MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 67185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014410	ATG	3	9	546944	546952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316053
13002	NC_014410	TA	3	6	546983	546988	50 %	50 %	0 %	0 %	304316053
13003	NC_014410	GGC	2	6	547035	547040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304316053
13004	NC_014410	T	6	6	547051	547056	0 %	100 %	0 %	0 %	304316053
13005	NC_014410	T	6	6	547060	547065	0 %	100 %	0 %	0 %	304316053
13006	NC_014410	TAG	2	6	547089	547094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316053
13007	NC_014410	TAT	2	6	547142	547147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316053
13008	NC_014410	ATAAG	2	10	547194	547203	60 %	20 %	20 %	0 %	304316053
13009	NC_014410	TAG	2	6	547212	547217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316053
13010	NC_014410	GAA	2	6	547235	547240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316053
13011	NC_014410	ATT	2	6	547317	547322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316053
13012	NC_014410	CCT	2	6	547325	547330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304316053
13013	NC_014410	AGG	2	6	547367	547372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304316053
13014	NC_014410	CAA	2	6	547380	547385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304316053
13015	NC_014410	AT	3	6	547432	547437	50 %	50 %	0 %	0 %	304316053
13016	NC_014410	TAC	2	6	547438	547443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316053
13017	NC_014410	CCA	2	6	547479	547484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304316053
13018	NC_014410	TTG	2	6	547590	547595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316053
13019	NC_014410	AT	3	6	547597	547602	50 %	50 %	0 %	0 %	304316053
13020	NC_014410	AAG	2	6	547614	547619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316053
13021	NC_014410	GGAT	2	8	547663	547670	25 %	25 %	50 %	0 %	304316053
13022	NC_014410	A	6	6	547705	547710	100 %	0 %	0 %	0 %	304316053
13023	NC_014410	A	7	7	547712	547718	100 %	0 %	0 %	0 %	304316053
13024	NC_014410	GGAT	2	8	547819	547826	25 %	25 %	50 %	0 %	304316053
13025	NC_014410	ATTC	2	8	547854	547861	25 %	50 %	0 %	25 %	304316053
13026	NC_014410	AAGA	2	8	547895	547902	75 %	0 %	25 %	0 %	304316053
13027	NC_014410	AAT	2	6	547931	547936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316053
13028	NC_014410	AGA	2	6	548005	548010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316053
13029	NC_014410	A	7	7	548027	548033	100 %	0 %	0 %	0 %	304316053
13030	NC_014410	TTG	2	6	548085	548090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316053
13031	NC_014410	AAG	2	6	548122	548127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316053
13032	NC_014410	T	6	6	548133	548138	0 %	100 %	0 %	0 %	304316053
13033	NC_014410	TAT	2	6	548180	548185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316053
13034	NC_014410	TTTG	2	8	548188	548195	0 %	75 %	25 %	0 %	304316053
13035	NC_014410	AGGCA	2	10	548202	548211	40 %	0 %	40 %	20 %	304316053
13036	NC_014410	TATAGC	2	12	548221	548232	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	304316053
13037	NC_014410	A	7	7	548233	548239	100 %	0 %	0 %	0 %	304316053
13038	NC_014410	ATT	2	6	548292	548297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316053
13039	NC_014410	GAA	2	6	548359	548364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316053
13040	NC_014410	TCA	2	6	548403	548408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316053
13041	NC_014410	A	6	6	548417	548422	100 %	0 %	0 %	0 %	304316053
13042	NC_014410	AGAT	2	8	548592	548599	50 %	25 %	25 %	0 %	304316053
13043	NC_014410	TGT	2	6	548608	548613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316053
13044	NC_014410	A	7	7	548623	548629	100 %	0 %	0 %	0 %	304316053
13045	NC_014410	GATT	2	8	548674	548681	25 %	50 %	25 %	0 %	304316053
13046	NC_014410	A	6	6	548708	548713	100 %	0 %	0 %	0 %	304316053
13047	NC_014410	CAC	2	6	548741	548746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304316053
13048	NC_014410	ATAA	2	8	548780	548787	75 %	25 %	0 %	0 %	304316053
13049	NC_014410	TTCA	2	8	548808	548815	25 %	50 %	0 %	25 %	304316053
13050	NC_014410	TA	3	6	548822	548827	50 %	50 %	0 %	0 %	304316053
13051	NC_014410	AG	4	8	548851	548858	50 %	0 %	50 %	0 %	304316053
13052	NC_014410	TGC	2	6	548874	548879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316053
13053	NC_014410	AGA	2	6	548884	548889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316053
13054	NC_014410	GAA	2	6	548927	548932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316053
13055	NC_014410	TTC	2	6	548970	548975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304316053
13056	NC_014410	TC	3	6	548989	548994	0 %	50 %	0 %	50 %	304316053
13057	NC_014410	A	6	6	549044	549049	100 %	0 %	0 %	0 %	304316053
13058	NC_014410	TAC	2	6	549133	549138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316053
13059	NC_014410	AGT	2	6	549187	549192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316053
13060	NC_014410	AAG	2	6	549221	549226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316053
13061	NC_014410	TAG	2	6	549310	549315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316053
13062	NC_014410	TAA	2	6	549397	549402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316053
13063	NC_014410	GTT	2	6	549403	549408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316053
13064	NC_014410	TGATA	2	10	549436	549445	40 %	40 %	20 %	0 %	304316053
13065	NC_014410	AGA	2	6	549455	549460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316053
13066	NC_014410	ATC	2	6	549478	549483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304316053
13067	NC_014410	GCT	2	6	549491	549496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316053
