MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014160	TAA	2	6	104779	104784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_014160	TACA	2	8	104823	104830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2003	NC_014160	CTT	2	6	104855	104860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_014160	CTTCT	2	10	104885	104894	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2005	NC_014160	GTGTT	2	10	105008	105017	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_014160	GAA	2	6	105055	105060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_014160	AAT	2	6	105115	105120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_014160	AAT	2	6	105133	105138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_014160	GGA	2	6	105293	105298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241865
2010	NC_014160	AT	3	6	105338	105343	50 %	50 %	0 %	0 %	296241865
2011	NC_014160	CGG	2	6	105503	105508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241865
2012	NC_014160	CTT	2	6	105509	105514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241865
2013	NC_014160	CG	3	6	105603	105608	0 %	0 %	50 %	50 %	296241865
2014	NC_014160	AAC	2	6	105641	105646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241865
2015	NC_014160	AAAG	2	8	105668	105675	75 %	0 %	25 %	0 %	296241865
2016	NC_014160	AG	3	6	105681	105686	50 %	0 %	50 %	0 %	296241865
2017	NC_014160	TGC	2	6	105767	105772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241865
2018	NC_014160	A	6	6	105807	105812	100 %	0 %	0 %	0 %	296241865
2019	NC_014160	GAA	2	6	105866	105871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241865
2020	NC_014160	GAA	2	6	105908	105913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241865
2021	NC_014160	GAG	2	6	105932	105937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241865
2022	NC_014160	TTCA	2	8	106013	106020	25 %	50 %	0 %	25 %	296241865
2023	NC_014160	ACG	2	6	106021	106026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241865
2024	NC_014160	G	6	6	106155	106160	0 %	0 %	100 %	0 %	296241865
2025	NC_014160	CAT	2	6	106316	106321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241865
2026	NC_014160	GGC	2	6	106338	106343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241865
2027	NC_014160	GTA	2	6	106360	106365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241865
2028	NC_014160	GGAA	2	8	106367	106374	50 %	0 %	50 %	0 %	296241865
2029	NC_014160	ATT	2	6	106382	106387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241865
2030	NC_014160	GCG	2	6	106446	106451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241865
2031	NC_014160	CATG	2	8	106511	106518	25 %	25 %	25 %	25 %	296241865
2032	NC_014160	GGTAGG	2	12	106532	106543	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	296241865
2033	NC_014160	TGG	2	6	106710	106715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296241865
2034	NC_014160	CTCA	2	8	106759	106766	25 %	25 %	0 %	50 %	296241865
2035	NC_014160	GCG	2	6	106809	106814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241865
2036	NC_014160	GGGTG	2	10	106818	106827	0 %	20 %	80 %	0 %	296241865
2037	NC_014160	TGA	2	6	106843	106848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241865
2038	NC_014160	GCGA	2	8	106851	106858	25 %	0 %	50 %	25 %	296241865
2039	NC_014160	GA	3	6	106857	106862	50 %	0 %	50 %	0 %	296241865
2040	NC_014160	TTC	2	6	106935	106940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241865
2041	NC_014160	AGGA	2	8	107038	107045	50 %	0 %	50 %	0 %	296241865
2042	NC_014160	TGT	2	6	107087	107092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241865
2043	NC_014160	GAA	2	6	107094	107099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241865
2044	NC_014160	TA	3	6	107101	107106	50 %	50 %	0 %	0 %	296241865
2045	NC_014160	CAAT	2	8	107140	107147	50 %	25 %	0 %	25 %	296241866
2046	NC_014160	GCAC	2	8	107218	107225	25 %	0 %	25 %	50 %	296241866
2047	NC_014160	TCA	2	6	107288	107293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241866
2048	NC_014160	TGGA	2	8	107437	107444	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_014160	TGT	2	6	107469	107474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_014160	CTC	2	6	107480	107485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2051	NC_014160	CTA	2	6	107503	107508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2052	NC_014160	TACT	2	8	107580	107587	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2053	NC_014160	GTA	2	6	107643	107648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241867
2054	NC_014160	TAA	2	6	107723	107728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241867
2055	NC_014160	TC	3	6	107736	107741	0 %	50 %	0 %	50 %	296241867
2056	NC_014160	ATGA	2	8	107773	107780	50 %	25 %	25 %	0 %	296241867
2057	NC_014160	TCT	2	6	107795	107800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241867
2058	NC_014160	CGC	2	6	107808	107813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296241867
2059	NC_014160	TCC	2	6	107917	107922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241867
2060	NC_014160	TTA	2	6	107972	107977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241867
2061	NC_014160	AGGG	2	8	108033	108040	25 %	0 %	75 %	0 %	296241867
2062	NC_014160	CTT	2	6	108078	108083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241867
2063	NC_014160	T	6	6	108135	108140	0 %	100 %	0 %	0 %	296241867
2064	NC_014160	GA	3	6	108271	108276	50 %	0 %	50 %	0 %	296241867
2065	NC_014160	GGA	2	6	108283	108288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241867
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2067	NC_014160	CTG	2	6	108414	108419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241867
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2069	NC_014160	TATC	2	8	108464	108471	25 %	50 %	0 %	25 %	296241867
2070	NC_014160	ATGC	2	8	108478	108485	25 %	25 %	25 %	25 %	296241867
2071	NC_014160	GTT	2	6	108538	108543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241867
2072	NC_014160	GCT	2	6	108574	108579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241867
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2078	NC_014160	CT	3	6	108858	108863	0 %	50 %	0 %	50 %	296241867
2079	NC_014160	AATCTC	2	12	108867	108878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241867
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2082	NC_014160	CGGG	2	8	109076	109083	0 %	0 %	75 %	25 %	296241867
2083	NC_014160	G	6	6	109188	109193	0 %	0 %	100 %	0 %	296241867
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2087	NC_014160	CT	3	6	109368	109373	0 %	50 %	0 %	50 %	296241867
2088	NC_014160	CGG	2	6	109389	109394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241867
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2091	NC_014160	TAG	2	6	109665	109670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241867
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2094	NC_014160	CTG	2	6	109973	109978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241868
