MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 67185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_014410	T	6	6	672623	672628	0 %	100 %	0 %	0 %	304316158
16003	NC_014410	A	7	7	672775	672781	100 %	0 %	0 %	0 %	304316158
16004	NC_014410	GAA	2	6	672785	672790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316158
16005	NC_014410	GAA	2	6	672845	672850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316158
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16007	NC_014410	CAT	2	6	673076	673081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316158
16008	NC_014410	GAA	2	6	673121	673126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316158
16009	NC_014410	TG	3	6	673164	673169	0 %	50 %	50 %	0 %	304316158
16010	NC_014410	AAG	2	6	673182	673187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316158
16011	NC_014410	ATG	2	6	673251	673256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316158
16012	NC_014410	GCT	2	6	673268	673273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316158
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16014	NC_014410	TTCT	2	8	673321	673328	0 %	75 %	0 %	25 %	304316158
16015	NC_014410	GAA	2	6	673349	673354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316158
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16017	NC_014410	TTG	2	6	673497	673502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316158
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16025	NC_014410	A	6	6	673721	673726	100 %	0 %	0 %	0 %	304316158
16026	NC_014410	GAA	2	6	673775	673780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316158
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16029	NC_014410	AT	3	6	673921	673926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_014410	ATTG	2	8	673932	673939	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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16033	NC_014410	TAATG	2	10	674089	674098	40 %	40 %	20 %	0 %	304316159
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16056	NC_014410	TGGA	2	8	675124	675131	25 %	25 %	50 %	0 %	304316159
16057	NC_014410	ATC	2	6	675222	675227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316159
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16061	NC_014410	TAA	2	6	675387	675392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_014410	AGA	2	6	675449	675454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_014410	T	7	7	675501	675507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_014410	TCT	2	6	675549	675554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16065	NC_014410	A	6	6	675565	675570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16108	NC_014410	TTTA	2	8	677168	677175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16110	NC_014410	AT	4	8	677195	677202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16247	NC_014410	TGC	2	6	683130	683135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316164
16248	NC_014410	AAG	2	6	683250	683255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316164
16249	NC_014410	GAT	2	6	683308	683313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316164
16250	NC_014410	AGA	2	6	683412	683417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316164
16251	NC_014410	GAA	2	6	683513	683518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316164
16252	NC_014410	GCATG	2	10	683520	683529	20 %	20 %	40 %	20 %	304316164
16253	NC_014410	TGA	2	6	683544	683549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316164
16254	NC_014410	AAAT	2	8	683579	683586	75 %	25 %	0 %	0 %	304316164
16255	NC_014410	AT	3	6	683613	683618	50 %	50 %	0 %	0 %	304316164
16256	NC_014410	GAA	2	6	683620	683625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316164
16257	NC_014410	GAA	2	6	683635	683640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316164
16258	NC_014410	AAG	2	6	683665	683670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316164
16259	NC_014410	TA	3	6	683677	683682	50 %	50 %	0 %	0 %	304316164
16260	NC_014410	TGA	2	6	683697	683702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316164
16261	NC_014410	TGC	2	6	683715	683720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316164
16262	NC_014410	AAG	2	6	683740	683745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316164
16263	NC_014410	ATG	2	6	683827	683832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316164
16264	NC_014410	GCA	2	6	683833	683838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316164
16265	NC_014410	GCA	2	6	683869	683874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316164
16266	NC_014410	GTC	2	6	683884	683889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316164
16267	NC_014410	GCA	2	6	683905	683910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316164
16268	NC_014410	TGA	2	6	683981	683986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316164
