MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_014160	TAAA	2	8	999518	999525	75 %	25 %	0 %	0 %	296242812
19002	NC_014160	TCT	2	6	999616	999621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242812
19003	NC_014160	CCA	2	6	999638	999643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242812
19004	NC_014160	CCT	2	6	999648	999653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242812
19005	NC_014160	AGT	2	6	999659	999664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242812
19006	NC_014160	ATC	2	6	999719	999724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242812
19007	NC_014160	AT	3	6	999735	999740	50 %	50 %	0 %	0 %	296242812
19008	NC_014160	ATGG	2	8	999774	999781	25 %	25 %	50 %	0 %	296242812
19009	NC_014160	AGG	2	6	999803	999808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242812
19010	NC_014160	CAT	2	6	999838	999843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242812
19011	NC_014160	TAA	2	6	999910	999915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242812
19012	NC_014160	GGC	2	6	1000102	1000107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242813
19013	NC_014160	GTA	2	6	1000133	1000138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242813
19014	NC_014160	TCA	2	6	1000222	1000227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242813
19015	NC_014160	TCT	2	6	1000314	1000319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242813
19016	NC_014160	AT	3	6	1000332	1000337	50 %	50 %	0 %	0 %	296242813
19017	NC_014160	TTG	2	6	1000346	1000351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242813
19018	NC_014160	GAA	2	6	1000362	1000367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242813
19019	NC_014160	ACT	2	6	1000459	1000464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242813
19020	NC_014160	TCCTTC	2	12	1000590	1000601	0 %	50 %	0 %	50 %	296242813
19021	NC_014160	TATC	2	8	1000684	1000691	25 %	50 %	0 %	25 %	296242813
19022	NC_014160	ATC	2	6	1000803	1000808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242814
19023	NC_014160	CCT	2	6	1000813	1000818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242814
19024	NC_014160	AGG	2	6	1000830	1000835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242814
19025	NC_014160	TAT	2	6	1000847	1000852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242814
19026	NC_014160	TGA	2	6	1000955	1000960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242814
19027	NC_014160	CTC	2	6	1000971	1000976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242814
19028	NC_014160	CAG	2	6	1000990	1000995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242814
19029	NC_014160	GTA	2	6	1001066	1001071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242814
19030	NC_014160	ATA	2	6	1001085	1001090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242814
19031	NC_014160	AAC	2	6	1001156	1001161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242814
19032	NC_014160	AGT	2	6	1001185	1001190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242814
19033	NC_014160	CAAG	2	8	1001215	1001222	50 %	0 %	25 %	25 %	296242814
19034	NC_014160	ATAGT	2	10	1001291	1001300	40 %	40 %	20 %	0 %	296242814
19035	NC_014160	TAT	2	6	1001324	1001329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242814
19036	NC_014160	CCATAC	2	12	1001330	1001341	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	296242814
19037	NC_014160	GAA	2	6	1001432	1001437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242814
19038	NC_014160	CCT	2	6	1001444	1001449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242814
19039	NC_014160	CAGC	2	8	1001467	1001474	25 %	0 %	25 %	50 %	296242814
19040	NC_014160	TGA	2	6	1001560	1001565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242814
19041	NC_014160	GGATGA	2	12	1001572	1001583	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296242814
19042	NC_014160	TGC	2	6	1001609	1001614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242814
19043	NC_014160	AGG	2	6	1001676	1001681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242814
19044	NC_014160	GCT	2	6	1001688	1001693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242814
19045	NC_014160	ATG	2	6	1001721	1001726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242814
19046	NC_014160	GGCC	2	8	1001755	1001762	0 %	0 %	50 %	50 %	296242814
19047	NC_014160	AT	3	6	1001792	1001797	50 %	50 %	0 %	0 %	296242814
19048	NC_014160	GAT	2	6	1001810	1001815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242814
19049	NC_014160	TCAA	2	8	1001829	1001836	50 %	25 %	0 %	25 %	296242814
19050	NC_014160	CGTAAA	2	12	1001944	1001955	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296242814
19051	NC_014160	GTA	2	6	1002008	1002013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242814
19052	NC_014160	T	6	6	1002075	1002080	0 %	100 %	0 %	0 %	296242814
19053	NC_014160	AT	3	6	1002146	1002151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_014160	GTG	2	6	1002165	1002170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19055	NC_014160	GTG	2	6	1002189	1002194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242815
19056	NC_014160	AG	3	6	1002297	1002302	50 %	0 %	50 %	0 %	296242815
19057	NC_014160	GGA	2	6	1002327	1002332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242815
19058	NC_014160	GCT	2	6	1002383	1002388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242815
19059	NC_014160	CAA	2	6	1002399	1002404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242815
19060	NC_014160	TAA	2	6	1002449	1002454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242815
19061	NC_014160	CCA	2	6	1002463	1002468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242815
19062	NC_014160	TGG	2	6	1002541	1002546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242815
19063	NC_014160	TAG	2	6	1002601	1002606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242815
