MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014160	ATT	2	6	35	40	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014160	ATA	2	6	90	95	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241749
3	NC_014160	TAA	2	6	103	108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241749
4	NC_014160	AGA	2	6	109	114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241749
5	NC_014160	AGG	2	6	204	209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241749
6	NC_014160	TTG	2	6	322	327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241749
7	NC_014160	AGG	2	6	474	479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241749
8	NC_014160	ACT	2	6	538	543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241749
9	NC_014160	AGG	2	6	549	554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241749
10	NC_014160	CCT	2	6	566	571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241749
11	NC_014160	GAG	2	6	594	599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241749
12	NC_014160	CCA	2	6	708	713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241749
13	NC_014160	CTG	2	6	855	860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241749
14	NC_014160	GGA	2	6	887	892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241749
15	NC_014160	AGG	2	6	943	948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241749
16	NC_014160	TCCT	2	8	969	976	0 %	50 %	0 %	50 %	296241749
17	NC_014160	GAA	2	6	1022	1027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241749
18	NC_014160	ATG	2	6	1143	1148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241749
19	NC_014160	GAA	2	6	1226	1231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241749
20	NC_014160	CGA	2	6	1276	1281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241750
21	NC_014160	CTT	2	6	1285	1290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241750
22	NC_014160	GAA	2	6	1309	1314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241750
23	NC_014160	ACC	2	6	1319	1324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241750
24	NC_014160	TGT	2	6	1486	1491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241750
25	NC_014160	TCA	2	6	1620	1625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241750
26	NC_014160	CAT	2	6	1635	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241750
27	NC_014160	AAG	2	6	1724	1729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241750
28	NC_014160	AGG	2	6	2041	2046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241751
29	NC_014160	AGG	2	6	2083	2088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241751
30	NC_014160	GAG	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241751
31	NC_014160	GAA	2	6	2231	2236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241751
32	NC_014160	AT	3	6	2485	2490	50 %	50 %	0 %	0 %	296241751
33	NC_014160	A	6	6	2574	2579	100 %	0 %	0 %	0 %	296241751
34	NC_014160	AGGG	2	8	2613	2620	25 %	0 %	75 %	0 %	296241751
35	NC_014160	ATA	2	6	2643	2648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241751
36	NC_014160	CAG	2	6	2698	2703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241751
37	NC_014160	GTA	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241751
38	NC_014160	TAT	2	6	2762	2767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241751
39	NC_014160	TGA	2	6	2846	2851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241751
40	NC_014160	TGG	2	6	2934	2939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241751
41	NC_014160	AGG	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241751
42	NC_014160	GTG	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241751
43	NC_014160	TAC	2	6	3053	3058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241751
44	NC_014160	CAG	2	6	3074	3079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241751
45	NC_014160	GGGA	2	8	3138	3145	25 %	0 %	75 %	0 %	296241751
46	NC_014160	CGT	2	6	3211	3216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241751
47	NC_014160	ACC	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241751
48	NC_014160	CAGG	2	8	3249	3256	25 %	0 %	50 %	25 %	296241751
49	NC_014160	GA	3	6	3341	3346	50 %	0 %	50 %	0 %	296241751
50	NC_014160	GAGAG	2	10	3389	3398	40 %	0 %	60 %	0 %	296241751
51	NC_014160	TGGA	2	8	3447	3454	25 %	25 %	50 %	0 %	296241751
52	NC_014160	CAA	2	6	3536	3541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241751
53	NC_014160	AGC	2	6	3601	3606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241751
54	NC_014160	GGA	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241751
55	NC_014160	TTC	2	6	3669	3674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241751
56	NC_014160	AGG	2	6	3685	3690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241751
57	NC_014160	AGC	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241751
58	NC_014160	CGTG	2	8	3756	3763	0 %	25 %	50 %	25 %	296241751
59	NC_014160	CCG	2	6	3789	3794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014160	CGC	2	6	3828	3833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_014160	TAT	2	6	3864	3869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014160	ATT	2	6	3960	3965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014160	GTC	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014160	CTA	2	6	4068	4073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014160	ACA	2	6	4111	4116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241752
66	NC_014160	TAT	2	6	4161	4166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241752
67	NC_014160	CG	3	6	4173	4178	0 %	0 %	50 %	50 %	296241752
68	NC_014160	GGT	2	6	4207	4212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241752
69	NC_014160	TCA	2	6	4247	4252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241752
70	NC_014160	ATT	2	6	4282	4287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241752
71	NC_014160	GCT	2	6	4310	4315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241752
72	NC_014160	CTT	2	6	4320	4325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241752
73	NC_014160	ACT	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241752
74	NC_014160	CCG	2	6	4436	4441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241752
75	NC_014160	TGA	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241752
