MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosediminibacter oceani DSM 16646 chromosome

Total Repeats: 46557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_014377	GGA	2	6	2111064	2111069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302390619
43002	NC_014377	CCT	2	6	2111139	2111144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43003	NC_014377	ATATT	2	10	2111150	2111159	40 %	60 %	0 %	0 %	302390620
43004	NC_014377	T	6	6	2111158	2111163	0 %	100 %	0 %	0 %	302390620
43005	NC_014377	CTC	2	6	2111336	2111341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390620
43006	NC_014377	TCG	2	6	2111457	2111462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390620
43007	NC_014377	CTT	3	9	2111516	2111524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390620
43008	NC_014377	T	6	6	2111529	2111534	0 %	100 %	0 %	0 %	302390620
43009	NC_014377	CTT	2	6	2111542	2111547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390620
43010	NC_014377	CCCT	2	8	2111702	2111709	0 %	25 %	0 %	75 %	302390621
43011	NC_014377	TCA	2	6	2111735	2111740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390621
43012	NC_014377	CTT	2	6	2111861	2111866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390621
43013	NC_014377	A	6	6	2111868	2111873	100 %	0 %	0 %	0 %	302390621
43014	NC_014377	CTG	2	6	2111875	2111880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390621
43015	NC_014377	CTT	2	6	2111881	2111886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390621
43016	NC_014377	CGC	2	6	2111900	2111905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302390621
43017	NC_014377	ATTT	2	8	2111943	2111950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43018	NC_014377	CCT	2	6	2112108	2112113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43019	NC_014377	TA	3	6	2112141	2112146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43020	NC_014377	CAC	2	6	2112260	2112265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302390623
43021	NC_014377	CTT	2	6	2112313	2112318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390623
43022	NC_014377	TAC	2	6	2112353	2112358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390623
43023	NC_014377	TTA	2	6	2112400	2112405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390623
43024	NC_014377	GTCG	2	8	2112416	2112423	0 %	25 %	50 %	25 %	302390623
43025	NC_014377	GT	3	6	2112463	2112468	0 %	50 %	50 %	0 %	302390623
43026	NC_014377	CTT	2	6	2112478	2112483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390623
43027	NC_014377	CTT	2	6	2112485	2112490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390623
43028	NC_014377	TGT	2	6	2112604	2112609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302390623
43029	NC_014377	TCT	4	12	2112667	2112678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390623
43030	NC_014377	CTA	2	6	2112691	2112696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390623
43031	NC_014377	TCG	2	6	2112705	2112710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390623
43032	NC_014377	CT	3	6	2112729	2112734	0 %	50 %	0 %	50 %	302390623
43033	NC_014377	TA	3	6	2112830	2112835	50 %	50 %	0 %	0 %	302390623
43034	NC_014377	CCGCAT	2	12	2112894	2112905	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302390623
43035	NC_014377	TCG	2	6	2112945	2112950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390623
43036	NC_014377	AGG	2	6	2112964	2112969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302390623
43037	NC_014377	GTC	2	6	2113016	2113021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390623
43038	NC_014377	TAC	2	6	2113046	2113051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390623
43039	NC_014377	CCTG	2	8	2113069	2113076	0 %	25 %	25 %	50 %	302390623
43040	NC_014377	TAC	2	6	2113127	2113132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390623
43041	NC_014377	GGC	2	6	2113154	2113159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302390623
43042	NC_014377	CT	3	6	2113275	2113280	0 %	50 %	0 %	50 %	302390623
43043	NC_014377	TTTGC	2	10	2113432	2113441	0 %	60 %	20 %	20 %	302390623
43044	NC_014377	TCC	2	6	2113451	2113456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43045	NC_014377	TAA	2	6	2113477	2113482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43046	NC_014377	T	6	6	2113505	2113510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43047	NC_014377	CA	3	6	2113517	2113522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43048	NC_014377	TCC	2	6	2113578	2113583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43049	NC_014377	CTC	2	6	2113626	2113631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43050	NC_014377	TGC	2	6	2113670	2113675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43051	NC_014377	TGA	2	6	2113911	2113916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390624
43052	NC_014377	TCA	2	6	2114000	2114005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390624
43053	NC_014377	TAAAAC	2	12	2114046	2114057	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	302390624
43054	NC_014377	TGCTC	2	10	2114070	2114079	0 %	40 %	20 %	40 %	302390624
43055	NC_014377	TGC	2	6	2114090	2114095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390624
43056	NC_014377	AAC	2	6	2114133	2114138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302390624
43057	NC_014377	GCT	2	6	2114286	2114291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390624
43058	NC_014377	GAA	2	6	2114311	2114316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390624
