MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46502	NC_014209	T	6	6	1899280	1899285	0 %	100 %	0 %	0 %	297545273
46503	NC_014209	TCT	2	6	1899308	1899313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545273
46504	NC_014209	TTA	2	6	1899414	1899419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545273
46505	NC_014209	CTTCT	2	10	1899435	1899444	0 %	60 %	0 %	40 %	297545273
46506	NC_014209	TCA	2	6	1899453	1899458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545273
46507	NC_014209	ATA	2	6	1899500	1899505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545273
46508	NC_014209	AT	3	6	1899611	1899616	50 %	50 %	0 %	0 %	297545273
46509	NC_014209	CT	3	6	1899640	1899645	0 %	50 %	0 %	50 %	297545273
46510	NC_014209	GTA	2	6	1899659	1899664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545273
46511	NC_014209	T	6	6	1899672	1899677	0 %	100 %	0 %	0 %	297545273
46512	NC_014209	CAT	2	6	1899727	1899732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545273
46513	NC_014209	ACA	2	6	1899761	1899766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297545273
46514	NC_014209	CCT	3	9	1899869	1899877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297545273
46515	NC_014209	AAT	2	6	1899891	1899896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545273
46516	NC_014209	ACC	2	6	1899931	1899936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297545273
46517	NC_014209	CTT	2	6	1899993	1899998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545273
46518	NC_014209	GCT	2	6	1900018	1900023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545273
46519	NC_014209	ACCT	2	8	1900114	1900121	25 %	25 %	0 %	50 %	297545273
46520	NC_014209	GCT	2	6	1900208	1900213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545273
46521	NC_014209	ATTT	2	8	1900268	1900275	25 %	75 %	0 %	0 %	297545274
46522	NC_014209	CAT	2	6	1900303	1900308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545274
46523	NC_014209	GAT	2	6	1900365	1900370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545274
46524	NC_014209	ATTT	2	8	1900381	1900388	25 %	75 %	0 %	0 %	297545274
46525	NC_014209	AAT	2	6	1900405	1900410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545274
46526	NC_014209	GACA	2	8	1900419	1900426	50 %	0 %	25 %	25 %	297545274
46527	NC_014209	AC	3	6	1900430	1900435	50 %	0 %	0 %	50 %	297545274
46528	NC_014209	TCC	2	6	1900489	1900494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46529	NC_014209	TTGA	2	8	1900566	1900573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46530	NC_014209	CT	3	6	1900578	1900583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46531	NC_014209	CTT	2	6	1900628	1900633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46532	NC_014209	CCA	2	6	1900634	1900639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46533	NC_014209	TCC	2	6	1900660	1900665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46534	NC_014209	TGT	2	6	1900668	1900673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46535	NC_014209	GCT	2	6	1900723	1900728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46536	NC_014209	ATTA	2	8	1900791	1900798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46537	NC_014209	ATA	2	6	1900802	1900807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46538	NC_014209	TAT	2	6	1900827	1900832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46539	NC_014209	AT	3	6	1900957	1900962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46540	NC_014209	TCT	2	6	1900966	1900971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46541	NC_014209	TCCT	2	8	1901008	1901015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46542	NC_014209	CTA	2	6	1901141	1901146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46543	NC_014209	TATC	2	8	1901172	1901179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46544	NC_014209	TTC	2	6	1901207	1901212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545275
46545	NC_014209	T	6	6	1901447	1901452	0 %	100 %	0 %	0 %	297545275
46546	NC_014209	CTT	2	6	1901458	1901463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545275
46547	NC_014209	T	7	7	1901467	1901473	0 %	100 %	0 %	0 %	297545275
46548	NC_014209	CAT	2	6	1901647	1901652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545275
46549	NC_014209	CTA	2	6	1901659	1901664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545275
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46551	NC_014209	CGG	2	6	1901752	1901757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297545275
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46553	NC_014209	CTA	2	6	1901872	1901877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545275
46554	NC_014209	TA	3	6	1901876	1901881	50 %	50 %	0 %	0 %	297545275
46555	NC_014209	C	6	6	1901925	1901930	0 %	0 %	0 %	100 %	297545275
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46557	NC_014209	T	6	6	1901980	1901985	0 %	100 %	0 %	0 %	297545275
46558	NC_014209	TCC	2	6	1902026	1902031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297545275
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46564	NC_014209	TATAT	2	10	1902283	1902292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46565	NC_014209	A	6	6	1902323	1902328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46566	NC_014209	TTA	2	6	1902329	1902334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46571	NC_014209	CT	3	6	1902651	1902656	0 %	50 %	0 %	50 %	297545276
46572	NC_014209	TTA	2	6	1902669	1902674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545276
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46582	NC_014209	TA	3	6	1903136	1903141	50 %	50 %	0 %	0 %	297545276
46583	NC_014209	ACC	3	9	1903208	1903216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297545276
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46589	NC_014209	C	6	6	1903454	1903459	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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46592	NC_014209	ATT	2	6	1903568	1903573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545277
46593	NC_014209	CTT	2	6	1903586	1903591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545277
46594	NC_014209	TA	3	6	1903597	1903602	50 %	50 %	0 %	0 %	297545277
46595	NC_014209	TTA	2	6	1903680	1903685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545277
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46604	NC_014209	AT	3	6	1904088	1904093	50 %	50 %	0 %	0 %	297545277
46605	NC_014209	T	6	6	1904147	1904152	0 %	100 %	0 %	0 %	297545277
46606	NC_014209	TAT	2	6	1904158	1904163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545277
46607	NC_014209	T	6	6	1904211	1904216	0 %	100 %	0 %	0 %	297545277
46608	NC_014209	CTT	2	6	1904262	1904267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545277
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46615	NC_014209	TC	3	6	1904666	1904671	0 %	50 %	0 %	50 %	297545278
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46618	NC_014209	T	6	6	1904729	1904734	0 %	100 %	0 %	0 %	297545278
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