76	NC_014160	GCT	2	6	4513	4518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241752
77	NC_014160	GAA	2	6	4527	4532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241752
78	NC_014160	GAG	2	6	4538	4543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241752
79	NC_014160	CCT	2	6	4563	4568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241752
80	NC_014160	CGC	2	6	4595	4600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241752
81	NC_014160	TTC	2	6	4670	4675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241752
82	NC_014160	TCA	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241752
83	NC_014160	TCC	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241752
84	NC_014160	CTC	2	6	4739	4744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241752
85	NC_014160	G	6	6	4759	4764	0 %	0 %	100 %	0 %	296241752
86	NC_014160	CGC	2	6	4772	4777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241752
87	NC_014160	TAT	2	6	4797	4802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241752
88	NC_014160	TGC	2	6	4806	4811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241752
89	NC_014160	CTT	3	9	4830	4838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241752
90	NC_014160	GAA	2	6	4839	4844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241752
91	NC_014160	CTC	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241752
92	NC_014160	AC	3	6	4903	4908	50 %	0 %	0 %	50 %	296241752
93	NC_014160	CTC	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241752
94	NC_014160	TGAA	2	8	5030	5037	50 %	25 %	25 %	0 %	296241752
95	NC_014160	TAT	2	6	5112	5117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241752
96	NC_014160	T	6	6	5121	5126	0 %	100 %	0 %	0 %	296241752
97	NC_014160	AATG	2	8	5204	5211	50 %	25 %	25 %	0 %	296241752
98	NC_014160	TGT	2	6	5267	5272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241752
99	NC_014160	AAG	2	6	5290	5295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241752
100	NC_014160	TAT	2	6	5485	5490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014160	ATG	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014160	TTGT	2	8	5508	5515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014160	AAG	2	6	5540	5545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014160	ACG	2	6	5716	5721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241753
105	NC_014160	TGTT	2	8	5729	5736	0 %	75 %	25 %	0 %	296241753
106	NC_014160	ATT	2	6	5770	5775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241753
107	NC_014160	CA	3	6	5788	5793	50 %	0 %	0 %	50 %	296241753
108	NC_014160	ATT	2	6	5794	5799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241753
109	NC_014160	ACC	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_014160	A	6	6	5908	5913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014160	TAGTA	2	10	5918	5927	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014160	TG	3	6	5943	5948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014160	CAT	2	6	5989	5994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014160	TAA	2	6	6037	6042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014160	CTGG	2	8	6045	6052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014160	GCTG	2	8	6059	6066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014160	AGG	2	6	6077	6082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014160	AGG	2	6	6242	6247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014160	GT	3	6	6273	6278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014160	GAGG	2	8	6360	6367	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014160	ATATT	2	10	6374	6383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014160	GCG	2	6	6444	6449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014160	AAC	2	6	6477	6482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014160	ATT	2	6	6512	6517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014160	GAG	2	6	6531	6536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014160	TGA	2	6	6571	6576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014160	TTC	2	6	6579	6584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014160	TCG	2	6	6592	6597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014160	GAG	2	6	6611	6616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014160	ATA	2	6	6665	6670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014160	CGC	2	6	6747	6752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_014160	GGC	2	6	6754	6759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014160	GGC	2	6	6764	6769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014160	TTG	2	6	6969	6974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014160	AT	3	6	6982	6987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014160	ATT	2	6	7061	7066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014160	GA	3	6	7125	7130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014160	CTG	2	6	7224	7229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014160	AGT	2	6	7395	7400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014160	T	6	6	7426	7431	0 %	100 %	0 %	0 %	296241754
141	NC_014160	CTT	2	6	7501	7506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241754
142	NC_014160	CTC	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241754
143	NC_014160	GTC	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241754
144	NC_014160	CT	3	6	7671	7676	0 %	50 %	0 %	50 %	296241754
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149	NC_014160	GTC	2	6	7865	7870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241754
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166	NC_014160	ATAA	2	8	9182	9189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_014160	GTT	2	6	21947	21952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241770
400	NC_014160	ACTCC	2	10	22008	22017	20 %	20 %	0 %	60 %	296241770
401	NC_014160	ACCC	2	8	22098	22105	25 %	0 %	0 %	75 %	296241770
402	NC_014160	CAC	2	6	22119	22124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241770
403	NC_014160	TACGC	2	10	22125	22134	20 %	20 %	20 %	40 %	296241770
404	NC_014160	AGG	2	6	22168	22173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241770
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