MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_014160	TTA	2	6	1238513	1238518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296243044
23502	NC_014160	GTC	2	6	1238523	1238528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296243044
23503	NC_014160	G	6	6	1238554	1238559	0 %	0 %	100 %	0 %	296243044
23504	NC_014160	GTA	2	6	1238570	1238575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243044
23505	NC_014160	GCCT	2	8	1238644	1238651	0 %	25 %	25 %	50 %	296243044
23506	NC_014160	CCT	2	6	1238723	1238728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243044
23507	NC_014160	CCT	2	6	1238841	1238846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243044
23508	NC_014160	CTT	2	6	1238856	1238861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243044
23509	NC_014160	ACC	2	6	1238925	1238930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23510	NC_014160	TAA	2	6	1238946	1238951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23511	NC_014160	ATT	2	6	1238963	1238968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23512	NC_014160	TGA	2	6	1239005	1239010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23513	NC_014160	GAT	2	6	1239028	1239033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243045
23514	NC_014160	CGT	2	6	1239061	1239066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296243045
23515	NC_014160	GAT	2	6	1239080	1239085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243045
23516	NC_014160	TCA	2	6	1239144	1239149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243045
23517	NC_014160	GAG	2	6	1239256	1239261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243045
23518	NC_014160	ATA	2	6	1239272	1239277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296243045
23519	NC_014160	TAC	2	6	1239305	1239310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243045
23520	NC_014160	CGG	2	6	1239325	1239330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296243045
23521	NC_014160	CTCG	2	8	1239373	1239380	0 %	25 %	25 %	50 %	296243045
23522	NC_014160	TTC	2	6	1239542	1239547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243045
23523	NC_014160	CGG	2	6	1239676	1239681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296243045
23524	NC_014160	AG	3	6	1239716	1239721	50 %	0 %	50 %	0 %	296243045
23525	NC_014160	GAG	2	6	1239731	1239736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243045
23526	NC_014160	CCA	2	6	1239741	1239746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243045
23527	NC_014160	TAG	2	6	1239801	1239806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243045
23528	NC_014160	ATC	2	6	1239865	1239870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243046
23529	NC_014160	TC	3	6	1239869	1239874	0 %	50 %	0 %	50 %	296243046
23530	NC_014160	CTC	2	6	1239889	1239894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243046
23531	NC_014160	TC	3	6	1239893	1239898	0 %	50 %	0 %	50 %	296243046
23532	NC_014160	TC	3	6	1239941	1239946	0 %	50 %	0 %	50 %	296243046
23533	NC_014160	GAG	2	6	1239991	1239996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243046
23534	NC_014160	CCT	2	6	1240017	1240022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243046
23535	NC_014160	A	6	6	1240037	1240042	100 %	0 %	0 %	0 %	296243046
23536	NC_014160	CCT	2	6	1240080	1240085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243046
23537	NC_014160	CCT	2	6	1240101	1240106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243046
23538	NC_014160	CTT	2	6	1240141	1240146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243046
23539	NC_014160	GGGA	2	8	1240266	1240273	25 %	0 %	75 %	0 %	296243046
23540	NC_014160	AGC	2	6	1240327	1240332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296243047
23541	NC_014160	TCT	2	6	1240356	1240361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243047
23542	NC_014160	AAG	2	6	1240426	1240431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243047
23543	NC_014160	TCA	2	6	1240448	1240453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243047
23544	NC_014160	GCG	2	6	1240470	1240475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296243047
23545	NC_014160	TCC	3	9	1240529	1240537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243047
23546	NC_014160	CT	3	6	1240560	1240565	0 %	50 %	0 %	50 %	296243047
23547	NC_014160	CTT	2	6	1240636	1240641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243047
23548	NC_014160	GGA	2	6	1240836	1240841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243048
23549	NC_014160	CT	3	6	1240898	1240903	0 %	50 %	0 %	50 %	296243048
23550	NC_014160	CAA	2	6	1240943	1240948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296243048
23551	NC_014160	GGA	2	6	1240979	1240984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243048
23552	NC_014160	CCA	2	6	1241019	1241024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243048
23553	NC_014160	TC	3	6	1241171	1241176	0 %	50 %	0 %	50 %	296243049
23554	NC_014160	CTC	3	9	1241174	1241182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243049
