MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosediminibacter oceani DSM 16646 chromosome

Total Repeats: 46557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014377	AGG	2	6	248213	248218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388839
5002	NC_014377	CGG	2	6	248225	248230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388839
5003	NC_014377	CAG	3	9	248236	248244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388839
5004	NC_014377	TTC	2	6	248325	248330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388839
5005	NC_014377	GAT	2	6	248444	248449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388839
5006	NC_014377	TGA	2	6	248551	248556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388839
5007	NC_014377	ATA	2	6	248571	248576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302388839
5008	NC_014377	CTA	2	6	248732	248737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388839
5009	NC_014377	AC	3	6	248759	248764	50 %	0 %	0 %	50 %	302388839
5010	NC_014377	G	6	6	248876	248881	0 %	0 %	100 %	0 %	302388839
5011	NC_014377	ACA	2	6	248920	248925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302388839
5012	NC_014377	CTG	2	6	248928	248933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388839
5013	NC_014377	CGC	2	6	248942	248947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388839
5014	NC_014377	CGG	3	9	248969	248977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388839
5015	NC_014377	AAG	2	6	249014	249019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388839
5016	NC_014377	TTC	2	6	249023	249028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388839
5017	NC_014377	GCT	2	6	249062	249067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388839
5018	NC_014377	GGC	2	6	249095	249100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388839
5019	NC_014377	AAAG	2	8	249113	249120	75 %	0 %	25 %	0 %	302388839
5020	NC_014377	T	7	7	249268	249274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_014377	GGT	2	6	249336	249341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_014377	AT	3	6	249395	249400	50 %	50 %	0 %	0 %	302388840
5023	NC_014377	T	6	6	249403	249408	0 %	100 %	0 %	0 %	302388840
5024	NC_014377	T	6	6	249415	249420	0 %	100 %	0 %	0 %	302388840
5025	NC_014377	GAA	2	6	249446	249451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388840
5026	NC_014377	A	7	7	249450	249456	100 %	0 %	0 %	0 %	302388840
5027	NC_014377	TTA	2	6	249475	249480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302388840
5028	NC_014377	CGA	2	6	249490	249495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388840
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5030	NC_014377	A	6	6	249673	249678	100 %	0 %	0 %	0 %	302388840
5031	NC_014377	AAAGGA	2	12	249691	249702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388840
5032	NC_014377	GCA	2	6	249717	249722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388840
5033	NC_014377	GAG	2	6	249739	249744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388840
5034	NC_014377	T	7	7	249911	249917	0 %	100 %	0 %	0 %	302388841
5035	NC_014377	T	6	6	250059	250064	0 %	100 %	0 %	0 %	302388841
5036	NC_014377	AGC	2	6	250071	250076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388841
5037	NC_014377	TCA	2	6	250093	250098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388841
5038	NC_014377	GCT	2	6	250142	250147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388841
5039	NC_014377	TGC	2	6	250150	250155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388841
5040	NC_014377	CTT	2	6	250158	250163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388841
5041	NC_014377	CTGG	2	8	250193	250200	0 %	25 %	50 %	25 %	302388841
5042	NC_014377	AAAAT	2	10	250279	250288	80 %	20 %	0 %	0 %	302388841
5043	NC_014377	TAA	2	6	250289	250294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302388841
5044	NC_014377	GCT	2	6	250323	250328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388841
5045	NC_014377	TCT	2	6	250334	250339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388841
5046	NC_014377	GGGCG	2	10	250358	250367	0 %	0 %	80 %	20 %	302388841
5047	NC_014377	GCC	2	6	250446	250451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388841
5048	NC_014377	CTTT	2	8	250475	250482	0 %	75 %	0 %	25 %	302388841
5049	NC_014377	GGC	2	6	250584	250589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388841
5050	NC_014377	GGC	2	6	250615	250620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388841
5051	NC_014377	TCT	2	6	250654	250659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388841
5052	NC_014377	GGA	2	6	250670	250675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388841
5053	NC_014377	GGA	2	6	250757	250762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388841
5054	NC_014377	G	6	6	250887	250892	0 %	0 %	100 %	0 %	302388841
5055	NC_014377	GA	3	6	250960	250965	50 %	0 %	50 %	0 %	302388841