13068	NC_014410	GACA	2	8	549547	549554	50 %	0 %	25 %	25 %	304316053
13069	NC_014410	CAGA	2	8	549609	549616	50 %	0 %	25 %	25 %	304316053
13070	NC_014410	GTCCT	2	10	549636	549645	0 %	40 %	20 %	40 %	304316053
13071	NC_014410	CTG	2	6	549717	549722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316053
13072	NC_014410	CAG	2	6	549869	549874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316053
13073	NC_014410	TGC	2	6	549876	549881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316053
13074	NC_014410	ATA	2	6	549887	549892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316053
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13076	NC_014410	GAG	2	6	550019	550024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304316053
13077	NC_014410	CTG	2	6	550043	550048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316053
13078	NC_014410	GGA	2	6	550065	550070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304316053
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13081	NC_014410	ACA	2	6	550176	550181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304316053
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13088	NC_014410	A	7	7	550365	550371	100 %	0 %	0 %	0 %	304316053
13089	NC_014410	TGG	2	6	550423	550428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304316053
13090	NC_014410	ATGG	2	8	550436	550443	25 %	25 %	50 %	0 %	304316053
13091	NC_014410	TA	3	6	550635	550640	50 %	50 %	0 %	0 %	304316053
13092	NC_014410	GAT	2	6	550646	550651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316053
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13094	NC_014410	CATT	2	8	550730	550737	25 %	50 %	0 %	25 %	304316053
13095	NC_014410	AATG	2	8	550789	550796	50 %	25 %	25 %	0 %	304316053
13096	NC_014410	GCG	2	6	550836	550841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304316053
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13100	NC_014410	GCT	2	6	550948	550953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316053
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13102	NC_014410	TGC	2	6	551137	551142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304316053
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13105	NC_014410	ATA	2	6	551234	551239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304316053
13106	NC_014410	ATT	2	6	551241	551246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316053
13107	NC_014410	AAG	2	6	551268	551273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316053
13108	NC_014410	TTG	2	6	551307	551312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304316053
13109	NC_014410	TCAG	2	8	551419	551426	25 %	25 %	25 %	25 %	304316053
13110	NC_014410	AAG	2	6	551535	551540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316053
13111	NC_014410	TGG	2	6	551555	551560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304316053
13112	NC_014410	TCT	2	6	551605	551610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304316053
13113	NC_014410	T	6	6	551683	551688	0 %	100 %	0 %	0 %	304316053
13114	NC_014410	GAA	2	6	551693	551698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316053
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13117	NC_014410	CATT	2	8	551792	551799	25 %	50 %	0 %	25 %	304316053
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13121	NC_014410	TATG	2	8	551908	551915	25 %	50 %	25 %	0 %	304316053
13122	NC_014410	GAT	2	6	551993	551998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304316053
13123	NC_014410	ATGG	2	8	552021	552028	25 %	25 %	50 %	0 %	304316053
13124	NC_014410	AATG	2	8	552092	552099	50 %	25 %	25 %	0 %	304316053
13125	NC_014410	GCA	2	6	552128	552133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304316053
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13209	NC_014410	TTA	2	6	555289	555294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13212	NC_014410	ATA	2	6	555380	555385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13213	NC_014410	TGG	2	6	555474	555479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304316057
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13231	NC_014410	TTAA	2	8	556388	556395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13232	NC_014410	ATA	2	6	556429	556434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13233	NC_014410	TAT	2	6	556480	556485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316058
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13235	NC_014410	T	6	6	556618	556623	0 %	100 %	0 %	0 %	304316058
13236	NC_014410	AAATA	2	10	556629	556638	80 %	20 %	0 %	0 %	304316058
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13240	NC_014410	AAAG	2	8	556859	556866	75 %	0 %	25 %	0 %	304316058
13241	NC_014410	ATT	2	6	556895	556900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304316058
13242	NC_014410	AGATT	2	10	556904	556913	40 %	40 %	20 %	0 %	304316058
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13366	NC_014410	A	6	6	562231	562236	100 %	0 %	0 %	0 %	304316064
13367	NC_014410	AGA	2	6	562257	562262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304316064
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13426	NC_014410	T	8	8	564311	564318	0 %	100 %	0 %	0 %	304316067
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13479	NC_014410	TTA	2	6	566312	566317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13480	NC_014410	AT	3	6	566349	566354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13481	NC_014410	ATGTA	2	10	566358	566367	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13482	NC_014410	ATTA	2	8	566386	566393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13499	NC_014410	AT	3	6	567364	567369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_014410	A	6	6	567388	567393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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