MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 67185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
67001	NC_014410	TAC	2	6	2778802	2778807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67002	NC_014410	TA	4	8	2778809	2778816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67003	NC_014410	ACA	2	6	2778821	2778826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67004	NC_014410	TCC	2	6	2778837	2778842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67005	NC_014410	ATT	2	6	2778852	2778857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67006	NC_014410	T	6	6	2778867	2778872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67007	NC_014410	AT	4	8	2778973	2778980	50 %	50 %	0 %	0 %	304318130
67008	NC_014410	TTGT	2	8	2779030	2779037	0 %	75 %	25 %	0 %	304318130
67009	NC_014410	CCA	2	6	2779076	2779081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304318130
67010	NC_014410	AAT	2	6	2779150	2779155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318130
67011	NC_014410	TCT	2	6	2779169	2779174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318130
67012	NC_014410	TCC	2	6	2779214	2779219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304318130
67013	NC_014410	CCA	2	6	2779226	2779231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304318130
67014	NC_014410	TAA	2	6	2779293	2779298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318130
67015	NC_014410	TAA	2	6	2779315	2779320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318130
67016	NC_014410	T	6	6	2779370	2779375	0 %	100 %	0 %	0 %	304318131
67017	NC_014410	AATT	2	8	2779377	2779384	50 %	50 %	0 %	0 %	304318131
67018	NC_014410	AAT	2	6	2779446	2779451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318131
67019	NC_014410	ATT	2	6	2779515	2779520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318131
67020	NC_014410	AT	3	6	2779610	2779615	50 %	50 %	0 %	0 %	304318131
67021	NC_014410	AT	3	6	2779643	2779648	50 %	50 %	0 %	0 %	304318131
67022	NC_014410	TCT	2	6	2779684	2779689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318131
67023	NC_014410	TAT	2	6	2779701	2779706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318131
67024	NC_014410	CAT	2	6	2779712	2779717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318131
67025	NC_014410	CTT	2	6	2779761	2779766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318131
67026	NC_014410	GCACCT	2	12	2779834	2779845	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	304318131
67027	NC_014410	TAT	2	6	2779851	2779856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318131
67028	NC_014410	A	6	6	2779906	2779911	100 %	0 %	0 %	0 %	304318131
67029	NC_014410	ACA	3	9	2779918	2779926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304318131
67030	NC_014410	TTC	2	6	2779932	2779937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318131
67031	NC_014410	T	6	6	2779958	2779963	0 %	100 %	0 %	0 %	304318131
67032	NC_014410	ATTCC	2	10	2779965	2779974	20 %	40 %	0 %	40 %	304318131
67033	NC_014410	AGA	3	9	2779975	2779983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304318131
67034	NC_014410	ATA	2	6	2779986	2779991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318131
67035	NC_014410	TTA	2	6	2780051	2780056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318131
67036	NC_014410	TCTT	2	8	2780071	2780078	0 %	75 %	0 %	25 %	304318131
67037	NC_014410	ATCT	2	8	2780083	2780090	25 %	50 %	0 %	25 %	304318132
67038	NC_014410	AT	3	6	2780120	2780125	50 %	50 %	0 %	0 %	304318132
67039	NC_014410	CAG	2	6	2780126	2780131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304318132
67040	NC_014410	TGCCT	2	10	2780194	2780203	0 %	40 %	20 %	40 %	304318132
67041	NC_014410	ATC	2	6	2780223	2780228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318132
67042	NC_014410	TA	3	6	2780301	2780306	50 %	50 %	0 %	0 %	304318132
67043	NC_014410	TCTGC	2	10	2780333	2780342	0 %	40 %	20 %	40 %	304318132
67044	NC_014410	CAT	2	6	2780345	2780350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318132
67045	NC_014410	AATC	2	8	2780399	2780406	50 %	25 %	0 %	25 %	304318132
67046	NC_014410	T	7	7	2780546	2780552	0 %	100 %	0 %	0 %	304318132
67047	NC_014410	TCA	2	6	2780575	2780580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318132
67048	NC_014410	TCA	2	6	2780710	2780715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318132
67049	NC_014410	TA	3	6	2780727	2780732	50 %	50 %	0 %	0 %	304318132
67050	NC_014410	ATCT	2	8	2780741	2780748	25 %	50 %	0 %	25 %	304318132
