MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_014160	CGC	2	6	1131303	1131308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242941
21502	NC_014160	CCCT	2	8	1131428	1131435	0 %	25 %	0 %	75 %	296242941
21503	NC_014160	GTA	2	6	1131442	1131447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242941
21504	NC_014160	AGCATG	2	12	1131466	1131477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296242941
21505	NC_014160	CGAG	2	8	1131579	1131586	25 %	0 %	50 %	25 %	296242941
21506	NC_014160	CCT	2	6	1131595	1131600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242941
21507	NC_014160	CCCTC	2	10	1131643	1131652	0 %	20 %	0 %	80 %	296242941
21508	NC_014160	CT	3	6	1131712	1131717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21509	NC_014160	ACA	2	6	1131779	1131784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21510	NC_014160	CGG	2	6	1131827	1131832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242942
21511	NC_014160	ACT	2	6	1131862	1131867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242942
21512	NC_014160	TCAGG	2	10	1131884	1131893	20 %	20 %	40 %	20 %	296242942
21513	NC_014160	CAC	2	6	1131936	1131941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242942
21514	NC_014160	GAGC	2	8	1131947	1131954	25 %	0 %	50 %	25 %	296242942
21515	NC_014160	AGG	2	6	1132131	1132136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242942
21516	NC_014160	G	6	6	1132139	1132144	0 %	0 %	100 %	0 %	296242942
21517	NC_014160	ATC	2	6	1132277	1132282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242942
21518	NC_014160	CTACG	2	10	1132317	1132326	20 %	20 %	20 %	40 %	296242942
21519	NC_014160	AT	3	6	1132362	1132367	50 %	50 %	0 %	0 %	296242942
21520	NC_014160	ATC	2	6	1132490	1132495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242942
21521	NC_014160	CTC	2	6	1132653	1132658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242942
21522	NC_014160	CTGGG	2	10	1132680	1132689	0 %	20 %	60 %	20 %	296242942
21523	NC_014160	GAG	2	6	1132719	1132724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242942
21524	NC_014160	CAT	2	6	1132831	1132836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242943
21525	NC_014160	CTC	2	6	1132868	1132873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242943
21526	NC_014160	GA	3	6	1132892	1132897	50 %	0 %	50 %	0 %	296242943
21527	NC_014160	TCAGC	2	10	1132944	1132953	20 %	20 %	20 %	40 %	296242943
21528	NC_014160	TGCC	2	8	1132978	1132985	0 %	25 %	25 %	50 %	296242943
21529	NC_014160	GAA	2	6	1132994	1132999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242943
21530	NC_014160	CAG	2	6	1133053	1133058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242943
21531	NC_014160	G	6	6	1133112	1133117	0 %	0 %	100 %	0 %	296242943
21532	NC_014160	AGCCC	2	10	1133231	1133240	20 %	0 %	20 %	60 %	296242943
21533	NC_014160	CCA	2	6	1133275	1133280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242943
21534	NC_014160	GGC	2	6	1133309	1133314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242943
21535	NC_014160	AGC	2	6	1133324	1133329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242943
21536	NC_014160	CTC	2	6	1133336	1133341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242943
21537	NC_014160	TGA	2	6	1133385	1133390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242943
21538	NC_014160	GAG	2	6	1133425	1133430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242943
21539	NC_014160	GCT	2	6	1133431	1133436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242943
21540	NC_014160	AGCCTC	2	12	1133519	1133530	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296242943
21541	NC_014160	GC	3	6	1133646	1133651	0 %	0 %	50 %	50 %	296242943
21542	NC_014160	CGC	2	6	1133673	1133678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242943
21543	NC_014160	CAA	2	6	1133709	1133714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242943
21544	NC_014160	AG	3	6	1133774	1133779	50 %	0 %	50 %	0 %	296242943
21545	NC_014160	CTC	2	6	1133836	1133841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242943
21546	NC_014160	CTC	2	6	1133884	1133889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242943
21547	NC_014160	CCT	2	6	1134171	1134176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242943
21548	NC_014160	CT	3	6	1134184	1134189	0 %	50 %	0 %	50 %	296242943
21549	NC_014160	CAA	2	6	1134190	1134195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242943
21550	NC_014160	ATT	3	9	1134278	1134286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242943
21551	NC_014160	T	6	6	1134375	1134380	0 %	100 %	0 %	0 %	296242943
