MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014160	TAA	2	6	159561	159566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241923
3002	NC_014160	CGA	2	6	159576	159581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241923
3003	NC_014160	GAA	2	6	159595	159600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241923
3004	NC_014160	TC	3	6	159721	159726	0 %	50 %	0 %	50 %	296241923
3005	NC_014160	TAA	2	6	159755	159760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241923
3006	NC_014160	CAT	2	6	159777	159782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241923
3007	NC_014160	TAA	2	6	159866	159871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241923
3008	NC_014160	GAAAT	2	10	159911	159920	60 %	20 %	20 %	0 %	296241923
3009	NC_014160	GAAGGA	2	12	159972	159983	50 %	0 %	50 %	0 %	296241923
3010	NC_014160	TCA	2	6	160004	160009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241923
3011	NC_014160	TCA	2	6	160049	160054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241923
3012	NC_014160	GAGAA	2	10	160063	160072	60 %	0 %	40 %	0 %	296241923
3013	NC_014160	AAC	2	6	160106	160111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241923
3014	NC_014160	AAG	2	6	160139	160144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241923
3015	NC_014160	TAC	2	6	160195	160200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241923
3016	NC_014160	CAG	2	6	160205	160210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241923
3017	NC_014160	ATA	2	6	160222	160227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241923
3018	NC_014160	AGG	2	6	160229	160234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241923
3019	NC_014160	GAG	2	6	160252	160257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241923
3020	NC_014160	AG	4	8	160302	160309	50 %	0 %	50 %	0 %	296241923
3021	NC_014160	ATGG	2	8	160392	160399	25 %	25 %	50 %	0 %	296241923
3022	NC_014160	CAA	2	6	160425	160430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_014160	AG	3	6	160481	160486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_014160	TA	3	6	160514	160519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_014160	AGCTG	2	10	160529	160538	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3026	NC_014160	AAGT	2	8	160555	160562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_014160	GAG	2	6	160594	160599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_014160	AGA	2	6	160621	160626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241924
3029	NC_014160	TCC	2	6	160729	160734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241924
3030	NC_014160	GCC	2	6	160742	160747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241924
3031	NC_014160	TTGG	2	8	160774	160781	0 %	50 %	50 %	0 %	296241924
3032	NC_014160	CCT	2	6	160807	160812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241924
3033	NC_014160	TCC	2	6	160831	160836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241924
3034	NC_014160	GGA	2	6	160866	160871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241924
3035	NC_014160	TAC	2	6	160907	160912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241924
3036	NC_014160	AGT	2	6	160915	160920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241924
3037	NC_014160	GAA	2	6	161056	161061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241924
3038	NC_014160	AAG	2	6	161077	161082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241924
3039	NC_014160	AGG	2	6	161141	161146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241924
3040	NC_014160	AGG	2	6	161149	161154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241924
3041	NC_014160	AGT	2	6	161169	161174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241924
3042	NC_014160	TCCT	2	8	161188	161195	0 %	50 %	0 %	50 %	296241924
3043	NC_014160	AGC	2	6	161232	161237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241924
3044	NC_014160	GAG	2	6	161284	161289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241924
3045	NC_014160	ATG	2	6	161323	161328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241924
3046	NC_014160	AAGG	2	8	161334	161341	50 %	0 %	50 %	0 %	296241924
3047	NC_014160	GAT	2	6	161343	161348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241924
3048	NC_014160	ACG	2	6	161419	161424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241925
3049	NC_014160	GA	3	6	161450	161455	50 %	0 %	50 %	0 %	296241925
3050	NC_014160	AGA	2	6	161483	161488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241925
3051	NC_014160	AGT	2	6	161561	161566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241925
3052	NC_014160	CGTTT	2	10	161687	161696	0 %	60 %	20 %	20 %	296241925
3053	NC_014160	A	6	6	161769	161774	100 %	0 %	0 %	0 %	296241925
3054	NC_014160	TCA	2	6	161779	161784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241925
3055	NC_014160	AAG	2	6	161799	161804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241925
3056	NC_014160	TAG	2	6	161883	161888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241926
3057	NC_014160	GAG	2	6	161918	161923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241926
3058	NC_014160	CTG	2	6	162090	162095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241926
3059	NC_014160	TTC	2	6	162119	162124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241926
3060	NC_014160	CTT	2	6	162131	162136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241926
3061	NC_014160	TAG	2	6	162156	162161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241926
3062	NC_014160	GTT	2	6	162197	162202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241926
3063	NC_014160	TAT	2	6	162295	162300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241926
3064	NC_014160	CCT	2	6	162431	162436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241926
3065	NC_014160	TGGT	2	8	162478	162485	0 %	50 %	50 %	0 %	296241926
3066	NC_014160	GAG	2	6	162636	162641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241927
