MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014209	TGC	2	6	142510	142515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_014209	TGG	2	6	142572	142577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_014209	AGG	2	6	142739	142744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_014209	GAAG	2	8	142877	142884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_014209	AGC	2	6	142920	142925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_014209	AG	3	6	143094	143099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_014209	CCG	2	6	143140	143145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_014209	AGG	2	6	143277	143282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_014209	GC	3	6	143292	143297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3510	NC_014209	AG	3	6	143382	143387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_014209	AGC	2	6	143394	143399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_014209	GAG	2	6	143476	143481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_014209	AGAGG	2	10	143602	143611	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_014209	AGGGG	2	10	143701	143710	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_014209	CGG	2	6	143740	143745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_014209	TGA	2	6	143834	143839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_014209	GTA	2	6	143856	143861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_014209	CGG	2	6	143999	144004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_014209	ACC	2	6	144011	144016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_014209	ACT	2	6	144022	144027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_014209	GAG	2	6	144047	144052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_014209	CCT	2	6	144099	144104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_014209	CG	3	6	144152	144157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_014209	CGG	2	6	144235	144240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_014209	AGTG	2	8	144242	144249	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_014209	CGT	2	6	144431	144436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_014209	GTT	2	6	144534	144539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_014209	GAC	2	6	144657	144662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_014209	T	7	7	144925	144931	0 %	100 %	0 %	0 %	297543626
3530	NC_014209	AT	4	8	144932	144939	50 %	50 %	0 %	0 %	297543626
3531	NC_014209	A	6	6	144992	144997	100 %	0 %	0 %	0 %	297543626
3532	NC_014209	T	6	6	145010	145015	0 %	100 %	0 %	0 %	297543626
3533	NC_014209	CCA	2	6	145032	145037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297543626
3534	NC_014209	CAT	2	6	145135	145140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543626
3535	NC_014209	AGA	2	6	145158	145163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543627
3536	NC_014209	T	7	7	145209	145215	0 %	100 %	0 %	0 %	297543627
3537	NC_014209	T	7	7	145221	145227	0 %	100 %	0 %	0 %	297543627
3538	NC_014209	T	7	7	145306	145312	0 %	100 %	0 %	0 %	297543627
3539	NC_014209	ATAG	2	8	145331	145338	50 %	25 %	25 %	0 %	297543627
3540	NC_014209	GCA	2	6	145349	145354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543627
3541	NC_014209	AAG	2	6	145429	145434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543627
3542	NC_014209	ATT	2	6	145445	145450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543627
3543	NC_014209	ATGA	2	8	145471	145478	50 %	25 %	25 %	0 %	297543627
3544	NC_014209	AAT	2	6	145496	145501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543627
3545	NC_014209	T	6	6	145505	145510	0 %	100 %	0 %	0 %	297543627
3546	NC_014209	TCA	2	6	145589	145594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543627
3547	NC_014209	CCT	2	6	145628	145633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297543627
3548	NC_014209	AGT	2	6	145909	145914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543627
3549	NC_014209	GATA	2	8	145964	145971	50 %	25 %	25 %	0 %	297543627
3550	NC_014209	AGA	2	6	145984	145989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543627
3551	NC_014209	TAA	2	6	146003	146008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543627
3552	NC_014209	ATT	2	6	146032	146037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543627
3553	NC_014209	T	6	6	146058	146063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_014209	TTTAA	2	10	146110	146119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_014209	TAC	2	6	146123	146128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_014209	ATA	2	6	146219	146224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_014209	A	7	7	146257	146263	100 %	0 %	0 %	0 %	297543628
3558	NC_014209	AAAAAG	2	12	146266	146277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	297543628
3559	NC_014209	TTC	2	6	146399	146404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543628
3560	NC_014209	GA	3	6	146436	146441	50 %	0 %	50 %	0 %	297543628
3561	NC_014209	GTA	2	6	146456	146461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543628
3562	NC_014209	AC	3	6	146583	146588	50 %	0 %	0 %	50 %	297543628
3563	NC_014209	TGA	2	6	146654	146659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543628
