MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 67185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_014410	GTTCT	2	10	2648953	2648962	0 %	60 %	20 %	20 %	304318010
64003	NC_014410	AT	3	6	2648986	2648991	50 %	50 %	0 %	0 %	304318010
64004	NC_014410	TC	3	6	2649029	2649034	0 %	50 %	0 %	50 %	304318010
64005	NC_014410	ATTT	2	8	2649115	2649122	25 %	75 %	0 %	0 %	304318010
64006	NC_014410	AATT	2	8	2649162	2649169	50 %	50 %	0 %	0 %	304318010
64007	NC_014410	AGT	2	6	2649287	2649292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304318010
64008	NC_014410	TAA	2	6	2649317	2649322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318010
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64010	NC_014410	AT	3	6	2649353	2649358	50 %	50 %	0 %	0 %	304318010
64011	NC_014410	T	6	6	2649380	2649385	0 %	100 %	0 %	0 %	304318010
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64015	NC_014410	T	6	6	2649571	2649576	0 %	100 %	0 %	0 %	304318010
64016	NC_014410	TA	3	6	2649583	2649588	50 %	50 %	0 %	0 %	304318010
64017	NC_014410	CAA	2	6	2649601	2649606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304318010
64018	NC_014410	GGC	2	6	2649625	2649630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304318010
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64022	NC_014410	TTTC	2	8	2649696	2649703	0 %	75 %	0 %	25 %	304318010
64023	NC_014410	T	7	7	2649719	2649725	0 %	100 %	0 %	0 %	304318010
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64038	NC_014410	T	6	6	2650428	2650433	0 %	100 %	0 %	0 %	304318011
64039	NC_014410	AGG	2	6	2650541	2650546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304318011
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64041	NC_014410	AT	4	8	2650613	2650620	50 %	50 %	0 %	0 %	304318011
64042	NC_014410	ATA	2	6	2650675	2650680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64043	NC_014410	TCG	2	6	2650755	2650760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304318012
64044	NC_014410	ACC	2	6	2650791	2650796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304318012
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64049	NC_014410	T	7	7	2650962	2650968	0 %	100 %	0 %	0 %	304318012
64050	NC_014410	ACT	2	6	2650977	2650982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318012
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64052	NC_014410	TA	3	6	2651156	2651161	50 %	50 %	0 %	0 %	304318012
64053	NC_014410	TA	3	6	2651222	2651227	50 %	50 %	0 %	0 %	304318012
64054	NC_014410	TGT	2	6	2651309	2651314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304318012
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64056	NC_014410	TC	3	6	2651415	2651420	0 %	50 %	0 %	50 %	304318012
64057	NC_014410	TCG	2	6	2651520	2651525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304318012
64058	NC_014410	CAT	2	6	2651578	2651583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318012
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64071	NC_014410	TCTG	2	8	2652196	2652203	0 %	50 %	25 %	25 %	304318013
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64073	NC_014410	TTAT	2	8	2652242	2652249	25 %	75 %	0 %	0 %	304318013
64074	NC_014410	T	6	6	2652306	2652311	0 %	100 %	0 %	0 %	304318013
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64093	NC_014410	CTGT	3	12	2653202	2653213	0 %	50 %	25 %	25 %	304318013
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64099	NC_014410	ATT	2	6	2653382	2653387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318013
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64101	NC_014410	AGC	2	6	2653413	2653418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304318014
64102	NC_014410	AGT	2	6	2653452	2653457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304318014
64103	NC_014410	CAT	2	6	2653491	2653496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318014
64104	NC_014410	AT	3	6	2653612	2653617	50 %	50 %	0 %	0 %	304318014
64105	NC_014410	CTT	2	6	2653627	2653632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318014
64106	NC_014410	TTA	2	6	2653640	2653645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318014
64107	NC_014410	TAA	2	6	2653685	2653690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318014
64108	NC_014410	TAG	2	6	2653716	2653721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304318014
64109	NC_014410	TAC	2	6	2653729	2653734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318014
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64112	NC_014410	GAT	2	6	2653886	2653891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304318014
64113	NC_014410	GGC	2	6	2653907	2653912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304318014
64114	NC_014410	TCT	2	6	2653928	2653933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318014
