MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014209	AT	3	6	529039	529044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_014209	AAT	2	6	529132	529137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543970
13003	NC_014209	A	6	6	529176	529181	100 %	0 %	0 %	0 %	297543970
13004	NC_014209	GTA	2	6	529202	529207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543970
13005	NC_014209	TTC	2	6	529237	529242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543970
13006	NC_014209	AGC	2	6	529303	529308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543970
13007	NC_014209	TTA	2	6	529317	529322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543970
13008	NC_014209	GAA	2	6	529427	529432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543970
13009	NC_014209	TG	3	6	529433	529438	0 %	50 %	50 %	0 %	297543970
13010	NC_014209	AGC	2	6	529507	529512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543970
13011	NC_014209	GAAA	2	8	529523	529530	75 %	0 %	25 %	0 %	297543970
13012	NC_014209	A	6	6	529528	529533	100 %	0 %	0 %	0 %	297543970
13013	NC_014209	GAG	2	6	529551	529556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543970
13014	NC_014209	T	6	6	529568	529573	0 %	100 %	0 %	0 %	297543970
13015	NC_014209	AGC	2	6	529584	529589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543970
13016	NC_014209	ACA	2	6	529698	529703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543970
13017	NC_014209	TAA	2	6	529714	529719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543970
13018	NC_014209	GGT	2	6	529748	529753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543970
13019	NC_014209	AAAG	2	8	529787	529794	75 %	0 %	25 %	0 %	297543970
13020	NC_014209	TAA	2	6	529831	529836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543970
13021	NC_014209	TTTG	2	8	529939	529946	0 %	75 %	25 %	0 %	297543970
13022	NC_014209	ATT	3	9	529956	529964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543970
13023	NC_014209	ACA	2	6	530051	530056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_014209	TG	3	6	530093	530098	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_014209	TAA	2	6	530144	530149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_014209	A	6	6	530204	530209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_014209	GGT	2	6	530300	530305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_014209	AT	3	6	530307	530312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_014209	A	6	6	530315	530320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_014209	TATT	2	8	530339	530346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_014209	TTG	2	6	530375	530380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_014209	GAA	2	6	530516	530521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_014209	CTT	2	6	530596	530601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_014209	GCA	2	6	530618	530623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_014209	T	6	6	530632	530637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_014209	TG	3	6	530652	530657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_014209	ATT	2	6	530660	530665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_014209	A	6	6	530707	530712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_014209	AAT	2	6	530730	530735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_014209	A	6	6	530741	530746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_014209	T	7	7	530767	530773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_014209	TA	3	6	530787	530792	50 %	50 %	0 %	0 %	297543971
13043	NC_014209	TTA	2	6	530856	530861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543971
13044	NC_014209	TCT	2	6	530915	530920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543971
13045	NC_014209	CTT	2	6	530960	530965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543971
13046	NC_014209	T	6	6	530979	530984	0 %	100 %	0 %	0 %	297543971
13047	NC_014209	CAT	2	6	530985	530990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543971
13048	NC_014209	T	6	6	531034	531039	0 %	100 %	0 %	0 %	297543971
13049	NC_014209	CTT	2	6	531055	531060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543971
13050	NC_014209	TAA	3	9	531062	531070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543971
13051	NC_014209	T	7	7	531097	531103	0 %	100 %	0 %	0 %	297543971
13052	NC_014209	ATTT	2	8	531106	531113	25 %	75 %	0 %	0 %	297543971
13053	NC_014209	ATC	2	6	531175	531180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543971
13054	NC_014209	CATTG	2	10	531182	531191	20 %	40 %	20 %	20 %	297543971
13055	NC_014209	TCA	2	6	531305	531310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543971
13056	NC_014209	GATA	2	8	531354	531361	50 %	25 %	25 %	0 %	297543971
13057	NC_014209	GAA	2	6	531384	531389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543971
13058	NC_014209	ATG	2	6	531695	531700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543971
13059	NC_014209	CTT	2	6	531717	531722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543971
13060	NC_014209	TGA	2	6	531743	531748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543971
13061	NC_014209	ATA	2	6	531766	531771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543971
13062	NC_014209	CAA	2	6	531780	531785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543971
13063	NC_014209	ATC	2	6	531811	531816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543971
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13071	NC_014209	TCA	2	6	532202	532207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543971
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13082	NC_014209	TG	3	6	532668	532673	0 %	50 %	50 %	0 %	297543972
13083	NC_014209	ATTC	2	8	532696	532703	25 %	50 %	0 %	25 %	297543972
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13091	NC_014209	TAT	2	6	533006	533011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543972
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13096	NC_014209	TA	3	6	533150	533155	50 %	50 %	0 %	0 %	297543972
13097	NC_014209	GGA	2	6	533190	533195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543972
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13100	NC_014209	TA	3	6	533258	533263	50 %	50 %	0 %	0 %	297543972
13101	NC_014209	ATT	2	6	533274	533279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543972
13102	NC_014209	T	6	6	533326	533331	0 %	100 %	0 %	0 %	297543972
13103	NC_014209	TA	3	6	533366	533371	50 %	50 %	0 %	0 %	297543973
13104	NC_014209	AT	3	6	533465	533470	50 %	50 %	0 %	0 %	297543973
13105	NC_014209	TCC	3	9	533498	533506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297543973
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13107	NC_014209	GCC	2	6	533643	533648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297543973
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13111	NC_014209	CCAA	2	8	533764	533771	50 %	0 %	0 %	50 %	297543973
13112	NC_014209	ATCA	2	8	533783	533790	50 %	25 %	0 %	25 %	297543973
13113	NC_014209	T	6	6	533927	533932	0 %	100 %	0 %	0 %	297543973
13114	NC_014209	TCA	2	6	533935	533940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543973
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13116	NC_014209	GAAGTT	2	12	534085	534096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543973
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13118	NC_014209	AAT	2	6	534152	534157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543973
13119	NC_014209	ATA	2	6	534160	534165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543973
13120	NC_014209	AT	4	8	534181	534188	50 %	50 %	0 %	0 %	297543973
13121	NC_014209	T	7	7	534243	534249	0 %	100 %	0 %	0 %	297543973
13122	NC_014209	CTT	2	6	534268	534273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13124	NC_014209	CAT	2	6	534502	534507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543974
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