MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_014209	GAA	2	6	2261905	2261910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297545612
55002	NC_014209	CAA	2	6	2261956	2261961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297545612
55003	NC_014209	ACA	2	6	2261962	2261967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297545612
55004	NC_014209	TCA	2	6	2262004	2262009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545612
55005	NC_014209	C	6	6	2262108	2262113	0 %	0 %	0 %	100 %	297545612
55006	NC_014209	GTA	2	6	2262150	2262155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545612
55007	NC_014209	AGAA	2	8	2262158	2262165	75 %	0 %	25 %	0 %	297545612
55008	NC_014209	TCA	2	6	2262174	2262179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545612
55009	NC_014209	ATA	2	6	2262207	2262212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545612
55010	NC_014209	GCA	2	6	2262249	2262254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297545612
55011	NC_014209	CAATT	2	10	2262270	2262279	40 %	40 %	0 %	20 %	297545612
55012	NC_014209	CAT	2	6	2262401	2262406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545612
55013	NC_014209	AG	3	6	2262463	2262468	50 %	0 %	50 %	0 %	297545612
55014	NC_014209	TTA	2	6	2262475	2262480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545612
55015	NC_014209	CGG	2	6	2262532	2262537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297545612
55016	NC_014209	ACC	2	6	2262560	2262565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297545612
55017	NC_014209	TG	3	6	2262609	2262614	0 %	50 %	50 %	0 %	297545612
55018	NC_014209	TGC	2	6	2262677	2262682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545612
55019	NC_014209	AGA	2	6	2262683	2262688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297545612
55020	NC_014209	AGGT	2	8	2262714	2262721	25 %	25 %	50 %	0 %	297545612
55021	NC_014209	GCA	2	6	2262813	2262818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297545612
55022	NC_014209	GCC	3	9	2262839	2262847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297545612
55023	NC_014209	CCCT	2	8	2262967	2262974	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55024	NC_014209	T	6	6	2262981	2262986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55025	NC_014209	A	7	7	2263003	2263009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55026	NC_014209	T	7	7	2263010	2263016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55027	NC_014209	TAA	2	6	2263027	2263032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55028	NC_014209	TTA	2	6	2263040	2263045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55029	NC_014209	A	6	6	2263069	2263074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55030	NC_014209	CAA	2	6	2263090	2263095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55031	NC_014209	TAT	2	6	2263099	2263104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55032	NC_014209	ATA	2	6	2263110	2263115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55033	NC_014209	TAA	2	6	2263148	2263153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55034	NC_014209	CCG	2	6	2263207	2263212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297545613
55035	NC_014209	A	8	8	2263312	2263319	100 %	0 %	0 %	0 %	297545613
55036	NC_014209	A	7	7	2263337	2263343	100 %	0 %	0 %	0 %	297545613
55037	NC_014209	A	6	6	2263348	2263353	100 %	0 %	0 %	0 %	297545613
55038	NC_014209	A	7	7	2263374	2263380	100 %	0 %	0 %	0 %	297545613
55039	NC_014209	CT	3	6	2263512	2263517	0 %	50 %	0 %	50 %	297545613
55040	NC_014209	T	6	6	2263523	2263528	0 %	100 %	0 %	0 %	297545613
55041	NC_014209	GCT	2	6	2263533	2263538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545613
55042	NC_014209	A	7	7	2263587	2263593	100 %	0 %	0 %	0 %	297545613
55043	NC_014209	TAA	2	6	2263624	2263629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545613
55044	NC_014209	ACAA	2	8	2263718	2263725	75 %	0 %	0 %	25 %	297545613
55045	NC_014209	TAA	2	6	2263756	2263761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545613
55046	NC_014209	GCC	2	6	2263766	2263771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297545613
55047	NC_014209	CTT	2	6	2263788	2263793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545613
55048	NC_014209	T	6	6	2263792	2263797	0 %	100 %	0 %	0 %	297545613
55049	NC_014209	A	6	6	2263854	2263859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55050	NC_014209	ACC	2	6	2263976	2263981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297545614
55051	NC_014209	GCC	2	6	2264036	2264041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297545614
55052	NC_014209	A	6	6	2264080	2264085	100 %	0 %	0 %	0 %	297545614
55053	NC_014209	AAG	2	6	2264151	2264156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297545614
55054	NC_014209	TAG	2	6	2264172	2264177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545614