23555	NC_014160	CTT	2	6	1241267	1241272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243049
23556	NC_014160	CTC	2	6	1241279	1241284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243049
23557	NC_014160	ACCTT	2	10	1241382	1241391	20 %	40 %	0 %	40 %	296243049
23558	NC_014160	TG	3	6	1241434	1241439	0 %	50 %	50 %	0 %	296243049
23559	NC_014160	ATA	2	6	1241477	1241482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23560	NC_014160	CCG	2	6	1241546	1241551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296243050
23561	NC_014160	TCC	2	6	1241564	1241569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243050
23562	NC_014160	CCT	2	6	1241679	1241684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243050
23563	NC_014160	CTC	2	6	1241719	1241724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243050
23564	NC_014160	GCG	2	6	1241769	1241774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296243050
23565	NC_014160	CTTAGT	2	12	1241776	1241787	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296243050
23566	NC_014160	TCCT	2	8	1241846	1241853	0 %	50 %	0 %	50 %	296243050
23567	NC_014160	CTT	2	6	1241992	1241997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243050
23568	NC_014160	GCC	2	6	1242022	1242027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296243050
23569	NC_014160	TTC	2	6	1242050	1242055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243050
23570	NC_014160	CTG	2	6	1242279	1242284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296243050
23571	NC_014160	AG	3	6	1242293	1242298	50 %	0 %	50 %	0 %	296243050
23572	NC_014160	TAGC	2	8	1242323	1242330	25 %	25 %	25 %	25 %	296243050
23573	NC_014160	CT	3	6	1242351	1242356	0 %	50 %	0 %	50 %	296243050
23574	NC_014160	ACC	2	6	1242359	1242364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243050
23575	NC_014160	CCAGG	2	10	1242370	1242379	20 %	0 %	40 %	40 %	296243050
23576	NC_014160	CTT	2	6	1242412	1242417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243050
23577	NC_014160	AT	3	6	1242418	1242423	50 %	50 %	0 %	0 %	296243050
23578	NC_014160	T	6	6	1242577	1242582	0 %	100 %	0 %	0 %	296243050
23579	NC_014160	GAC	2	6	1242616	1242621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296243050
23580	NC_014160	GAA	2	6	1242628	1242633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243050
23581	NC_014160	CTT	2	6	1242673	1242678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243050
23582	NC_014160	AAT	2	6	1242685	1242690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296243050
23583	NC_014160	CGTCCC	2	12	1242697	1242708	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	296243050
23584	NC_014160	TCC	2	6	1242728	1242733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243050
23585	NC_014160	AGA	2	6	1242771	1242776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243050
23586	NC_014160	CCT	2	6	1242805	1242810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243050
23587	NC_014160	CTAG	2	8	1242842	1242849	25 %	25 %	25 %	25 %	296243050
23588	NC_014160	AAT	2	6	1242853	1242858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296243050
23589	NC_014160	GGC	2	6	1242928	1242933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296243050
23590	NC_014160	TCC	2	6	1243022	1243027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243050
23591	NC_014160	C	6	6	1243036	1243041	0 %	0 %	0 %	100 %	296243050
23592	NC_014160	GAA	2	6	1243072	1243077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243050
23593	NC_014160	TCC	2	6	1243121	1243126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243050
23594	NC_014160	GAC	2	6	1243222	1243227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296243050
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23597	NC_014160	CAG	2	6	1243354	1243359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296243050
23598	NC_014160	TTC	2	6	1243367	1243372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243050
23599	NC_014160	ATGCT	2	10	1243392	1243401	20 %	40 %	20 %	20 %	296243050
23600	NC_014160	CTC	2	6	1243501	1243506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243050
23601	NC_014160	AGG	2	6	1243514	1243519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243050
23602	NC_014160	CAGC	2	8	1243527	1243534	25 %	0 %	25 %	50 %	296243050
23603	NC_014160	AGG	2	6	1243546	1243551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243050
23604	NC_014160	AAC	2	6	1243562	1243567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296243050
23605	NC_014160	CAA	2	6	1243581	1243586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296243050
23606	NC_014160	TAT	2	6	1243674	1243679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296243050
23607	NC_014160	ACC	2	6	1243772	1243777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243050
23608	NC_014160	CTC	3	9	1243822	1243830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243050
23609	NC_014160	CT	3	6	1243850	1243855	0 %	50 %	0 %	50 %	296243050
23610	NC_014160	GTC	2	6	1243888	1243893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296243050
