MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014209	AGG	2	6	120201	120206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_014209	GCA	2	6	120232	120237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543614
3003	NC_014209	A	6	6	120248	120253	100 %	0 %	0 %	0 %	297543614
3004	NC_014209	TAA	2	6	120254	120259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543614
3005	NC_014209	TTG	3	9	120287	120295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543614
3006	NC_014209	A	6	6	120453	120458	100 %	0 %	0 %	0 %	297543614
3007	NC_014209	CAA	2	6	120459	120464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543614
3008	NC_014209	A	6	6	120493	120498	100 %	0 %	0 %	0 %	297543614
3009	NC_014209	A	7	7	120519	120525	100 %	0 %	0 %	0 %	297543614
3010	NC_014209	TTC	2	6	120582	120587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543614
3011	NC_014209	AAG	2	6	120595	120600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543614
3012	NC_014209	CTA	2	6	120602	120607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543614
3013	NC_014209	TA	3	6	120613	120618	50 %	50 %	0 %	0 %	297543614
3014	NC_014209	AT	3	6	120711	120716	50 %	50 %	0 %	0 %	297543614
3015	NC_014209	TGA	2	6	120738	120743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543614
3016	NC_014209	AAG	2	6	120761	120766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543614
3017	NC_014209	ATG	2	6	120812	120817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543614
3018	NC_014209	CAAA	2	8	120864	120871	75 %	0 %	0 %	25 %	297543614
3019	NC_014209	AAG	2	6	120875	120880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543614
3020	NC_014209	TCT	2	6	120951	120956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543614
3021	NC_014209	GCAA	2	8	120976	120983	50 %	0 %	25 %	25 %	297543614
3022	NC_014209	GAAT	2	8	121004	121011	50 %	25 %	25 %	0 %	297543614
3023	NC_014209	ATG	2	6	121052	121057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543614
3024	NC_014209	TCT	2	6	121135	121140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543614
3025	NC_014209	CAA	2	6	121351	121356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543614
3026	NC_014209	AGG	2	6	121382	121387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543614
3027	NC_014209	TAA	2	6	121401	121406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543614
3028	NC_014209	AT	3	6	121437	121442	50 %	50 %	0 %	0 %	297543614
3029	NC_014209	AAAT	2	8	121476	121483	75 %	25 %	0 %	0 %	297543614
3030	NC_014209	TA	3	6	121559	121564	50 %	50 %	0 %	0 %	297543614
3031	NC_014209	AAT	2	6	121570	121575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543614
3032	NC_014209	TA	3	6	121610	121615	50 %	50 %	0 %	0 %	297543614
3033	NC_014209	TA	3	6	121631	121636	50 %	50 %	0 %	0 %	297543614
3034	NC_014209	CTT	2	6	121648	121653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543614
3035	NC_014209	A	6	6	121742	121747	100 %	0 %	0 %	0 %	297543614
3036	NC_014209	TCA	2	6	121753	121758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543614
3037	NC_014209	AGA	2	6	121813	121818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543614
3038	NC_014209	TGGG	2	8	121879	121886	0 %	25 %	75 %	0 %	297543614
3039	NC_014209	CTT	3	9	121899	121907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543614
3040	NC_014209	GATA	2	8	121908	121915	50 %	25 %	25 %	0 %	297543614
3041	NC_014209	TAG	2	6	121988	121993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543614
3042	NC_014209	GGT	2	6	122007	122012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543614
3043	NC_014209	CTA	2	6	122064	122069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543614
3044	NC_014209	TAA	2	6	122075	122080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543614
3045	NC_014209	TC	3	6	122092	122097	0 %	50 %	0 %	50 %	297543614
3046	NC_014209	AGT	2	6	122160	122165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543614
3047	NC_014209	ATT	2	6	122166	122171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543614
3048	NC_014209	TCA	2	6	122188	122193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543614
3049	NC_014209	GGA	2	6	122194	122199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543614
3050	NC_014209	TAA	2	6	122237	122242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543614
3051	NC_014209	GCT	2	6	122439	122444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_014209	TAG	2	6	122448	122453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_014209	AAC	2	6	122491	122496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_014209	ACA	2	6	122503	122508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_014209	A	6	6	122508	122513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_014209	TAA	2	6	122525	122530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_014209	TAA	2	6	122705	122710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543615
3058	NC_014209	CAG	2	6	122752	122757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543615
3059	NC_014209	CTG	2	6	122815	122820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543615
3060	NC_014209	GGCA	2	8	122825	122832	25 %	0 %	50 %	25 %	297543615
3061	NC_014209	CAG	2	6	122873	122878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543615
3062	NC_014209	AAT	2	6	123006	123011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543615
