MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014160	GAA	2	6	132242	132247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241894
2502	NC_014160	TAA	2	6	132271	132276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241894
2503	NC_014160	CCT	2	6	132288	132293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241894
2504	NC_014160	GAAT	2	8	132343	132350	50 %	25 %	25 %	0 %	296241894
2505	NC_014160	AGA	2	6	132369	132374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241894
2506	NC_014160	CGG	2	6	132379	132384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241894
2507	NC_014160	AACC	2	8	132414	132421	50 %	0 %	0 %	50 %	296241894
2508	NC_014160	AGG	2	6	132445	132450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241894
2509	NC_014160	TAA	2	6	132605	132610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241894
2510	NC_014160	TAT	2	6	132613	132618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241894
2511	NC_014160	GGA	2	6	132626	132631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241894
2512	NC_014160	GGC	2	6	132729	132734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241894
2513	NC_014160	ATT	2	6	132844	132849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_014160	ACTCC	2	10	132953	132962	20 %	20 %	0 %	60 %	296241895
2515	NC_014160	ATTTT	2	10	133006	133015	20 %	80 %	0 %	0 %	296241895
2516	NC_014160	TCAT	2	8	133094	133101	25 %	50 %	0 %	25 %	296241895
2517	NC_014160	AGT	2	6	133111	133116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241895
2518	NC_014160	CAG	2	6	133179	133184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241895
2519	NC_014160	CAA	2	6	133210	133215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241895
2520	NC_014160	CTT	2	6	133233	133238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241895
2521	NC_014160	C	6	6	133344	133349	0 %	0 %	0 %	100 %	296241895
2522	NC_014160	GCTA	2	8	133427	133434	25 %	25 %	25 %	25 %	296241895
2523	NC_014160	GAG	2	6	133517	133522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241895
2524	NC_014160	TGA	2	6	133549	133554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241895
2525	NC_014160	TAT	2	6	133586	133591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241895
2526	NC_014160	TAT	2	6	133775	133780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241895
2527	NC_014160	GAT	2	6	133840	133845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241895
2528	NC_014160	ATT	2	6	133912	133917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241895
2529	NC_014160	TC	3	6	133937	133942	0 %	50 %	0 %	50 %	296241895
2530	NC_014160	AAACG	2	10	133957	133966	60 %	0 %	20 %	20 %	296241895
2531	NC_014160	CA	4	8	133989	133996	50 %	0 %	0 %	50 %	296241895
2532	NC_014160	CAA	2	6	134004	134009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241895
2533	NC_014160	AGC	2	6	134137	134142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241895
2534	NC_014160	TAG	2	6	134148	134153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241895
2535	NC_014160	GAG	2	6	134194	134199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241895
2536	NC_014160	TAT	2	6	134252	134257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_014160	TAT	2	6	134272	134277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_014160	CAA	2	6	134320	134325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241896
2539	NC_014160	GAC	2	6	134344	134349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241896
2540	NC_014160	AGGA	2	8	134485	134492	50 %	0 %	50 %	0 %	296241896
2541	NC_014160	GT	4	8	134614	134621	0 %	50 %	50 %	0 %	296241896
2542	NC_014160	AT	3	6	134635	134640	50 %	50 %	0 %	0 %	296241896
2543	NC_014160	AGGG	2	8	134651	134658	25 %	0 %	75 %	0 %	296241896
2544	NC_014160	AT	3	6	134694	134699	50 %	50 %	0 %	0 %	296241896
2545	NC_014160	AAG	2	6	134701	134706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241896
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2547	NC_014160	TGT	2	6	134868	134873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241897
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2549	NC_014160	TCT	2	6	135045	135050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241897
2550	NC_014160	ACC	2	6	135051	135056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241897
2551	NC_014160	CTA	2	6	135091	135096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241897
2552	NC_014160	CCA	2	6	135142	135147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241897
2553	NC_014160	CT	3	6	135151	135156	0 %	50 %	0 %	50 %	296241897
2554	NC_014160	CA	3	6	135371	135376	50 %	0 %	0 %	50 %	296241897
2555	NC_014160	TCT	2	6	135389	135394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241897
2556	NC_014160	CCT	2	6	135580	135585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241897
2557	NC_014160	GTT	2	6	135614	135619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241897
2558	NC_014160	CAC	2	6	135682	135687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241897
2559	NC_014160	CT	3	6	135857	135862	0 %	50 %	0 %	50 %	296241897
2560	NC_014160	CT	3	6	135870	135875	0 %	50 %	0 %	50 %	296241897
2561	NC_014160	ATT	2	6	135923	135928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241897
2562	NC_014160	ATT	2	6	135974	135979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241898
2563	NC_014160	CAC	2	6	136075	136080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241898
2564	NC_014160	GCCA	2	8	136289	136296	25 %	0 %	25 %	50 %	296241898
2565	NC_014160	ACCCT	2	10	136332	136341	20 %	20 %	0 %	60 %	296241898
2566	NC_014160	GCC	2	6	136345	136350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241898
2567	NC_014160	CT	3	6	136351	136356	0 %	50 %	0 %	50 %	296241898
2568	NC_014160	TAC	2	6	136411	136416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241898
2569	NC_014160	CCT	2	6	136480	136485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_014160	CTT	2	6	136504	136509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241899
2571	NC_014160	AGG	2	6	136559	136564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241899
2572	NC_014160	CAT	2	6	136593	136598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241899
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2574	NC_014160	TGT	2	6	136648	136653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241899
