MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014209	TTA	2	6	8	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014209	AATTA	2	10	16	25	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014209	ATA	2	6	31	36	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014209	TAT	2	6	37	42	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014209	AGG	2	6	86	91	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014209	ATC	2	6	109	114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543499
7	NC_014209	CCA	2	6	163	168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297543499
8	NC_014209	A	6	6	251	256	100 %	0 %	0 %	0 %	297543499
9	NC_014209	TAA	2	6	259	264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543499
10	NC_014209	AT	3	6	272	277	50 %	50 %	0 %	0 %	297543499
11	NC_014209	ATT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543499
12	NC_014209	ATG	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543499
13	NC_014209	AGA	2	6	341	346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543499
14	NC_014209	GAA	3	9	348	356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543499
15	NC_014209	ACT	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543499
16	NC_014209	TGT	2	6	449	454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543499
17	NC_014209	TTTA	2	8	527	534	25 %	75 %	0 %	0 %	297543499
18	NC_014209	GGA	2	6	540	545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543499
19	NC_014209	ATGC	2	8	570	577	25 %	25 %	25 %	25 %	297543499
20	NC_014209	TAA	2	6	593	598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543499
21	NC_014209	AAT	2	6	617	622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543499
22	NC_014209	GAC	2	6	672	677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543499
23	NC_014209	GAA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543499
24	NC_014209	GAT	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543499
25	NC_014209	A	7	7	749	755	100 %	0 %	0 %	0 %	297543499
26	NC_014209	GAAC	2	8	756	763	50 %	0 %	25 %	25 %	297543499
27	NC_014209	AAG	2	6	766	771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543499
28	NC_014209	T	6	6	774	779	0 %	100 %	0 %	0 %	297543499
29	NC_014209	CAAA	3	12	805	816	75 %	0 %	0 %	25 %	297543499
30	NC_014209	CCA	2	6	912	917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297543499
31	NC_014209	A	6	6	948	953	100 %	0 %	0 %	0 %	297543499
32	NC_014209	CGA	2	6	980	985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543499
33	NC_014209	A	6	6	1006	1011	100 %	0 %	0 %	0 %	297543499
34	NC_014209	TCAA	2	8	1013	1020	50 %	25 %	0 %	25 %	297543499
35	NC_014209	TAA	2	6	1045	1050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543499
36	NC_014209	TAA	2	6	1130	1135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543499
37	NC_014209	AAG	3	9	1165	1173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543499
38	NC_014209	TAT	2	6	1182	1187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543499
39	NC_014209	AGA	2	6	1199	1204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543499
40	NC_014209	A	6	6	1226	1231	100 %	0 %	0 %	0 %	297543499
41	NC_014209	AG	3	6	1269	1274	50 %	0 %	50 %	0 %	297543499
42	NC_014209	GAA	2	6	1305	1310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543499
43	NC_014209	A	6	6	1348	1353	100 %	0 %	0 %	0 %	297543499
44	NC_014209	AGA	2	6	1370	1375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543499
45	NC_014209	CTT	2	6	1380	1385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543499
46	NC_014209	GAA	2	6	1398	1403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543499
47	NC_014209	A	6	6	1406	1411	100 %	0 %	0 %	0 %	297543499
48	NC_014209	TTA	2	6	1424	1429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543499
49	NC_014209	T	6	6	1469	1474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014209	TAA	2	6	1490	1495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014209	CAA	2	6	1521	1526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014209	CTTT	2	8	1540	1547	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014209	TAT	2	6	1582	1587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014209	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014209	TTATT	2	10	1605	1614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014209	TAT	2	6	1615	1620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014209	A	8	8	1633	1640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014209	A	7	7	1661	1667	100 %	0 %	0 %	0 %	297543500
59	NC_014209	TG	4	8	1675	1682	0 %	50 %	50 %	0 %	297543500
60	NC_014209	ATT	2	6	1693	1698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543500
61	NC_014209	G	6	6	1722	1727	0 %	0 %	100 %	0 %	297543500
62	NC_014209	TCC	2	6	1730	1735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297543500
63	NC_014209	AGA	3	9	1849	1857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543500
64	NC_014209	TAG	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543500
65	NC_014209	TAA	2	6	2076	2081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543500
66	NC_014209	A	6	6	2080	2085	100 %	0 %	0 %	0 %	297543500
67	NC_014209	T	6	6	2225	2230	0 %	100 %	0 %	0 %	297543500
68	NC_014209	GAA	2	6	2231	2236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543500
69	NC_014209	AT	3	6	2285	2290	50 %	50 %	0 %	0 %	297543500
70	NC_014209	AGA	2	6	2299	2304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543500
71	NC_014209	AT	3	6	2322	2327	50 %	50 %	0 %	0 %	297543500
72	NC_014209	GAAG	2	8	2390	2397	50 %	0 %	50 %	0 %	297543500
73	NC_014209	AAT	2	6	2510	2515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543500
