	ACC	2	6	502133	502138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230352
10038	NC_014804	GTC	2	6	502160	502165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230352
10039	NC_014804	TGG	2	6	502249	502254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230352
10040	NC_014804	GA	3	6	502291	502296	50 %	0 %	50 %	0 %	315230352
10041	NC_014804	GAT	2	6	502312	502317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230352
10042	NC_014804	AGT	2	6	502437	502442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230352
10043	NC_014804	AAAT	2	8	502516	502523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_014804	CAC	2	6	502544	502549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10045	NC_014804	CAA	2	6	502575	502580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_014804	TGT	2	6	502669	502674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_014804	ACT	2	6	502699	502704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230353
10048	NC_014804	CTA	2	6	502739	502744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230353
10049	NC_014804	TAA	2	6	502754	502759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230353
10050	NC_014804	C	6	6	502779	502784	0 %	0 %	0 %	100 %	315230353
10051	NC_014804	TAC	2	6	502830	502835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230353
10052	NC_014804	CTC	2	6	502856	502861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230353
10053	NC_014804	ACC	2	6	502864	502869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230353
10054	NC_014804	TCC	2	6	502910	502915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230353
10055	NC_014804	AAGA	2	8	503003	503010	75 %	0 %	25 %	0 %	315230354
10056	NC_014804	TCC	2	6	503031	503036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230354
10057	NC_014804	ATT	2	6	503043	503048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230354
10058	NC_014804	TCT	2	6	503049	503054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230354
10059	NC_014804	CAG	2	6	503101	503106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230354
10060	NC_014804	ATG	2	6	503115	503120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230354
10061	NC_014804	GAA	2	6	503162	503167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230354
10062	NC_014804	CCA	2	6	503253	503258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10063	NC_014804	CCG	2	6	503271	503276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10064	NC_014804	AAAG	2	8	503277	503284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_014804	AAT	2	6	503286	503291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_014804	GTT	2	6	503303	503308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_014804	GAAA	2	8	503324	503331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_014804	TTC	2	6	503465	503470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_014804	ATC	2	6	503554	503559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230355
10070	NC_014804	ACA	2	6	503597	503602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230355
10071	NC_014804	ATA	2	6	503655	503660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230355
10072	NC_014804	GAT	2	6	503665	503670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_014804	AAT	2	6	503709	503714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_014804	AAC	2	6	503737	503742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_014804	GTAAAA	2	12	503787	503798	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_014804	CAA	2	6	503820	503825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230356
10077	NC_014804	GTT	2	6	503882	503887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230356
10078	NC_014804	TAC	2	6	503922	503927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230356
10079	NC_014804	CAG	2	6	503940	503945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230356
10080	NC_014804	ATG	2	6	503986	503991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230356
10081	NC_014804	CATG	2	8	503993	504000	25 %	25 %	25 %	25 %	315230356
10082	NC_014804	TGC	2	6	504027	504032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230356
10083	NC_014804	CTC	2	6	504042	504047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230356
10084	NC_014804	TCC	2	6	504096	504101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230356
10085	NC_014804	CCT	2	6	504114	504119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10086	NC_014804	TTC	2	6	504122	504127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_014804	TGT	2	6	504138	504143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_014804	TAC	2	6	504147	504152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_014804	TTC	2	6	504161	504166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_014804	ATT	2	6	504170	504175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_014804	T	10	10	504185	504194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_014804	TTTG	2	8	504203	504210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_014804	AT	3	6	504222	504227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_014804	ATT	2	6	504236	504241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_014804	AATT	2	8	504249	504256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_014804	TGA	2	6	504273	504278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_014804	ATA	3	9	504344	504352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230357
10098	NC_014804	CT	3	6	504354	504359	0 %	50 %	0 %	50 %	315230357
10099	NC_014804	AAT	2	6	504364	504369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230357
10100	NC_014804	CT	3	6	504370	504375	0 %	50 %	0 %	50 %	315230357
10101	NC_014804	TA	3	6	504420	504425	50 %	50 %	0 %	0 %	315230357
10102	NC_014804	ACT	2	6	504474	504479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230357
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10104	NC_014804	TAG	2	6	504552	504557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230357
10105	NC_014804	TA	3	6	504570	504575	50 %	50 %	0 %	0 %	315230357
10106	NC_014804	AAT	2	6	504583	504588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230357