2095	NC_014160	AC	3	6	110086	110091	50 %	0 %	0 %	50 %	296241868
2096	NC_014160	TAC	2	6	110197	110202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241868
2097	NC_014160	TTC	2	6	110218	110223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241868
2098	NC_014160	TTC	2	6	110257	110262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241868
2099	NC_014160	TTTA	2	8	110323	110330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_014160	CAAT	2	8	110332	110339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2101	NC_014160	A	6	6	110477	110482	100 %	0 %	0 %	0 %	296241869
2102	NC_014160	AAC	2	6	110542	110547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241869
2103	NC_014160	TTA	2	6	110640	110645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241869
2104	NC_014160	CG	3	6	110673	110678	0 %	0 %	50 %	50 %	296241869
2105	NC_014160	ATA	2	6	110702	110707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296241869
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2107	NC_014160	AG	3	6	110876	110881	50 %	0 %	50 %	0 %	296241869
2108	NC_014160	GAG	2	6	110980	110985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241869
2109	NC_014160	CAG	2	6	111009	111014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241869
2110	NC_014160	GAT	2	6	111085	111090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241869
2111	NC_014160	GCG	2	6	111165	111170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241869
2112	NC_014160	AGC	2	6	111206	111211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241869
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2115	NC_014160	AGG	2	6	111433	111438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241870
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2117	NC_014160	TTC	2	6	111502	111507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241870
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2119	NC_014160	TGA	2	6	111775	111780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241870
2120	NC_014160	AAC	2	6	111786	111791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296241870
2121	NC_014160	CCT	2	6	111806	111811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241870
2122	NC_014160	TGT	2	6	111866	111871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241870
2123	NC_014160	GAA	2	6	111881	111886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241870
2124	NC_014160	ATG	2	6	112147	112152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241870
2125	NC_014160	ATT	2	6	112154	112159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296241870
2126	NC_014160	CTA	2	6	112247	112252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241870
2127	NC_014160	ATG	2	6	112305	112310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241870
2128	NC_014160	GAA	2	6	112379	112384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241870
2129	NC_014160	GA	3	6	112409	112414	50 %	0 %	50 %	0 %	296241870
2130	NC_014160	GA	3	6	112418	112423	50 %	0 %	50 %	0 %	296241870
2131	NC_014160	GAA	2	6	112619	112624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296241870
2132	NC_014160	GAGGGG	2	12	112643	112654	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	296241870
2133	NC_014160	TCT	2	6	112675	112680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296241871
2134	NC_014160	TAGGG	2	10	112728	112737	20 %	20 %	60 %	0 %	296241871
2135	NC_014160	CTC	2	6	112880	112885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241871
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2138	NC_014160	TCG	2	6	113178	113183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296241871
2139	NC_014160	CATA	2	8	113194	113201	50 %	25 %	0 %	25 %	296241871
2140	NC_014160	TTG	2	6	113237	113242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241871
2141	NC_014160	CAG	2	6	113276	113281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241871
2142	NC_014160	TCC	2	6	113364	113369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241871
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2144	NC_014160	AGT	2	6	113425	113430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241871
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2146	NC_014160	CT	3	6	113710	113715	0 %	50 %	0 %	50 %	296241871
2147	NC_014160	CTGGT	2	10	113795	113804	0 %	40 %	40 %	20 %	296241871
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2151	NC_014160	TCC	2	6	114184	114189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296241872
2152	NC_014160	TCA	2	6	114375	114380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2153	NC_014160	TGA	2	6	114397	114402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2154	NC_014160	TCC	2	6	114428	114433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2155	NC_014160	ATC	2	6	114472	114477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2156	NC_014160	TTC	2	6	114511	114516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2157	NC_014160	GTC	2	6	114536	114541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2158	NC_014160	CAA	2	6	114558	114563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2159	NC_014160	AGT	2	6	114591	114596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241873
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2163	NC_014160	ATG	2	6	114874	114879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296241873
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2199	NC_014160	ATA	2	6	117090	117095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2200	NC_014160	ATTA	2	8	117097	117104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2202	NC_014160	ATTT	2	8	117159	117166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2203	NC_014160	TAT	2	6	117171	117176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2244	NC_014160	GCC	2	6	119641	119646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2249	NC_014160	TC	4	8	119876	119883	0 %	50 %	0 %	50 %	296241879
2250	NC_014160	TGT	2	6	119889	119894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296241879
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2366	NC_014160	TA	3	6	126141	126146	50 %	50 %	0 %	0 %	296241886
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2370	NC_014160	CT	3	6	126369	126374	0 %	50 %	0 %	50 %	296241886
2371	NC_014160	GGA	2	6	126416	126421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241886
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2497	NC_014160	TAC	3	9	131875	131883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296241893
2498	NC_014160	AGG	2	6	131917	131922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296241893
2499	NC_014160	GCG	2	6	131949	131954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296241894
2500	NC_014160	CGA	2	6	131987	131992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296241894

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