MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46003	NC_014209	ATTC	2	8	1878294	1878301	25 %	50 %	0 %	25 %	297545258
46004	NC_014209	CTG	2	6	1878319	1878324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545258
46005	NC_014209	T	6	6	1878327	1878332	0 %	100 %	0 %	0 %	297545258
46006	NC_014209	TTCT	2	8	1878337	1878344	0 %	75 %	0 %	25 %	297545258
46007	NC_014209	TAT	2	6	1878438	1878443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545258
46008	NC_014209	CAA	2	6	1878474	1878479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297545258
46009	NC_014209	T	6	6	1878489	1878494	0 %	100 %	0 %	0 %	297545258
46010	NC_014209	TCTTT	2	10	1878509	1878518	0 %	80 %	0 %	20 %	297545258
46011	NC_014209	T	7	7	1878533	1878539	0 %	100 %	0 %	0 %	297545258
46012	NC_014209	T	6	6	1878584	1878589	0 %	100 %	0 %	0 %	297545258
46013	NC_014209	TCA	2	6	1878629	1878634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545258
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46017	NC_014209	TTA	2	6	1878822	1878827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545258
46018	NC_014209	TCA	2	6	1878851	1878856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545258
46019	NC_014209	T	6	6	1878879	1878884	0 %	100 %	0 %	0 %	297545258
46020	NC_014209	CTG	2	6	1878937	1878942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545258
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46028	NC_014209	AT	3	6	1879275	1879280	50 %	50 %	0 %	0 %	297545258
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46033	NC_014209	TAC	2	6	1879422	1879427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545258
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46052	NC_014209	TCTTTA	2	12	1879832	1879843	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	297545258
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46055	NC_014209	TAA	3	9	1880005	1880013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46088	NC_014209	TTA	2	6	1881064	1881069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46093	NC_014209	TAA	2	6	1881295	1881300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545260
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46101	NC_014209	CT	3	6	1881663	1881668	0 %	50 %	0 %	50 %	297545261
46102	NC_014209	TCT	2	6	1881742	1881747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545261
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46105	NC_014209	TCA	2	6	1881931	1881936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545261
46106	NC_014209	CAA	2	6	1881939	1881944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297545261
46107	NC_014209	CTCA	2	8	1882008	1882015	25 %	25 %	0 %	50 %	297545261
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46117	NC_014209	TTTA	2	8	1882296	1882303	25 %	75 %	0 %	0 %	297545261
46118	NC_014209	TCT	2	6	1882339	1882344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545261
46119	NC_014209	T	6	6	1882349	1882354	0 %	100 %	0 %	0 %	297545261
46120	NC_014209	AACA	2	8	1882391	1882398	75 %	0 %	0 %	25 %	297545261
46121	NC_014209	AGC	2	6	1882449	1882454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297545261
46122	NC_014209	TGCCAG	2	12	1882482	1882493	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297545261
46123	NC_014209	TCA	2	6	1882501	1882506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545261
46124	NC_014209	GGCAC	2	10	1882628	1882637	20 %	0 %	40 %	40 %	297545261
46125	NC_014209	T	6	6	1882706	1882711	0 %	100 %	0 %	0 %	297545261
46126	NC_014209	TA	3	6	1882736	1882741	50 %	50 %	0 %	0 %	297545261
46127	NC_014209	TCA	2	6	1882816	1882821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545261
46128	NC_014209	CTTAA	2	10	1882837	1882846	40 %	40 %	0 %	20 %	297545261
46129	NC_014209	CATA	2	8	1882884	1882891	50 %	25 %	0 %	25 %	297545261
46130	NC_014209	TTC	2	6	1882926	1882931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545261
46131	NC_014209	CTTT	2	8	1882969	1882976	0 %	75 %	0 %	25 %	297545261
46132	NC_014209	CTT	3	9	1883033	1883041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545261
46133	NC_014209	CTT	2	6	1883054	1883059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545261
46134	NC_014209	GTA	2	6	1883115	1883120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545261
46135	NC_014209	TCT	2	6	1883140	1883145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545261
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46137	NC_014209	TGCC	2	8	1883259	1883266	0 %	25 %	25 %	50 %	297545261
46138	NC_014209	TA	3	6	1883268	1883273	50 %	50 %	0 %	0 %	297545261
46139	NC_014209	AGAA	2	8	1883349	1883356	75 %	0 %	25 %	0 %	297545261
46140	NC_014209	CTT	2	6	1883373	1883378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545261
46141	NC_014209	T	6	6	1883385	1883390	0 %	100 %	0 %	0 %	297545261
46142	NC_014209	ACC	2	6	1883404	1883409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297545261
46143	NC_014209	CTTCTG	2	12	1883420	1883431	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	297545261
46144	NC_014209	A	6	6	1883454	1883459	100 %	0 %	0 %	0 %	297545261
46145	NC_014209	GCC	2	6	1883463	1883468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297545261
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46147	NC_014209	CTGC	2	8	1883513	1883520	0 %	25 %	25 %	50 %	297545261
46148	NC_014209	TTGCA	2	10	1883543	1883552	20 %	40 %	20 %	20 %	297545261
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46150	NC_014209	CGGT	2	8	1883587	1883594	0 %	25 %	50 %	25 %	297545261
46151	NC_014209	TAT	2	6	1883634	1883639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545261
46152	NC_014209	TTC	2	6	1883705	1883710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545261
46153	NC_014209	TCT	2	6	1883743	1883748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545261
