MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 67185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_014410	A	6	6	649954	649959	100 %	0 %	0 %	0 %	304316142
15502	NC_014410	GAA	2	6	650098	650103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316142
15503	NC_014410	AGT	2	6	650171	650176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_014410	TTTA	2	8	650202	650209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_014410	AGG	2	6	650220	650225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_014410	AAT	2	6	650250	650255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316143
15507	NC_014410	CAT	2	6	650281	650286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316143
15508	NC_014410	GTA	2	6	650317	650322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316143
15509	NC_014410	AAG	2	6	650363	650368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316143
15510	NC_014410	GAA	2	6	650413	650418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316143
15511	NC_014410	ATA	2	6	650545	650550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316143
15512	NC_014410	AAT	2	6	650566	650571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316143
15513	NC_014410	GTA	2	6	650572	650577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316143
15514	NC_014410	TAA	2	6	650616	650621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316143
15515	NC_014410	A	6	6	650626	650631	100 %	0 %	0 %	0 %	304316143
15516	NC_014410	GATT	2	8	650696	650703	25 %	50 %	25 %	0 %	304316143
15517	NC_014410	GGA	2	6	650711	650716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304316143
15518	NC_014410	GCG	2	6	650729	650734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304316143
15519	NC_014410	TA	3	6	650780	650785	50 %	50 %	0 %	0 %	304316143
15520	NC_014410	AGT	2	6	650799	650804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316143
15521	NC_014410	TAAA	2	8	650834	650841	75 %	25 %	0 %	0 %	304316143
15522	NC_014410	GAC	2	6	650848	650853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316143
15523	NC_014410	TGA	2	6	650867	650872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316143
15524	NC_014410	GTA	2	6	650968	650973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316143
15525	NC_014410	GAT	2	6	650974	650979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316143
15526	NC_014410	TAG	2	6	651041	651046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316143
15527	NC_014410	GAC	2	6	651048	651053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316143
15528	NC_014410	GACC	2	8	651059	651066	25 %	0 %	25 %	50 %	304316143
15529	NC_014410	AGA	2	6	651087	651092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316143
15530	NC_014410	A	6	6	651207	651212	100 %	0 %	0 %	0 %	304316143
15531	NC_014410	AAT	2	6	651222	651227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316143
15532	NC_014410	GCTTAA	2	12	651301	651312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15533	NC_014410	TCA	2	6	651316	651321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15534	NC_014410	AGGA	2	8	651339	651346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_014410	ATG	2	6	651419	651424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316144
15536	NC_014410	ATGA	2	8	651493	651500	50 %	25 %	25 %	0 %	304316144
15537	NC_014410	AGA	2	6	651519	651524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316144
15538	NC_014410	TTTGAT	2	12	651550	651561	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	304316144
15539	NC_014410	GAA	2	6	651568	651573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316144
15540	NC_014410	TGA	2	6	651576	651581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316144
15541	NC_014410	ATA	2	6	651694	651699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316144
15542	NC_014410	TCAT	2	8	651732	651739	25 %	50 %	0 %	25 %	304316144
15543	NC_014410	ATC	2	6	651789	651794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316144
15544	NC_014410	TA	3	6	651892	651897	50 %	50 %	0 %	0 %	304316144
15545	NC_014410	TTC	2	6	651931	651936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304316144
15546	NC_014410	AAG	2	6	651953	651958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316144
15547	NC_014410	ATC	2	6	651990	651995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316144
15548	NC_014410	ATG	2	6	652037	652042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316144
15549	NC_014410	GAA	2	6	652055	652060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316144
15550	NC_014410	ACA	2	6	652157	652162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304316144
15551	NC_014410	TGAAT	2	10	652200	652209	40 %	40 %	20 %	0 %	304316144
15552	NC_014410	TTTC	2	8	652336	652343	0 %	75 %	0 %	25 %	304316144
15553	NC_014410	TAC	2	6	652363	652368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316144
15554	NC_014410	AATATG	2	12	652396	652407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	304316144
15555	NC_014410	GGC	2	6	652423	652428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304316144
15556	NC_014410	ATG	2	6	652451	652456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316144
15557	NC_014410	TGA	2	6	652461	652466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316144
15558	NC_014410	CAG	2	6	652537	652542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316144
15559	NC_014410	AGA	2	6	652551	652556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316144
15560	NC_014410	CAA	2	6	652614	652619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304316144