43059	NC_014377	CGGT	2	8	2114370	2114377	0 %	25 %	50 %	25 %	302390624
43060	NC_014377	GAA	2	6	2114383	2114388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390624
43061	NC_014377	GTTG	2	8	2114472	2114479	0 %	50 %	50 %	0 %	302390624
43062	NC_014377	GAA	2	6	2114497	2114502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390624
43063	NC_014377	GGA	2	6	2114541	2114546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302390624
43064	NC_014377	CCG	2	6	2114802	2114807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302390624
43065	NC_014377	TTA	2	6	2114829	2114834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390624
43066	NC_014377	CT	4	8	2114913	2114920	0 %	50 %	0 %	50 %	302390624
43067	NC_014377	TCC	2	6	2114961	2114966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390624
43068	NC_014377	A	7	7	2115069	2115075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43069	NC_014377	TAT	2	6	2115089	2115094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43070	NC_014377	TGG	2	6	2115217	2115222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43071	NC_014377	CGA	2	6	2115264	2115269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43072	NC_014377	T	7	7	2115300	2115306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43073	NC_014377	TGG	2	6	2115387	2115392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43074	NC_014377	AG	3	6	2115393	2115398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43075	NC_014377	ACC	2	6	2115409	2115414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43076	NC_014377	CAG	2	6	2115426	2115431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43077	NC_014377	TC	3	6	2115466	2115471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43078	NC_014377	TA	3	6	2115486	2115491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43079	NC_014377	TAAAAA	2	12	2115495	2115506	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43080	NC_014377	T	7	7	2115523	2115529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43081	NC_014377	CCT	2	6	2115612	2115617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390625
43082	NC_014377	CTT	2	6	2115725	2115730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390625
43083	NC_014377	TCC	2	6	2115748	2115753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390625
43084	NC_014377	CAG	2	6	2115786	2115791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302390625
43085	NC_014377	TCG	2	6	2115808	2115813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390625
43086	NC_014377	TGA	2	6	2115887	2115892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390625
43087	NC_014377	TCT	2	6	2116000	2116005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390625
43088	NC_014377	TATT	2	8	2116060	2116067	25 %	75 %	0 %	0 %	302390625
43089	NC_014377	TAC	2	6	2116113	2116118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302390625
43090	NC_014377	AGT	2	6	2116236	2116241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390626
43091	NC_014377	T	6	6	2116257	2116262	0 %	100 %	0 %	0 %	302390626
43092	NC_014377	TCT	2	6	2116288	2116293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390626
43093	NC_014377	TCC	2	6	2116305	2116310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390626
43094	NC_014377	TCC	2	6	2116338	2116343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390626
43095	NC_014377	TCC	2	6	2116348	2116353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390626
43096	NC_014377	T	6	6	2116354	2116359	0 %	100 %	0 %	0 %	302390626
43097	NC_014377	CATGGA	2	12	2116475	2116486	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302390626
43098	NC_014377	T	6	6	2116495	2116500	0 %	100 %	0 %	0 %	302390626
43099	NC_014377	TA	3	6	2116502	2116507	50 %	50 %	0 %	0 %	302390626
43100	NC_014377	CGG	2	6	2116513	2116518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302390626
43101	NC_014377	CTT	2	6	2116525	2116530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390626
43102	NC_014377	GAT	2	6	2116565	2116570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390626
43103	NC_014377	CCT	2	6	2116578	2116583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390626
43104	NC_014377	TGG	2	6	2116590	2116595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302390626
43105	NC_014377	ATG	2	6	2116608	2116613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390626
43106	NC_014377	GGC	2	6	2116670	2116675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302390626
43107	NC_014377	CAGGC	2	10	2116708	2116717	20 %	0 %	40 %	40 %	302390626
43108	NC_014377	AAAT	2	8	2116742	2116749	75 %	25 %	0 %	0 %	302390626
43109	NC_014377	CCTT	2	8	2116773	2116780	0 %	50 %	0 %	50 %	302390627
43110	NC_014377	CAG	2	6	2116811	2116816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302390627
43111	NC_014377	TCT	2	6	2116912	2116917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390627
43112	NC_014377	GGT	2	6	2116958	2116963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302390627
43113	NC_014377	CAC	2	6	2116989	2116994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302390627
43114	NC_014377	CGGC	2	8	2117093	2117100	0 %	0 %	50 %	50 %	302390627
43115	NC_014377	GAT	2	6	2117127	2117132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302390627
43116	NC_014377	TGC	2	6	2117171	2117176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390627
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43118	NC_014377	GTC	2	6	2117256	2117261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390627
