MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014209	ATG	2	6	162312	162317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543648
4002	NC_014209	AT	3	6	162340	162345	50 %	50 %	0 %	0 %	297543648
4003	NC_014209	GAA	2	6	162348	162353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543648
4004	NC_014209	AAG	2	6	162367	162372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543648
4005	NC_014209	TAT	2	6	162384	162389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543648
4006	NC_014209	AGA	2	6	162428	162433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543648
4007	NC_014209	ATA	2	6	162444	162449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543648
4008	NC_014209	ATG	2	6	162478	162483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543648
4009	NC_014209	TCT	2	6	162513	162518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543648
4010	NC_014209	ATA	2	6	162537	162542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543648
4011	NC_014209	A	8	8	162650	162657	100 %	0 %	0 %	0 %	297543648
4012	NC_014209	AGAATG	2	12	162666	162677	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	297543648
4013	NC_014209	A	6	6	162681	162686	100 %	0 %	0 %	0 %	297543648
4014	NC_014209	TCT	2	6	162690	162695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543648
4015	NC_014209	A	6	6	162702	162707	100 %	0 %	0 %	0 %	297543648
4016	NC_014209	ACCA	2	8	162755	162762	50 %	0 %	0 %	50 %	297543648
4017	NC_014209	T	7	7	162780	162786	0 %	100 %	0 %	0 %	297543648
4018	NC_014209	GAT	2	6	162798	162803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543648
4019	NC_014209	ATA	3	9	162966	162974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543648
4020	NC_014209	GA	3	6	163086	163091	50 %	0 %	50 %	0 %	297543648
4021	NC_014209	AGT	2	6	163120	163125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_014209	AATA	2	8	163158	163165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_014209	AG	3	6	163215	163220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_014209	TAG	2	6	163289	163294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_014209	GT	3	6	163327	163332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_014209	GAA	2	6	163369	163374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_014209	GGT	2	6	163376	163381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_014209	T	6	6	163416	163421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_014209	GAG	2	6	163434	163439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_014209	GAA	2	6	163449	163454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543649
4031	NC_014209	CTAT	2	8	163475	163482	25 %	50 %	0 %	25 %	297543649
4032	NC_014209	TCAT	2	8	163509	163516	25 %	50 %	0 %	25 %	297543649
4033	NC_014209	TAC	2	6	163518	163523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543649
4034	NC_014209	TGC	2	6	163527	163532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543649
4035	NC_014209	ATG	2	6	163568	163573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543649
4036	NC_014209	TGA	2	6	163593	163598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543649
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4039	NC_014209	A	6	6	163760	163765	100 %	0 %	0 %	0 %	297543649
4040	NC_014209	AT	3	6	163793	163798	50 %	50 %	0 %	0 %	297543649
4041	NC_014209	GTACT	2	10	163821	163830	20 %	40 %	20 %	20 %	297543649
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4043	NC_014209	T	7	7	163923	163929	0 %	100 %	0 %	0 %	297543649
4044	NC_014209	ATG	2	6	163967	163972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543649
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4046	NC_014209	GGA	2	6	164040	164045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543649
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4050	NC_014209	CAG	2	6	164198	164203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543649
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4052	NC_014209	ATA	2	6	164245	164250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543649
4053	NC_014209	A	6	6	164290	164295	100 %	0 %	0 %	0 %	297543649
4054	NC_014209	GGCT	2	8	164308	164315	0 %	25 %	50 %	25 %	297543649
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4056	NC_014209	GTA	2	6	164356	164361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543649
4057	NC_014209	GA	3	6	164418	164423	50 %	0 %	50 %	0 %	297543649
4058	NC_014209	AGA	2	6	164577	164582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543649
4059	NC_014209	GAT	2	6	164587	164592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543649
4060	NC_014209	ACT	2	6	164602	164607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543649
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4062	NC_014209	AATA	2	8	164701	164708	75 %	25 %	0 %	0 %	297543649
4063	NC_014209	TA	3	6	164777	164782	50 %	50 %	0 %	0 %	297543649
4064	NC_014209	A	8	8	164844	164851	100 %	0 %	0 %	0 %	297543649
4065	NC_014209	AGA	2	6	164871	164876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543649
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4083	NC_014209	TAA	2	6	165452	165457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543650
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4085	NC_014209	TA	3	6	165519	165524	50 %	50 %	0 %	0 %	297543650
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4088	NC_014209	AGCT	2	8	165590	165597	25 %	25 %	25 %	25 %	297543650
4089	NC_014209	ATT	3	9	165638	165646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543650
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4091	NC_014209	AAT	3	9	165723	165731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543650
4092	NC_014209	AT	3	6	165755	165760	50 %	50 %	0 %	0 %	297543650
4093	NC_014209	A	6	6	165771	165776	100 %	0 %	0 %	0 %	297543650
4094	NC_014209	A	6	6	165900	165905	100 %	0 %	0 %	0 %	297543650
4095	NC_014209	AAG	2	6	165911	165916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543650
4096	NC_014209	GAG	2	6	166063	166068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543650
4097	NC_014209	A	8	8	166132	166139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_014209	AATC	2	8	166245	166252	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4099	NC_014209	TTAC	2	8	166267	166274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4100	NC_014209	TAAAT	2	10	166283	166292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_014209	AGG	2	6	166300	166305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_014209	TTG	2	6	166306	166311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_014209	A	6	6	166355	166360	100 %	0 %	0 %	0 %	297543651
4104	NC_014209	A	7	7	166460	166466	100 %	0 %	0 %	0 %	297543651
4105	NC_014209	GTT	2	6	166469	166474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543651
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4107	NC_014209	AGA	2	6	166507	166512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543651
4108	NC_014209	A	7	7	166528	166534	100 %	0 %	0 %	0 %	297543651
4109	NC_014209	GTA	2	6	166541	166546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543651
4110	NC_014209	CTT	2	6	166551	166556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543651
4111	NC_014209	A	6	6	166570	166575	100 %	0 %	0 %	0 %	297543651
4112	NC_014209	TG	3	6	166619	166624	0 %	50 %	50 %	0 %	297543651
4113	NC_014209	A	6	6	166636	166641	100 %	0 %	0 %	0 %	297543651
4114	NC_014209	CTG	2	6	166650	166655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543651
4115	NC_014209	AAG	2	6	166668	166673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543651
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4117	NC_014209	GTACAT	2	12	166747	166758	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297543651
4118	NC_014209	AAG	2	6	166794	166799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543651
4119	NC_014209	A	6	6	166828	166833	100 %	0 %	0 %	0 %	297543651
4120	NC_014209	AGT	2	6	166861	166866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543651
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4122	NC_014209	TGA	2	6	166899	166904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543651
4123	NC_014209	TTAT	2	8	166908	166915	25 %	75 %	0 %	0 %	297543651
4124	NC_014209	A	6	6	166936	166941	100 %	0 %	0 %	0 %	297543651
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