MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014209	TAATA	2	10	263303	263312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_014209	AGG	2	6	263325	263330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_014209	AATA	2	8	263342	263349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_014209	TTG	2	6	263373	263378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_014209	TTA	2	6	263382	263387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_014209	A	7	7	263412	263418	100 %	0 %	0 %	0 %	297543743
6507	NC_014209	AAT	2	6	263470	263475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543743
6508	NC_014209	AGCA	2	8	263607	263614	50 %	0 %	25 %	25 %	297543743
6509	NC_014209	AACT	2	8	263647	263654	50 %	25 %	0 %	25 %	297543743
6510	NC_014209	T	6	6	263677	263682	0 %	100 %	0 %	0 %	297543743
6511	NC_014209	AGC	2	6	263749	263754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543743
6512	NC_014209	TCA	2	6	263758	263763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543743
6513	NC_014209	TA	3	6	263796	263801	50 %	50 %	0 %	0 %	297543743
6514	NC_014209	TTA	2	6	263830	263835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543743
6515	NC_014209	ATT	2	6	263929	263934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543743
6516	NC_014209	TAT	2	6	263969	263974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543743
6517	NC_014209	ATT	2	6	264023	264028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543743
6518	NC_014209	TAC	2	6	264055	264060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543743
6519	NC_014209	GGTA	2	8	264067	264074	25 %	25 %	50 %	0 %	297543743
6520	NC_014209	CTG	2	6	264093	264098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543743
6521	NC_014209	AGA	2	6	264103	264108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543743
6522	NC_014209	CTG	2	6	264138	264143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543743
6523	NC_014209	CAG	2	6	264150	264155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543743
6524	NC_014209	AAT	2	6	264236	264241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543743
6525	NC_014209	CAA	2	6	264285	264290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543743
6526	NC_014209	AT	3	6	264304	264309	50 %	50 %	0 %	0 %	297543743
6527	NC_014209	TAA	2	6	264316	264321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543743
6528	NC_014209	A	6	6	264335	264340	100 %	0 %	0 %	0 %	297543743
6529	NC_014209	AT	3	6	264404	264409	50 %	50 %	0 %	0 %	297543743
6530	NC_014209	TGA	2	6	264445	264450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543743
6531	NC_014209	AAG	2	6	264495	264500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543743
6532	NC_014209	AAG	2	6	264663	264668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543743
6533	NC_014209	ACAT	2	8	264739	264746	50 %	25 %	0 %	25 %	297543743
6534	NC_014209	CAC	2	6	264810	264815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297543743
6535	NC_014209	AAT	2	6	264898	264903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543743
6536	NC_014209	TTAT	2	8	265037	265044	25 %	75 %	0 %	0 %	297543743
6537	NC_014209	ACA	2	6	265053	265058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543743
6538	NC_014209	AAT	2	6	265064	265069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543743
6539	NC_014209	ATATTA	2	12	265155	265166	50 %	50 %	0 %	0 %	297543743
6540	NC_014209	ATT	2	6	265279	265284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543743
6541	NC_014209	TA	3	6	265299	265304	50 %	50 %	0 %	0 %	297543743
6542	NC_014209	TTA	2	6	265319	265324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543743
6543	NC_014209	AGC	2	6	265392	265397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543743
6544	NC_014209	CTT	2	6	265409	265414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543743
6545	NC_014209	TAG	2	6	265455	265460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543743
6546	NC_014209	AAT	2	6	265571	265576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543743
6547	NC_014209	A	6	6	265582	265587	100 %	0 %	0 %	0 %	297543743
6548	NC_014209	GTT	2	6	265615	265620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543743
6549	NC_014209	GAT	2	6	265658	265663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543743
6550	NC_014209	ACG	2	6	265893	265898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543743
6551	NC_014209	AGG	3	9	265903	265911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543743
6552	NC_014209	AGAT	2	8	265914	265921	50 %	25 %	25 %	0 %	297543743
6553	NC_014209	TAT	2	6	265983	265988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543743
6554	NC_014209	TAT	2	6	266029	266034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543743
6555	NC_014209	GAT	2	6	266048	266053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543743
6556	NC_014209	AT	3	6	266052	266057	50 %	50 %	0 %	0 %	297543743
6557	NC_014209	AT	3	6	266075	266080	50 %	50 %	0 %	0 %	297543743
6558	NC_014209	TAAA	2	8	266184	266191	75 %	25 %	0 %	0 %	297543743
6559	NC_014209	T	6	6	266228	266233	0 %	100 %	0 %	0 %	297543743
6560	NC_014209	AAT	2	6	266243	266248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543743
6561	NC_014209	CAA	2	6	266352	266357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543743
6562	NC_014209	CTT	2	6	266364	266369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543743
6563	NC_014209	TA	3	6	266378	266383	50 %	50 %	0 %	0 %	297543743
6564	NC_014209	TGA	2	6	266464	266469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543743
6565	NC_014209	TTG	2	6	266556	266561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543743
6566	NC_014209	CACCAA	2	12	266601	266612	50 %	0 %	0 %	50 %	297543743
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6570	NC_014209	TAA	2	6	266802	266807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543743
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6572	NC_014209	ATG	2	6	266850	266855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543743
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6574	NC_014209	AGGT	2	8	266919	266926	25 %	25 %	50 %	0 %	297543743
6575	NC_014209	TACAA	2	10	266938	266947	60 %	20 %	0 %	20 %	297543743
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6582	NC_014209	GAT	3	9	267305	267313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543743
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6587	NC_014209	GAA	2	6	267487	267492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543743
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6590	NC_014209	AGA	2	6	267574	267579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543743
6591	NC_014209	ACA	2	6	267684	267689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543743
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6595	NC_014209	A	6	6	267794	267799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_014209	A	6	6	267811	267816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_014209	GCT	2	6	267838	267843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6599	NC_014209	TTA	2	6	267886	267891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_014209	TA	3	6	267912	267917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_014209	T	6	6	267931	267936	0 %	100 %	0 %	0 %	297543744
6602	NC_014209	ATT	2	6	268008	268013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543744
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6604	NC_014209	AATT	2	8	268043	268050	50 %	50 %	0 %	0 %	297543744
6605	NC_014209	TAT	2	6	268061	268066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543744
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6608	NC_014209	ATA	2	6	268213	268218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543744
6609	NC_014209	TAA	2	6	268223	268228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543744
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6620	NC_014209	A	6	6	268622	268627	100 %	0 %	0 %	0 %	297543744
6621	NC_014209	GA	3	6	268659	268664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_014209	T	7	7	268686	268692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_014209	GAAA	2	8	268693	268700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7000	NC_014209	AAG	2	6	283606	283611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543757

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