21552	NC_014160	ATC	2	6	1134403	1134408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242943
21553	NC_014160	GA	3	6	1134488	1134493	50 %	0 %	50 %	0 %	296242943
21554	NC_014160	TC	3	6	1134562	1134567	0 %	50 %	0 %	50 %	296242943
21555	NC_014160	CAC	2	6	1134589	1134594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242943
21556	NC_014160	GTG	2	6	1134650	1134655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242943
21557	NC_014160	TCCC	2	8	1134698	1134705	0 %	25 %	0 %	75 %	296242943
21558	NC_014160	CCG	2	6	1134773	1134778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242943
21559	NC_014160	TGA	2	6	1134796	1134801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242943
21560	NC_014160	TCCA	2	8	1134842	1134849	25 %	25 %	0 %	50 %	296242943
21561	NC_014160	CTC	2	6	1134855	1134860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242944
21562	NC_014160	TTG	2	6	1134949	1134954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242944
21563	NC_014160	CTTC	2	8	1135021	1135028	0 %	50 %	0 %	50 %	296242944
21564	NC_014160	CTC	2	6	1135056	1135061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242944
21565	NC_014160	AAC	2	6	1135170	1135175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21566	NC_014160	CCT	2	6	1135229	1135234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242945
21567	NC_014160	GAG	2	6	1135281	1135286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242945
21568	NC_014160	CTTG	2	8	1135352	1135359	0 %	50 %	25 %	25 %	296242945
21569	NC_014160	TTA	2	6	1135492	1135497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242945
21570	NC_014160	TGT	2	6	1135592	1135597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242945
21571	NC_014160	TAC	2	6	1135641	1135646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242945
21572	NC_014160	CAA	2	6	1135766	1135771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242945
21573	NC_014160	GGA	2	6	1135925	1135930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242945
21574	NC_014160	AGT	2	6	1135964	1135969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242945
21575	NC_014160	CTG	2	6	1135999	1136004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242945
21576	NC_014160	ACT	2	6	1136089	1136094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242945
21577	NC_014160	TGA	2	6	1136114	1136119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242945
21578	NC_014160	TC	3	6	1136188	1136193	0 %	50 %	0 %	50 %	296242946
21579	NC_014160	CCT	2	6	1136206	1136211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242946
21580	NC_014160	CTC	2	6	1136216	1136221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242946
21581	NC_014160	TCT	2	6	1136227	1136232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242946
21582	NC_014160	CTC	2	6	1136249	1136254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242946
21583	NC_014160	CGG	2	6	1136255	1136260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242946
21584	NC_014160	AAG	2	6	1136283	1136288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242946
21585	NC_014160	AAC	2	6	1136342	1136347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242946
21586	NC_014160	CT	3	6	1136415	1136420	0 %	50 %	0 %	50 %	296242947
21587	NC_014160	TAT	2	6	1136561	1136566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242947
21588	NC_014160	GAA	3	9	1136673	1136681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242947
21589	NC_014160	ATG	2	6	1136743	1136748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242947
21590	NC_014160	GAA	2	6	1136802	1136807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242947
21591	NC_014160	CAT	3	9	1136826	1136834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242947
21592	NC_014160	CTT	2	6	1136844	1136849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242947
21593	NC_014160	CAT	2	6	1136877	1136882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242947
21594	NC_014160	GCTC	2	8	1136924	1136931	0 %	25 %	25 %	50 %	296242947
21595	NC_014160	CGG	2	6	1136934	1136939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242947
21596	NC_014160	GAA	2	6	1137003	1137008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242947
21597	NC_014160	CAC	2	6	1137027	1137032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242947
21598	NC_014160	GGC	2	6	1137094	1137099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242947
21599	NC_014160	TCA	2	6	1137104	1137109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242947
