MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_014209	CCA	2	6	1671997	1672002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297545099
41002	NC_014209	AGC	2	6	1672086	1672091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297545099
41003	NC_014209	TA	4	8	1672153	1672160	50 %	50 %	0 %	0 %	297545099
41004	NC_014209	TAT	2	6	1672203	1672208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545099
41005	NC_014209	CAACCA	2	12	1672223	1672234	50 %	0 %	0 %	50 %	297545099
41006	NC_014209	TTC	2	6	1672251	1672256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545099
41007	NC_014209	ATT	2	6	1672341	1672346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545099
41008	NC_014209	CAT	2	6	1672356	1672361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545099
41009	NC_014209	CATTA	2	10	1672435	1672444	40 %	40 %	0 %	20 %	297545100
41010	NC_014209	GAA	2	6	1672470	1672475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297545100
41011	NC_014209	TTC	2	6	1672483	1672488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545100
41012	NC_014209	AAT	2	6	1672490	1672495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545100
41013	NC_014209	AT	3	6	1672501	1672506	50 %	50 %	0 %	0 %	297545100
41014	NC_014209	TTC	2	6	1672537	1672542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545100
41015	NC_014209	CCT	2	6	1672589	1672594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297545100
41016	NC_014209	CTG	2	6	1672605	1672610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545100
41017	NC_014209	TGC	2	6	1672627	1672632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545100
41018	NC_014209	T	7	7	1672715	1672721	0 %	100 %	0 %	0 %	297545100
41019	NC_014209	TCC	2	6	1672729	1672734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297545100
41020	NC_014209	TACT	2	8	1672755	1672762	25 %	50 %	0 %	25 %	297545100
41021	NC_014209	ATC	2	6	1672787	1672792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545100
41022	NC_014209	CTA	2	6	1672890	1672895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545100
41023	NC_014209	CCA	2	6	1672915	1672920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297545100
41024	NC_014209	TAA	2	6	1672975	1672980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545100
41025	NC_014209	T	6	6	1673001	1673006	0 %	100 %	0 %	0 %	297545100
41026	NC_014209	CA	3	6	1673032	1673037	50 %	0 %	0 %	50 %	297545100
41027	NC_014209	CAA	2	6	1673043	1673048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297545100
41028	NC_014209	TCT	2	6	1673117	1673122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545100
41029	NC_014209	CA	3	6	1673130	1673135	50 %	0 %	0 %	50 %	297545100
41030	NC_014209	CTT	2	6	1673151	1673156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545100
41031	NC_014209	ATC	2	6	1673158	1673163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545100
41032	NC_014209	CATTAC	2	12	1673191	1673202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545100
41033	NC_014209	CTG	2	6	1673229	1673234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545100
41034	NC_014209	ATT	2	6	1673294	1673299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545100
41035	NC_014209	AT	4	8	1673344	1673351	50 %	50 %	0 %	0 %	297545100
41036	NC_014209	TCT	2	6	1673366	1673371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545100
41037	NC_014209	GAAA	2	8	1673403	1673410	75 %	0 %	25 %	0 %	297545100
41038	NC_014209	CTTT	2	8	1673428	1673435	0 %	75 %	0 %	25 %	297545100
41039	NC_014209	AAC	2	6	1673500	1673505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297545100
41040	NC_014209	CTT	2	6	1673535	1673540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545100
41041	NC_014209	TCC	2	6	1673608	1673613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297545100
41042	NC_014209	A	6	6	1673624	1673629	100 %	0 %	0 %	0 %	297545100
41043	NC_014209	TTTG	2	8	1673662	1673669	0 %	75 %	25 %	0 %	297545100
41044	NC_014209	GCA	2	6	1673681	1673686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297545100
41045	NC_014209	ATGA	2	8	1673709	1673716	50 %	25 %	25 %	0 %	297545100
41046	NC_014209	T	7	7	1673761	1673767	0 %	100 %	0 %	0 %	297545100
41047	NC_014209	CCTG	2	8	1673831	1673838	0 %	25 %	25 %	50 %	297545100
41048	NC_014209	TTA	2	6	1673841	1673846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545100
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41050	NC_014209	TTC	2	6	1673935	1673940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545100
41051	NC_014209	CTT	2	6	1673982	1673987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545100
41052	NC_014209	ATA	2	6	1674110	1674115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545101
41053	NC_014209	GT	3	6	1674128	1674133	0 %	50 %	50 %	0 %	297545101