43119	NC_014377	ACC	2	6	2117356	2117361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302390627
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43121	NC_014377	TCT	2	6	2117393	2117398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390627
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43124	NC_014377	TCCC	2	8	2117525	2117532	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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43221	NC_014377	T	6	6	2122250	2122255	0 %	100 %	0 %	0 %	302390633
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43238	NC_014377	CTT	2	6	2122894	2122899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390634
43239	NC_014377	G	6	6	2122936	2122941	0 %	0 %	100 %	0 %	302390634
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43356	NC_014377	TCC	2	6	2128155	2128160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390639
43357	NC_014377	GAG	2	6	2128166	2128171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302390639
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43360	NC_014377	CTG	2	6	2128280	2128285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390639
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43371	NC_014377	AT	3	6	2128768	2128773	50 %	50 %	0 %	0 %	302390639
43372	NC_014377	CGG	2	6	2128795	2128800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302390639
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43376	NC_014377	TTTC	2	8	2129101	2129108	0 %	75 %	0 %	25 %	302390639
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43421	NC_014377	T	7	7	2131232	2131238	0 %	100 %	0 %	0 %	302390641
43422	NC_014377	T	6	6	2131362	2131367	0 %	100 %	0 %	0 %	302390642
43423	NC_014377	CT	3	6	2131397	2131402	0 %	50 %	0 %	50 %	302390642
43424	NC_014377	CCA	2	6	2131435	2131440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302390642
43425	NC_014377	CCA	2	6	2131474	2131479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302390642
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43427	NC_014377	TA	3	6	2131535	2131540	50 %	50 %	0 %	0 %	302390642
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43433	NC_014377	TAT	2	6	2131799	2131804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43441	NC_014377	TCG	2	6	2132022	2132027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390643
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43444	NC_014377	CGCC	2	8	2132099	2132106	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43445	NC_014377	CCT	2	6	2132107	2132112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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43447	NC_014377	TACT	2	8	2132176	2132183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43448	NC_014377	TAT	2	6	2132189	2132194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302390644
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43457	NC_014377	CGT	2	6	2132583	2132588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390644
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43462	NC_014377	GCC	2	6	2132782	2132787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302390644
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43464	NC_014377	T	6	6	2132963	2132968	0 %	100 %	0 %	0 %	302390644
43465	NC_014377	ATCTT	2	10	2133020	2133029	20 %	60 %	0 %	20 %	302390644
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43469	NC_014377	CCTA	2	8	2133316	2133323	25 %	25 %	0 %	50 %	302390644
43470	NC_014377	TCG	2	6	2133368	2133373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390644
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43473	NC_014377	AAC	2	6	2133456	2133461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302390644
43474	NC_014377	AAG	2	6	2133475	2133480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302390644
43475	NC_014377	GAG	2	6	2133503	2133508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302390644
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43477	NC_014377	TCG	3	9	2133569	2133577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390644
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43479	NC_014377	GTC	3	9	2133613	2133621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390644
43480	NC_014377	GTC	2	6	2133679	2133684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390644
43481	NC_014377	CCT	2	6	2133696	2133701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302390644
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43485	NC_014377	TTC	2	6	2133901	2133906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302390644
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43492	NC_014377	T	6	6	2134346	2134351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43493	NC_014377	TAAAT	2	10	2134357	2134366	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43494	NC_014377	TCC	2	6	2134371	2134376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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43496	NC_014377	AT	3	6	2134404	2134409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43497	NC_014377	TAA	2	6	2134410	2134415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43498	NC_014377	A	6	6	2134414	2134419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43499	NC_014377	CGG	2	6	2134428	2134433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43500	NC_014377	CGT	2	6	2134484	2134489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302390645

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