MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 67185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014410	TAT	2	6	123268	123273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315645
3002	NC_014410	AAT	2	6	123295	123300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315645
3003	NC_014410	TTA	2	6	123314	123319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315645
3004	NC_014410	TGG	2	6	123426	123431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315645
3005	NC_014410	ACT	2	6	123524	123529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315645
3006	NC_014410	A	6	6	123607	123612	100 %	0 %	0 %	0 %	304315645
3007	NC_014410	TGA	2	6	123648	123653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315645
3008	NC_014410	GCT	2	6	123733	123738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315645
3009	NC_014410	AGA	2	6	123787	123792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315645
3010	NC_014410	TTA	2	6	123804	123809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315645
3011	NC_014410	ACG	2	6	123824	123829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315645
3012	NC_014410	A	6	6	123916	123921	100 %	0 %	0 %	0 %	304315645
3013	NC_014410	GTT	2	6	123926	123931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315645
3014	NC_014410	GCTTT	2	10	123932	123941	0 %	60 %	20 %	20 %	304315645
3015	NC_014410	TAA	2	6	123942	123947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315645
3016	NC_014410	GCAGT	2	10	123951	123960	20 %	20 %	40 %	20 %	304315645
3017	NC_014410	TAC	2	6	123971	123976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315645
3018	NC_014410	AAC	2	6	124035	124040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315645
3019	NC_014410	TAGTT	2	10	124066	124075	20 %	60 %	20 %	0 %	304315645
3020	NC_014410	CA	3	6	124105	124110	50 %	0 %	0 %	50 %	304315645
3021	NC_014410	GCT	2	6	124172	124177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315645
3022	NC_014410	GGA	2	6	124202	124207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315645
3023	NC_014410	TA	3	6	124213	124218	50 %	50 %	0 %	0 %	304315645
3024	NC_014410	T	6	6	124226	124231	0 %	100 %	0 %	0 %	304315645
3025	NC_014410	GAT	2	6	124325	124330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315645
3026	NC_014410	A	6	6	124351	124356	100 %	0 %	0 %	0 %	304315645
3027	NC_014410	TTA	2	6	124357	124362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315645
3028	NC_014410	ATA	2	6	124373	124378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315645
3029	NC_014410	AT	3	6	124399	124404	50 %	50 %	0 %	0 %	304315645
3030	NC_014410	TGATAC	2	12	124419	124430	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	304315645
3031	NC_014410	ATGG	2	8	124461	124468	25 %	25 %	50 %	0 %	304315646
3032	NC_014410	AGG	2	6	124512	124517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315646
3033	NC_014410	TCC	2	6	124572	124577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315646
3034	NC_014410	ATG	2	6	124595	124600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315646
3035	NC_014410	ATT	2	6	124608	124613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315646
3036	NC_014410	A	6	6	124622	124627	100 %	0 %	0 %	0 %	304315646
3037	NC_014410	TGC	2	6	124653	124658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304315646
3038	NC_014410	AT	5	10	124659	124668	50 %	50 %	0 %	0 %	304315646
3039	NC_014410	T	7	7	124695	124701	0 %	100 %	0 %	0 %	304315646
3040	NC_014410	CAA	2	6	124778	124783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315646
3041	NC_014410	GTAT	2	8	124868	124875	25 %	50 %	25 %	0 %	304315646
3042	NC_014410	GTT	2	6	124923	124928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315646
3043	NC_014410	A	6	6	124984	124989	100 %	0 %	0 %	0 %	304315646
3044	NC_014410	ATT	2	6	125054	125059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315646
3045	NC_014410	T	6	6	125132	125137	0 %	100 %	0 %	0 %	304315646
3046	NC_014410	ATA	2	6	125204	125209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315646
3047	NC_014410	GTG	2	6	125275	125280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315646
3048	NC_014410	A	6	6	125346	125351	100 %	0 %	0 %	0 %	304315647
3049	NC_014410	GA	3	6	125452	125457	50 %	0 %	50 %	0 %	304315647
3050	NC_014410	A	7	7	125525	125531	100 %	0 %	0 %	0 %	304315647
3051	NC_014410	ATG	2	6	125560	125565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315647