15561	NC_014410	ACA	2	6	652625	652630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304316144
15562	NC_014410	TGG	2	6	652645	652650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304316144
15563	NC_014410	AGA	2	6	652923	652928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316144
15564	NC_014410	AT	3	6	652935	652940	50 %	50 %	0 %	0 %	304316144
15565	NC_014410	A	7	7	653082	653088	100 %	0 %	0 %	0 %	304316144
15566	NC_014410	TAT	2	6	653188	653193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316144
15567	NC_014410	TAT	2	6	653215	653220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316144
15568	NC_014410	T	6	6	653230	653235	0 %	100 %	0 %	0 %	304316144
15569	NC_014410	AT	3	6	653250	653255	50 %	50 %	0 %	0 %	304316144
15570	NC_014410	CGG	2	6	653268	653273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304316144
15571	NC_014410	CAG	2	6	653302	653307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316144
15572	NC_014410	GA	3	6	653365	653370	50 %	0 %	50 %	0 %	304316144
15573	NC_014410	TGT	2	6	653400	653405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316144
15574	NC_014410	ATG	2	6	653420	653425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316144
15575	NC_014410	GA	3	6	653497	653502	50 %	0 %	50 %	0 %	304316144
15576	NC_014410	CGT	2	6	653523	653528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316144
15577	NC_014410	TGA	2	6	653547	653552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316144
15578	NC_014410	A	6	6	653552	653557	100 %	0 %	0 %	0 %	304316144
15579	NC_014410	TAACA	2	10	653613	653622	60 %	20 %	0 %	20 %	304316144
15580	NC_014410	ACG	2	6	653696	653701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316144
15581	NC_014410	AT	3	6	653785	653790	50 %	50 %	0 %	0 %	304316144
15582	NC_014410	ATAG	2	8	653817	653824	50 %	25 %	25 %	0 %	304316144
15583	NC_014410	TAA	2	6	653831	653836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_014410	TCATA	2	10	653871	653880	40 %	40 %	0 %	20 %	304316145
15585	NC_014410	TA	3	6	653916	653921	50 %	50 %	0 %	0 %	304316145
15586	NC_014410	TCA	2	6	653929	653934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316145
15587	NC_014410	TAT	3	9	653940	653948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316145
15588	NC_014410	CTTT	2	8	653978	653985	0 %	75 %	0 %	25 %	304316145
15589	NC_014410	TGT	2	6	654005	654010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316145
15590	NC_014410	AT	3	6	654016	654021	50 %	50 %	0 %	0 %	304316145
15591	NC_014410	TCT	2	6	654022	654027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304316145
15592	NC_014410	TA	3	6	654033	654038	50 %	50 %	0 %	0 %	304316145
15593	NC_014410	T	6	6	654047	654052	0 %	100 %	0 %	0 %	304316145
15594	NC_014410	TAT	2	6	654093	654098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316145
15595	NC_014410	AGC	2	6	654103	654108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316145
15596	NC_014410	ATC	3	9	654111	654119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316145
15597	NC_014410	TCAT	2	8	654295	654302	25 %	50 %	0 %	25 %	304316145
15598	NC_014410	GAT	2	6	654337	654342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316145
15599	NC_014410	T	7	7	654383	654389	0 %	100 %	0 %	0 %	304316145
15600	NC_014410	ATT	2	6	654456	654461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316145
15601	NC_014410	TTA	2	6	654542	654547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316145
15602	NC_014410	TGT	2	6	654563	654568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316145
15603	NC_014410	ATTG	2	8	654586	654593	25 %	50 %	25 %	0 %	304316145
15604	NC_014410	TGG	2	6	654641	654646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304316145
15605	NC_014410	CTA	2	6	654746	654751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316145
15606	NC_014410	TTG	2	6	654874	654879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316145
15607	NC_014410	ATT	2	6	654922	654927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316145
15608	NC_014410	TCT	2	6	655006	655011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304316145
15609	NC_014410	T	7	7	655043	655049	0 %	100 %	0 %	0 %	304316145
15610	NC_014410	TTG	2	6	655129	655134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316145
15611	NC_014410	AAG	2	6	655203	655208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316145
15612	NC_014410	CTGT	2	8	655231	655238	0 %	50 %	25 %	25 %	304316145
15613	NC_014410	TAT	2	6	655245	655250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316145
15614	NC_014410	TCT	2	6	655252	655257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304316145
15615	NC_014410	TGTT	2	8	655279	655286	0 %	75 %	25 %	0 %	304316145
15616	NC_014410	AT	3	6	655305	655310	50 %	50 %	0 %	0 %	304316145
15617	NC_014410	TAT	2	6	655407	655412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316145
15618	NC_014410	A	6	6	655479	655484	100 %	0 %	0 %	0 %	304316145
15619	NC_014410	CTTT	2	8	655547	655554	0 %	75 %	0 %	25 %	304316145
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15993	NC_014410	AT	4	8	672316	672323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15994	NC_014410	TATT	2	8	672350	672357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15995	NC_014410	T	6	6	672376	672381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15996	NC_014410	TGT	2	6	672424	672429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316158
15997	NC_014410	A	6	6	672443	672448	100 %	0 %	0 %	0 %	304316158
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