2575	NC_014160	TA	3	6	136705	136710	50 %	50 %	0 %	0 %	296241899
2576	NC_014160	AAT	2	6	136723	136728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241899
2577	NC_014160	CT	4	8	136753	136760	0 %	50 %	0 %	50 %	296241899
2578	NC_014160	ATT	2	6	136769	136774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241899
2579	NC_014160	ATC	2	6	136780	136785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241899
2580	NC_014160	CTT	2	6	136967	136972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241899
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2583	NC_014160	TC	3	6	137123	137128	0 %	50 %	0 %	50 %	296241899
2584	NC_014160	CTG	2	6	137156	137161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241899
2585	NC_014160	TCT	2	6	137192	137197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241899
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2587	NC_014160	AAC	2	6	137245	137250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241899
2588	NC_014160	TCCTTC	2	12	137252	137263	0 %	50 %	0 %	50 %	296241899
2589	NC_014160	ACGAG	2	10	137301	137310	40 %	0 %	40 %	20 %	296241899
2590	NC_014160	AAT	2	6	137431	137436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_014160	CGA	2	6	137723	137728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241900
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2594	NC_014160	CT	3	6	137817	137822	0 %	50 %	0 %	50 %	296241900
2595	NC_014160	AT	3	6	137882	137887	50 %	50 %	0 %	0 %	296241900
2596	NC_014160	GTC	2	6	137896	137901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241900
2597	NC_014160	TC	3	6	138039	138044	0 %	50 %	0 %	50 %	296241900
2598	NC_014160	TCC	2	6	138100	138105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241900
2599	NC_014160	CCA	2	6	138110	138115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296241900
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2601	NC_014160	CCT	2	6	138176	138181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241901
2602	NC_014160	TCT	2	6	138187	138192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241901
2603	NC_014160	CCTCT	2	10	138209	138218	0 %	40 %	0 %	60 %	296241901
2604	NC_014160	T	6	6	138224	138229	0 %	100 %	0 %	0 %	296241901
2605	NC_014160	TCCTC	2	10	138268	138277	0 %	40 %	0 %	60 %	296241901
2606	NC_014160	TTTC	2	8	138280	138287	0 %	75 %	0 %	25 %	296241901
2607	NC_014160	GAA	2	6	138317	138322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241901
2608	NC_014160	GCA	2	6	138351	138356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241901
2609	NC_014160	CT	3	6	138376	138381	0 %	50 %	0 %	50 %	296241901
2610	NC_014160	TCA	2	6	138604	138609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241901
2611	NC_014160	CAGC	2	8	138958	138965	25 %	0 %	25 %	50 %	296241901
2612	NC_014160	TC	3	6	138969	138974	0 %	50 %	0 %	50 %	296241901
2613	NC_014160	CAT	2	6	139013	139018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241901
2614	NC_014160	TC	3	6	139031	139036	0 %	50 %	0 %	50 %	296241901
2615	NC_014160	ATA	2	6	139037	139042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241901
2616	NC_014160	GAA	2	6	139196	139201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241901
2617	NC_014160	CAA	2	6	139268	139273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241901
2618	NC_014160	ATC	2	6	139286	139291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241901
2619	NC_014160	CAA	2	6	139366	139371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241901
2620	NC_014160	ATT	2	6	139410	139415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_014160	AGT	2	6	139458	139463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_014160	AGA	2	6	139561	139566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241902
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2624	NC_014160	CCT	2	6	139620	139625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241902
2625	NC_014160	TAA	2	6	139744	139749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241903
2626	NC_014160	ATT	3	9	139752	139760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241903
2627	NC_014160	GAG	2	6	139812	139817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241903
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2630	NC_014160	CGA	2	6	139963	139968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241903
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2632	NC_014160	ACT	2	6	140179	140184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241903
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2645	NC_014160	ATG	2	6	141096	141101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241903
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2652	NC_014160	CTG	2	6	141348	141353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241903
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2725	NC_014160	TGA	2	6	144883	144888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2872	NC_014160	AGG	3	9	152462	152470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241915
2873	NC_014160	GAA	2	6	152517	152522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241915
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2883	NC_014160	AT	3	6	153394	153399	50 %	50 %	0 %	0 %	296241915
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2890	NC_014160	TTG	2	6	153854	153859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241915
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2899	NC_014160	AG	3	6	154096	154101	50 %	0 %	50 %	0 %	296241915
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2903	NC_014160	GA	3	6	154210	154215	50 %	0 %	50 %	0 %	296241915
2904	NC_014160	ATA	2	6	154281	154286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241915
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2909	NC_014160	TAAC	2	8	154535	154542	50 %	25 %	0 %	25 %	296241916
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2957	NC_014160	TAG	2	6	156946	156951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241920
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2962	NC_014160	TTG	2	6	157279	157284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2963	NC_014160	TGA	3	9	157298	157306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2981	NC_014160	GTTG	2	8	158408	158415	0 %	50 %	50 %	0 %	296241922
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