3052	NC_014410	GTT	2	6	125581	125586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315647
3053	NC_014410	GGA	2	6	125611	125616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315647
3054	NC_014410	TTAGG	2	10	125791	125800	20 %	40 %	40 %	0 %	304315647
3055	NC_014410	A	6	6	125850	125855	100 %	0 %	0 %	0 %	304315648
3056	NC_014410	A	6	6	125862	125867	100 %	0 %	0 %	0 %	304315648
3057	NC_014410	ATG	3	9	125872	125880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315648
3058	NC_014410	ATA	2	6	125931	125936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315648
3059	NC_014410	TA	3	6	125935	125940	50 %	50 %	0 %	0 %	304315648
3060	NC_014410	ATA	2	6	125965	125970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315648
3061	NC_014410	TTG	3	9	126082	126090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315648
3062	NC_014410	GGC	2	6	126096	126101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304315648
3063	NC_014410	GA	3	6	126115	126120	50 %	0 %	50 %	0 %	304315648
3064	NC_014410	ATA	2	6	126153	126158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315648
3065	NC_014410	AGA	2	6	126159	126164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315648
3066	NC_014410	GGT	2	6	126171	126176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315648
3067	NC_014410	GCA	2	6	126213	126218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315649
3068	NC_014410	GTT	2	6	126271	126276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315649
3069	NC_014410	A	8	8	126329	126336	100 %	0 %	0 %	0 %	304315649
3070	NC_014410	TGT	2	6	126357	126362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315649
3071	NC_014410	GA	3	6	126364	126369	50 %	0 %	50 %	0 %	304315649
3072	NC_014410	ATT	2	6	126404	126409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315649
3073	NC_014410	AGA	2	6	126578	126583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315649
3074	NC_014410	ATT	2	6	126622	126627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315649
3075	NC_014410	TAG	2	6	126638	126643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315649
3076	NC_014410	AGC	2	6	126713	126718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315649
3077	NC_014410	ATG	2	6	126731	126736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315649
3078	NC_014410	AG	3	6	126762	126767	50 %	0 %	50 %	0 %	304315649
3079	NC_014410	AGA	2	6	126795	126800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315649
3080	NC_014410	AAC	2	6	126864	126869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315649
3081	NC_014410	GAAA	2	8	126954	126961	75 %	0 %	25 %	0 %	304315649
3082	NC_014410	CCG	2	6	127042	127047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304315649
3083	NC_014410	TAT	2	6	127096	127101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315649
3084	NC_014410	TATTGA	2	12	127217	127228	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304315649
3085	NC_014410	GA	3	6	127255	127260	50 %	0 %	50 %	0 %	304315649
3086	NC_014410	T	6	6	127313	127318	0 %	100 %	0 %	0 %	304315650
3087	NC_014410	AG	3	6	127362	127367	50 %	0 %	50 %	0 %	304315650
3088	NC_014410	TGA	2	6	127410	127415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315650
3089	NC_014410	T	6	6	127421	127426	0 %	100 %	0 %	0 %	304315650
3090	NC_014410	AG	3	6	127439	127444	50 %	0 %	50 %	0 %	304315650
3091	NC_014410	GT	3	6	127509	127514	0 %	50 %	50 %	0 %	304315650
3092	NC_014410	GCG	2	6	127520	127525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304315650
3093	NC_014410	ACA	2	6	127598	127603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315650
3094	NC_014410	GAT	2	6	127621	127626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315650
3095	NC_014410	A	6	6	127702	127707	100 %	0 %	0 %	0 %	304315651
3096	NC_014410	GAA	2	6	127765	127770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315651
3097	NC_014410	AGC	2	6	127927	127932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315651
3098	NC_014410	GT	3	6	127934	127939	0 %	50 %	50 %	0 %	304315651
3099	NC_014410	ACA	2	6	128041	128046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315652
3100	NC_014410	GAAA	2	8	128079	128086	75 %	0 %	25 %	0 %	304315652
3101	NC_014410	CAT	2	6	128102	128107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315652
3102	NC_014410	CAGGTA	2	12	128116	128127	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	304315652
