MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014804	CATA	2	8	294271	294278	50 %	25 %	0 %	25 %	315230112
6002	NC_014804	AG	3	6	294307	294312	50 %	0 %	50 %	0 %	315230112
6003	NC_014804	TA	3	6	294364	294369	50 %	50 %	0 %	0 %	315230112
6004	NC_014804	GAA	2	6	294451	294456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230112
6005	NC_014804	AGG	2	6	294481	294486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230112
6006	NC_014804	CCT	3	9	294501	294509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_014804	CGG	2	6	294520	294525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_014804	TCAGC	2	10	294565	294574	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6009	NC_014804	GAA	2	6	294895	294900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230113
6010	NC_014804	GAAA	2	8	294923	294930	75 %	0 %	25 %	0 %	315230113
6011	NC_014804	CTTTC	2	10	294937	294946	0 %	60 %	0 %	40 %	315230113
6012	NC_014804	CAG	2	6	294976	294981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230113
6013	NC_014804	AG	3	6	294993	294998	50 %	0 %	50 %	0 %	315230113
6014	NC_014804	AG	4	8	295162	295169	50 %	0 %	50 %	0 %	315230113
6015	NC_014804	GA	3	6	295183	295188	50 %	0 %	50 %	0 %	315230113
6016	NC_014804	ATA	2	6	295195	295200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230113
6017	NC_014804	GAG	2	6	295264	295269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230113
6018	NC_014804	TGAA	2	8	295314	295321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_014804	GAC	2	6	295399	295404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230114
6020	NC_014804	AAATA	2	10	295409	295418	80 %	20 %	0 %	0 %	315230114
6021	NC_014804	TGT	2	6	295488	295493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230114
6022	NC_014804	GAA	2	6	295509	295514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230114
6023	NC_014804	TTG	2	6	295553	295558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230114
6024	NC_014804	TAG	2	6	295580	295585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230114
6025	NC_014804	CAC	2	6	295588	295593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230114
6026	NC_014804	CTT	2	6	295684	295689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230114
6027	NC_014804	GAA	2	6	295744	295749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230114
6028	NC_014804	TATTC	2	10	295870	295879	20 %	60 %	0 %	20 %	315230114
6029	NC_014804	TGA	2	6	295899	295904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230114
6030	NC_014804	GTT	2	6	295909	295914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230114
6031	NC_014804	TACC	2	8	295921	295928	25 %	25 %	0 %	50 %	315230114
6032	NC_014804	A	6	6	296021	296026	100 %	0 %	0 %	0 %	315230114
6033	NC_014804	GAA	2	6	296064	296069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230114
6034	NC_014804	AG	3	6	296120	296125	50 %	0 %	50 %	0 %	315230114
6035	NC_014804	AT	3	6	296140	296145	50 %	50 %	0 %	0 %	315230114
6036	NC_014804	TTG	2	6	296162	296167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230114
6037	NC_014804	A	6	6	296200	296205	100 %	0 %	0 %	0 %	315230114
6038	NC_014804	AAG	2	6	296243	296248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230114
6039	NC_014804	CAG	2	6	296252	296257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230114
6040	NC_014804	CATC	2	8	296328	296335	25 %	25 %	0 %	50 %	315230114
6041	NC_014804	GGCTG	2	10	296413	296422	0 %	20 %	60 %	20 %	315230114
6042	NC_014804	GAG	2	6	296457	296462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230114
6043	NC_014804	AG	3	6	296520	296525	50 %	0 %	50 %	0 %	315230114
6044	NC_014804	ACT	2	6	296621	296626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_014804	GAT	2	6	296703	296708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_014804	AAG	2	6	296731	296736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230115
6047	NC_014804	GAG	2	6	296785	296790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230115
6048	NC_014804	GAAG	2	8	296821	296828	50 %	0 %	50 %	0 %	315230115
6049	NC_014804	AGCA	2	8	296873	296880	50 %	0 %	25 %	25 %	315230115
6050	NC_014804	AG	3	6	296926	296931	50 %	0 %	50 %	0 %	315230115
6051	NC_014804	A	6	6	297064	297069	100 %	0 %	0 %	0 %	315230115
6052	NC_014804	GAG	2	6	297145	297150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230115
6053	NC_014804	TCAA	2	8	297212	297219	50 %	25 %	0 %	25 %	315230115
6054	NC_014804	TAC	2	6	297229	297234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230115
6055	NC_014804	AAT	2	6	297342	297347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230116
6056	NC_014804	TGA	2	6	297411	297416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230116
6057	NC_014804	AGA	2	6	297455	297460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230116
6058	NC_014804	TGA	2	6	297518	297523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230116
6059	NC_014804	TTCTTG	2	12	297551	297562	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	315230116
6060	NC_014804	GCAAGG	2	12	297571	297582	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	315230116
6061	NC_014804	G	6	6	297687	297692	0 %	0 %	100 %	0 %	315230116
6062	NC_014804	ATG	2	6	297740	297745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230116
