MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 56059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014209	ATT	2	6	182096	182101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_014209	TAA	2	6	182168	182173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_014209	TTA	2	6	182204	182209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_014209	TGA	2	6	182220	182225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_014209	T	6	6	182267	182272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_014209	AG	3	6	182291	182296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_014209	ATTT	2	8	182301	182308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_014209	T	7	7	182306	182312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_014209	ATT	2	6	182320	182325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_014209	TG	3	6	182329	182334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_014209	AAAC	2	8	182338	182345	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_014209	TTTTAG	2	12	182384	182395	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	297543668
4513	NC_014209	ATA	2	6	182399	182404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543668
4514	NC_014209	AGA	2	6	182424	182429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543668
4515	NC_014209	ATGG	2	8	182440	182447	25 %	25 %	50 %	0 %	297543668
4516	NC_014209	AG	3	6	182488	182493	50 %	0 %	50 %	0 %	297543668
4517	NC_014209	ATT	2	6	182557	182562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543668
4518	NC_014209	A	6	6	182563	182568	100 %	0 %	0 %	0 %	297543668
4519	NC_014209	TATC	2	8	182577	182584	25 %	50 %	0 %	25 %	297543668
4520	NC_014209	TAT	2	6	182598	182603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543668
4521	NC_014209	TGA	2	6	182613	182618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543668
4522	NC_014209	ATA	2	6	182668	182673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543668
4523	NC_014209	TA	3	6	182806	182811	50 %	50 %	0 %	0 %	297543669
4524	NC_014209	GCA	2	6	182820	182825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543669
4525	NC_014209	GTA	2	6	182840	182845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_014209	GTT	2	6	182851	182856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_014209	A	7	7	182887	182893	100 %	0 %	0 %	0 %	297543670
4528	NC_014209	AAG	2	6	182901	182906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543670
4529	NC_014209	AGC	2	6	182965	182970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543670
4530	NC_014209	AGA	2	6	182971	182976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543670
4531	NC_014209	ATG	2	6	183161	183166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543670
4532	NC_014209	GAA	2	6	183188	183193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543670
4533	NC_014209	GTA	2	6	183215	183220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543670
4534	NC_014209	TGG	2	6	183271	183276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543670
4535	NC_014209	ATAAC	2	10	183285	183294	60 %	20 %	0 %	20 %	297543670
4536	NC_014209	AGA	2	6	183328	183333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543670
4537	NC_014209	ATT	2	6	183366	183371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543670
4538	NC_014209	TAGCTA	2	12	183372	183383	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297543670
4539	NC_014209	A	7	7	183511	183517	100 %	0 %	0 %	0 %	297543670
4540	NC_014209	ATAA	2	8	183533	183540	75 %	25 %	0 %	0 %	297543670
4541	NC_014209	AAG	2	6	183577	183582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543670
4542	NC_014209	GA	3	6	183586	183591	50 %	0 %	50 %	0 %	297543670
4543	NC_014209	AAG	2	6	183660	183665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543670
4544	NC_014209	A	6	6	183675	183680	100 %	0 %	0 %	0 %	297543670
4545	NC_014209	GCA	2	6	183695	183700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543670
4546	NC_014209	T	6	6	183741	183746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_014209	ACT	2	6	183797	183802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_014209	A	7	7	183812	183818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_014209	TAAA	2	8	183821	183828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_014209	TAA	3	9	183882	183890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_014209	TCT	2	6	183934	183939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_014209	T	6	6	183960	183965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_014209	ATT	3	9	183998	184006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_014209	AG	3	6	184070	184075	50 %	0 %	50 %	0 %	297543671
4555	NC_014209	A	6	6	184134	184139	100 %	0 %	0 %	0 %	297543671
4556	NC_014209	A	7	7	184167	184173	100 %	0 %	0 %	0 %	297543671
4557	NC_014209	A	6	6	184193	184198	100 %	0 %	0 %	0 %	297543671
4558	NC_014209	GAA	2	6	184199	184204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543671
4559	NC_014209	GCA	2	6	184244	184249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543671
4560	NC_014209	AT	5	10	184518	184527	50 %	50 %	0 %	0 %	297543671
4561	NC_014209	TGA	2	6	184684	184689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543671
4562	NC_014209	ATT	2	6	184766	184771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543671
4563	NC_014209	TTG	2	6	184803	184808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543671