3564	NC_014209	ATG	2	6	146677	146682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543628
3565	NC_014209	AAT	2	6	146694	146699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543628
3566	NC_014209	TGG	2	6	146743	146748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543628
3567	NC_014209	A	6	6	146889	146894	100 %	0 %	0 %	0 %	297543628
3568	NC_014209	AGG	2	6	146905	146910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_014209	ATTG	2	8	147014	147021	25 %	50 %	25 %	0 %	297543629
3570	NC_014209	GAA	2	6	147096	147101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543629
3571	NC_014209	TGA	2	6	147104	147109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543629
3572	NC_014209	A	6	6	147133	147138	100 %	0 %	0 %	0 %	297543629
3573	NC_014209	T	6	6	147184	147189	0 %	100 %	0 %	0 %	297543630
3574	NC_014209	ATA	2	6	147196	147201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543630
3575	NC_014209	ACG	2	6	147292	147297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543630
3576	NC_014209	AGG	2	6	147336	147341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543630
3577	NC_014209	CACT	2	8	147389	147396	25 %	25 %	0 %	50 %	297543630
3578	NC_014209	GTTCA	2	10	147419	147428	20 %	40 %	20 %	20 %	297543630
3579	NC_014209	ATT	2	6	147439	147444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543630
3580	NC_014209	T	6	6	147453	147458	0 %	100 %	0 %	0 %	297543630
3581	NC_014209	TTAAAA	2	12	147482	147493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543630
3582	NC_014209	GTT	2	6	147514	147519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543630
3583	NC_014209	ATC	2	6	147603	147608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543630
3584	NC_014209	TC	3	6	147613	147618	0 %	50 %	0 %	50 %	297543630
3585	NC_014209	TA	3	6	147629	147634	50 %	50 %	0 %	0 %	297543630
3586	NC_014209	AAT	2	6	147696	147701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543630
3587	NC_014209	AGG	2	6	147729	147734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_014209	GAAAA	2	10	147746	147755	80 %	0 %	20 %	0 %	297543631
3589	NC_014209	A	6	6	147752	147757	100 %	0 %	0 %	0 %	297543631
3590	NC_014209	ATG	2	6	147765	147770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543631
3591	NC_014209	TAG	2	6	147771	147776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543631
3592	NC_014209	CTG	2	6	147792	147797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543631
3593	NC_014209	CAG	2	6	147804	147809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543631
3594	NC_014209	TA	3	6	147811	147816	50 %	50 %	0 %	0 %	297543631
3595	NC_014209	TC	3	6	147857	147862	0 %	50 %	0 %	50 %	297543631
3596	NC_014209	TGG	2	6	147865	147870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543631
3597	NC_014209	TGA	2	6	147939	147944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543631
3598	NC_014209	ATT	2	6	147946	147951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543631
3599	NC_014209	AGA	3	9	148015	148023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543631
3600	NC_014209	AGT	2	6	148030	148035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543631
3601	NC_014209	ATT	2	6	148053	148058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543631
3602	NC_014209	TTA	2	6	148071	148076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543631
3603	NC_014209	AGG	2	6	148084	148089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543631
3604	NC_014209	GA	3	6	148255	148260	50 %	0 %	50 %	0 %	297543631
3605	NC_014209	A	6	6	148330	148335	100 %	0 %	0 %	0 %	297543631
3606	NC_014209	A	6	6	148338	148343	100 %	0 %	0 %	0 %	297543631
3607	NC_014209	GTT	2	6	148403	148408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543631
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3609	NC_014209	TGTAGA	2	12	148441	148452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543631
3610	NC_014209	GTT	2	6	148455	148460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543631
3611	NC_014209	TAA	2	6	148506	148511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543631
3612	NC_014209	TTATA	2	10	148528	148537	40 %	60 %	0 %	0 %	297543631
3613	NC_014209	AT	3	6	148663	148668	50 %	50 %	0 %	0 %	297543631
3614	NC_014209	A	6	6	148790	148795	100 %	0 %	0 %	0 %	297543631
3615	NC_014209	GATA	2	8	148822	148829	50 %	25 %	25 %	0 %	297543631
3616	NC_014209	TGT	2	6	148888	148893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543631
3617	NC_014209	AAG	2	6	148896	148901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543631
3618	NC_014209	TA	3	6	148960	148965	50 %	50 %	0 %	0 %	297543631
3619	NC_014209	ATT	2	6	149014	149019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_014209	CGG	2	6	149090	149095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_014209	CCT	2	6	149141	149146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_014209	TCA	2	6	149245	149250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_014209	TAT	2	6	149279	149284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_014209	GGA	2	6	149305	149310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_014209	GAA	2	6	149330	149335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3627	NC_014209	TAT	2	6	149423	149428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543632
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