MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014209	T	7	7	201875	201881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_014209	T	6	6	201902	201907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_014209	ATTT	2	8	201910	201917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_014209	TTA	2	6	201936	201941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_014209	ATT	2	6	201944	201949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_014209	TTA	2	6	201988	201993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_014209	AT	3	6	202002	202007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_014209	ACAA	2	8	202030	202037	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5009	NC_014209	AAG	2	6	202062	202067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_014209	TGGC	2	8	202085	202092	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5011	NC_014209	TAC	2	6	202122	202127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_014209	AGTA	2	8	202138	202145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_014209	TTAT	2	8	202224	202231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_014209	AAT	2	6	202239	202244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_014209	AT	3	6	202268	202273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_014209	TA	3	6	202283	202288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_014209	T	7	7	202328	202334	0 %	100 %	0 %	0 %	297543689
5018	NC_014209	T	6	6	202339	202344	0 %	100 %	0 %	0 %	297543689
5019	NC_014209	TAA	2	6	202349	202354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543689
5020	NC_014209	CTT	2	6	202397	202402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543689
5021	NC_014209	AAT	2	6	202465	202470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543689
5022	NC_014209	AAAAT	2	10	202508	202517	80 %	20 %	0 %	0 %	297543689
5023	NC_014209	A	6	6	202520	202525	100 %	0 %	0 %	0 %	297543689
5024	NC_014209	GGA	2	6	202533	202538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543689
5025	NC_014209	GAAA	2	8	202635	202642	75 %	0 %	25 %	0 %	297543689
5026	NC_014209	AGG	2	6	202650	202655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543689
5027	NC_014209	TG	3	6	202686	202691	0 %	50 %	50 %	0 %	297543689
5028	NC_014209	GGA	3	9	202725	202733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543689
5029	NC_014209	AGA	2	6	202803	202808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543689
5030	NC_014209	ATG	2	6	202826	202831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543689
5031	NC_014209	AAG	2	6	202917	202922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543689
5032	NC_014209	TGT	2	6	202923	202928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543689
5033	NC_014209	GAA	2	6	202939	202944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543689
5034	NC_014209	ACT	2	6	202963	202968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543689
5035	NC_014209	TAAA	2	8	202994	203001	75 %	25 %	0 %	0 %	297543689
5036	NC_014209	A	8	8	203009	203016	100 %	0 %	0 %	0 %	297543689
5037	NC_014209	CTT	2	6	203018	203023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543689
5038	NC_014209	ATA	2	6	203033	203038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543689
5039	NC_014209	TGG	2	6	203121	203126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543689
5040	NC_014209	AGA	2	6	203127	203132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543689
5041	NC_014209	TAA	2	6	203198	203203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543689
5042	NC_014209	TGA	2	6	203280	203285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543689
5043	NC_014209	ATT	2	6	203297	203302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543689
5044	NC_014209	T	6	6	203368	203373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_014209	TAA	2	6	203445	203450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543690
5046	NC_014209	T	6	6	203453	203458	0 %	100 %	0 %	0 %	297543690
5047	NC_014209	ATA	2	6	203477	203482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543690
5048	NC_014209	TAG	2	6	203496	203501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543690
5049	NC_014209	GCT	2	6	203507	203512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543690
5050	NC_014209	AT	3	6	203519	203524	50 %	50 %	0 %	0 %	297543690
5051	NC_014209	TAA	3	9	203530	203538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543690
5052	NC_014209	A	7	7	203542	203548	100 %	0 %	0 %	0 %	297543690
5053	NC_014209	AGA	2	6	203551	203556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543690
5054	NC_014209	CAG	2	6	203570	203575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543690
5055	NC_014209	GAA	2	6	203576	203581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543690
5056	NC_014209	AAG	2	6	203637	203642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543690
5057	NC_014209	AAC	2	6	203649	203654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543690
5058	NC_014209	AAT	2	6	203657	203662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543690
5059	NC_014209	CAA	2	6	203681	203686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543690
5060	NC_014209	GAAA	2	8	203689	203696	75 %	0 %	25 %	0 %	297543690
5061	NC_014209	AAC	2	6	203770	203775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543690