3103	NC_014410	TGT	2	6	128240	128245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315652
3104	NC_014410	TAAA	2	8	128290	128297	75 %	25 %	0 %	0 %	304315652
3105	NC_014410	ATT	2	6	128330	128335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315652
3106	NC_014410	ATTTG	2	10	128353	128362	20 %	60 %	20 %	0 %	304315652
3107	NC_014410	TGGCAA	2	12	128398	128409	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	304315652
3108	NC_014410	TGA	2	6	128423	128428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315652
3109	NC_014410	TAA	2	6	128480	128485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315652
3110	NC_014410	TAA	2	6	128513	128518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315652
3111	NC_014410	ATG	2	6	128530	128535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315652
3112	NC_014410	TCA	2	6	128577	128582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315652
3113	NC_014410	CAAT	2	8	128633	128640	50 %	25 %	0 %	25 %	304315652
3114	NC_014410	AT	3	6	128639	128644	50 %	50 %	0 %	0 %	304315652
3115	NC_014410	GCAAA	2	10	128645	128654	60 %	0 %	20 %	20 %	304315652
3116	NC_014410	CAT	2	6	128748	128753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315653
3117	NC_014410	ATTT	2	8	128800	128807	25 %	75 %	0 %	0 %	304315653
3118	NC_014410	TCC	2	6	128824	128829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315653
3119	NC_014410	TGA	2	6	128845	128850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315653
3120	NC_014410	GAT	2	6	128915	128920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315653
3121	NC_014410	GT	3	6	128949	128954	0 %	50 %	50 %	0 %	304315653
3122	NC_014410	AAATG	2	10	128968	128977	60 %	20 %	20 %	0 %	304315653
3123	NC_014410	ATA	2	6	128988	128993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315653
3124	NC_014410	TAT	2	6	129046	129051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315653
3125	NC_014410	A	6	6	129089	129094	100 %	0 %	0 %	0 %	304315653
3126	NC_014410	CAAATG	2	12	129207	129218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	304315653
3127	NC_014410	AGA	2	6	129241	129246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315653
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3129	NC_014410	GGAAA	2	10	129340	129349	60 %	0 %	40 %	0 %	304315653
3130	NC_014410	ATG	2	6	129377	129382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315653
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3132	NC_014410	GAT	2	6	129422	129427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315653
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3144	NC_014410	CTAA	2	8	129848	129855	50 %	25 %	0 %	25 %	304315653
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3231	NC_014410	ATCA	2	8	133611	133618	50 %	25 %	0 %	25 %	304315657
3232	NC_014410	T	6	6	133620	133625	0 %	100 %	0 %	0 %	304315657
3233	NC_014410	ATT	2	6	133661	133666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3234	NC_014410	TA	4	8	133672	133679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_014410	TTGA	2	8	133735	133742	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_014410	GAT	2	6	133781	133786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315658
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3239	NC_014410	TTG	2	6	133935	133940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315658
3240	NC_014410	TGA	2	6	134014	134019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315658
3241	NC_014410	AAG	2	6	134057	134062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315658
3242	NC_014410	TTG	2	6	134166	134171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315658
3243	NC_014410	A	6	6	134241	134246	100 %	0 %	0 %	0 %	304315658
3244	NC_014410	A	6	6	134262	134267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_014410	A	6	6	134317	134322	100 %	0 %	0 %	0 %	304315659
3246	NC_014410	GAT	2	6	134337	134342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315659
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3497	NC_014410	ATT	2	6	145186	145191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315664
3498	NC_014410	AAT	2	6	145210	145215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315664
3499	NC_014410	AAT	2	6	145300	145305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315664
3500	NC_014410	T	6	6	145331	145336	0 %	100 %	0 %	0 %	304315664

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