3063	NC_014209	ATTACA	2	12	123052	123063	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297543615
3064	NC_014209	GAA	2	6	123108	123113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543615
3065	NC_014209	TAA	2	6	123212	123217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543615
3066	NC_014209	ATA	2	6	123430	123435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543615
3067	NC_014209	AT	3	6	123438	123443	50 %	50 %	0 %	0 %	297543615
3068	NC_014209	TTC	2	6	123477	123482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543615
3069	NC_014209	CAAG	2	8	123534	123541	50 %	0 %	25 %	25 %	297543615
3070	NC_014209	GAT	2	6	123579	123584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543615
3071	NC_014209	AAGTT	2	10	123658	123667	40 %	40 %	20 %	0 %	297543615
3072	NC_014209	TTA	2	6	123731	123736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543615
3073	NC_014209	G	6	6	123758	123763	0 %	0 %	100 %	0 %	297543615
3074	NC_014209	TAAA	2	8	123787	123794	75 %	25 %	0 %	0 %	297543615
3075	NC_014209	ATG	2	6	123952	123957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543615
3076	NC_014209	CTT	2	6	124034	124039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543615
3077	NC_014209	GAT	2	6	124062	124067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543615
3078	NC_014209	CTG	2	6	124153	124158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543615
3079	NC_014209	A	6	6	124203	124208	100 %	0 %	0 %	0 %	297543615
3080	NC_014209	TGA	2	6	124274	124279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543615
3081	NC_014209	GATA	2	8	124293	124300	50 %	25 %	25 %	0 %	297543615
3082	NC_014209	TGG	2	6	124416	124421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543615
3083	NC_014209	ATAA	2	8	124497	124504	75 %	25 %	0 %	0 %	297543615
3084	NC_014209	GATG	2	8	124563	124570	25 %	25 %	50 %	0 %	297543615
3085	NC_014209	CAT	2	6	124681	124686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543615
3086	NC_014209	TGA	2	6	124772	124777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543615
3087	NC_014209	TA	3	6	124835	124840	50 %	50 %	0 %	0 %	297543615
3088	NC_014209	GA	3	6	124842	124847	50 %	0 %	50 %	0 %	297543615
3089	NC_014209	CTA	2	6	124870	124875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543615
3090	NC_014209	CTG	2	6	124933	124938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543615
3091	NC_014209	GCT	2	6	124959	124964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543615
3092	NC_014209	CGA	2	6	125045	125050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543615
3093	NC_014209	GGGAA	2	10	125102	125111	40 %	0 %	60 %	0 %	297543615
3094	NC_014209	GAA	3	9	125227	125235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543615
3095	NC_014209	TTG	2	6	125287	125292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543615
3096	NC_014209	TAAT	2	8	125293	125300	50 %	50 %	0 %	0 %	297543615
3097	NC_014209	ATG	2	6	125398	125403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543615
3098	NC_014209	TTG	2	6	125410	125415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543615
3099	NC_014209	ATGG	2	8	125430	125437	25 %	25 %	50 %	0 %	297543615
3100	NC_014209	AGG	2	6	125588	125593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543615
3101	NC_014209	A	6	6	125602	125607	100 %	0 %	0 %	0 %	297543615
3102	NC_014209	AAT	2	6	125802	125807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543615
3103	NC_014209	TA	3	6	125938	125943	50 %	50 %	0 %	0 %	297543615
3104	NC_014209	AAT	2	6	126015	126020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543615
3105	NC_014209	TCT	2	6	126084	126089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543615
3106	NC_014209	ACAG	2	8	126110	126117	50 %	0 %	25 %	25 %	297543615
3107	NC_014209	TCC	2	6	126158	126163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297543615
3108	NC_014209	TGA	2	6	126233	126238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543615
3109	NC_014209	GT	3	6	126319	126324	0 %	50 %	50 %	0 %	297543615
3110	NC_014209	GTA	2	6	126345	126350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543615
3111	NC_014209	TAT	3	9	126363	126371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543615
3112	NC_014209	CCT	2	6	126391	126396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297543615
3113	NC_014209	ATA	2	6	126397	126402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543615
3114	NC_014209	ATA	2	6	126438	126443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543615
3115	NC_014209	TGA	2	6	126488	126493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543615
3116	NC_014209	ACTT	2	8	126587	126594	25 %	50 %	0 %	25 %	297543615
3117	NC_014209	TAA	2	6	126724	126729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543615
3118	NC_014209	GA	3	6	126749	126754	50 %	0 %	50 %	0 %	297543615
3119	NC_014209	AT	4	8	126762	126769	50 %	50 %	0 %	0 %	297543615
3120	NC_014209	ACA	2	6	126784	126789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543615
3121	NC_014209	ATG	2	6	126862	126867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543615
3122	NC_014209	CAA	2	6	126879	126884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543615
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3124	NC_014209	GA	3	6	127026	127031	50 %	0 %	50 %	0 %	297543615
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