16269	NC_014410	AG	3	6	684049	684054	50 %	0 %	50 %	0 %	304316164
16270	NC_014410	TCC	2	6	684078	684083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304316164
16271	NC_014410	AGT	2	6	684087	684092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316164
16272	NC_014410	GAA	2	6	684193	684198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316164
16273	NC_014410	GAA	2	6	684201	684206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316164
16274	NC_014410	ATGG	2	8	684263	684270	25 %	25 %	50 %	0 %	304316164
16275	NC_014410	TGG	2	6	684279	684284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304316164
16276	NC_014410	CAT	2	6	684289	684294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316164
16277	NC_014410	ACT	2	6	684316	684321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316164
16278	NC_014410	TTA	2	6	684346	684351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316164
16279	NC_014410	CAG	2	6	684459	684464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316165
16280	NC_014410	CTT	2	6	684474	684479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304316165
16281	NC_014410	GATG	2	8	684505	684512	25 %	25 %	50 %	0 %	304316165
16282	NC_014410	GAT	2	6	684566	684571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316165
16283	NC_014410	TAA	2	6	684606	684611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316165
16284	NC_014410	AATA	2	8	684622	684629	75 %	25 %	0 %	0 %	304316165
16285	NC_014410	GAT	2	6	684632	684637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316165
16286	NC_014410	A	7	7	684685	684691	100 %	0 %	0 %	0 %	304316165
16287	NC_014410	AAATC	2	10	684725	684734	60 %	20 %	0 %	20 %	304316165
16288	NC_014410	CAT	2	6	684761	684766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316165
16289	NC_014410	GCA	2	6	684767	684772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316165
16290	NC_014410	TAAA	2	8	684792	684799	75 %	25 %	0 %	0 %	304316165
16291	NC_014410	CGAGG	2	10	684812	684821	20 %	0 %	60 %	20 %	304316165
16292	NC_014410	TGG	2	6	684838	684843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304316165
16293	NC_014410	ACTG	2	8	684938	684945	25 %	25 %	25 %	25 %	304316165
16294	NC_014410	CAG	2	6	684990	684995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316165
16295	NC_014410	T	6	6	685043	685048	0 %	100 %	0 %	0 %	304316165
16296	NC_014410	GTA	2	6	685076	685081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316165
16297	NC_014410	AT	4	8	685101	685108	50 %	50 %	0 %	0 %	304316165
16298	NC_014410	TTGCTG	2	12	685176	685187	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	304316165
16299	NC_014410	CAG	2	6	685377	685382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316165
16300	NC_014410	AT	3	6	685389	685394	50 %	50 %	0 %	0 %	304316165
16301	NC_014410	AGA	2	6	685423	685428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316165
16302	NC_014410	AAG	2	6	685437	685442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316165
16303	NC_014410	AGAA	2	8	685447	685454	75 %	0 %	25 %	0 %	304316165
16304	NC_014410	CTT	2	6	685517	685522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304316165
16305	NC_014410	GAA	2	6	685613	685618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316165
16306	NC_014410	ATA	2	6	685664	685669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316165
16307	NC_014410	TGG	2	6	685717	685722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304316165
16308	NC_014410	A	7	7	685731	685737	100 %	0 %	0 %	0 %	304316165
16309	NC_014410	AAATC	2	10	685793	685802	60 %	20 %	0 %	20 %	304316165
16310	NC_014410	GCG	2	6	685820	685825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304316165
16311	NC_014410	GCA	2	6	685841	685846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316165
16312	NC_014410	GGAAA	2	10	685847	685856	60 %	0 %	40 %	0 %	304316165
16313	NC_014410	AGC	2	6	685882	685887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316165
16314	NC_014410	AGACA	2	10	685909	685918	60 %	0 %	20 %	20 %	304316165
16315	NC_014410	CTC	2	6	685976	685981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304316165
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16318	NC_014410	A	6	6	686026	686031	100 %	0 %	0 %	0 %	304316165
16319	NC_014410	GGT	2	6	686041	686046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304316165
16320	NC_014410	AAC	2	6	686068	686073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304316165
16321	NC_014410	TA	3	6	686077	686082	50 %	50 %	0 %	0 %	304316165
16322	NC_014410	ATG	2	6	686091	686096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316166
16323	NC_014410	TGACAA	2	12	686116	686127	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	304316166
16324	NC_014410	GTC	2	6	686166	686171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316166
