MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosphaera aggregans DSM 11486 chromosome

Total Repeats: 24968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_014160	CGA	2	6	869102	869107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242655
16502	NC_014160	GGAG	2	8	869151	869158	25 %	0 %	75 %	0 %	296242655
16503	NC_014160	CTC	2	6	869160	869165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242655
16504	NC_014160	TTC	2	6	869194	869199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242655
16505	NC_014160	CA	3	6	869372	869377	50 %	0 %	0 %	50 %	296242655
16506	NC_014160	GCT	2	6	869386	869391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242655
16507	NC_014160	ATGA	2	8	869421	869428	50 %	25 %	25 %	0 %	296242655
16508	NC_014160	CCA	2	6	869461	869466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242655
16509	NC_014160	AAT	2	6	869485	869490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242655
16510	NC_014160	GTA	2	6	869547	869552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242655
16511	NC_014160	CGC	2	6	869705	869710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242655
16512	NC_014160	CTT	2	6	869732	869737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242655
16513	NC_014160	GGA	2	6	869807	869812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242655
16514	NC_014160	CTA	2	6	869844	869849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16515	NC_014160	TAAT	2	8	869866	869873	50 %	50 %	0 %	0 %	296242656
16516	NC_014160	CCT	2	6	869902	869907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242656
16517	NC_014160	GGT	2	6	869923	869928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242656
16518	NC_014160	TGA	2	6	870012	870017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242656
16519	NC_014160	TCC	2	6	870018	870023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242656
16520	NC_014160	ACT	2	6	870024	870029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242656
16521	NC_014160	TGG	2	6	870103	870108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242656
16522	NC_014160	GAA	2	6	870163	870168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242656
16523	NC_014160	GAGGG	2	10	870214	870223	20 %	0 %	80 %	0 %	296242656
16524	NC_014160	GAA	2	6	870354	870359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242657
16525	NC_014160	GGGA	2	8	870372	870379	25 %	0 %	75 %	0 %	296242657
16526	NC_014160	GGT	2	6	870455	870460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242657
16527	NC_014160	AGC	2	6	870624	870629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242657
16528	NC_014160	CAT	2	6	870655	870660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242657
16529	NC_014160	CG	3	6	870707	870712	0 %	0 %	50 %	50 %	296242657
16530	NC_014160	GCA	2	6	870750	870755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242657
16531	NC_014160	ATCA	2	8	870851	870858	50 %	25 %	0 %	25 %	296242657
16532	NC_014160	GCC	3	9	870940	870948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16533	NC_014160	TAC	2	6	871039	871044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16534	NC_014160	GGC	2	6	871045	871050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16535	NC_014160	TAT	2	6	871126	871131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296242658
16536	NC_014160	AGG	2	6	871139	871144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242658
16537	NC_014160	GGA	2	6	871222	871227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242658
16538	NC_014160	GCC	2	6	871262	871267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296242658
16539	NC_014160	GGGA	2	8	871316	871323	25 %	0 %	75 %	0 %	296242658
16540	NC_014160	CTC	2	6	871350	871355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242658
16541	NC_014160	CCA	2	6	871369	871374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242658
16542	NC_014160	CTC	2	6	871445	871450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242658
16543	NC_014160	T	6	6	871607	871612	0 %	100 %	0 %	0 %	296242658
16544	NC_014160	ATT	2	6	871697	871702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16545	NC_014160	AGG	2	6	871770	871775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16546	NC_014160	ATCTT	2	10	871979	871988	20 %	60 %	0 %	20 %	296242659
16547	NC_014160	TAG	2	6	872083	872088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242659
16548	NC_014160	GGA	2	6	872205	872210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242659
16549	NC_014160	TAA	2	6	872321	872326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242659
16550	NC_014160	CTT	2	6	872364	872369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242659
16551	NC_014160	G	6	6	872387	872392	0 %	0 %	100 %	0 %	296242659
16552	NC_014160	ATC	2	6	872434	872439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242659
16553	NC_014160	CCT	2	6	872454	872459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242659
16554	NC_014160	AAG	2	6	872480	872485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242659
16555	NC_014160	CAA	2	6	872526	872531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242659
16556	NC_014160	GTGCCT	2	12	872584	872595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242659
16557	NC_014160	T	6	6	872704	872709	0 %	100 %	0 %	0 %	296242659
16558	NC_014160	CTG	2	6	872714	872719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242659
16559	NC_014160	GGC	2	6	872767	872772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242659