55055	NC_014209	TCC	2	6	2264197	2264202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297545614
55056	NC_014209	TAT	2	6	2264269	2264274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545614
55057	NC_014209	ATC	2	6	2264339	2264344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545614
55058	NC_014209	CCG	2	6	2264351	2264356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297545614
55059	NC_014209	A	6	6	2264380	2264385	100 %	0 %	0 %	0 %	297545614
55060	NC_014209	A	6	6	2264391	2264396	100 %	0 %	0 %	0 %	297545614
55061	NC_014209	AT	3	6	2264404	2264409	50 %	50 %	0 %	0 %	297545614
55062	NC_014209	CTC	2	6	2264424	2264429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297545615
55063	NC_014209	TAA	2	6	2264451	2264456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297545615
55064	NC_014209	TAT	2	6	2264487	2264492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545615
55065	NC_014209	GA	3	6	2264523	2264528	50 %	0 %	50 %	0 %	297545615
55066	NC_014209	GCT	2	6	2264533	2264538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297545615
55067	NC_014209	CAG	2	6	2264549	2264554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297545615
55068	NC_014209	T	6	6	2264638	2264643	0 %	100 %	0 %	0 %	297545615
55069	NC_014209	TAT	2	6	2264691	2264696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297545615
55070	NC_014209	GAAG	2	8	2264704	2264711	50 %	0 %	50 %	0 %	297545615
55071	NC_014209	ATGA	2	8	2264731	2264738	50 %	25 %	25 %	0 %	297545615
55072	NC_014209	CAA	2	6	2264741	2264746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297545615
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55075	NC_014209	T	6	6	2264974	2264979	0 %	100 %	0 %	0 %	297545615
55076	NC_014209	TCA	2	6	2264996	2265001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297545615
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55078	NC_014209	ATA	2	6	2265013	2265018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55079	NC_014209	A	7	7	2265085	2265091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55080	NC_014209	TAAAAT	2	12	2265142	2265153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55082	NC_014209	ACCC	2	8	2265176	2265183	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
55083	NC_014209	T	6	6	2265204	2265209	0 %	100 %	0 %	0 %	297545616
55084	NC_014209	GCG	2	6	2265346	2265351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297545616
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55086	NC_014209	GCA	2	6	2265420	2265425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297545616
55087	NC_014209	CCG	2	6	2265459	2265464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297545616
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55089	NC_014209	ATG	2	6	2265542	2265547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545616
55090	NC_014209	CT	3	6	2265596	2265601	0 %	50 %	0 %	50 %	297545616
55091	NC_014209	CCA	2	6	2265603	2265608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297545616
55092	NC_014209	TGGC	2	8	2265612	2265619	0 %	25 %	50 %	25 %	297545616
55093	NC_014209	CTT	2	6	2265626	2265631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545616
55094	NC_014209	TGA	2	6	2265657	2265662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545616
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55096	NC_014209	TTC	2	6	2265719	2265724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545616
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55101	NC_014209	AT	3	6	2266200	2266205	50 %	50 %	0 %	0 %	297545617
55102	NC_014209	GGGT	2	8	2266276	2266283	0 %	25 %	75 %	0 %	297545617
55103	NC_014209	CCTTC	2	10	2266330	2266339	0 %	40 %	0 %	60 %	297545617
55104	NC_014209	AT	3	6	2266362	2266367	50 %	50 %	0 %	0 %	297545617
55105	NC_014209	TA	3	6	2266382	2266387	50 %	50 %	0 %	0 %	297545617
55106	NC_014209	ACAGT	2	10	2266589	2266598	40 %	20 %	20 %	20 %	297545617
55107	NC_014209	AGT	2	6	2266637	2266642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545617
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55109	NC_014209	GCCT	2	8	2266714	2266721	0 %	25 %	25 %	50 %	297545617
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55111	NC_014209	TGAA	2	8	2266831	2266838	50 %	25 %	25 %	0 %	297545617
55112	NC_014209	CCA	2	6	2267126	2267131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297545617
55113	NC_014209	CCT	2	6	2267225	2267230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297545618
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55116	NC_014209	CTT	2	6	2267388	2267393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297545618
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55120	NC_014209	GTA	2	6	2267589	2267594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297545618
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