19064	NC_014160	CTT	2	6	1002669	1002674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242815
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19066	NC_014160	GATAAT	2	12	1002747	1002758	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296242815
19067	NC_014160	TTG	2	6	1002777	1002782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242815
19068	NC_014160	GGC	2	6	1002810	1002815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242815
19069	NC_014160	CGT	2	6	1002902	1002907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242815
19070	NC_014160	ATT	2	6	1002945	1002950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242815
19071	NC_014160	AGG	2	6	1002961	1002966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242815
19072	NC_014160	GT	3	6	1002967	1002972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19073	NC_014160	ACA	2	6	1002997	1003002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242816
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19075	NC_014160	TCCC	2	8	1003042	1003049	0 %	25 %	0 %	75 %	296242816
19076	NC_014160	C	6	6	1003047	1003052	0 %	0 %	0 %	100 %	296242816
19077	NC_014160	CGA	2	6	1003082	1003087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242816
19078	NC_014160	CTT	2	6	1003257	1003262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242816
19079	NC_014160	TAA	2	6	1003478	1003483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19080	NC_014160	CCT	2	6	1003777	1003782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242818
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19082	NC_014160	GGA	2	6	1003977	1003982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242818
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19084	NC_014160	T	6	6	1004020	1004025	0 %	100 %	0 %	0 %	296242818
19085	NC_014160	TCT	2	6	1004089	1004094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242818
19086	NC_014160	GCTG	2	8	1004190	1004197	0 %	25 %	50 %	25 %	296242818
19087	NC_014160	TAT	2	6	1004206	1004211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242818
19088	NC_014160	CTCCGT	2	12	1004221	1004232	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296242818
19089	NC_014160	AAT	2	6	1004242	1004247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242818
19090	NC_014160	CAA	2	6	1004338	1004343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242818
19091	NC_014160	TCTG	2	8	1004419	1004426	0 %	50 %	25 %	25 %	296242818
19092	NC_014160	TATT	2	8	1004468	1004475	25 %	75 %	0 %	0 %	296242818
19093	NC_014160	TA	3	6	1004485	1004490	50 %	50 %	0 %	0 %	296242818
19094	NC_014160	GTT	2	6	1004607	1004612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242818
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19097	NC_014160	ATCG	2	8	1004773	1004780	25 %	25 %	25 %	25 %	296242818
19098	NC_014160	T	6	6	1004796	1004801	0 %	100 %	0 %	0 %	296242818
19099	NC_014160	CTC	2	6	1004821	1004826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242818
19100	NC_014160	CGC	2	6	1004841	1004846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242818
19101	NC_014160	AAT	2	6	1004874	1004879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19102	NC_014160	GT	3	6	1004917	1004922	0 %	50 %	50 %	0 %	296242819
19103	NC_014160	GAT	2	6	1004929	1004934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242819
19104	NC_014160	CTG	2	6	1004940	1004945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242819
19105	NC_014160	TTG	2	6	1004948	1004953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242819
19106	NC_014160	GA	3	6	1004964	1004969	50 %	0 %	50 %	0 %	296242819
19107	NC_014160	GAG	2	6	1005001	1005006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242819
19108	NC_014160	AAC	2	6	1005034	1005039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242819
19109	NC_014160	TCT	2	6	1005081	1005086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242819
19110	NC_014160	ACC	2	6	1005155	1005160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242819
19111	NC_014160	AAG	2	6	1005199	1005204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242819
19112	NC_014160	TGTT	2	8	1005218	1005225	0 %	75 %	25 %	0 %	296242819
19113	NC_014160	CTC	2	6	1005255	1005260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242819
19114	NC_014160	GA	3	6	1005336	1005341	50 %	0 %	50 %	0 %	296242819
19115	NC_014160	TGA	2	6	1005425	1005430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242819
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19117	NC_014160	GAT	3	9	1005570	1005578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242819
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19233	NC_014160	ACC	2	6	1012645	1012650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242829
19234	NC_014160	CGT	2	6	1012761	1012766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242829
19235	NC_014160	AGA	2	6	1012842	1012847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242829
19236	NC_014160	GATAA	2	10	1013000	1013009	60 %	20 %	20 %	0 %	296242829
19237	NC_014160	CA	3	6	1013153	1013158	50 %	0 %	0 %	50 %	296242829
19238	NC_014160	GCT	2	6	1013198	1013203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242829
19239	NC_014160	T	6	6	1013203	1013208	0 %	100 %	0 %	0 %	296242829
19240	NC_014160	AGT	2	6	1013235	1013240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242829
19241	NC_014160	TGA	2	6	1013245	1013250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242829
19242	NC_014160	GA	3	6	1013249	1013254	50 %	0 %	50 %	0 %	296242829
19243	NC_014160	CCT	2	6	1013308	1013313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242829
19244	NC_014160	CT	4	8	1013331	1013338	0 %	50 %	0 %	50 %	296242829
19245	NC_014160	T	6	6	1013353	1013358	0 %	100 %	0 %	0 %	296242829
19246	NC_014160	TA	3	6	1013410	1013415	50 %	50 %	0 %	0 %	296242829
19247	NC_014160	GTG	2	6	1013450	1013455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19248	NC_014160	GA	3	6	1013486	1013491	50 %	0 %	50 %	0 %	296242830