41054	NC_014209	ATG	2	6	1674156	1674161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545101
41055	NC_014209	TCC	2	6	1674165	1674170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297545101
41056	NC_014209	CCAT	2	8	1674180	1674187	25 %	25 %	0 %	50 %	297545101
41057	NC_014209	CTT	2	6	1674251	1674256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545101
41058	NC_014209	CGG	2	6	1674366	1674371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297545101
41059	NC_014209	CTG	2	6	1674575	1674580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545101
41060	NC_014209	CATATC	2	12	1674581	1674592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545101
41061	NC_014209	CAT	2	6	1674618	1674623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545101
41062	NC_014209	TAA	2	6	1674695	1674700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545101
41063	NC_014209	T	6	6	1674705	1674710	0 %	100 %	0 %	0 %	297545101
41064	NC_014209	GCA	2	6	1674730	1674735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297545101
41065	NC_014209	TTC	2	6	1674747	1674752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545101
41066	NC_014209	TTCT	2	8	1674778	1674785	0 %	75 %	0 %	25 %	297545101
41067	NC_014209	AT	3	6	1674832	1674837	50 %	50 %	0 %	0 %	297545101
41068	NC_014209	CAT	2	6	1674899	1674904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545101
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41070	NC_014209	CAA	2	6	1675001	1675006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297545101
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41072	NC_014209	TTC	2	6	1675017	1675022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545101
41073	NC_014209	TTC	2	6	1675032	1675037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545101
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41077	NC_014209	ATA	2	6	1675249	1675254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545101
41078	NC_014209	TGC	2	6	1675314	1675319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545101
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41082	NC_014209	ATA	2	6	1675471	1675476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545101
41083	NC_014209	TCC	2	6	1675479	1675484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41084	NC_014209	TGT	2	6	1675501	1675506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41085	NC_014209	GTAC	2	8	1675537	1675544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41086	NC_014209	TAAT	2	8	1675550	1675557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41087	NC_014209	AT	3	6	1675556	1675561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41088	NC_014209	CTT	2	6	1675583	1675588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41089	NC_014209	A	6	6	1675596	1675601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41090	NC_014209	AAAT	2	8	1675622	1675629	75 %	25 %	0 %	0 %	297545102
41091	NC_014209	TA	3	6	1675649	1675654	50 %	50 %	0 %	0 %	297545102
41092	NC_014209	CTT	2	6	1675708	1675713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545102
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41094	NC_014209	TCT	2	6	1675885	1675890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545103
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41100	NC_014209	TCT	2	6	1676191	1676196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545103
41101	NC_014209	CT	3	6	1676262	1676267	0 %	50 %	0 %	50 %	297545103
41102	NC_014209	AATA	2	8	1676408	1676415	75 %	25 %	0 %	0 %	297545103
41103	NC_014209	AGG	2	6	1676451	1676456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297545103
41104	NC_014209	ACA	2	6	1676457	1676462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297545103
41105	NC_014209	TTC	2	6	1676566	1676571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545103
41106	NC_014209	TAA	2	6	1676591	1676596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545103
41107	NC_014209	A	6	6	1676670	1676675	100 %	0 %	0 %	0 %	297545103
41108	NC_014209	GTTAT	2	10	1676800	1676809	20 %	60 %	20 %	0 %	297545103
41109	NC_014209	TAAG	2	8	1676883	1676890	50 %	25 %	25 %	0 %	297545103
41110	NC_014209	TC	3	6	1676926	1676931	0 %	50 %	0 %	50 %	297545103
41111	NC_014209	TCA	2	6	1677031	1677036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545103
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41114	NC_014209	ATA	2	6	1677225	1677230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545103
41115	NC_014209	CAG	2	6	1677236	1677241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297545103
41116	NC_014209	T	6	6	1677297	1677302	0 %	100 %	0 %	0 %	297545103
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41118	NC_014209	CTG	2	6	1677348	1677353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545103
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