MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 40132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014804	CTA	2	6	223113	223118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_014804	TTA	2	6	223137	223142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_014804	TC	3	6	223150	223155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4504	NC_014804	TAAA	2	8	223208	223215	75 %	25 %	0 %	0 %	315230033
4505	NC_014804	CTC	3	9	223231	223239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230033
4506	NC_014804	GAA	2	6	223243	223248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230033
4507	NC_014804	TGC	2	6	223286	223291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230033
4508	NC_014804	TTA	2	6	223330	223335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230033
4509	NC_014804	CTG	2	6	223343	223348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230033
4510	NC_014804	TGA	2	6	223399	223404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230033
4511	NC_014804	CTT	2	6	223406	223411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230033
4512	NC_014804	TCC	2	6	223442	223447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230033
4513	NC_014804	CCA	2	6	223470	223475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230033
4514	NC_014804	GTTG	2	8	223540	223547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_014804	TTTGA	2	10	223608	223617	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_014804	GAAA	2	8	223672	223679	75 %	0 %	25 %	0 %	315230034
4517	NC_014804	AAG	2	6	223689	223694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230034
4518	NC_014804	TCT	2	6	223717	223722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230034
4519	NC_014804	AG	3	6	223726	223731	50 %	0 %	50 %	0 %	315230034
4520	NC_014804	CAGT	2	8	223794	223801	25 %	25 %	25 %	25 %	315230034
4521	NC_014804	TAT	2	6	223889	223894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230034
4522	NC_014804	AGA	2	6	223924	223929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230034
4523	NC_014804	CTC	3	9	223983	223991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230035
4524	NC_014804	AT	3	6	224082	224087	50 %	50 %	0 %	0 %	315230035
4525	NC_014804	TGA	2	6	224150	224155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_014804	TCA	2	6	224306	224311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_014804	AAT	2	6	224343	224348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_014804	TGA	2	6	224396	224401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_014804	GAT	2	6	224403	224408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230036
4530	NC_014804	GAA	2	6	224426	224431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230036
4531	NC_014804	AG	3	6	224505	224510	50 %	0 %	50 %	0 %	315230036
4532	NC_014804	GAT	2	6	224548	224553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230036
4533	NC_014804	GGT	2	6	224589	224594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230036
4534	NC_014804	GGA	2	6	224599	224604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230036
4535	NC_014804	AGA	2	6	224610	224615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_014804	CTTT	2	8	224630	224637	0 %	75 %	0 %	25 %	315230037
4537	NC_014804	GGC	2	6	224684	224689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315230037
4538	NC_014804	CTC	2	6	224903	224908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230037
4539	NC_014804	GGC	2	6	224968	224973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315230037
4540	NC_014804	T	6	6	225318	225323	0 %	100 %	0 %	0 %	315230037
4541	NC_014804	TCT	2	6	225330	225335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230037
4542	NC_014804	CTT	3	9	225366	225374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230037
4543	NC_014804	CAA	2	6	225474	225479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230037
4544	NC_014804	CATCA	2	10	225526	225535	40 %	20 %	0 %	40 %	315230037
4545	NC_014804	TTC	3	9	225557	225565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230037
4546	NC_014804	CTA	2	6	225576	225581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230037
4547	NC_014804	CT	3	6	225611	225616	0 %	50 %	0 %	50 %	315230037
4548	NC_014804	TAG	2	6	225620	225625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230037
4549	NC_014804	TGG	2	6	225673	225678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230037
4550	NC_014804	ATT	2	6	225719	225724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230037
4551	NC_014804	AAC	2	6	225760	225765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230037
4552	NC_014804	CAA	2	6	225826	225831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230037
4553	NC_014804	GAT	2	6	225909	225914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_014804	TTA	2	6	225940	225945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_014804	AGCA	2	8	226001	226008	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4556	NC_014804	ATG	2	6	226018	226023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_014804	CTT	2	6	226085	226090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230038
4558	NC_014804	TCC	2	6	226115	226120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230038
4559	NC_014804	CTT	2	6	226130	226135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230038
