MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014209	AAAGA	2	10	653433	653442	80 %	0 %	20 %	0 %	297544087
16002	NC_014209	GGC	2	6	653465	653470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297544087
16003	NC_014209	AGC	2	6	653477	653482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297544087
16004	NC_014209	AGA	2	6	653486	653491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544087
16005	NC_014209	AGA	2	6	653534	653539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544087
16006	NC_014209	AGT	2	6	653549	653554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544087
16007	NC_014209	AGA	2	6	653609	653614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544087
16008	NC_014209	GCA	2	6	653631	653636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297544087
16009	NC_014209	TAA	2	6	653659	653664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297544087
16010	NC_014209	A	6	6	653668	653673	100 %	0 %	0 %	0 %	297544087
16011	NC_014209	GCT	2	6	653679	653684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297544087
16012	NC_014209	ATG	2	6	653704	653709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544087
16013	NC_014209	CAA	2	6	653758	653763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297544087
16014	NC_014209	TGC	2	6	653789	653794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297544087
16015	NC_014209	ACA	2	6	653817	653822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297544087
16016	NC_014209	AGT	2	6	653828	653833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544087
16017	NC_014209	AGA	2	6	653848	653853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544087
16018	NC_014209	ACA	2	6	653856	653861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297544087
16019	NC_014209	ATG	2	6	653886	653891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544087
16020	NC_014209	TAA	2	6	653981	653986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_014209	CAG	2	6	654007	654012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16022	NC_014209	AGC	2	6	654018	654023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16023	NC_014209	T	7	7	654128	654134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_014209	T	7	7	654195	654201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_014209	TTG	2	6	654205	654210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_014209	AAT	2	6	654238	654243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_014209	TTA	2	6	654272	654277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_014209	AGC	2	6	654324	654329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16029	NC_014209	TGT	2	6	654358	654363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_014209	TTTA	2	8	654401	654408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_014209	A	7	7	654447	654453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_014209	TAA	2	6	654473	654478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_014209	GGA	2	6	654504	654509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297544088
16034	NC_014209	TTC	2	6	654572	654577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297544088
16035	NC_014209	A	7	7	654610	654616	100 %	0 %	0 %	0 %	297544088
16036	NC_014209	TGA	2	6	654635	654640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544088
16037	NC_014209	AAT	2	6	654897	654902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297544088
16038	NC_014209	GAT	2	6	654928	654933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544088
16039	NC_014209	AAG	2	6	654950	654955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544088
16040	NC_014209	CTC	2	6	654983	654988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297544088
16041	NC_014209	ACT	2	6	654994	654999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297544088
16042	NC_014209	A	7	7	655023	655029	100 %	0 %	0 %	0 %	297544088
16043	NC_014209	TAG	2	6	655052	655057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544088
16044	NC_014209	AAC	2	6	655063	655068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297544088
16045	NC_014209	TTA	2	6	655082	655087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297544088
16046	NC_014209	AAGG	2	8	655142	655149	50 %	0 %	50 %	0 %	297544088
16047	NC_014209	TGG	2	6	655154	655159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297544088
16048	NC_014209	GCT	2	6	655162	655167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297544088
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16050	NC_014209	TAG	2	6	655208	655213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544088
16051	NC_014209	GATA	2	8	655236	655243	50 %	25 %	25 %	0 %	297544088
16052	NC_014209	TAAAA	2	10	655284	655293	80 %	20 %	0 %	0 %	297544088
16053	NC_014209	CTG	2	6	655337	655342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297544088
16054	NC_014209	AG	4	8	655362	655369	50 %	0 %	50 %	0 %	297544088