46154	NC_014209	TTTA	2	8	1883754	1883761	25 %	75 %	0 %	0 %	297545261
46155	NC_014209	TTA	2	6	1883837	1883842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545261
46156	NC_014209	CTT	2	6	1883854	1883859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545261
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46161	NC_014209	TC	3	6	1884314	1884319	0 %	50 %	0 %	50 %	297545261
46162	NC_014209	TGT	2	6	1884320	1884325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297545261
46163	NC_014209	TTC	2	6	1884352	1884357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545261
46164	NC_014209	TTA	2	6	1884410	1884415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545261
46165	NC_014209	T	6	6	1884433	1884438	0 %	100 %	0 %	0 %	297545261
46166	NC_014209	CT	3	6	1884447	1884452	0 %	50 %	0 %	50 %	297545261
46167	NC_014209	GCC	2	6	1884529	1884534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297545261
46168	NC_014209	TTGA	2	8	1884558	1884565	25 %	50 %	25 %	0 %	297545261
46169	NC_014209	ATT	2	6	1884575	1884580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46170	NC_014209	TCA	2	6	1884639	1884644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545262
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46172	NC_014209	TCT	2	6	1884863	1884868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545262
46173	NC_014209	A	6	6	1884907	1884912	100 %	0 %	0 %	0 %	297545262
46174	NC_014209	CAA	2	6	1885018	1885023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297545262
46175	NC_014209	TCG	2	6	1885037	1885042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545262
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46177	NC_014209	CCA	2	6	1885160	1885165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297545262
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46179	NC_014209	TC	3	6	1885209	1885214	0 %	50 %	0 %	50 %	297545262
46180	NC_014209	T	6	6	1885261	1885266	0 %	100 %	0 %	0 %	297545262
46181	NC_014209	AGT	2	6	1885272	1885277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545262
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46183	NC_014209	TGTT	2	8	1885409	1885416	0 %	75 %	25 %	0 %	297545262
46184	NC_014209	TTA	2	6	1885487	1885492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545262
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46188	NC_014209	ATTT	2	8	1885746	1885753	25 %	75 %	0 %	0 %	297545262
46189	NC_014209	TCT	3	9	1885868	1885876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545262
46190	NC_014209	TCA	2	6	1885907	1885912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545262
46191	NC_014209	CTT	2	6	1885917	1885922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545262
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46195	NC_014209	CTTT	2	8	1886156	1886163	0 %	75 %	0 %	25 %	297545262
46196	NC_014209	TTC	2	6	1886236	1886241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545262
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46198	NC_014209	GCAG	2	8	1886267	1886274	25 %	0 %	50 %	25 %	297545262
46199	NC_014209	CTG	2	6	1886285	1886290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545262
46200	NC_014209	T	6	6	1886297	1886302	0 %	100 %	0 %	0 %	297545262
46201	NC_014209	CAT	2	6	1886307	1886312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545262
46202	NC_014209	AT	3	6	1886311	1886316	50 %	50 %	0 %	0 %	297545262
46203	NC_014209	ATAA	2	8	1886435	1886442	75 %	25 %	0 %	0 %	297545263
46204	NC_014209	TAA	2	6	1886489	1886494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545263
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46209	NC_014209	TTA	2	6	1886669	1886674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545263
46210	NC_014209	A	6	6	1886690	1886695	100 %	0 %	0 %	0 %	297545263
46211	NC_014209	TCA	2	6	1886704	1886709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545263
46212	NC_014209	TTA	2	6	1886717	1886722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545263
46213	NC_014209	TTC	2	6	1886744	1886749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545263
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46219	NC_014209	TTC	2	6	1887123	1887128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545263
46220	NC_014209	GTT	2	6	1887147	1887152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297545263
46221	NC_014209	T	6	6	1887194	1887199	0 %	100 %	0 %	0 %	297545263
46222	NC_014209	GTT	2	6	1887200	1887205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297545263
46223	NC_014209	G	7	7	1887212	1887218	0 %	0 %	100 %	0 %	297545263
46224	NC_014209	TTCTAT	2	12	1887222	1887233	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	297545263
46225	NC_014209	TGTTT	2	10	1887246	1887255	0 %	80 %	20 %	0 %	297545263
46226	NC_014209	TCT	2	6	1887298	1887303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545263
46227	NC_014209	AAT	2	6	1887317	1887322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545263
46228	NC_014209	TCA	2	6	1887343	1887348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545263
46229	NC_014209	GAT	2	6	1887354	1887359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545263
46230	NC_014209	TTG	2	6	1887369	1887374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297545263
46231	NC_014209	GGA	2	6	1887448	1887453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297545263
46232	NC_014209	TAA	2	6	1887468	1887473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545263
46233	NC_014209	TA	3	6	1887513	1887518	50 %	50 %	0 %	0 %	297545263
46234	NC_014209	TC	3	6	1887535	1887540	0 %	50 %	0 %	50 %	297545263
46235	NC_014209	TAA	2	6	1887545	1887550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545263
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