MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosediminibacter oceani DSM 16646 chromosome

Total Repeats: 46557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_014377	GAT	2	6	100146	100151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388689
2003	NC_014377	T	6	6	100216	100221	0 %	100 %	0 %	0 %	302388689
2004	NC_014377	CCT	2	6	100256	100261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302388689
2005	NC_014377	GCGG	2	8	100268	100275	0 %	0 %	75 %	25 %	302388689
2006	NC_014377	GTC	2	6	100320	100325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388689
2007	NC_014377	TCCC	2	8	100367	100374	0 %	25 %	0 %	75 %	302388689
2008	NC_014377	CGC	2	6	100500	100505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388689
2009	NC_014377	AGC	2	6	100537	100542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388689
2010	NC_014377	CGT	2	6	100583	100588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388689
2011	NC_014377	TGG	2	6	100589	100594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388689
2012	NC_014377	CGG	2	6	100655	100660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388689
2013	NC_014377	AGAA	2	8	100684	100691	75 %	0 %	25 %	0 %	302388689
2014	NC_014377	TGCGA	2	10	100819	100828	20 %	20 %	40 %	20 %	302388689
2015	NC_014377	GTA	2	6	100854	100859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388689
2016	NC_014377	AGC	2	6	100927	100932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388689
2017	NC_014377	GGT	2	6	100937	100942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388689
2018	NC_014377	TTCC	2	8	100950	100957	0 %	50 %	0 %	50 %	302388689
2019	NC_014377	GCC	2	6	101061	101066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388689
2020	NC_014377	GGTC	2	8	101069	101076	0 %	25 %	50 %	25 %	302388689
2021	NC_014377	GGCA	2	8	101085	101092	25 %	0 %	50 %	25 %	302388689
2022	NC_014377	CCG	2	6	101102	101107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388689
2023	NC_014377	CTT	2	6	101109	101114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388689
2024	NC_014377	CAG	2	6	101118	101123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388689
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2027	NC_014377	TTTG	2	8	101210	101217	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2028	NC_014377	TA	3	6	101218	101223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_014377	TA	3	6	101225	101230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_014377	T	6	6	101242	101247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_014377	T	6	6	101295	101300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_014377	ATTA	2	8	101319	101326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_014377	GGC	2	6	101379	101384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388690
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2035	NC_014377	AGG	3	9	101444	101452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388690
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2037	NC_014377	ATC	2	6	101485	101490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388690
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2041	NC_014377	TGCCCT	2	12	101610	101621	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	302388690
2042	NC_014377	GCC	2	6	101644	101649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388690
2043	NC_014377	CGG	2	6	101660	101665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388690
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2052	NC_014377	GCT	2	6	102003	102008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388691
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2055	NC_014377	GGT	2	6	102162	102167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388691
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2062	NC_014377	CGG	2	6	102771	102776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2063	NC_014377	TA	3	6	102807	102812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2065	NC_014377	TAA	2	6	102838	102843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2067	NC_014377	ATA	2	6	102898	102903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2107	NC_014377	GCC	2	6	104636	104641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388692
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2121	NC_014377	C	6	6	105357	105362	0 %	0 %	0 %	100 %	302388692
2122	NC_014377	GTG	2	6	105390	105395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388692
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2124	NC_014377	TTA	2	6	105458	105463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302388692
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2375	NC_014377	CCT	2	6	116856	116861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302388704
2376	NC_014377	GAC	2	6	116890	116895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388704
2377	NC_014377	GTC	2	6	116983	116988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388704
2378	NC_014377	TCA	2	6	117038	117043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388704
2379	NC_014377	AGC	2	6	117060	117065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388704
2380	NC_014377	TTC	2	6	117076	117081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388704
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2382	NC_014377	GACCA	2	10	117109	117118	40 %	0 %	20 %	40 %	302388704
2383	NC_014377	GGGC	2	8	117188	117195	0 %	0 %	75 %	25 %	302388704
2384	NC_014377	TCA	2	6	117275	117280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388704
2385	NC_014377	AAAG	2	8	117349	117356	75 %	0 %	25 %	0 %	302388704
2386	NC_014377	GTT	2	6	117361	117366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302388704
2387	NC_014377	CCG	2	6	117389	117394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388704
2388	NC_014377	GAGGAA	2	12	117397	117408	50 %	0 %	50 %	0 %	302388704
2389	NC_014377	TCA	2	6	117410	117415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388704
2390	NC_014377	A	6	6	117461	117466	100 %	0 %	0 %	0 %	302388704
2391	NC_014377	GAC	2	6	117487	117492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388704
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2393	NC_014377	TTCCT	2	10	117572	117581	0 %	60 %	0 %	40 %	302388704
2394	NC_014377	ACG	3	9	117587	117595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388704
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2398	NC_014377	TCCA	2	8	117909	117916	25 %	25 %	0 %	50 %	302388704
2399	NC_014377	TGG	2	6	117953	117958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388704
2400	NC_014377	GAT	2	6	118024	118029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388704
2401	NC_014377	GAG	2	6	118093	118098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388704
2402	NC_014377	ATC	2	6	118159	118164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388704
2403	NC_014377	CCGGG	2	10	118182	118191	0 %	0 %	60 %	40 %	302388704
2404	NC_014377	TGG	2	6	118199	118204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302388704
2405	NC_014377	CCG	2	6	118238	118243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388704
2406	NC_014377	GCT	2	6	118251	118256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388704
2407	NC_014377	TCG	2	6	118331	118336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388704
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2413	NC_014377	GGC	2	6	118608	118613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388704
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2415	NC_014377	TACATG	2	12	118774	118785	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	302388704
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2420	NC_014377	GAGATC	2	12	119125	119136	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	302388704
2421	NC_014377	CGA	2	6	119145	119150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388704
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2423	NC_014377	AGA	3	9	119220	119228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388704
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2428	NC_014377	CGA	2	6	119355	119360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388704
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2431	NC_014377	GGA	2	6	119395	119400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2432	NC_014377	ATG	2	6	119426	119431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2433	NC_014377	AAT	3	9	119435	119443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2434	NC_014377	GA	3	6	119449	119454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2435	NC_014377	GCG	2	6	119693	119698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388705
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2477	NC_014377	GA	3	6	121827	121832	50 %	0 %	50 %	0 %	302388705
2478	NC_014377	GTA	2	6	121942	121947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388705
2479	NC_014377	GC	3	6	121974	121979	0 %	0 %	50 %	50 %	302388705
2480	NC_014377	GATGA	2	10	121981	121990	40 %	20 %	40 %	0 %	302388705
2481	NC_014377	CGC	2	6	122019	122024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388705
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2483	NC_014377	CGGT	2	8	122047	122054	0 %	25 %	50 %	25 %	302388705
2484	NC_014377	CAT	2	6	122148	122153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388705
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2489	NC_014377	CAAT	2	8	122468	122475	50 %	25 %	0 %	25 %	302388705
2490	NC_014377	ACCT	2	8	122518	122525	25 %	25 %	0 %	50 %	302388705
2491	NC_014377	GGA	2	6	122625	122630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388705
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2493	NC_014377	GCCG	2	8	122721	122728	0 %	0 %	50 %	50 %	302388705
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2496	NC_014377	CTTC	2	8	122795	122802	0 %	50 %	0 %	50 %	302388705
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