MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 67185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014410	TAA	2	6	40958	40963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315573
1002	NC_014410	TAA	2	6	40995	41000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315573
1003	NC_014410	TTGC	2	8	41020	41027	0 %	50 %	25 %	25 %	304315573
1004	NC_014410	AAG	2	6	41031	41036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315573
1005	NC_014410	T	6	6	41045	41050	0 %	100 %	0 %	0 %	304315573
1006	NC_014410	GAAA	2	8	41102	41109	75 %	0 %	25 %	0 %	304315573
1007	NC_014410	TAA	2	6	41112	41117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315573
1008	NC_014410	GAC	2	6	41130	41135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315573
1009	NC_014410	TAT	2	6	41192	41197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315573
1010	NC_014410	CTT	2	6	41214	41219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315573
1011	NC_014410	ATA	2	6	41224	41229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315573
1012	NC_014410	ATA	2	6	41260	41265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315573
1013	NC_014410	ATA	2	6	41285	41290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315573
1014	NC_014410	ATA	2	6	41338	41343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315573
1015	NC_014410	TA	4	8	41433	41440	50 %	50 %	0 %	0 %	304315573
1016	NC_014410	ATA	2	6	41447	41452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315573
1017	NC_014410	AATT	3	12	41463	41474	50 %	50 %	0 %	0 %	304315573
1018	NC_014410	TA	3	6	41476	41481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014410	TTAA	2	8	41512	41519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014410	ATT	2	6	41540	41545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014410	TAG	2	6	41568	41573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014410	AGT	2	6	41661	41666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014410	AGT	2	6	41713	41718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014410	CAT	2	6	41798	41803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_014410	ATA	2	6	41902	41907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014410	A	6	6	41974	41979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014410	AG	3	6	41986	41991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014410	AGAAA	2	10	42006	42015	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014410	ATC	2	6	42102	42107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_014410	ACAA	2	8	42123	42130	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_014410	AGA	2	6	42213	42218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_014410	T	6	6	42285	42290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014410	A	6	6	42301	42306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014410	AAT	2	6	42313	42318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014410	TC	3	6	42329	42334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_014410	AG	4	8	42377	42384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014410	A	6	6	42435	42440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014410	TCA	2	6	42441	42446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_014410	TAG	2	6	42568	42573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_014410	AGAA	2	8	42578	42585	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014410	AGA	2	6	42602	42607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_014410	ATA	2	6	42644	42649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014410	TAA	2	6	42654	42659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_014410	AAT	2	6	42711	42716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_014410	TTC	2	6	42737	42742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_014410	GATA	2	8	42776	42783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014410	CCT	2	6	42813	42818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_014410	TAT	2	6	42835	42840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014410	ATA	2	6	42841	42846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014410	CAA	2	6	42850	42855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_014410	GGA	2	6	42860	42865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014410	AGG	2	6	42946	42951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014410	CCT	2	6	43136	43141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_014410	AGG	2	6	43146	43151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014410	GAAG	2	8	43267	43274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014410	TGA	2	6	43295	43300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014410	AT	3	6	43396	43401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_014410	CAG	2	6	43509	43514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_014410	AAGG	2	8	43547	43554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014410	AGG	2	6	43565	43570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014410	CAA	2	6	43620	43625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_014410	TCAA	2	8	43639	43646	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_014410	AG	4	8	43661	43668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014410	ATC	2	6	