6063	NC_014804	AGG	2	6	297760	297765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230116
6064	NC_014804	CCT	2	6	297771	297776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230116
6065	NC_014804	A	7	7	297808	297814	100 %	0 %	0 %	0 %	315230116
6066	NC_014804	GT	3	6	297919	297924	0 %	50 %	50 %	0 %	315230116
6067	NC_014804	GAG	2	6	297960	297965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230116
6068	NC_014804	GAT	2	6	297997	298002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230116
6069	NC_014804	TGG	2	6	298209	298214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230116
6070	NC_014804	ATC	2	6	298256	298261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230116
6071	NC_014804	GA	3	6	298262	298267	50 %	0 %	50 %	0 %	315230116
6072	NC_014804	AGT	2	6	298281	298286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230116
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6074	NC_014804	TCA	2	6	298325	298330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230116
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6076	NC_014804	G	6	6	298437	298442	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_014804	AAG	2	6	298473	298478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230117
6078	NC_014804	CA	3	6	298513	298518	50 %	0 %	0 %	50 %	315230117
6079	NC_014804	GGA	2	6	298638	298643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230117
6080	NC_014804	GA	3	6	298744	298749	50 %	0 %	50 %	0 %	315230117
6081	NC_014804	CAC	2	6	298766	298771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230117
6082	NC_014804	AGA	2	6	298837	298842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230117
6083	NC_014804	AAG	2	6	298857	298862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230117
6084	NC_014804	CTGT	2	8	298876	298883	0 %	50 %	25 %	25 %	315230117
6085	NC_014804	CGG	2	6	298891	298896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315230117
6086	NC_014804	TGA	2	6	298898	298903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230117
6087	NC_014804	TGT	2	6	298949	298954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230117
6088	NC_014804	GAAT	2	8	298959	298966	50 %	25 %	25 %	0 %	315230117
6089	NC_014804	CTTT	2	8	298967	298974	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_014804	T	6	6	298972	298977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_014804	GTAT	2	8	299038	299045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_014804	AT	3	6	299080	299085	50 %	50 %	0 %	0 %	315230118
6093	NC_014804	AGGA	2	8	299093	299100	50 %	0 %	50 %	0 %	315230118
6094	NC_014804	AAG	2	6	299285	299290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230119
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6096	NC_014804	CAC	2	6	299357	299362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230119
6097	NC_014804	TGGT	2	8	299415	299422	0 %	50 %	50 %	0 %	315230119
6098	NC_014804	AAG	2	6	299492	299497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230119
6099	NC_014804	TC	3	6	299571	299576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_014804	T	6	6	299603	299608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_014804	TCC	2	6	299672	299677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230120
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6105	NC_014804	ATGTTT	2	12	299908	299919	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	315230120
6106	NC_014804	TAG	2	6	299938	299943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230120
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6108	NC_014804	GTT	2	6	300078	300083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230121
6109	NC_014804	AG	3	6	300094	300099	50 %	0 %	50 %	0 %	315230121
6110	NC_014804	TGA	2	6	300131	300136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230121
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6120	NC_014804	AG	3	6	300453	300458	50 %	0 %	50 %	0 %	315230122
6121	NC_014804	GAA	3	9	300525	300533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230122
6122	NC_014804	CTT	2	6	300549	300554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230122
6123	NC_014804	GGAGA	2	10	300582	300591	40 %	0 %	60 %	0 %	315230122
6124	NC_014804	ATA	2	6	300663	300668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230122
6125	NC_014804	TCA	2	6	300673	300678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230122
6126	NC_014804	GGC	2	6	300704	300709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315230122
6127	NC_014804	GAG	2	6	300720	300725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230122
6128	NC_014804	TTG	2	6	300736	300741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230122
6129	NC_014804	GAAGA	2	10	300747	300756	60 %	0 %	40 %	0 %	315230122
6130	NC_014804	A	6	6	300756	300761	100 %	0 %	0 %	0 %	315230122
6131	NC_014804	TGA	2	6	300763	300768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230122
6132	NC_014804	CTC	2	6	300825	300830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230122
6133	NC_014804	GAT	2	6	300854	300859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230122
6134	NC_014804	CTT	2	6	300970	300975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230123
6135	NC_014804	CTC	2	6	300992	300997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230123