64115	NC_014410	T	7	7	2653933	2653939	0 %	100 %	0 %	0 %	304318014
64116	NC_014410	AAT	2	6	2653976	2653981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318014
64117	NC_014410	TGT	3	9	2654049	2654057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304318014
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64119	NC_014410	A	10	10	2654195	2654204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64238	NC_014410	TTGTCC	2	12	2660152	2660163	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	304318022
64239	NC_014410	T	7	7	2660167	2660173	0 %	100 %	0 %	0 %	304318022
64240	NC_014410	TC	3	6	2660297	2660302	0 %	50 %	0 %	50 %	304318022
64241	NC_014410	TGTCTT	2	12	2660373	2660384	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	304318022
64242	NC_014410	TTTA	2	8	2660392	2660399	25 %	75 %	0 %	0 %	304318022
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64244	NC_014410	AACTTT	2	12	2660432	2660443	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304318022
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64253	NC_014410	TA	3	6	2660772	2660777	50 %	50 %	0 %	0 %	304318022
64254	NC_014410	TAT	2	6	2660788	2660793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318022
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64267	NC_014410	TA	3	6	2661235	2661240	50 %	50 %	0 %	0 %	304318022
64268	NC_014410	T	6	6	2661264	2661269	0 %	100 %	0 %	0 %	304318023
64269	NC_014410	CAT	2	6	2661273	2661278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318023
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64275	NC_014410	T	6	6	2661522	2661527	0 %	100 %	0 %	0 %	304318023
64276	NC_014410	TTA	2	6	2661567	2661572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318023
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64281	NC_014410	TTGT	2	8	2661815	2661822	0 %	75 %	25 %	0 %	304318023
64282	NC_014410	AT	3	6	2661855	2661860	50 %	50 %	0 %	0 %	304318023
64283	NC_014410	T	6	6	2661881	2661886	0 %	100 %	0 %	0 %	304318023
64284	NC_014410	TTAT	2	8	2661917	2661924	25 %	75 %	0 %	0 %	304318023
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64289	NC_014410	T	8	8	2662036	2662043	0 %	100 %	0 %	0 %	304318023
64290	NC_014410	GTA	2	6	2662084	2662089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304318023
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64294	NC_014410	TTC	3	9	2662243	2662251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318023
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64297	NC_014410	CTTT	2	8	2662419	2662426	0 %	75 %	0 %	25 %	304318023
64298	NC_014410	A	7	7	2662530	2662536	100 %	0 %	0 %	0 %	304318023
64299	NC_014410	TTG	2	6	2662539	2662544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304318023
64300	NC_014410	T	6	6	2662625	2662630	0 %	100 %	0 %	0 %	304318024
64301	NC_014410	CTA	2	6	2662691	2662696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318024
64302	NC_014410	TAA	2	6	2662698	2662703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304318024
64303	NC_014410	GGT	2	6	2662810	2662815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304318024
64304	NC_014410	T	7	7	2662829	2662835	0 %	100 %	0 %	0 %	304318024
64305	NC_014410	TCA	2	6	2662861	2662866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318024
64306	NC_014410	CTTTGA	2	12	2662894	2662905	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	304318024
64307	NC_014410	AATG	2	8	2662909	2662916	50 %	25 %	25 %	0 %	304318024
64308	NC_014410	A	7	7	2663066	2663072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64309	NC_014410	A	7	7	2663089	2663095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64310	NC_014410	TA	3	6	2663129	2663134	50 %	50 %	0 %	0 %	304318025
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64312	NC_014410	CTGG	2	8	2663177	2663184	0 %	25 %	50 %	25 %	304318025
64313	NC_014410	T	6	6	2663242	2663247	0 %	100 %	0 %	0 %	304318025
64314	NC_014410	CTT	2	6	2663286	2663291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318025
64315	NC_014410	T	6	6	2663290	2663295	0 %	100 %	0 %	0 %	304318025
64316	NC_014410	CAT	2	6	2663320	2663325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318025
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64319	NC_014410	CT	4	8	2663442	2663449	0 %	50 %	0 %	50 %	304318025
64320	NC_014410	CT	3	6	2663470	2663475	0 %	50 %	0 %	50 %	304318025
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64327	NC_014410	TCC	2	6	2664006	2664011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304318026
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64330	NC_014410	TCT	2	6	2664043	2664048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318026
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64332	NC_014410	ATCT	2	8	2664132	2664139	25 %	50 %	0 %	25 %	304318026
64333	NC_014410	TAT	2	6	2664225	2664230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318026
