MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_014209	CTC	2	6	1921278	1921283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47002	NC_014209	GCT	2	6	1921360	1921365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47003	NC_014209	CT	3	6	1921372	1921377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47004	NC_014209	TCCC	2	8	1921379	1921386	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
47005	NC_014209	CG	3	6	1921461	1921466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47006	NC_014209	CCT	2	6	1921477	1921482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47007	NC_014209	CGG	2	6	1921614	1921619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47008	NC_014209	TC	3	6	1921659	1921664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47009	NC_014209	GCT	2	6	1921834	1921839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47010	NC_014209	CTTC	2	8	1921875	1921882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47011	NC_014209	CCT	2	6	1922015	1922020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47012	NC_014209	CCA	2	6	1922182	1922187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47013	NC_014209	GCA	2	6	1922244	1922249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47014	NC_014209	TCGCTT	2	12	1922270	1922281	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47015	NC_014209	CTCCC	2	10	1922415	1922424	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
47016	NC_014209	GTA	2	6	1922475	1922480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47017	NC_014209	GGT	2	6	1922494	1922499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47018	NC_014209	CCTC	2	8	1922500	1922507	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
47019	NC_014209	CTA	2	6	1922628	1922633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47020	NC_014209	CCT	2	6	1922699	1922704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47021	NC_014209	CTC	2	6	1922723	1922728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47022	NC_014209	TCGC	2	8	1922734	1922741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47023	NC_014209	TCTTT	2	10	1922760	1922769	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47024	NC_014209	GGGT	2	8	1922858	1922865	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47025	NC_014209	C	6	6	1922867	1922872	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47026	NC_014209	CGC	2	6	1922922	1922927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47027	NC_014209	CT	3	6	1922982	1922987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47028	NC_014209	TAA	2	6	1923044	1923049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47029	NC_014209	TGG	2	6	1923060	1923065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47030	NC_014209	TGG	2	6	1923138	1923143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47031	NC_014209	GAG	2	6	1923148	1923153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47032	NC_014209	CT	3	6	1923265	1923270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47033	NC_014209	AGG	2	6	1923279	1923284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47034	NC_014209	CTCC	2	8	1923358	1923365	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
47035	NC_014209	GTG	2	6	1923406	1923411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47036	NC_014209	GT	3	6	1923421	1923426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47037	NC_014209	GT	3	6	1923590	1923595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47038	NC_014209	ATG	2	6	1923615	1923620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47039	NC_014209	TCC	2	6	1923641	1923646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47040	NC_014209	TCC	2	6	1923650	1923655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47041	NC_014209	CACGA	2	10	1923741	1923750	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47042	NC_014209	GAC	2	6	1923754	1923759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47043	NC_014209	CAC	2	6	1923767	1923772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47044	NC_014209	CTA	2	6	1923821	1923826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47045	NC_014209	TTC	2	6	1923851	1923856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47046	NC_014209	AG	3	6	1924088	1924093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47047	NC_014209	TCC	2	6	1924113	1924118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47048	NC_014209	TTGA	2	8	1924232	1924239	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47049	NC_014209	GCT	2	6	1924303	1924308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47050	NC_014209	CTT	2	6	1924350	1924355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47051	NC_014209	TCC	2	6	1924389	1924394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47052	NC_014209	CTG	2	6	1924446	1924451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47053	NC_014209	ACC	2	6	1924496	1924501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47054	NC_014209	CGT	2	6	1924519	1924524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47055	NC_014209	TCC	2	6	1924603	1924608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47056	NC_014209	ACC	2	6	1924644	1924649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47057	NC_014209	CCG	2	6	1924707	1924712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47058	NC_014209	CGC	2	6	1924770	1924775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47059	NC_014209	TAT	2	6	1924899	1924904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47060	NC_014209	ATCT	2	8	1924908	1924915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47061	NC_014209	CTT	2	6	1924931	1924936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47062	NC_014209	TAG	2	6	1924958	1924963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47063	NC_014209	CGA	2	6	1924964	1924969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47064	NC_014209	AATAT	2	10	1924970	1924979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47065	NC_014209	AGT	2	6	1925003	1925008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47066	NC_014209	CTTTT	2	10	1925049	1925058	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47067	NC_014209	TAT	2	6	1925095	1925100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47068	NC_014209	T	6	6	1925104	1925109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47069	NC_014209	TA	3	6	1925114	1925119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47070	NC_014209	A	6	6	1925122	1925127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47071	NC_014209	T	6	6	1925176	1925181	0 %	100 %	0 %	0 %	297545294
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47074	NC_014209	CTTT	2	8	1925235	1925242	0 %	75 %	0 %	25 %	297545294
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47082	NC_014209	TA	3	6	1925607	1925612	50 %	50 %	0 %	0 %	297545295
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47085	NC_014209	TC	3	6	1925944	1925949	0 %	50 %	0 %	50 %	297545295
47086	NC_014209	AT	3	6	1925969	1925974	50 %	50 %	0 %	0 %	297545295
47087	NC_014209	T	6	6	1925982	1925987	0 %	100 %	0 %	0 %	297545295
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47089	NC_014209	ATA	2	6	1926038	1926043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47090	NC_014209	TTA	2	6	1926085	1926090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545296
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47092	NC_014209	ATT	2	6	1926210	1926215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545296
47093	NC_014209	A	6	6	1926231	1926236	100 %	0 %	0 %	0 %	297545296
47094	NC_014209	T	7	7	1926273	1926279	0 %	100 %	0 %	0 %	297545296
47095	NC_014209	TAC	2	6	1926319	1926324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545296
47096	NC_014209	TAAG	2	8	1926365	1926372	50 %	25 %	25 %	0 %	297545296
47097	NC_014209	TGC	2	6	1926374	1926379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545296
47098	NC_014209	T	6	6	1926380	1926385	0 %	100 %	0 %	0 %	297545296
47099	NC_014209	T	6	6	1926388	1926393	0 %	100 %	0 %	0 %	297545296
47100	NC_014209	AAT	2	6	1926424	1926429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545296
47101	NC_014209	TCG	2	6	1926549	1926554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545296
47102	NC_014209	AATTA	2	10	1926668	1926677	60 %	40 %	0 %	0 %	297545296
47103	NC_014209	CTT	2	6	1926679	1926684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545296
47104	NC_014209	CTTT	2	8	1926694	1926701	0 %	75 %	0 %	25 %	297545296
47105	NC_014209	TAC	2	6	1926782	1926787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545296
47106	NC_014209	CTT	2	6	1927092	1927097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545297
47107	NC_014209	TCA	3	9	1927131	1927139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545297
47108	NC_014209	AGT	2	6	1927222	1927227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545297
47109	NC_014209	AGTA	2	8	1927231	1927238	50 %	25 %	25 %	0 %	297545297
47110	NC_014209	TAG	2	6	1927302	1927307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545297
47111	NC_014209	TA	3	6	1927329	1927334	50 %	50 %	0 %	0 %	297545297
47112	NC_014209	A	6	6	1927354	1927359	100 %	0 %	0 %	0 %	297545297
47113	NC_014209	CAA	2	6	1927378	1927383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297545297
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47115	NC_014209	TAT	2	6	1927447	1927452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545297
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47117	NC_014209	GAA	2	6	1927501	1927506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297545297
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47120	NC_014209	CTG	2	6	1927566	1927571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545297
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47122	NC_014209	TA	3	6	1927640	1927645	50 %	50 %	0 %	0 %	297545298
47123	NC_014209	CTT	2	6	1927654	1927659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545298
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