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6140	NC_014804	CAC	2	6	301231	301236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6141	NC_014804	ATA	2	6	301240	301245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6142	NC_014804	TAA	2	6	301257	301262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6143	NC_014804	GAG	2	6	301343	301348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230124
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6151	NC_014804	GAA	2	6	301929	301934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230125
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6155	NC_014804	GA	3	6	302153	302158	50 %	0 %	50 %	0 %	315230125
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6163	NC_014804	TTG	2	6	302696	302701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230126
6164	NC_014804	ACC	2	6	302784	302789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6165	NC_014804	TTA	2	6	302795	302800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6166	NC_014804	GAA	2	6	302828	302833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6167	NC_014804	GTGG	2	8	302939	302946	0 %	25 %	75 %	0 %	315230127
6168	NC_014804	A	7	7	302947	302953	100 %	0 %	0 %	0 %	315230127
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6179	NC_014804	TGT	2	6	303404	303409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6180	NC_014804	TA	3	6	303414	303419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6181	NC_014804	AAT	2	6	303479	303484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6182	NC_014804	TA	3	6	303510	303515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6183	NC_014804	AGG	2	6	303543	303548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6190	NC_014804	CTT	2	6	303837	303842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230128
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6192	NC_014804	GGA	2	6	303918	303923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230128
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6201	NC_014804	TGA	2	6	304286	304291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230129
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6209	NC_014804	A	6	6	304782	304787	100 %	0 %	0 %	0 %	315230129
6210	NC_014804	GTT	2	6	304972	304977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230130
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6217	NC_014804	GAC	2	6	305223	305228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230130
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6219	NC_014804	TTG	2	6	305290	305295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230130
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6221	NC_014804	ACT	2	6	305381	305386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230130
6222	NC_014804	AT	3	6	305392	305397	50 %	50 %	0 %	0 %	315230130
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6229	NC_014804	GTT	2	6	305499	305504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230131
6230	NC_014804	CGCT	2	8	305581	305588	0 %	25 %	25 %	50 %	315230131
6231	NC_014804	TTC	2	6	305598	305603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230131
6232	NC_014804	CTC	3	9	305673	305681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230131
6233	NC_014804	TAAA	2	8	305707	305714	75 %	25 %	0 %	0 %	315230131
6234	NC_014804	TAC	2	6	305967	305972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230131
6235	NC_014804	TGCT	2	8	305992	305999	0 %	50 %	25 %	25 %	315230131
6236	NC_014804	TAT	2	6	306046	306051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6237	NC_014804	GA	3	6	306128	306133	50 %	0 %	50 %	0 %	315230132
6238	NC_014804	CTG	3	9	306173	306181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230132
6239	NC_014804	AAAT	2	8	306216	306223	75 %	25 %	0 %	0 %	315230132
6240	NC_014804	TGGT	2	8	306362	306369	0 %	50 %	50 %	0 %	315230133
6241	NC_014804	TCA	2	6	306428	306433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230133
6242	NC_014804	AG	3	6	306475	306480	50 %	0 %	50 %	0 %	315230133
6243	NC_014804	CT	3	6	306525	306530	0 %	50 %	0 %	50 %	315230133
6244	NC_014804	GGA	2	6	306535	306540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230133
6245	NC_014804	GGT	2	6	306605	306610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230133
6246	NC_014804	CTG	2	6	306628	306633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230133
6247	NC_014804	GA	4	8	306684	306691	50 %	0 %	50 %	0 %	315230133
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6249	NC_014804	CAA	2	6	306764	306769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230133
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6495	NC_014804	CGT	2	6	320089	320094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230154
6496	NC_014804	AATC	2	8	320245	320252	50 %	25 %	0 %	25 %	315230154
6497	NC_014804	ACC	2	6	320352	320357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230154
6498	NC_014804	TCC	2	6	320371	320376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230154
6499	NC_014804	CAT	2	6	320389	320394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230154
6500	NC_014804	ATA	2	6	320463	320468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230154

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