5062	NC_014209	CTA	2	6	203796	203801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543690
5063	NC_014209	A	7	7	203803	203809	100 %	0 %	0 %	0 %	297543690
5064	NC_014209	TCT	2	6	203822	203827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543690
5065	NC_014209	ATA	2	6	203864	203869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543690
5066	NC_014209	ATGG	2	8	203978	203985	25 %	25 %	50 %	0 %	297543690
5067	NC_014209	TA	3	6	204000	204005	50 %	50 %	0 %	0 %	297543690
5068	NC_014209	TGT	2	6	204028	204033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543690
5069	NC_014209	A	6	6	204037	204042	100 %	0 %	0 %	0 %	297543690
5070	NC_014209	ACA	2	6	204094	204099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543690
5071	NC_014209	AGT	2	6	204106	204111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543690
5072	NC_014209	A	6	6	204246	204251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_014209	TACT	2	8	204260	204267	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_014209	T	7	7	204279	204285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_014209	GTTTTG	2	12	204356	204367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543691
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5077	NC_014209	GA	3	6	204383	204388	50 %	0 %	50 %	0 %	297543691
5078	NC_014209	GA	3	6	204433	204438	50 %	0 %	50 %	0 %	297543691
5079	NC_014209	TA	3	6	204519	204524	50 %	50 %	0 %	0 %	297543691
5080	NC_014209	AAG	2	6	204525	204530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543691
5081	NC_014209	AG	3	6	204533	204538	50 %	0 %	50 %	0 %	297543691
5082	NC_014209	A	6	6	204603	204608	100 %	0 %	0 %	0 %	297543691
5083	NC_014209	AAC	2	6	204611	204616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543691
5084	NC_014209	TAA	2	6	204662	204667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_014209	ATA	2	6	204672	204677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_014209	CAT	2	6	204693	204698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_014209	GT	3	6	204747	204752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_014209	GGAA	2	8	204825	204832	50 %	0 %	50 %	0 %	297543692
5089	NC_014209	TAA	2	6	204876	204881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543692
5090	NC_014209	GAA	2	6	204898	204903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543692
5091	NC_014209	AT	3	6	204935	204940	50 %	50 %	0 %	0 %	297543692
5092	NC_014209	AAT	2	6	205053	205058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543692
5093	NC_014209	A	6	6	205091	205096	100 %	0 %	0 %	0 %	297543692
5094	NC_014209	GCA	2	6	205111	205116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543692
5095	NC_014209	CTTAT	2	10	205139	205148	20 %	60 %	0 %	20 %	297543692
5096	NC_014209	CAC	2	6	205233	205238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297543692
5097	NC_014209	GTG	2	6	205270	205275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543692
5098	NC_014209	A	7	7	205335	205341	100 %	0 %	0 %	0 %	297543692
5099	NC_014209	GAT	2	6	205347	205352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543692
5100	NC_014209	AGA	2	6	205371	205376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543692
5101	NC_014209	AATAAA	2	12	205377	205388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	297543692
5102	NC_014209	AGA	2	6	205416	205421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543692
5103	NC_014209	GAA	2	6	205439	205444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543692
5104	NC_014209	GAA	2	6	205519	205524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543692
5105	NC_014209	TTG	2	6	205526	205531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543692
5106	NC_014209	AGAA	2	8	205551	205558	75 %	0 %	25 %	0 %	297543692
5107	NC_014209	CTC	2	6	205559	205564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297543692
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5109	NC_014209	ATT	2	6	205737	205742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543692
5110	NC_014209	AAAT	2	8	205780	205787	75 %	25 %	0 %	0 %	297543692
5111	NC_014209	AAG	2	6	205789	205794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_014209	TGC	2	6	205821	205826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543693
5113	NC_014209	TTC	2	6	205827	205832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543693
5114	NC_014209	TAC	2	6	205893	205898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543693
5115	NC_014209	CTT	3	9	205925	205933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297543693
5116	NC_014209	GAA	2	6	206041	206046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543693
5117	NC_014209	T	6	6	206101	206106	0 %	100 %	0 %	0 %	297543693
5118	NC_014209	GATA	2	8	206109	206116	50 %	25 %	25 %	0 %	297543693
5119	NC_014209	CA	3	6	206181	206186	50 %	0 %	0 %	50 %	297543693
5120	NC_014209	AT	3	6	206193	206198	50 %	50 %	0 %	0 %	297543693
5121	NC_014209	AAT	2	6	206272	206277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543693
5122	NC_014209	TGG	2	6	206285	206290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543693
5123	NC_014209	ATG	2	6	206321	206326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543693
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5125	NC_014209	T	6	6	206353	206358	0 %	100 %	0 %	0 %	297543693
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