23611	NC_014160	AAG	2	6	1243901	1243906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296243050
23612	NC_014160	TCA	2	6	1243958	1243963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243050
23613	NC_014160	CAT	2	6	1243995	1244000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243050
23614	NC_014160	AGGGA	2	10	1244055	1244064	40 %	0 %	60 %	0 %	296243050
23615	NC_014160	TCA	2	6	1244091	1244096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296243050
23616	NC_014160	ATG	2	6	1244136	1244141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243051
23617	NC_014160	CCT	2	6	1244173	1244178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243051
23618	NC_014160	TCC	2	6	1244217	1244222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243051
23619	NC_014160	CCT	2	6	1244236	1244241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243051
23620	NC_014160	GAG	2	6	1244257	1244262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296243051
23621	NC_014160	CCT	3	9	1244278	1244286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243051
23622	NC_014160	CAC	2	6	1244291	1244296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243051
23623	NC_014160	CGA	2	6	1244338	1244343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296243051
23624	NC_014160	CTT	2	6	1244366	1244371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243051
23625	NC_014160	TTC	2	6	1244411	1244416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243051
23626	NC_014160	CT	3	6	1244453	1244458	0 %	50 %	0 %	50 %	296243051
23627	NC_014160	AAAC	2	8	1244500	1244507	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23628	NC_014160	ATA	2	6	1244510	1244515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23629	NC_014160	AGT	2	6	1244554	1244559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23630	NC_014160	AGTG	2	8	1244561	1244568	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23631	NC_014160	GGC	2	6	1244599	1244604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296243052
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23637	NC_014160	AT	3	6	1244809	1244814	50 %	50 %	0 %	0 %	296243052
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23648	NC_014160	GA	3	6	1245430	1245435	50 %	0 %	50 %	0 %	296243052
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23657	NC_014160	CGGGG	2	10	1245868	1245877	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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23660	NC_014160	TTG	2	6	1246231	1246236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296243053
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23711	NC_014160	ATTT	2	8	1249374	1249381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23712	NC_014160	ACT	3	9	1249426	1249434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23729	NC_014160	TGGT	2	8	1250357	1250364	0 %	50 %	50 %	0 %	296243059
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23734	NC_014160	CTT	2	6	1250494	1250499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296243059
23735	NC_014160	ACC	2	6	1250558	1250563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296243059
23736	NC_014160	TCC	2	6	1250564	1250569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243059
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23739	NC_014160	GTA	2	6	1250701	1250706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243059
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23799	NC_014160	AAT	2	6	1254242	1254247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23835	NC_014160	GGT	2	6	1255598	1255603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23853	NC_014160	G	6	6	1256628	1256633	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23854	NC_014160	ACT	2	6	1256710	1256715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23855	NC_014160	TCG	2	6	1256764	1256769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23856	NC_014160	CAT	3	9	1256799	1256807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23948	NC_014160	TACC	2	8	1262058	1262065	25 %	25 %	0 %	50 %	296243074
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23952	NC_014160	TCC	2	6	1262285	1262290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243074
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23959	NC_014160	TC	3	6	1262434	1262439	0 %	50 %	0 %	50 %	296243074
23960	NC_014160	CTC	2	6	1262478	1262483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296243074
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23965	NC_014160	TAGG	2	8	1262722	1262729	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23966	NC_014160	AGT	2	6	1262783	1262788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243075
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23975	NC_014160	AT	3	6	1263281	1263286	50 %	50 %	0 %	0 %	296243076
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24000	NC_014160	TGA	2	6	1264924	1264929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296243077

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