MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014209	CAT	2	6	221106	221111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543710
5502	NC_014209	TA	3	6	221118	221123	50 %	50 %	0 %	0 %	297543710
5503	NC_014209	AGAT	2	8	221151	221158	50 %	25 %	25 %	0 %	297543710
5504	NC_014209	GTT	2	6	221216	221221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543710
5505	NC_014209	T	7	7	221305	221311	0 %	100 %	0 %	0 %	297543710
5506	NC_014209	CAAG	2	8	221417	221424	50 %	0 %	25 %	25 %	297543710
5507	NC_014209	AAT	2	6	221431	221436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543710
5508	NC_014209	AGC	2	6	221482	221487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543710
5509	NC_014209	GAA	2	6	221497	221502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543710
5510	NC_014209	AATG	2	8	221524	221531	50 %	25 %	25 %	0 %	297543710
5511	NC_014209	A	7	7	221564	221570	100 %	0 %	0 %	0 %	297543710
5512	NC_014209	AGA	2	6	221716	221721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543710
5513	NC_014209	TA	3	6	221802	221807	50 %	50 %	0 %	0 %	297543710
5514	NC_014209	A	7	7	221897	221903	100 %	0 %	0 %	0 %	297543710
5515	NC_014209	TGTAGC	2	12	221929	221940	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	297543710
5516	NC_014209	TGC	2	6	221971	221976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543710
5517	NC_014209	TGA	2	6	222148	222153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543710
5518	NC_014209	A	6	6	222164	222169	100 %	0 %	0 %	0 %	297543710
5519	NC_014209	GGA	2	6	222207	222212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543710
5520	NC_014209	AT	3	6	222265	222270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_014209	TGA	2	6	222380	222385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543711
5522	NC_014209	AT	3	6	222394	222399	50 %	50 %	0 %	0 %	297543711
5523	NC_014209	GGT	2	6	222419	222424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543711
5524	NC_014209	AGA	2	6	222455	222460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543711
5525	NC_014209	TAG	2	6	222496	222501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543711
5526	NC_014209	TAAT	2	8	222526	222533	50 %	50 %	0 %	0 %	297543711
5527	NC_014209	AAG	2	6	222540	222545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543711
5528	NC_014209	TGC	2	6	222596	222601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543711
5529	NC_014209	A	6	6	222606	222611	100 %	0 %	0 %	0 %	297543711
5530	NC_014209	TTG	2	6	222616	222621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543711
5531	NC_014209	TAA	3	9	222641	222649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543711
5532	NC_014209	TGCTTG	2	12	222679	222690	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	297543711
5533	NC_014209	AAT	2	6	222743	222748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543711
5534	NC_014209	AG	3	6	222817	222822	50 %	0 %	50 %	0 %	297543711
5535	NC_014209	ATG	2	6	222853	222858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543711
5536	NC_014209	AGA	2	6	222881	222886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543711
5537	NC_014209	ATG	2	6	223002	223007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543711
5538	NC_014209	GGT	2	6	223041	223046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543711
5539	NC_014209	CTT	2	6	223146	223151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543711
5540	NC_014209	TGT	2	6	223163	223168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543711
5541	NC_014209	GGA	2	6	223185	223190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543711
5542	NC_014209	TGT	2	6	223238	223243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543711
5543	NC_014209	TAAA	2	8	223252	223259	75 %	25 %	0 %	0 %	297543711
5544	NC_014209	CA	3	6	223270	223275	50 %	0 %	0 %	50 %	297543711
5545	NC_014209	AAT	2	6	223288	223293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543711
5546	NC_014209	AGG	2	6	223298	223303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_014209	TA	3	6	223391	223396	50 %	50 %	0 %	0 %	297543712
5548	NC_014209	G	6	6	223420	223425	0 %	0 %	100 %	0 %	297543712
5549	NC_014209	TGC	2	6	223461	223466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543712
5550	NC_014209	GAT	2	6	223470	223475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543712
5551	NC_014209	TTG	2	6	223484	223489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543712
5552	NC_014209	CAT	2	6	223571	223576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543712
5553	NC_014209	TAT	2	6	223580	223585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543712
5554	NC_014209	CTT	2	6	223589	223594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543712
5555	NC_014209	TAC	2	6	223634	223639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543712
5556	NC_014209	CTG	2	6	223715	223720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543712
5557	NC_014209	TA	3	6	223738	223743	50 %	50 %	0 %	0 %	297543712
5558	NC_014209	ATG	2	6	223777	223782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543712
5559	NC_014209	ATA	2	6	223868	223873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543712