67051	NC_014410	CT	3	6	2780760	2780765	0 %	50 %	0 %	50 %	304318132
67052	NC_014410	AGC	2	6	2780781	2780786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304318132
67053	NC_014410	GCA	2	6	2780812	2780817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304318132
67054	NC_014410	ACCTG	2	10	2780845	2780854	20 %	20 %	20 %	40 %	304318132
67055	NC_014410	A	6	6	2780856	2780861	100 %	0 %	0 %	0 %	304318132
67056	NC_014410	TACA	2	8	2781030	2781037	50 %	25 %	0 %	25 %	304318132
67057	NC_014410	TTCC	2	8	2781049	2781056	0 %	50 %	0 %	50 %	304318132
67058	NC_014410	AAC	2	6	2781102	2781107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304318132
67059	NC_014410	TCT	2	6	2781112	2781117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318132
67060	NC_014410	CAC	2	6	2781155	2781160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304318132
67061	NC_014410	GTG	2	6	2781167	2781172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304318132
67062	NC_014410	CTA	2	6	2781208	2781213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318132
67063	NC_014410	ATTT	2	8	2781249	2781256	25 %	75 %	0 %	0 %	304318132
67064	NC_014410	T	6	6	2781284	2781289	0 %	100 %	0 %	0 %	304318132
67065	NC_014410	T	6	6	2781330	2781335	0 %	100 %	0 %	0 %	304318132
67066	NC_014410	TCA	2	6	2781368	2781373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318132
67067	NC_014410	TC	3	6	2781387	2781392	0 %	50 %	0 %	50 %	304318132
67068	NC_014410	AAAC	2	8	2781420	2781427	75 %	0 %	0 %	25 %	304318132
67069	NC_014410	ACC	2	6	2781435	2781440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304318132
67070	NC_014410	TTC	2	6	2781467	2781472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318132
67071	NC_014410	T	6	6	2781529	2781534	0 %	100 %	0 %	0 %	304318132
67072	NC_014410	TTCAC	2	10	2781547	2781556	20 %	40 %	0 %	40 %	304318132
67073	NC_014410	CAA	2	6	2781575	2781580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304318132
67074	NC_014410	T	7	7	2781647	2781653	0 %	100 %	0 %	0 %	304318132
67075	NC_014410	CAG	2	6	2781680	2781685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304318132
67076	NC_014410	C	6	6	2781751	2781756	0 %	0 %	0 %	100 %	304318132
67077	NC_014410	TC	3	6	2781767	2781772	0 %	50 %	0 %	50 %	304318132
67078	NC_014410	CCT	2	6	2781796	2781801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304318132
67079	NC_014410	GCT	2	6	2781889	2781894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304318132
67080	NC_014410	CAT	2	6	2781929	2781934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318132
67081	NC_014410	GCA	2	6	2782053	2782058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304318133
67082	NC_014410	AAGAC	2	10	2782109	2782118	60 %	0 %	20 %	20 %	304318133
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67085	NC_014410	GAT	2	6	2782257	2782262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304318133
67086	NC_014410	TA	3	6	2782268	2782273	50 %	50 %	0 %	0 %	304318133
67087	NC_014410	TTC	2	6	2782288	2782293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318133
67088	NC_014410	TTTA	2	8	2782331	2782338	25 %	75 %	0 %	0 %	304318133
67089	NC_014410	ATC	2	6	2782358	2782363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318133
67090	NC_014410	CTTC	2	8	2782387	2782394	0 %	50 %	0 %	50 %	304318133
67091	NC_014410	CAAAAA	2	12	2782414	2782425	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	304318133
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67102	NC_014410	TCCT	2	8	2782690	2782697	0 %	50 %	0 %	50 %	304318133
67103	NC_014410	TGA	2	6	2782703	2782708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304318133
67104	NC_014410	TAA	2	6	2782712	2782717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318133
67105	NC_014410	TCA	2	6	2782719	2782724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318133
67106	NC_014410	T	6	6	2782740	2782745	0 %	100 %	0 %	0 %	304318133
67107	NC_014410	TCA	2	6	2782788	2782793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318133
67108	NC_014410	AT	3	6	2782813	2782818	50 %	50 %	0 %	0 %	304318133
67109	NC_014410	ATTT	2	8	2782853	2782860	25 %	75 %	0 %	0 %	304318133
67110	NC_014410	TATT	2	8	2782896	2782903	25 %	75 %	0 %	0 %	304318133
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67113	NC_014410	CT	3	6	2782981	2782986	0 %	50 %	0 %	50 %	304318133
67114	NC_014410	T	6	6	2783022	2783027	0 %	100 %	0 %	0 %	304318133
67115	NC_014410	ACC	2	6	2783063	2783068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304318133
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.