3067	NC_014160	AGA	3	9	162733	162741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241927
3068	NC_014160	GGA	2	6	162742	162747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241927
3069	NC_014160	GGA	2	6	162756	162761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241927
3070	NC_014160	CTT	2	6	162767	162772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241927
3071	NC_014160	GGT	2	6	162866	162871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241927
3072	NC_014160	CCA	2	6	162889	162894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241927
3073	NC_014160	ATT	2	6	162990	162995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241927
3074	NC_014160	GGA	2	6	163085	163090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241927
3075	NC_014160	TTGA	2	8	163185	163192	25 %	50 %	25 %	0 %	296241927
3076	NC_014160	GAT	2	6	163278	163283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241927
3077	NC_014160	CCAT	2	8	163320	163327	25 %	25 %	0 %	50 %	296241927
3078	NC_014160	GTT	2	6	163328	163333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241927
3079	NC_014160	ATG	2	6	163363	163368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241927
3080	NC_014160	A	6	6	163444	163449	100 %	0 %	0 %	0 %	296241927
3081	NC_014160	ATG	2	6	163558	163563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241927
3082	NC_014160	TCT	2	6	163626	163631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241927
3083	NC_014160	GA	3	6	163644	163649	50 %	0 %	50 %	0 %	296241927
3084	NC_014160	GTT	2	6	163683	163688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241927
3085	NC_014160	CA	3	6	163717	163722	50 %	0 %	0 %	50 %	296241928
3086	NC_014160	TCG	2	6	163783	163788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241928
3087	NC_014160	TCT	2	6	163837	163842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241928
3088	NC_014160	TGA	2	6	163848	163853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241928
3089	NC_014160	ATT	2	6	163894	163899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241928
3090	NC_014160	CAAC	2	8	163907	163914	50 %	0 %	0 %	50 %	296241928
3091	NC_014160	TTA	2	6	163937	163942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241928
3092	NC_014160	AT	3	6	164049	164054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_014160	AAG	2	6	164076	164081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_014160	TGA	2	6	164109	164114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241929
3095	NC_014160	TAC	2	6	164199	164204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241929
3096	NC_014160	GTA	2	6	164243	164248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241929
3097	NC_014160	GCA	2	6	164360	164365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241929
3098	NC_014160	AAAT	2	8	164400	164407	75 %	25 %	0 %	0 %	296241929
3099	NC_014160	AAG	2	6	164418	164423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241929
3100	NC_014160	GGA	2	6	164630	164635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241930
3101	NC_014160	GA	3	6	164785	164790	50 %	0 %	50 %	0 %	296241930
3102	NC_014160	AG	3	6	164843	164848	50 %	0 %	50 %	0 %	296241930
3103	NC_014160	GGA	2	6	164857	164862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241930
3104	NC_014160	GGGA	2	8	164871	164878	25 %	0 %	75 %	0 %	296241930
3105	NC_014160	ATTG	2	8	164891	164898	25 %	50 %	25 %	0 %	296241930
3106	NC_014160	GTT	2	6	164960	164965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241930
3107	NC_014160	GGT	2	6	165166	165171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241930
3108	NC_014160	ATG	2	6	165204	165209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241930
3109	NC_014160	TC	3	6	165275	165280	0 %	50 %	0 %	50 %	296241930
3110	NC_014160	GA	3	6	165302	165307	50 %	0 %	50 %	0 %	296241930
3111	NC_014160	TA	3	6	165324	165329	50 %	50 %	0 %	0 %	296241930
3112	NC_014160	TCC	2	6	165338	165343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241930
3113	NC_014160	GAA	2	6	165356	165361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241930
3114	NC_014160	GTC	2	6	165386	165391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241930
3115	NC_014160	GAA	2	6	165430	165435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241930
3116	NC_014160	GA	3	6	165502	165507	50 %	0 %	50 %	0 %	296241930
3117	NC_014160	GGT	2	6	165509	165514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241930
3118	NC_014160	TTG	2	6	165642	165647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241930
3119	NC_014160	AGA	2	6	165661	165666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241930
3120	NC_014160	GA	3	6	165677	165682	50 %	0 %	50 %	0 %	296241930
3121	NC_014160	GGT	2	6	165706	165711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241930
3122	NC_014160	TTG	2	6	165758	165763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241930
3123	NC_014160	ATG	2	6	165850	165855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241930
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3153	NC_014160	CAGTG	2	10	167852	167861	20 %	20 %	40 %	20 %	296241934
3154	NC_014160	TAG	2	6	167880	167885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241934
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3236	NC_014160	ACC	2	6	171763	171768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3493	NC_014160	GTG	2	6	184891	184896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241952
3494	NC_014160	CAAG	2	8	184920	184927	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3495	NC_014160	CTAA	2	8	184954	184961	50 %	25 %	0 %	25 %	296241953
3496	NC_014160	AT	3	6	185058	185063	50 %	50 %	0 %	0 %	296241953
3497	NC_014160	TTG	2	6	185065	185070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241953
3498	NC_014160	AACGTA	2	12	185159	185170	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296241953
3499	NC_014160	A	6	6	185291	185296	100 %	0 %	0 %	0 %	296241954
3500	NC_014160	GCTC	2	8	185358	185365	0 %	25 %	25 %	50 %	296241954

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