4560	NC_014804	GCA	2	6	226233	226238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230038
4561	NC_014804	TCA	2	6	226324	226329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230038
4562	NC_014804	GCT	2	6	226365	226370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230038
4563	NC_014804	CTTT	2	8	226467	226474	0 %	75 %	0 %	25 %	315230038
4564	NC_014804	GGA	2	6	226586	226591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230038
4565	NC_014804	TTG	2	6	226608	226613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230038
4566	NC_014804	TCTT	2	8	226644	226651	0 %	75 %	0 %	25 %	315230038
4567	NC_014804	CTT	2	6	226677	226682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230038
4568	NC_014804	T	6	6	226685	226690	0 %	100 %	0 %	0 %	315230038
4569	NC_014804	CTT	2	6	226693	226698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230038
4570	NC_014804	TTC	2	6	226712	226717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230038
4571	NC_014804	TGG	2	6	226796	226801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315230038
4572	NC_014804	CTT	2	6	226834	226839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230038
4573	NC_014804	TGT	2	6	226975	226980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230038
4574	NC_014804	GA	3	6	227080	227085	50 %	0 %	50 %	0 %	315230038
4575	NC_014804	TTC	2	6	227123	227128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230038
4576	NC_014804	T	7	7	227134	227140	0 %	100 %	0 %	0 %	315230038
4577	NC_014804	TTC	2	6	227149	227154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230038
4578	NC_014804	TTA	2	6	227227	227232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230038
4579	NC_014804	TC	3	6	227322	227327	0 %	50 %	0 %	50 %	315230038
4580	NC_014804	TGT	2	6	227359	227364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230038
4581	NC_014804	CT	3	6	227374	227379	0 %	50 %	0 %	50 %	315230038
4582	NC_014804	GATGCT	2	12	227453	227464	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315230038
4583	NC_014804	T	7	7	227466	227472	0 %	100 %	0 %	0 %	315230038
4584	NC_014804	CT	4	8	227546	227553	0 %	50 %	0 %	50 %	315230038
4585	NC_014804	T	6	6	227603	227608	0 %	100 %	0 %	0 %	315230038
4586	NC_014804	ATT	2	6	227610	227615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230038
4587	NC_014804	GAA	2	6	227675	227680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230038
4588	NC_014804	ATT	2	6	227691	227696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230038
4589	NC_014804	C	6	6	227789	227794	0 %	0 %	0 %	100 %	315230038
4590	NC_014804	T	6	6	227877	227882	0 %	100 %	0 %	0 %	315230038
4591	NC_014804	GA	3	6	227946	227951	50 %	0 %	50 %	0 %	315230038
4592	NC_014804	AC	3	6	227992	227997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_014804	A	6	6	228056	228061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_014804	AATA	2	8	228063	228070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_014804	CTT	2	6	228146	228151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230039
4596	NC_014804	T	6	6	228210	228215	0 %	100 %	0 %	0 %	315230039
4597	NC_014804	GAA	3	9	228216	228224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230039
4598	NC_014804	GTT	2	6	228282	228287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230039
4599	NC_014804	C	6	6	228331	228336	0 %	0 %	0 %	100 %	315230039
4600	NC_014804	AGT	2	6	228410	228415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230039
4601	NC_014804	TGA	2	6	228477	228482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230039
4602	NC_014804	GTT	2	6	228490	228495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230039
4603	NC_014804	GTA	2	6	228504	228509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230039
4604	NC_014804	TTC	2	6	228517	228522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230039
4605	NC_014804	AGG	2	6	228553	228558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230039
4606	NC_014804	GCT	2	6	228565	228570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230039
4607	NC_014804	TAT	2	6	228588	228593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230039
4608	NC_014804	CTT	2	6	228613	228618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230039
4609	NC_014804	CTC	2	6	228696	228701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315230039
4610	NC_014804	CTT	2	6	228764	228769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230039
4611	NC_014804	GAA	2	6	228882	228887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315230039
4612	NC_014804	TGT	2	6	228890	228895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230039
4613	NC_014804	T	6	6	228930	228935	0 %	100 %	0 %	0 %	315230039
4614	NC_014804	ATAAC	2	10	228937	228946	60 %	20 %	0 %	20 %	315230039
4615	NC_014804	TCA	2	6	228955	228960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230039
4616	NC_014804	TCA	2	6	229033	229038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230039
4617	NC_014804	CTT	2	6	229097	229102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230039
4618	NC_014804	T	6	6	229125	229130	0 %	100 %	0 %	0 %	315230039
4619	NC_014804	CAT	2	6	229134	229139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230039
4620	NC_014804	CAT	2	6	229175	229180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230039
4621	NC_014804	TC	3	6	229232	229237	0 %	50 %	0 %	50 %	315230039
4622	NC_014804	AT	3	6	229320	229325	50 %	50 %	0 %	0 %	315230039