21600	NC_014160	TAA	2	6	1137168	1137173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21601	NC_014160	TGA	3	9	1137186	1137194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21602	NC_014160	GAG	3	9	1137262	1137270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21603	NC_014160	GAA	2	6	1137287	1137292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21604	NC_014160	CTCA	2	8	1137311	1137318	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21605	NC_014160	ATT	2	6	1137403	1137408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242948
21606	NC_014160	CAT	3	9	1137415	1137423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242948
21607	NC_014160	C	6	6	1137497	1137502	0 %	0 %	0 %	100 %	296242948
21608	NC_014160	GGA	2	6	1137565	1137570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242948
21609	NC_014160	CT	3	6	1137597	1137602	0 %	50 %	0 %	50 %	296242948
21610	NC_014160	GAGG	2	8	1137648	1137655	25 %	0 %	75 %	0 %	296242948
21611	NC_014160	GCGT	2	8	1137656	1137663	0 %	25 %	50 %	25 %	296242948
21612	NC_014160	GGA	2	6	1137703	1137708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242948
21613	NC_014160	CCCT	2	8	1137745	1137752	0 %	25 %	0 %	75 %	296242948
21614	NC_014160	TGA	2	6	1137866	1137871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242948
21615	NC_014160	TGA	2	6	1137897	1137902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21616	NC_014160	AAAC	2	8	1137983	1137990	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21617	NC_014160	TTG	2	6	1138142	1138147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242949
21618	NC_014160	AGT	2	6	1138230	1138235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242949
21619	NC_014160	CAG	2	6	1138306	1138311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242949
21620	NC_014160	TGCT	2	8	1138334	1138341	0 %	50 %	25 %	25 %	296242949
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21657	NC_014160	GAG	2	6	1140235	1140240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21720	NC_014160	TGA	2	6	1143325	1143330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242955
21721	NC_014160	CT	3	6	1143386	1143391	0 %	50 %	0 %	50 %	296242955
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21725	NC_014160	CTT	2	6	1143580	1143585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21726	NC_014160	GACCT	2	10	1143684	1143693	20 %	20 %	20 %	40 %	296242956
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21733	NC_014160	A	7	7	1143969	1143975	100 %	0 %	0 %	0 %	296242956
21734	NC_014160	GCAA	2	8	1144006	1144013	50 %	0 %	25 %	25 %	296242956
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21972	NC_014160	GCCT	2	8	1156289	1156296	0 %	25 %	25 %	50 %	296242968
21973	NC_014160	ATC	2	6	1156347	1156352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242969
21974	NC_014160	GCC	2	6	1156359	1156364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242969
21975	NC_014160	CAGTA	2	10	1156395	1156404	40 %	20 %	20 %	20 %	296242969
21976	NC_014160	TGT	2	6	1156432	1156437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242969
21977	NC_014160	AAT	2	6	1156463	1156468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242969
21978	NC_014160	CTT	2	6	1156469	1156474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242969
21979	NC_014160	CTG	2	6	1156485	1156490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242969
21980	NC_014160	TTC	2	6	1156656	1156661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242969
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21982	NC_014160	CTT	3	9	1156825	1156833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242969
21983	NC_014160	TTAT	2	8	1156872	1156879	25 %	75 %	0 %	0 %	296242969
21984	NC_014160	CTC	2	6	1156905	1156910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242969
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21990	NC_014160	ACT	2	6	1157193	1157198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242969
21991	NC_014160	T	6	6	1157294	1157299	0 %	100 %	0 %	0 %	296242969
21992	NC_014160	GC	3	6	1157350	1157355	0 %	0 %	50 %	50 %	296242969
21993	NC_014160	CCTC	2	8	1157527	1157534	0 %	25 %	0 %	75 %	296242969
21994	NC_014160	TGT	2	6	1157638	1157643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242969
21995	NC_014160	T	6	6	1157648	1157653	0 %	100 %	0 %	0 %	296242969
21996	NC_014160	GAT	2	6	1157732	1157737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242969
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21999	NC_014160	TCC	2	6	1157886	1157891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242969
22000	NC_014160	CGA	2	6	1157908	1157913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242969

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