43685	43690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_014410	AGA	2	6	43704	43709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014410	AGT	2	6	43787	43792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014410	GATGG	2	10	43818	43827	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014410	CAA	2	6	43878	43883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_014410	GGAA	2	8	43889	43896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014410	GGA	2	6	43944	43949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014410	ACT	2	6	43955	43960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_014410	AGAC	2	8	43979	43986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_014410	ACA	2	6	43991	43996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_014410	AT	3	6	44105	44110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_014410	GTA	2	6	44130	44135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_014410	ATTA	2	8	44247	44254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_014410	ATT	2	6	44345	44350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_014410	CATATA	2	12	44358	44369	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1079	NC_014410	GTT	2	6	44459	44464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_014410	GAA	2	6	44529	44534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_014410	AT	3	6	44544	44549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_014410	ATT	2	6	44553	44558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315575
1083	NC_014410	T	6	6	44610	44615	0 %	100 %	0 %	0 %	304315575
1084	NC_014410	CTTT	2	8	44618	44625	0 %	75 %	0 %	25 %	304315575
1085	NC_014410	AATT	2	8	44658	44665	50 %	50 %	0 %	0 %	304315575
1086	NC_014410	AT	3	6	44692	44697	50 %	50 %	0 %	0 %	304315575
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1089	NC_014410	AAT	2	6	44802	44807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315575
1090	NC_014410	TAAT	2	8	44859	44866	50 %	50 %	0 %	0 %	304315575
1091	NC_014410	ATA	2	6	44880	44885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315575
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1098	NC_014410	AAG	2	6	45162	45167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315575
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1100	NC_014410	T	6	6	45232	45237	0 %	100 %	0 %	0 %	304315575
1101	NC_014410	TA	3	6	45271	45276	50 %	50 %	0 %	0 %	304315575
1102	NC_014410	TCACA	2	10	45300	45309	40 %	20 %	0 %	40 %	304315575
1103	NC_014410	ATA	2	6	45340	45345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315575
1104	NC_014410	CTT	2	6	45366	45371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_014410	TTTCT	2	10	45396	45405	0 %	80 %	0 %	20 %	304315576
1106	NC_014410	TCTTA	2	10	45406	45415	20 %	60 %	0 %	20 %	304315576
1107	NC_014410	TTGT	2	8	45444	45451	0 %	75 %	25 %	0 %	304315576
1108	NC_014410	AT	3	6	45476	45481	50 %	50 %	0 %	0 %	304315576
1109	NC_014410	ATA	2	6	45502	45507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315576
1110	NC_014410	T	6	6	45558	45563	0 %	100 %	0 %	0 %	304315576
1111	NC_014410	TCT	2	6	45629	45634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315576
1112	NC_014410	TGA	2	6	45700	45705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315576
1113	NC_014410	TGA	2	6	45716	45721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315576
1114	NC_014410	AT	3	6	45734	45739	50 %	50 %	0 %	0 %	304315576
1115	NC_014410	CATAA	2	10	45870	45879	60 %	20 %	0 %	20 %	304315576
1116	NC_014410	ATG	2	6	45891	45896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315576
1117	NC_014410	CAA	2	6	45942	45947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315576
1118	NC_014410	T	6	6	45982	45987	0 %	100 %	0 %	0 %	304315576
1119	NC_014410	TTA	2	6	46041	46046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315576
1120	NC_014410	TGA	2	6	46051	46056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315576
1121	NC_014410	ATC	2	6	46057	46062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315576
1122	NC_014410	TCT	2	6	46089	46094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315576
1123	NC_014410	AT	3	6	46125	46130	50 %	50 %	0 %	0 %	304315576
1124	NC_014410	GATT	2	8	46291	46298	25 %	50 %	25 %	0 %	304315576
1125	NC_014410	TCT	2	6	46306	46311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315576
1126	NC_014410	CAT	2	6	46350	46355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315576
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1129	NC_014410	AT	3	6	46517	46522	50 %	50 %	0 %	0 %	304315576
1130	NC_014410	T	6	6	46593	46598	0 %	100 %	0 %	0 %	304315576
1131	NC_014410	CAT	2	6	46605	46610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315576
1132	NC_014410	CCT	2	6	46627	46632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_014410	TAT	2	6	46648	46653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014410	ATG	2	6	46664	46669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014410	GA	3	6	46692	46697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1402	NC_014410	ATA	2	6	57251	57256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1403	NC_014410	ATG	2	6	57273	57278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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