16560	NC_014160	TAC	2	6	872893	872898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16561	NC_014160	TCA	2	6	872918	872923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16562	NC_014160	TG	3	6	872939	872944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16563	NC_014160	AGA	2	6	872962	872967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296242660
16564	NC_014160	GCG	2	6	873008	873013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242660
16565	NC_014160	CTT	2	6	873088	873093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296242660
16566	NC_014160	ATA	2	6	873124	873129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296242660
16567	NC_014160	CTA	2	6	873155	873160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242660
16568	NC_014160	CACC	2	8	873166	873173	25 %	0 %	0 %	75 %	296242660
16569	NC_014160	GGA	2	6	873192	873197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242660
16570	NC_014160	TGG	2	6	873230	873235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296242660
16571	NC_014160	ATC	2	6	873247	873252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242660
16572	NC_014160	AGCAT	2	10	873298	873307	40 %	20 %	20 %	20 %	296242660
16573	NC_014160	TGA	2	6	873312	873317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242660
16574	NC_014160	AGCC	2	8	873398	873405	25 %	0 %	25 %	50 %	296242660
16575	NC_014160	CAA	2	6	873415	873420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242660
16576	NC_014160	CAT	2	6	873448	873453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242661
16577	NC_014160	GAAA	2	8	873462	873469	75 %	0 %	25 %	0 %	296242661
16578	NC_014160	CA	3	6	873485	873490	50 %	0 %	0 %	50 %	296242661
16579	NC_014160	AC	3	6	873498	873503	50 %	0 %	0 %	50 %	296242661
16580	NC_014160	GTT	2	6	873522	873527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242661
16581	NC_014160	AGG	2	6	873530	873535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242661
16582	NC_014160	GAT	2	6	873551	873556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242661
16583	NC_014160	GAC	2	6	873557	873562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296242661
16584	NC_014160	CAA	2	6	873592	873597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242661
16585	NC_014160	GAG	2	6	873629	873634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242661
16586	NC_014160	AGT	2	6	873681	873686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242661
16587	NC_014160	CTG	2	6	873730	873735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296242661
16588	NC_014160	CT	4	8	873796	873803	0 %	50 %	0 %	50 %	296242661
16589	NC_014160	GA	3	6	873863	873868	50 %	0 %	50 %	0 %	296242661
16590	NC_014160	CCT	2	6	873877	873882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242661
16591	NC_014160	GTAG	2	8	873937	873944	25 %	25 %	50 %	0 %	296242661
16592	NC_014160	CAA	2	6	873976	873981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296242661
16593	NC_014160	GAG	2	6	874134	874139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296242661
16594	NC_014160	TA	3	6	874140	874145	50 %	50 %	0 %	0 %	296242661
16595	NC_014160	AG	3	6	874146	874151	50 %	0 %	50 %	0 %	296242661
16596	NC_014160	GA	4	8	874212	874219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16597	NC_014160	CTCC	2	8	874254	874261	0 %	25 %	0 %	75 %	296242662
16598	NC_014160	GTA	2	6	874293	874298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242662
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16600	NC_014160	TGGC	2	8	874400	874407	0 %	25 %	50 %	25 %	296242662
16601	NC_014160	CCT	2	6	874478	874483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
16602	NC_014160	CAT	2	6	874500	874505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242662
16603	NC_014160	CTC	2	6	874508	874513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
16604	NC_014160	CCTCGA	2	12	874538	874549	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296242662
16605	NC_014160	GTA	2	6	874578	874583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242662
16606	NC_014160	CGG	2	6	874613	874618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296242662
16607	NC_014160	TCC	2	6	874766	874771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
16608	NC_014160	TCA	2	6	874772	874777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296242662
16609	NC_014160	CCT	2	6	874800	874805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
16610	NC_014160	GTGC	2	8	874887	874894	0 %	25 %	50 %	25 %	296242662
16611	NC_014160	CTC	2	6	874902	874907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
16612	NC_014160	CTC	2	6	875037	875042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
16613	NC_014160	C	6	6	875042	875047	0 %	0 %	0 %	100 %	296242662
16614	NC_014160	CCA	2	6	875081	875086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296242662
16615	NC_014160	CTC	2	6	875149	875154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
16616	NC_014160	AGT	2	6	875156	875161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242662
16617	NC_014160	CCT	2	6	875171	875176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
16618	NC_014160	CTC	2	6	875185	875190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
16619	NC_014160	TTG	2	6	875230	875235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296242662
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16621	NC_014160	CCT	3	9	875468	875476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296242662
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16743	NC_014160	TGA	2	6	880551	880556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296242673
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