4564	NC_014209	AAC	2	6	184828	184833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543671
4565	NC_014209	TGA	2	6	184903	184908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543671
4566	NC_014209	GAA	2	6	184916	184921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543671
4567	NC_014209	TGAC	2	8	184923	184930	25 %	25 %	25 %	25 %	297543671
4568	NC_014209	AGT	2	6	184954	184959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543671
4569	NC_014209	TGA	2	6	184972	184977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543671
4570	NC_014209	CAT	2	6	184988	184993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543671
4571	NC_014209	CCT	2	6	185111	185116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297543671
4572	NC_014209	GAA	2	6	185121	185126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543671
4573	NC_014209	TGG	2	6	185134	185139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543671
4574	NC_014209	TCC	2	6	185161	185166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297543671
4575	NC_014209	AGC	2	6	185182	185187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543671
4576	NC_014209	AGA	2	6	185197	185202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543671
4577	NC_014209	TTGA	2	8	185234	185241	25 %	50 %	25 %	0 %	297543671
4578	NC_014209	GAT	2	6	185258	185263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543671
4579	NC_014209	GAA	2	6	185273	185278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543671
4580	NC_014209	AGA	2	6	185330	185335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543671
4581	NC_014209	AT	3	6	185352	185357	50 %	50 %	0 %	0 %	297543671
4582	NC_014209	GAA	2	6	185378	185383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543671
4583	NC_014209	TGC	2	6	185385	185390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297543671
4584	NC_014209	AGA	2	6	185398	185403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543671
4585	NC_014209	TA	3	6	185535	185540	50 %	50 %	0 %	0 %	297543671
4586	NC_014209	CCTA	2	8	185629	185636	25 %	25 %	0 %	50 %	297543672
4587	NC_014209	ATG	2	6	185642	185647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543672
4588	NC_014209	AAAG	2	8	185694	185701	75 %	0 %	25 %	0 %	297543672
4589	NC_014209	CTTT	2	8	185735	185742	0 %	75 %	0 %	25 %	297543672
4590	NC_014209	CAG	2	6	185749	185754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297543672
4591	NC_014209	TGG	2	6	185769	185774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543672
4592	NC_014209	ATTTA	2	10	185799	185808	40 %	60 %	0 %	0 %	297543672
4593	NC_014209	GAA	2	6	185809	185814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543672
4594	NC_014209	AAT	2	6	185816	185821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543672
4595	NC_014209	GGT	2	6	185879	185884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_014209	GAA	2	6	185958	185963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543673
4597	NC_014209	TAA	2	6	185965	185970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543673
4598	NC_014209	CAAA	2	8	185996	186003	75 %	0 %	0 %	25 %	297543673
4599	NC_014209	ATA	2	6	186031	186036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543673
4600	NC_014209	GTA	2	6	186093	186098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543673
4601	NC_014209	AAT	2	6	186110	186115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543673
4602	NC_014209	AGA	3	9	186125	186133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543673
4603	NC_014209	TGA	2	6	186152	186157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543673
4604	NC_014209	T	6	6	186165	186170	0 %	100 %	0 %	0 %	297543673
4605	NC_014209	TGT	2	6	186188	186193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543673
4606	NC_014209	TG	3	6	186324	186329	0 %	50 %	50 %	0 %	297543673
4607	NC_014209	ATG	2	6	186388	186393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543673
4608	NC_014209	TAG	2	6	186406	186411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543673
4609	NC_014209	TGAAGA	2	12	186481	186492	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	297543674
4610	NC_014209	GGT	2	6	186504	186509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297543674
4611	NC_014209	ATG	2	6	186531	186536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543674
4612	NC_014209	ACA	2	6	186544	186549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297543674
4613	NC_014209	AAT	2	6	186581	186586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543674
4614	NC_014209	AAAG	2	8	186590	186597	75 %	0 %	25 %	0 %	297543674
4615	NC_014209	T	7	7	186630	186636	0 %	100 %	0 %	0 %	297543674
4616	NC_014209	CTTA	2	8	186699	186706	25 %	50 %	0 %	25 %	297543674
4617	NC_014209	GAA	2	6	186723	186728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543674
4618	NC_014209	GAA	2	6	186735	186740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543674
4619	NC_014209	T	6	6	186849	186854	0 %	100 %	0 %	0 %	297543674
4620	NC_014209	A	6	6	186896	186901	100 %	0 %	0 %	0 %	297543674
4621	NC_014209	TATTTT	2	12	186944	186955	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	297543674
4622	NC_014209	GAG	2	6	187047	187052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297543674
4623	NC_014209	TAC	2	6	187082	187087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543674
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