MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_014160	ATA	2	6	1025903	1025908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242845
19502	NC_014160	GGAT	2	8	1025966	1025973	25 %	25 %	50 %	0 %	296242845
19503	NC_014160	AG	3	6	1026004	1026009	50 %	0 %	50 %	0 %	296242845
19504	NC_014160	ATA	2	6	1026017	1026022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242845
19505	NC_014160	ATGT	2	8	1026074	1026081	25 %	50 %	25 %	0 %	296242845
19506	NC_014160	CAGA	2	8	1026104	1026111	50 %	0 %	25 %	25 %	296242845
19507	NC_014160	CAA	2	6	1026129	1026134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242845
19508	NC_014160	ACA	2	6	1026143	1026148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242845
19509	NC_014160	ACTG	2	8	1026203	1026210	25 %	25 %	25 %	25 %	296242845
19510	NC_014160	ACTG	2	8	1026214	1026221	25 %	25 %	25 %	25 %	296242845
19511	NC_014160	A	6	6	1026275	1026280	100 %	0 %	0 %	0 %	296242845
19512	NC_014160	T	6	6	1026312	1026317	0 %	100 %	0 %	0 %	296242846
19513	NC_014160	ATC	2	6	1026350	1026355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242846
19514	NC_014160	TCA	3	9	1026368	1026376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242846
19515	NC_014160	CCTCC	2	10	1026415	1026424	0 %	20 %	0 %	80 %	296242846
19516	NC_014160	AAG	2	6	1026478	1026483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242846
19517	NC_014160	CT	3	6	1026513	1026518	0 %	50 %	0 %	50 %	296242846
19518	NC_014160	GAT	2	6	1026621	1026626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242846
19519	NC_014160	AGG	2	6	1026649	1026654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242846
19520	NC_014160	TAA	2	6	1026681	1026686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242846
19521	NC_014160	CTTC	2	8	1026717	1026724	0 %	50 %	0 %	50 %	296242846
19522	NC_014160	GTA	2	6	1026734	1026739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242846
19523	NC_014160	CCT	2	6	1026832	1026837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242846
19524	NC_014160	ACG	2	6	1026921	1026926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242846
19525	NC_014160	AGG	2	6	1026944	1026949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242846
19526	NC_014160	TCC	2	6	1026956	1026961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242846
19527	NC_014160	TTC	2	6	1026995	1027000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242846
19528	NC_014160	ATC	2	6	1027030	1027035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242846
19529	NC_014160	AGA	2	6	1027037	1027042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242846
19530	NC_014160	GAG	2	6	1027102	1027107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242846
19531	NC_014160	AAT	2	6	1027225	1027230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242846
19532	NC_014160	GGA	2	6	1027273	1027278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242846
19533	NC_014160	AAG	2	6	1027309	1027314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242846
19534	NC_014160	GAA	2	6	1027504	1027509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242846
19535	NC_014160	TAA	2	6	1027599	1027604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242846
19536	NC_014160	TAT	2	6	1027735	1027740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242846
19537	NC_014160	TACC	2	8	1027779	1027786	25 %	25 %	0 %	50 %	296242846
19538	NC_014160	TTA	2	6	1027832	1027837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19539	NC_014160	T	6	6	1027877	1027882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19540	NC_014160	TTA	2	6	1027889	1027894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19541	NC_014160	TAG	2	6	1027905	1027910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19542	NC_014160	ATG	2	6	1027919	1027924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242847
19543	NC_014160	ATT	2	6	1027988	1027993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242847
19544	NC_014160	CGC	2	6	1028064	1028069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242847
19545	NC_014160	ACG	2	6	1028280	1028285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242847
19546	NC_014160	CTGT	2	8	1028303	1028310	0 %	50 %	25 %	25 %	296242847
19547	NC_014160	GGCT	2	8	1028332	1028339	0 %	25 %	50 %	25 %	296242847
19548	NC_014160	ACT	2	6	1028415	1028420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242847
19549	NC_014160	ATT	2	6	1028504	1028509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242847
19550	NC_014160	GGA	2	6	1028514	1028519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242847
19551	NC_014160	GGA	2	6	1028525	1028530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242847
19552	NC_014160	CGA	2	6	1028536	1028541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242847
19553	NC_014160	TAC	2	6	1028585	1028590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242847
19554	NC_014160	CGA	2	6	1028593	1028598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242847
19555	NC_014160	TGG	2	6	1028630	1028635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242847
19556	NC_014160	AT	3	6	1028684	1028689	50 %	50 %	0 %	0 %	296242847
19557	NC_014160	TAA	2	6	1028848	1028853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242847
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19559	NC_014160	TAA	2	6	1028922	1028927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242847
19560	NC_014160	ATGGT	2	10	1028935	1028944	20 %	40 %	40 %	0 %	296242847
19561	NC_014160	AGGC	2	8	1028951	1028958	25 %	0 %	50 %	25 %	296242847
19562	NC_014160	CAA	2	6	1029023	1029028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242847
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19564	NC_014160	GAT	2	6	1029193	1029198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242847
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19566	NC_014160	CAG	2	6	1029376	1029381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242847
19567	NC_014160	TCC	2	6	1029388	1029393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242847
19568	NC_014160	AAC	2	6	1029416	1029421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242847
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19570	NC_014160	GAG	2	6	1029470	1029475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242847
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19572	NC_014160	TA	3	6	1029510	1029515	50 %	50 %	0 %	0 %	296242847
19573	NC_014160	TGGG	2	8	1029578	1029585	0 %	25 %	75 %	0 %	296242847
19574	NC_014160	GTG	2	6	1029607	1029612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242847
19575	NC_014160	GGC	2	6	1029706	1029711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242847
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19583	NC_014160	TCA	2	6	1029957	1029962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242847
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19585	NC_014160	T	7	7	1030049	1030055	0 %	100 %	0 %	0 %	296242848
19586	NC_014160	ACT	2	6	1030056	1030061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242848
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19588	NC_014160	CAA	2	6	1030126	1030131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242848
19589	NC_014160	ATA	2	6	1030132	1030137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242848
19590	NC_014160	GAG	2	6	1030265	1030270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242848
19591	NC_014160	GTA	2	6	1030306	1030311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242848
19592	NC_014160	GGA	2	6	1030396	1030401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242848
19593	NC_014160	TAC	2	6	1030477	1030482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242848
19594	NC_014160	TC	3	6	1030495	1030500	0 %	50 %	0 %	50 %	296242848
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19598	NC_014160	TCCA	2	8	1030638	1030645	25 %	25 %	0 %	50 %	296242848
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19602	NC_014160	TAA	2	6	1031071	1031076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242849
19603	NC_014160	GGC	2	6	1031122	1031127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242849
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19605	NC_014160	GA	3	6	1031227	1031232	50 %	0 %	50 %	0 %	296242849
19606	NC_014160	GTT	2	6	1031246	1031251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242849
19607	NC_014160	ACTC	2	8	1031265	1031272	25 %	25 %	0 %	50 %	296242849
19608	NC_014160	TGAT	2	8	1031352	1031359	25 %	50 %	25 %	0 %	296242849
19609	NC_014160	TAA	2	6	1031391	1031396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242849
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19612	NC_014160	TC	3	6	1031531	1031536	0 %	50 %	0 %	50 %	296242849
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19614	NC_014160	CT	3	6	1031558	1031563	0 %	50 %	0 %	50 %	296242849
19615	NC_014160	CCT	2	6	1031605	1031610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242849
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