5056	NC_014377	AGG	2	6	251114	251119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302388842
5057	NC_014377	CGC	2	6	251166	251171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388842
5058	NC_014377	GCT	2	6	251232	251237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302388842
5059	NC_014377	CAG	2	6	251247	251252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388842
5060	NC_014377	CAG	2	6	251311	251316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388842
5061	NC_014377	TGT	2	6	251327	251332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302388842
5062	NC_014377	AGA	2	6	251339	251344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388842
5063	NC_014377	A	6	6	251399	251404	100 %	0 %	0 %	0 %	302388842
5064	NC_014377	G	6	6	251432	251437	0 %	0 %	100 %	0 %	302388842
5065	NC_014377	CAG	2	6	251505	251510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388842
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5070	NC_014377	GAT	2	6	252009	252014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388842
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5072	NC_014377	CGA	2	6	252099	252104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302388842
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5074	NC_014377	GA	3	6	252227	252232	50 %	0 %	50 %	0 %	302388842
5075	NC_014377	CGG	2	6	252260	252265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388842
5076	NC_014377	CGG	2	6	252312	252317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388842
5077	NC_014377	GTA	2	6	252409	252414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_014377	A	6	6	252427	252432	100 %	0 %	0 %	0 %	302388843
5079	NC_014377	A	7	7	252595	252601	100 %	0 %	0 %	0 %	302388843
5080	NC_014377	CAT	2	6	252631	252636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388843
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5082	NC_014377	GTA	2	6	252728	252733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388843
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5088	NC_014377	TCA	2	6	253140	253145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302388843
5089	NC_014377	TCCT	2	8	253178	253185	0 %	50 %	0 %	50 %	302388843
5090	NC_014377	TGA	2	6	253298	253303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388843
5091	NC_014377	ATA	2	6	253311	253316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_014377	AGGGGG	2	12	253360	253371	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_014377	A	7	7	253393	253399	100 %	0 %	0 %	0 %	302388844
5094	NC_014377	AGGTG	2	10	253455	253464	20 %	20 %	60 %	0 %	302388844
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5098	NC_014377	CGG	2	6	253557	253562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302388844
5099	NC_014377	CCGG	2	8	253563	253570	0 %	0 %	50 %	50 %	302388844
5100	NC_014377	T	6	6	253596	253601	0 %	100 %	0 %	0 %	302388844
5101	NC_014377	GCC	2	6	253687	253692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388844
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5103	NC_014377	GCGG	2	8	253794	253801	0 %	0 %	75 %	25 %	302388844
5104	NC_014377	TGA	2	6	253845	253850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302388844
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5107	NC_014377	TCC	2	6	253939	253944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302388844
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5109	NC_014377	GAA	2	6	254026	254031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388844
5110	NC_014377	GAA	2	6	254044	254049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302388844
5111	NC_014377	AT	3	6	254065	254070	50 %	50 %	0 %	0 %	302388844
5112	NC_014377	TTC	2	6	254234	254239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388844
5113	NC_014377	CCG	2	6	254268	254273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302388844
5114	NC_014377	TTC	2	6	254279	254284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302388844
5115	NC_014377	ACC	2	6	254292	254297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302388844
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5117	NC_014377	TAT	2	6	254372	254377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_014377	GATA	2	8	254404	254411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_014377	TAA	2	6	254412	254417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_014377	GAT	2	6	254425	254430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_014377	AGG	2	6	254440	254445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_014377	GCC	2	6	254462	254467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_014377	TAT	2	6	254525	254530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_014377	GGC	2	6	254575	254580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5372	NC_014377	T	6	6	266039	266044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_014377	TAAAT	2	10	266047	266056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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