74	NC_014209	TTA	2	6	2544	2549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543500
75	NC_014209	GAA	3	9	2672	2680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543500
76	NC_014209	TAA	3	9	2715	2723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543500
77	NC_014209	T	6	6	2793	2798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014209	AT	3	6	2826	2831	50 %	50 %	0 %	0 %	297543501
79	NC_014209	AT	3	6	2853	2858	50 %	50 %	0 %	0 %	297543501
80	NC_014209	AAGCA	2	10	2882	2891	60 %	0 %	20 %	20 %	297543501
81	NC_014209	ATTT	2	8	2892	2899	25 %	75 %	0 %	0 %	297543501
82	NC_014209	AAAAGT	2	12	2907	2918	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	297543501
83	NC_014209	A	6	6	2947	2952	100 %	0 %	0 %	0 %	297543501
84	NC_014209	AGAAT	2	10	3068	3077	60 %	20 %	20 %	0 %	297543502
85	NC_014209	AATA	2	8	3088	3095	75 %	25 %	0 %	0 %	297543502
86	NC_014209	TTA	2	6	3131	3136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543502
87	NC_014209	ATT	2	6	3213	3218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543502
88	NC_014209	AAT	2	6	3232	3237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543502
89	NC_014209	A	7	7	3257	3263	100 %	0 %	0 %	0 %	297543502
90	NC_014209	A	6	6	3278	3283	100 %	0 %	0 %	0 %	297543502
91	NC_014209	TAA	2	6	3289	3294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543502
92	NC_014209	TTA	2	6	3297	3302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543502
93	NC_014209	AATAA	2	10	3314	3323	80 %	20 %	0 %	0 %	297543502
94	NC_014209	T	6	6	3363	3368	0 %	100 %	0 %	0 %	297543502
95	NC_014209	ATA	2	6	3386	3391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543502
96	NC_014209	AAG	2	6	3393	3398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543502
97	NC_014209	TAT	2	6	3439	3444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543502
98	NC_014209	A	6	6	3511	3516	100 %	0 %	0 %	0 %	297543502
99	NC_014209	AAG	2	6	3522	3527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543502
100	NC_014209	AT	3	6	3540	3545	50 %	50 %	0 %	0 %	297543502
101	NC_014209	TGA	2	6	3556	3561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543502
102	NC_014209	TAG	2	6	3567	3572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543502
103	NC_014209	AAT	2	6	3586	3591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543502
104	NC_014209	ATT	2	6	3606	3611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543502
105	NC_014209	A	6	6	3613	3618	100 %	0 %	0 %	0 %	297543502
106	NC_014209	A	7	7	3634	3640	100 %	0 %	0 %	0 %	297543502
107	NC_014209	A	8	8	3727	3734	100 %	0 %	0 %	0 %	297543502
108	NC_014209	GAAA	2	8	3739	3746	75 %	0 %	25 %	0 %	297543502
109	NC_014209	ACA	2	6	3785	3790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543502
110	NC_014209	ATT	2	6	3821	3826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543502
111	NC_014209	TTC	2	6	3853	3858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543502
112	NC_014209	A	6	6	3916	3921	100 %	0 %	0 %	0 %	297543502
113	NC_014209	GAT	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543502
114	NC_014209	A	6	6	3985	3990	100 %	0 %	0 %	0 %	297543502
115	NC_014209	TAC	2	6	4036	4041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543502
116	NC_014209	GTT	2	6	4088	4093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543502
117	NC_014209	A	6	6	4112	4117	100 %	0 %	0 %	0 %	297543503
118	NC_014209	GGC	2	6	4132	4137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297543503
119	NC_014209	TGT	2	6	4185	4190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543503
120	NC_014209	ACT	2	6	4192	4197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543503
121	NC_014209	GAA	2	6	4234	4239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543503
122	NC_014209	TTAT	3	12	4310	4321	25 %	75 %	0 %	0 %	297543503
123	NC_014209	A	6	6	4358	4363	100 %	0 %	0 %	0 %	297543503
124	NC_014209	ATT	2	6	4408	4413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543504
125	NC_014209	A	6	6	4424	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	297543504
126	NC_014209	ATT	2	6	4462	4467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543504
127	NC_014209	AGA	2	6	4488	4493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543504
128	NC_014209	A	6	6	4493	4498	100 %	0 %	0 %	0 %	297543504
129	NC_014209	AGAA	2	8	4518	4525	75 %	0 %	25 %	0 %	297543504
130	NC_014209	AGA	2	6	4557	4562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543504
131	NC_014209	TAAT	2	8	4655	4662	50 %	50 %	0 %	0 %	297543504
132	NC_014209	GAG	2	6	4676	4681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543504
133	NC_014209	AGA	2	6	4725	4730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543504
134	NC_014209	A	6	6	4771	4776	100 %	0 %	0 %	0 %	297543504
135	NC_014209	T	6	6	4857	4862	0 %	100 %	0 %	0 %	297543504
136	NC_014209	T	7	7	4920	4926	0 %	100 %	0 %	0 %	297543504
137	NC_014209	T	6	6	4957	4962	0 %	100 %	0 %	0 %	297543504
138	NC_014209	GGC	2	6	4972	4977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297543504
139	NC_014209	ACT	3	9	4985	4993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543504
140	NC_014209	TA	3	6	4995	5000	50 %	50 %	0 %	0 %	297543504
141	NC_014209	AGGA	2	8	5046	5053	50 %	0 %	50 %	0 %	297543504
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154	NC_014209	ATGGCA	2	12	5632	5643	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297543504
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164	NC_014209	CTTA	2	8	6020	6027	25 %	50 %	0 %	25 %	297543504
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173	NC_014209	GGA	2	6	6307	6312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543504
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