4623	NC_014804	ATTG	2	8	229408	229415	25 %	50 %	25 %	0 %	315230039
4624	NC_014804	TTTC	2	8	229496	229503	0 %	75 %	0 %	25 %	315230039
4625	NC_014804	CTG	2	6	229531	229536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315230039
4626	NC_014804	GGA	2	6	229605	229610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230039
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4631	NC_014804	T	6	6	229945	229950	0 %	100 %	0 %	0 %	315230039
4632	NC_014804	TC	4	8	230053	230060	0 %	50 %	0 %	50 %	315230039
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4642	NC_014804	T	6	6	230806	230811	0 %	100 %	0 %	0 %	315230040
4643	NC_014804	TCT	3	9	230817	230825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230040
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4645	NC_014804	TAAT	2	8	230907	230914	50 %	50 %	0 %	0 %	315230040
4646	NC_014804	A	7	7	230915	230921	100 %	0 %	0 %	0 %	315230040
4647	NC_014804	T	6	6	230960	230965	0 %	100 %	0 %	0 %	315230040
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4652	NC_014804	TTCT	2	8	231062	231069	0 %	75 %	0 %	25 %	315230041
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4658	NC_014804	ATT	2	6	231352	231357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315230041
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4672	NC_014804	ATA	2	6	232171	232176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4673	NC_014804	TA	3	6	232187	232192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4683	NC_014804	GCTG	2	8	232428	232435	0 %	25 %	50 %	25 %	315230042
4684	NC_014804	GA	3	6	232444	232449	50 %	0 %	50 %	0 %	315230042
4685	NC_014804	TGAAA	2	10	232451	232460	60 %	20 %	20 %	0 %	315230042
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4729	NC_014804	TGA	2	6	235037	235042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315230044
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4732	NC_014804	CATTG	2	10	235125	235134	20 %	40 %	20 %	20 %	315230044
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4734	NC_014804	TCT	2	6	235214	235219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230044
4735	NC_014804	CT	3	6	235311	235316	0 %	50 %	0 %	50 %	315230044
4736	NC_014804	AAT	2	6	235335	235340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315230044
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4745	NC_014804	A	6	6	235737	235742	100 %	0 %	0 %	0 %	315230045
4746	NC_014804	AGG	2	6	235747	235752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315230045
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4749	NC_014804	GTT	2	6	235937	235942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230045
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4764	NC_014804	TCC	2	6	236498	236503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4765	NC_014804	TCA	2	6	236511	236516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315230046
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4771	NC_014804	AT	3	6	236767	236772	50 %	50 %	0 %	0 %	315230046
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4865	NC_014804	AT	3	6	241559	241564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4866	NC_014804	TAA	2	6	241620	241625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4867	NC_014804	A	6	6	241631	241636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4868	NC_014804	TGAA	2	8	241659	241666	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4869	NC_014804	CTT	2	6	241732	241737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230052
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4872	NC_014804	ACA	2	6	241890	241895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315230052
4873	NC_014804	CCA	2	6	241899	241904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315230052
4874	NC_014804	CCG	2	6	241936	241941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315230052
4875	NC_014804	GGAGCT	2	12	241959	241970	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315230052
4876	NC_014804	GGTGCA	2	12	241971	241982	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315230052
4877	NC_014804	GTT	2	6	241986	241991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315230052
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4884	NC_014804	TTC	2	6	242297	242302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230052
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4889	NC_014804	CTT	2	6	242503	242508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230052
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4893	NC_014804	TTGT	2	8	242743	242750	0 %	75 %	25 %	0 %	315230052
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4902	NC_014804	CT	3	6	243263	243268	0 %	50 %	0 %	50 %	315230052
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4931	NC_014804	TGG	2	6	244578	244583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4996	NC_014804	A	7	7	247886	247892	100 %	0 %	0 %	0 %	315230056
4997	NC_014804	AAACC	2	10	247976	247985	60 %	0 %	0 %	40 %	315230056
4998	NC_014804	CTT	2	6	248163	248168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315230056
4999	NC_014804	CAG	2	6	248177	248182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230056
5000	NC_014804	GCA	2	6	248244	248249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315230056

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