MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosediminibacter oceani DSM 16646 chromosome

Total Repeats: 46557

< Previous12...82838485868788899091929394Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_014377	GGAA	2	8	2277783	2277790	50 %	0 %	50 %	0 %	302390791
46502	NC_014377	TCT	2	6	2277791	2277796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390791
46503	NC_014377	TAC	2	6	2277819	2277824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390791
46504	NC_014377	GCG	2	6	2277834	2277839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302390791
46505	NC_014377	TCC	2	6	2277883	2277888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46506	NC_014377	AT	3	6	2277896	2277901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46507	NC_014377	CCT	2	6	2277902	2277907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46508	NC_014377	AGG	2	6	2277918	2277923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302390792
46509	NC_014377	ATT	2	6	2277937	2277942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390792
46510	NC_014377	TTC	2	6	2277957	2277962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390792
46511	NC_014377	TCG	2	6	2277988	2277993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390792
46512	NC_014377	GGC	2	6	2278030	2278035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302390792
46513	NC_014377	CTT	2	6	2278075	2278080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390792
46514	NC_014377	T	6	6	2278109	2278114	0 %	100 %	0 %	0 %	302390792
46515	NC_014377	ATT	2	6	2278248	2278253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390792
46516	NC_014377	TTC	2	6	2278359	2278364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390792
46517	NC_014377	AG	3	6	2278404	2278409	50 %	0 %	50 %	0 %	302390792
46518	NC_014377	AAC	2	6	2278417	2278422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302390792
46519	NC_014377	CTG	2	6	2278426	2278431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390792
46520	NC_014377	CTC	2	6	2278434	2278439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390792
46521	NC_014377	CACTTC	3	18	2278443	2278460	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	302390792
46522	NC_014377	TTACT	2	10	2278543	2278552	20 %	60 %	0 %	20 %	302390793
46523	NC_014377	TCC	2	6	2278553	2278558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390793
46524	NC_014377	ATT	2	6	2278580	2278585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390793
46525	NC_014377	TGT	2	6	2278592	2278597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302390793
46526	NC_014377	TTAC	2	8	2278613	2278620	25 %	50 %	0 %	25 %	302390793
46527	NC_014377	CCAT	2	8	2278659	2278666	25 %	25 %	0 %	50 %	302390793
46528	NC_014377	GGT	2	6	2278750	2278755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302390793
46529	NC_014377	ATG	2	6	2278840	2278845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390793
46530	NC_014377	GCA	2	6	2278848	2278853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302390793
46531	NC_014377	TAT	2	6	2278867	2278872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390793
46532	NC_014377	C	6	6	2278904	2278909	0 %	0 %	0 %	100 %	302390793
46533	NC_014377	T	6	6	2279024	2279029	0 %	100 %	0 %	0 %	302390793
46534	NC_014377	TTG	2	6	2279041	2279046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302390793
46535	NC_014377	TA	3	6	2279118	2279123	50 %	50 %	0 %	0 %	302390793
46536	NC_014377	A	6	6	2279129	2279134	100 %	0 %	0 %	0 %	302390793
46537	NC_014377	TAA	2	6	2279161	2279166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390793
46538	NC_014377	T	6	6	2279204	2279209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46539	NC_014377	TAT	2	6	2279211	2279216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46540	NC_014377	T	6	6	2279223	2279228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46541	NC_014377	CCT	2	6	2279306	2279311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390794
46542	NC_014377	AGG	2	6	2279358	2279363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302390794
46543	NC_014377	GCG	2	6	2279391	2279396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302390794
46544	NC_014377	A	6	6	2279412	2279417	100 %	0 %	0 %	0 %	302390794
46545	NC_014377	TAA	2	6	2279427	2279432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302390794
46546	NC_014377	T	6	6	2279437	2279442	0 %	100 %	0 %	0 %	302390794
46547	NC_014377	T	6	6	2279474	2279479	0 %	100 %	0 %	0 %	302390795
46548	NC_014377	CTT	2	6	2279496	2279501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390795
46549	NC_014377	TCT	2	6	2279532	2279537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390795
46550	NC_014377	T	6	6	2279564	2279569	0 %	100 %	0 %	0 %	302390795
46551	NC_014377	CCG	2	6	2279606	2279611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302390795
46552	NC_014377	AAC	2	6	2279627	2279632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302390795
46553	NC_014377	TTTC	2	8	2279645	2279652	0 %	75 %	0 %	25 %	302390795
46554	NC_014377	T	6	6	2279763	2279768	0 %	100 %	0 %	0 %	302390795
46555	NC_014377	TTC	2	6	2279865	2279870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390796
46556	NC_014377	TCT	3	9	2279878	2279886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390796
46557	NC_014377	TTC	2	6	2279898	2279903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390796

< Previous12...82838485868788899091929394Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.