10107	NC_014804	G	6	6	504604	504609	0 %	0 %	100 %	0 %	315230357
10108	NC_014804	GTT	2	6	504637	504642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230357
10109	NC_014804	TAA	2	6	504684	504689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230357
10110	NC_014804	TGA	2	6	504702	504707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230357
10111	NC_014804	A	6	6	504788	504793	100 %	0 %	0 %	0 %	315230357
10112	NC_014804	TAA	2	6	504807	504812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230357
10113	NC_014804	TCT	2	6	504831	504836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230357
10114	NC_014804	AAT	2	6	504853	504858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230357
10115	NC_014804	GTA	2	6	504866	504871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230357
10116	NC_014804	TGGC	2	8	504882	504889	0 %	25 %	50 %	25 %	315230357
10117	NC_014804	TC	3	6	505026	505031	0 %	50 %	0 %	50 %	315230357
10118	NC_014804	AAT	2	6	505051	505056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230357
10119	NC_014804	GGA	2	6	505070	505075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230357
10120	NC_014804	GGA	2	6	505129	505134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230357
10121	NC_014804	AG	3	6	505147	505152	50 %	0 %	50 %	0 %	315230357
10122	NC_014804	ACT	2	6	505183	505188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230357
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10124	NC_014804	CAA	2	6	505387	505392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230358
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10245	NC_014804	TCA	2	6	511548	511553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230363
10246	NC_014804	CCTT	2	8	511577	511584	0 %	50 %	0 %	50 %	315230363
10247	NC_014804	CTT	2	6	511732	511737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230363
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10249	NC_014804	TGA	2	6	511782	511787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230363
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10251	NC_014804	CAT	2	6	511888	511893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230363
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10253	NC_014804	CT	3	6	512005	512010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10254	NC_014804	GCTTT	2	10	512024	512033	0 %	60 %	20 %	20 %	315230364
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10265	NC_014804	TTA	2	6	512503	512508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10266	NC_014804	GAAAA	2	10	512564	512573	80 %	0 %	20 %	0 %	315230365
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10300	NC_014804	AAG	2	6	514458	514463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10301	NC_014804	TCGATT	2	12	514482	514493	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	315230367
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10309	NC_014804	AGAA	2	8	514820	514827	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10332	NC_014804	AG	3	6	516223	516228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10349	NC_014804	TA	3	6	517422	517427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10350	NC_014804	AAT	2	6	517454	517459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10367	NC_014804	GAC	2	6	518329	518334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230370
10368	NC_014804	ACATCA	2	12	518348	518359	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	315230370
10369	NC_014804	TCT	2	6	518369	518374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230370
10370	NC_014804	TC	3	6	518627	518632	0 %	50 %	0 %	50 %	315230370
10371	NC_014804	CTG	2	6	518658	518663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230370
10372	NC_014804	CT	3	6	518684	518689	0 %	50 %	0 %	50 %	315230370
10373	NC_014804	CTG	2	6	518710	518715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230370
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10389	NC_014804	TGA	2	6	519279	519284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230370
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10404	NC_014804	TC	3	6	519982	519987	0 %	50 %	0 %	50 %	315230371
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10442	NC_014804	A	7	7	522041	522047	100 %	0 %	0 %	0 %	315230373
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10453	NC_014804	CT	3	6	522510	522515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10469	NC_014804	AG	3	6	523473	523478	50 %	0 %	50 %	0 %	315230375
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10476	NC_014804	CT	3	6	523811	523816	0 %	50 %	0 %	50 %	315230375
10477	NC_014804	AG	3	6	523836	523841	50 %	0 %	50 %	0 %	315230375
10478	NC_014804	AAG	2	6	523917	523922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230375
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10486	NC_014804	GTC	2	6	524365	524370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230376
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10488	NC_014804	ATC	2	6	524411	524416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230376
10489	NC_014804	GAA	2	6	524432	524437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230376
10490	NC_014804	AAC	2	6	524464	524469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230376
10491	NC_014804	CAA	2	6	524504	524509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230376
10492	NC_014804	ACA	3	9	524530	524538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230376
10493	NC_014804	AG	3	6	524654	524659	50 %	0 %	50 %	0 %	315230376
10494	NC_014804	TTG	2	6	524684	524689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230376
10495	NC_014804	CAGTT	2	10	524708	524717	20 %	40 %	20 %	20 %	315230376
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10497	NC_014804	GAA	2	6	524812	524817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230376
10498	NC_014804	TGAT	2	8	524891	524898	25 %	50 %	25 %	0 %	315230376
10499	NC_014804	TGA	2	6	524925	524930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230376
10500	NC_014804	GTT	2	6	524969	524974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230377

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