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64339	NC_014410	TCC	2	6	2664775	2664780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304318027
64340	NC_014410	GT	3	6	2664826	2664831	0 %	50 %	50 %	0 %	304318027
64341	NC_014410	CAT	2	6	2664899	2664904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318027
64342	NC_014410	GTA	2	6	2664905	2664910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304318027
64343	NC_014410	TCG	2	6	2664921	2664926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304318027
64344	NC_014410	ACT	2	6	2665026	2665031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318027
64345	NC_014410	TTCTG	2	10	2665139	2665148	0 %	60 %	20 %	20 %	304318027
64346	NC_014410	TAAG	2	8	2665217	2665224	50 %	25 %	25 %	0 %	304318027
64347	NC_014410	CTA	2	6	2665227	2665232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318027
64348	NC_014410	CAT	2	6	2665312	2665317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318027
64349	NC_014410	TTA	3	9	2665324	2665332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318027
64350	NC_014410	TTG	2	6	2665335	2665340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304318027
64351	NC_014410	GAA	2	6	2665350	2665355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304318027
64352	NC_014410	TCA	2	6	2665356	2665361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318027
64353	NC_014410	GAC	2	6	2665412	2665417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304318027
64354	NC_014410	T	6	6	2665441	2665446	0 %	100 %	0 %	0 %	304318027
64355	NC_014410	CT	3	6	2665483	2665488	0 %	50 %	0 %	50 %	304318027
64356	NC_014410	TAT	2	6	2665493	2665498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304318027
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64358	NC_014410	ATC	2	6	2665520	2665525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318027
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64469	NC_014410	GAA	2	6	2670851	2670856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304318033
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64472	NC_014410	ACC	2	6	2670971	2670976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64473	NC_014410	CAT	2	6	2670995	2671000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64474	NC_014410	A	6	6	2671008	2671013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64475	NC_014410	CAT	2	6	2671035	2671040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318034
64476	NC_014410	CT	3	6	2671078	2671083	0 %	50 %	0 %	50 %	304318034
64477	NC_014410	T	6	6	2671114	2671119	0 %	100 %	0 %	0 %	304318034
64478	NC_014410	CAT	2	6	2671272	2671277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318034
64479	NC_014410	CAT	2	6	2671335	2671340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318034
64480	NC_014410	CAT	2	6	2671377	2671382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318034
64481	NC_014410	TCTCT	2	10	2671408	2671417	0 %	60 %	0 %	40 %	304318034
64482	NC_014410	TA	3	6	2671506	2671511	50 %	50 %	0 %	0 %	304318034
64483	NC_014410	TCA	2	6	2671517	2671522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304318034
64484	NC_014410	TTC	2	6	2671558	2671563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304318034
64485	NC_014410	TCCC	2	8	2671580	2671587	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
64486	NC_014410	CAA	2	6	2671630	2671635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64487	NC_014410	GT	3	6	2671659	2671664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64488	NC_014410	TCAAT	2	10	2671673	2671682	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64489	NC_014410	GA	3	6	2671685	2671690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64490	NC_014410	A	8	8	2671700	2671707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64491	NC_014410	T	6	6	2671710	2671715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64492	NC_014410	A	6	6	2671730	2671735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64493	NC_014410	ATA	2	6	2671753	2671758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64494	NC_014410	ATA	2	6	2671762	2671767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64495	NC_014410	AT	3	6	2671808	2671813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64496	NC_014410	TTC	2	6	2671819	2671824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64497	NC_014410	ACA	2	6	2671879	2671884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64498	NC_014410	A	6	6	2671900	2671905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64499	NC_014410	TTAA	3	12	2671911	2671922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64500	NC_014410	AAG	2	6	2672003	2672008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304318035

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