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19250	NC_014160	CCT	2	6	1013548	1013553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242830
19251	NC_014160	GGA	2	6	1013560	1013565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242830
19252	NC_014160	GA	3	6	1013635	1013640	50 %	0 %	50 %	0 %	296242830
19253	NC_014160	AGA	2	6	1013784	1013789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242830
19254	NC_014160	T	6	6	1013852	1013857	0 %	100 %	0 %	0 %	296242831
19255	NC_014160	ATG	2	6	1013934	1013939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242831
19256	NC_014160	TCA	2	6	1013987	1013992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242831
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19258	NC_014160	TCT	2	6	1014096	1014101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242831
19259	NC_014160	TACC	2	8	1014118	1014125	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19260	NC_014160	ATT	2	6	1014135	1014140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19261	NC_014160	TAA	2	6	1014153	1014158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19262	NC_014160	AAT	2	6	1014292	1014297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242832
19263	NC_014160	CTT	2	6	1014298	1014303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242832
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19271	NC_014160	TTG	2	6	1014709	1014714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242832
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19282	NC_014160	GAC	2	6	1015711	1015716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242833
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19300	NC_014160	CAC	2	6	1016612	1016617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19301	NC_014160	CTTC	2	8	1016625	1016632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19305	NC_014160	GTG	2	6	1016863	1016868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19333	NC_014160	TTCA	2	8	1018558	1018565	25 %	50 %	0 %	25 %	296242837
19334	NC_014160	CTTTA	2	10	1018609	1018618	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19335	NC_014160	CAG	2	6	1018735	1018740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242838
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19340	NC_014160	AAGG	2	8	1019083	1019090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19341	NC_014160	GTAT	2	8	1019166	1019173	25 %	50 %	25 %	0 %	296242839
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19345	NC_014160	CTT	2	6	1019358	1019363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242839
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19347	NC_014160	ACC	2	6	1019402	1019407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242839
19348	NC_014160	ACTC	2	8	1019446	1019453	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19349	NC_014160	TTC	2	6	1019515	1019520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242840
19350	NC_014160	CT	3	6	1019529	1019534	0 %	50 %	0 %	50 %	296242840
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19471	NC_014160	AGCC	2	8	1024396	1024403	25 %	0 %	25 %	50 %	296242844
19472	NC_014160	TTC	2	6	1024427	1024432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242844
19473	NC_014160	AG	3	6	1024457	1024462	50 %	0 %	50 %	0 %	296242844
19474	NC_014160	CCT	2	6	1024547	1024552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242844
19475	NC_014160	TCA	2	6	1024564	1024569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242844
19476	NC_014160	ATC	2	6	1024587	1024592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242844
19477	NC_014160	TGC	2	6	1024610	1024615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242844
19478	NC_014160	TC	4	8	1024624	1024631	0 %	50 %	0 %	50 %	296242844
19479	NC_014160	CGC	2	6	1024778	1024783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242844
19480	NC_014160	GCT	2	6	1024795	1024800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242844
19481	NC_014160	CCA	2	6	1024827	1024832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242844
19482	NC_014160	TA	3	6	1024986	1024991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19483	NC_014160	TAAAT	2	10	1024997	1025006	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19484	NC_014160	TGA	2	6	1025021	1025026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19485	NC_014160	CTA	2	6	1025069	1025074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242845
19486	NC_014160	GGC	3	9	1025162	1025170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242845
19487	NC_014160	GA	3	6	1025307	1025312	50 %	0 %	50 %	0 %	296242845
19488	NC_014160	GTGGG	2	10	1025383	1025392	0 %	20 %	80 %	0 %	296242845
19489	NC_014160	AGT	2	6	1025413	1025418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242845
19490	NC_014160	CAC	2	6	1025433	1025438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242845
19491	NC_014160	CTTC	2	8	1025453	1025460	0 %	50 %	0 %	50 %	296242845
19492	NC_014160	AAGC	2	8	1025538	1025545	50 %	0 %	25 %	25 %	296242845
19493	NC_014160	AGT	2	6	1025551	1025556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242845
19494	NC_014160	CTA	2	6	1025591	1025596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242845
19495	NC_014160	TGGG	2	8	1025666	1025673	0 %	25 %	75 %	0 %	296242845
19496	NC_014160	TTG	2	6	1025712	1025717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242845
19497	NC_014160	ATT	2	6	1025725	1025730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242845
19498	NC_014160	GTG	2	6	1025763	1025768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242845
19499	NC_014160	CATT	2	8	1025844	1025851	25 %	50 %	0 %	25 %	296242845
19500	NC_014160	ACT	2	6	1025877	1025882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242845

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