5560	NC_014209	GAA	2	6	223882	223887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543712
5561	NC_014209	TGA	2	6	223896	223901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543712
5562	NC_014209	GAG	2	6	223908	223913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543712
5563	NC_014209	GCA	2	6	223918	223923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543712
5564	NC_014209	AAG	2	6	223940	223945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543712
5565	NC_014209	TCC	2	6	223973	223978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_014209	ATT	2	6	223994	223999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_014209	ATT	2	6	224058	224063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543713
5568	NC_014209	TGA	2	6	224071	224076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543713
5569	NC_014209	AAT	2	6	224087	224092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543713
5570	NC_014209	GAT	2	6	224153	224158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543713
5571	NC_014209	GTTT	2	8	224161	224168	0 %	75 %	25 %	0 %	297543713
5572	NC_014209	T	7	7	224204	224210	0 %	100 %	0 %	0 %	297543713
5573	NC_014209	TGC	2	6	224263	224268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543713
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5575	NC_014209	TAT	2	6	224336	224341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543713
5576	NC_014209	TGC	2	6	224384	224389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543713
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5578	NC_014209	T	7	7	224436	224442	0 %	100 %	0 %	0 %	297543713
5579	NC_014209	TAT	2	6	224456	224461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543713
5580	NC_014209	TAA	2	6	224593	224598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543713
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5582	NC_014209	CT	3	6	224750	224755	0 %	50 %	0 %	50 %	297543713
5583	NC_014209	CT	3	6	224760	224765	0 %	50 %	0 %	50 %	297543713
5584	NC_014209	T	6	6	224769	224774	0 %	100 %	0 %	0 %	297543713
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5588	NC_014209	TGC	2	6	224861	224866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543713
5589	NC_014209	TATT	2	8	224869	224876	25 %	75 %	0 %	0 %	297543713
5590	NC_014209	TGT	2	6	224887	224892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543713
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5592	NC_014209	AAT	2	6	224939	224944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543713
5593	NC_014209	A	6	6	224982	224987	100 %	0 %	0 %	0 %	297543713
5594	NC_014209	T	6	6	225050	225055	0 %	100 %	0 %	0 %	297543713
5595	NC_014209	TTAT	2	8	225111	225118	25 %	75 %	0 %	0 %	297543713
5596	NC_014209	GTA	2	6	225123	225128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543713
5597	NC_014209	A	6	6	225162	225167	100 %	0 %	0 %	0 %	297543713
5598	NC_014209	TAA	2	6	225221	225226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_014209	ATTA	2	8	225228	225235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_014209	ACAA	2	8	225286	225293	75 %	0 %	0 %	25 %	297543714
5601	NC_014209	AAAGA	2	10	225343	225352	80 %	0 %	20 %	0 %	297543714
5602	NC_014209	A	7	7	225378	225384	100 %	0 %	0 %	0 %	297543714
5603	NC_014209	AAG	2	6	225393	225398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543714
5604	NC_014209	TTA	2	6	225415	225420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543714
5605	NC_014209	ATA	2	6	225445	225450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543714
5606	NC_014209	T	6	6	225474	225479	0 %	100 %	0 %	0 %	297543714
5607	NC_014209	AAG	2	6	225485	225490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543714
5608	NC_014209	AAG	2	6	225499	225504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543714
5609	NC_014209	CTG	2	6	225629	225634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543714
5610	NC_014209	TCC	2	6	225642	225647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297543714
5611	NC_014209	ACT	2	6	225801	225806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543714
5612	NC_014209	GATAAA	2	12	225853	225864	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	297543714
5613	NC_014209	AGA	2	6	225876	225881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543714
5614	NC_014209	GGA	2	6	225889	225894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543714
5615	NC_014209	GCC	2	6	225924	225929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297543714
5616	NC_014209	ACA	2	6	226033	226038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543714
5617	NC_014209	T	6	6	226068	226073	0 %	100 %	0 %	0 %	297543714
5618	NC_014209	AAG	2	6	226074	226079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543714
5619	NC_014209	TTCC	2	8	226100	226107	0 %	50 %	0 %	50 %	297543714
5620	NC_014209	A	6	6	226170	226175	100 %	0 %	0 %	0 %	297543714
5621	NC_014209	TAA	2	6	226193	226198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543714
5622	NC_014209	GCAA	2	8	226199	226206	50 %	0 %	25 %	25 %	297543714
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5624	NC_014209	AG	3	6	226306	226311	50 %	0 %	50 %	0 %	297543714
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