MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosediminibacter oceani DSM 16646 chromosome

Total Repeats: 46557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_014377	TCA	2	6	658492	658497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302389230
13502	NC_014377	TCC	2	6	658536	658541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302389230
13503	NC_014377	CGG	2	6	658549	658554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302389230
13504	NC_014377	CCG	2	6	658555	658560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302389230
13505	NC_014377	GCG	2	6	658563	658568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302389230
13506	NC_014377	GCG	2	6	658633	658638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302389230
13507	NC_014377	TTG	2	6	658639	658644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302389230
13508	NC_014377	TGG	2	6	658684	658689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302389230
13509	NC_014377	AGG	2	6	658897	658902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302389230
13510	NC_014377	GCC	2	6	658920	658925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302389230
13511	NC_014377	GC	3	6	658926	658931	0 %	0 %	50 %	50 %	302389230
13512	NC_014377	TAC	2	6	659001	659006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302389230
13513	NC_014377	ATA	2	6	659007	659012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302389230
13514	NC_014377	CGG	2	6	659017	659022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302389230
13515	NC_014377	ACG	2	6	659047	659052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302389230
13516	NC_014377	ACG	2	6	659083	659088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302389230
13517	NC_014377	GGA	2	6	659146	659151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302389230
13518	NC_014377	ACG	2	6	659188	659193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302389230
13519	NC_014377	TAC	2	6	659196	659201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302389230
13520	NC_014377	ACG	2	6	659263	659268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302389230
13521	NC_014377	CACC	2	8	659278	659285	25 %	0 %	0 %	75 %	302389230
13522	NC_014377	CAG	2	6	659293	659298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302389230
13523	NC_014377	ATA	2	6	659439	659444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302389230
13524	NC_014377	AAT	2	6	659468	659473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302389230
13525	NC_014377	GGC	2	6	659477	659482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302389230
13526	NC_014377	A	6	6	659516	659521	100 %	0 %	0 %	0 %	302389230
13527	NC_014377	CTG	2	6	659658	659663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302389231
13528	NC_014377	GGC	2	6	659733	659738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302389231
13529	NC_014377	ACT	2	6	659789	659794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302389231
13530	NC_014377	TA	3	6	659860	659865	50 %	50 %	0 %	0 %	302389231
13531	NC_014377	GGA	3	9	659919	659927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302389231
13532	NC_014377	TGG	2	6	659969	659974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302389231
13533	NC_014377	GAG	2	6	660037	660042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302389231
13534	NC_014377	CAA	2	6	660057	660062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302389231
13535	NC_014377	GAA	2	6	660109	660114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302389231
13536	NC_014377	CGCTG	2	10	660119	660128	0 %	20 %	40 %	40 %	302389231
13537	NC_014377	GTTGA	2	10	660181	660190	20 %	40 %	40 %	0 %	302389231
13538	NC_014377	CGG	2	6	660217	660222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302389231
13539	NC_014377	GAA	2	6	660235	660240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302389231
13540	NC_014377	GCG	2	6	660269	660274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302389231
13541	NC_014377	AAG	2	6	660330	660335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302389231
13542	NC_014377	A	7	7	660454	660460	100 %	0 %	0 %	0 %	302389231
13543	NC_014377	ACG	2	6	660491	660496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302389231
13544	NC_014377	TTC	2	6	660532	660537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302389231
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13546	NC_014377	GAT	2	6	660678	660683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302389231
13547	NC_014377	CGA	2	6	660684	660689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302389231
13548	NC_014377	AAG	2	6	660716	660721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302389231
13549	NC_014377	GGA	2	6	660855	660860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302389231
13550	NC_014377	GGAAA	2	10	660871	660880	60 %	0 %	40 %	0 %	302389231
13551	NC_014377	TAA	2	6	661040	661045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_014377	A	8	8	661062	661069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_014377	TGT	2	6	661086	661091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_014377	TAA	2	6	661107	661112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_014377	ACCT	2	8	661146	661153	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13556	NC_014377	ATA	2	6	661175	661180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_014377	TA	4	8	661200	661207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_014377	G	7	7	661220	661226	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_014377	ATT	2	6	661276	661281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_014377	AGG	2	6	661283	661288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_014377	GATTA	2	10	661290	661299	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_014377	CTG	3	9	661334	661342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302389232
13563	NC_014377	AGA	2	6	661371	661376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302389232
13564	NC_014377	CAG	2	6	661382	661387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302389232
13565	NC_014377	ACAG	2	8	661396	661403	50 %	0 %	25 %	25 %	302389232
13566	NC_014377	AGA	2	6	661578	661583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302389232
13567	NC_014377	GCT	2	6	661666	661671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302389232
13568	NC_014377	CTA	2	6	661708	661713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302389232
13569	NC_014377	CAA	2	6	661735	661740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302389232
13570	NC_014377	CCAG	2	8	661758	661765	25 %	0 %	25 %	50 %	302389232
13571	NC_014377	AGGA	2	8	661868	661875	50 %	0 %	50 %	0 %	302389232
13572	NC_014377	TGT	2	6	661876	661881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302389232
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13575	NC_014377	GCT	2	6	661921	661926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302389232
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13578	NC_014377	AAGGC	2	10	662139	662148	40 %	0 %	40 %	20 %	302389232
13579	NC_014377	CGAT	2	8	662253	662260	25 %	25 %	25 %	25 %	302389232
13580	NC_014377	TA	3	6	662270	662275	50 %	50 %	0 %	0 %	302389232
13581	NC_014377	GAA	2	6	662357	662362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302389232
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13588	NC_014377	CAA	2	6	662719	662724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302389232
13589	NC_014377	GCT	2	6	662806	662811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302389232
13590	NC_014377	CT	3	6	662835	662840	0 %	50 %	0 %	50 %	302389232
13591	NC_014377	GGT	2	6	662903	662908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302389232
13592	NC_014377	GTT	2	6	662961	662966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_014377	TAT	2	6	663020	663025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_014377	AAT	2	6	663035	663040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_014377	T	6	6	663044	663049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_014377	TA	3	6	663088	663093	50 %	50 %	0 %	0 %	302389233
13597	NC_014377	ATG	2	6	663220	663225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302389233
13598	NC_014377	TAC	2	6	663229	663234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302389233
13599	NC_014377	TA	3	6	663262	663267	50 %	50 %	0 %	0 %	302389233
13600	NC_014377	AGA	2	6	663345	663350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302389233
13601	NC_014377	AAT	2	6	663423	663428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302389233
13602	NC_014377	AT	3	6	663528	663533	50 %	50 %	0 %	0 %	302389233
13603	NC_014377	T	6	6	663533	663538	0 %	100 %	0 %	0 %	302389233
13604	NC_014377	AAT	2	6	663591	663596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302389233
13605	NC_014377	GCT	2	6	663630	663635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302389233
13606	NC_014377	GGT	2	6	663762	663767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302389233
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13608	NC_014377	T	6	6	663908	663913	0 %	100 %	0 %	0 %	302389233
13609	NC_014377	CTT	2	6	663921	663926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302389233
13610	NC_014377	TAT	2	6	663963	663968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302389233
13611	NC_014377	AGG	2	6	663998	664003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302389233
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13614	NC_014377	GCC	2	6	664257	664262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302389234
13615	NC_014377	GC	3	6	664312	664317	0 %	0 %	50 %	50 %	302389234
13616	NC_014377	TGA	2	6	664343	664348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302389234
13617	NC_014377	TAA	2	6	664436	664441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302389234
13618	NC_014377	TGA	2	6	664493	664498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302389234
13619	NC_014377	GTT	2	6	664543	664548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302389234
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