16325	NC_014410	GAT	2	6	686196	686201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316166
16326	NC_014410	GTT	2	6	686220	686225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316166
16327	NC_014410	TGT	2	6	686243	686248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316166
16328	NC_014410	ATG	2	6	686311	686316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316166
16329	NC_014410	GCA	2	6	686361	686366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316166
16330	NC_014410	AT	3	6	686483	686488	50 %	50 %	0 %	0 %	304316166
16331	NC_014410	TGA	2	6	686509	686514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316166
16332	NC_014410	AGC	2	6	686552	686557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316166
16333	NC_014410	AGA	2	6	686579	686584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316166
16334	NC_014410	GTT	2	6	686609	686614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316166
16335	NC_014410	GAA	2	6	686643	686648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316166
16336	NC_014410	AGG	2	6	686745	686750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16337	NC_014410	CAG	2	6	686799	686804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316167
16338	NC_014410	AGA	2	6	686836	686841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316167
16339	NC_014410	GTA	2	6	686848	686853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316167
16340	NC_014410	AATG	2	8	686922	686929	50 %	25 %	25 %	0 %	304316167
16341	NC_014410	TGTT	2	8	687041	687048	0 %	75 %	25 %	0 %	304316167
16342	NC_014410	GCG	2	6	687049	687054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304316167
16343	NC_014410	TA	3	6	687154	687159	50 %	50 %	0 %	0 %	304316167
16344	NC_014410	AGA	2	6	687183	687188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316167
16345	NC_014410	TGATA	2	10	687195	687204	40 %	40 %	20 %	0 %	304316167
16346	NC_014410	ATA	2	6	687256	687261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316167
16347	NC_014410	AAT	2	6	687376	687381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316167
16348	NC_014410	GAT	2	6	687388	687393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316167
16349	NC_014410	TGG	2	6	687453	687458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304316167
16350	NC_014410	A	7	7	687509	687515	100 %	0 %	0 %	0 %	304316167
16351	NC_014410	TAA	2	6	687546	687551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316167
16352	NC_014410	AGC	2	6	687612	687617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316167
16353	NC_014410	AT	4	8	687647	687654	50 %	50 %	0 %	0 %	304316167
16354	NC_014410	ACT	2	6	687705	687710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316167
16355	NC_014410	CAA	2	6	687717	687722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304316167
16356	NC_014410	CAG	2	6	687816	687821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316167
16357	NC_014410	ATG	2	6	687826	687831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316167
16358	NC_014410	ATT	2	6	687870	687875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316167
16359	NC_014410	CAG	2	6	687965	687970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316167
16360	NC_014410	GCA	2	6	688034	688039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316167
16361	NC_014410	AG	3	6	688057	688062	50 %	0 %	50 %	0 %	304316167
16362	NC_014410	GC	3	6	688066	688071	0 %	0 %	50 %	50 %	304316167
16363	NC_014410	CAT	2	6	688108	688113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316167
16364	NC_014410	GCT	2	6	688153	688158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316167
16365	NC_014410	GAT	2	6	688177	688182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316167
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16490	NC_014410	AAT	2	6	692783	692788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16491	NC_014410	T	7	7	692829	692835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16492	NC_014410	TTA	2	6	692850	692855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16493	NC_014410	A	6	6	692864	692869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16494	NC_014410	GTA	2	6	692880	692885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16495	NC_014410	TTA	2	6	692891	692896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16496	NC_014410	AATG	2	8	692904	692911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16497	NC_014410	TG	3	6	692921	692926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16498	NC_014410	TAC	2	6	692937	692942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316174
16499	NC_014410	GAA	2	6	692959	692964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316174
16500	NC_014410	CAT	2	6	692991	692996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316174

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