16055	NC_014209	TAC	2	6	655413	655418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297544088
16056	NC_014209	AAG	2	6	655475	655480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544088
16057	NC_014209	GCG	2	6	655552	655557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297544088
16058	NC_014209	AGA	2	6	655599	655604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544088
16059	NC_014209	AT	3	6	655624	655629	50 %	50 %	0 %	0 %	297544088
16060	NC_014209	GAA	2	6	655634	655639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544088
16061	NC_014209	GAAG	3	12	655680	655691	50 %	0 %	50 %	0 %	297544088
16062	NC_014209	AGAT	2	8	655695	655702	50 %	25 %	25 %	0 %	297544088
16063	NC_014209	AAG	2	6	655709	655714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544088
16064	NC_014209	GAAG	2	8	655744	655751	50 %	0 %	50 %	0 %	297544088
16065	NC_014209	TGG	2	6	655797	655802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297544088
16066	NC_014209	GGGAT	2	10	655813	655822	20 %	20 %	60 %	0 %	297544088
16067	NC_014209	GAA	2	6	655843	655848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544088
16068	NC_014209	CAGG	2	8	655882	655889	25 %	0 %	50 %	25 %	297544088
16069	NC_014209	ATT	2	6	655918	655923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297544088
16070	NC_014209	AGG	2	6	655959	655964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_014209	AGT	2	6	655988	655993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544089
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16074	NC_014209	A	7	7	656105	656111	100 %	0 %	0 %	0 %	297544089
16075	NC_014209	TTCT	2	8	656128	656135	0 %	75 %	0 %	25 %	297544089
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16078	NC_014209	GGT	2	6	656405	656410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297544089
16079	NC_014209	AGAAA	2	10	656453	656462	80 %	0 %	20 %	0 %	297544089
16080	NC_014209	TTGA	2	8	656577	656584	25 %	50 %	25 %	0 %	297544089
16081	NC_014209	TGG	2	6	656645	656650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297544089
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16087	NC_014209	AGA	2	6	656852	656857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544089
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16090	NC_014209	TA	3	6	657124	657129	50 %	50 %	0 %	0 %	297544089
16091	NC_014209	AGA	2	6	657182	657187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544089
16092	NC_014209	AG	3	6	657228	657233	50 %	0 %	50 %	0 %	297544089
16093	NC_014209	A	6	6	657237	657242	100 %	0 %	0 %	0 %	297544089
16094	NC_014209	TAA	2	6	657254	657259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297544089
16095	NC_014209	GTA	2	6	657351	657356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544089
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16097	NC_014209	ATT	2	6	657520	657525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_014209	T	6	6	657530	657535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_014209	A	6	6	657570	657575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16100	NC_014209	GATAA	2	10	657579	657588	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_014209	AAC	2	6	657654	657659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16102	NC_014209	TA	3	6	657746	657751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_014209	GGA	2	6	657776	657781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_014209	CTTAA	2	10	657798	657807	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16105	NC_014209	ATA	2	6	657864	657869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_014209	AGA	2	6	657871	657876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_014209	GGA	2	6	657877	657882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_014209	ATG	2	6	657885	657890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544090
16109	NC_014209	TAT	2	6	658025	658030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297544090
16110	NC_014209	AAG	2	6	658054	658059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297544090
16111	NC_014209	GATG	2	8	658064	658071	25 %	25 %	50 %	0 %	297544090
16112	NC_014209	CAG	2	6	658102	658107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297544090
16113	NC_014209	ATG	2	6	658122	658127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297544090
16114	NC_014209	CTTT	2	8	658180	658187	0 %	75 %	0 %	25 %	297544090
16115	NC_014209	T	7	7	658243	658249	0 %	100 %	0 %	0 %	297544090
16116	NC_014209	TATT	2	8	658261	658268	25 %	75 %	0 %	0 %	297544090
16117	NC_014209	ATT	2	6	658352	658357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297544090
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16119	NC_014209	ACAT	2	8	658410	658417	50 %	25 %	0 %	25 %	297544090
16120	NC_014209	CTT	2	6	658449	658454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297544090
16121	NC_014209	CTT	2	6	658515	658520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297544090
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